MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Lorraine plasmid pLELO

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018141	AAAAG	2	10	490	499	80 %	0 %	20 %	0 %	397668687
2	NC_018141	AGGTA	2	10	1859	1868	40 %	20 %	40 %	0 %	397668688
3	NC_018141	TTTTC	2	10	2802	2811	0 %	80 %	0 %	20 %	397668690
4	NC_018141	TATCC	2	10	3339	3348	20 %	40 %	0 %	40 %	397668690
5	NC_018141	CTTTT	2	10	4699	4708	0 %	80 %	0 %	20 %	397668692
6	NC_018141	AAGAA	2	10	6371	6380	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018141	GTGAT	2	10	7160	7169	20 %	40 %	40 %	0 %	397668696
8	NC_018141	TTGGA	2	10	7507	7516	20 %	40 %	40 %	0 %	397668696
9	NC_018141	TCGTG	2	10	7867	7876	0 %	40 %	40 %	20 %	397668696
10	NC_018141	CATTG	2	10	12111	12120	20 %	40 %	20 %	20 %	397668703
11	NC_018141	GTTTT	2	10	12417	12426	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018141	TAAAT	2	10	15919	15928	60 %	40 %	0 %	0 %	397668708
13	NC_018141	TCAAG	2	10	19212	19221	40 %	20 %	20 %	20 %	397668712
14	NC_018141	TTCAT	2	10	19797	19806	20 %	60 %	0 %	20 %	397668713
15	NC_018141	AAGCA	2	10	19915	19924	60 %	0 %	20 %	20 %	397668713
16	NC_018141	CTTTC	2	10	19995	20004	0 %	60 %	0 %	40 %	397668713
17	NC_018141	TGTTC	2	10	20073	20082	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018141	GAAAA	2	10	20230	20239	80 %	0 %	20 %	0 %	397668714
19	NC_018141	TGGTT	2	10	20441	20450	0 %	60 %	40 %	0 %	397668714
20	NC_018141	AAGTA	2	10	21028	21037	60 %	20 %	20 %	0 %	397668715
21	NC_018141	AGTGG	2	10	21943	21952	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018141	TTTAT	2	10	23966	23975	20 %	80 %	0 %	0 %	397668718
23	NC_018141	ATTGA	2	10	24832	24841	40 %	40 %	20 %	0 %	397668719
24	NC_018141	TTATC	2	10	25811	25820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018141	TTAGA	2	10	25892	25901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018141	ACAAT	2	10	30594	30603	60 %	20 %	0 %	20 %	397668726
27	NC_018141	AATAG	2	10	30800	30809	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018141	AAATC	2	10	36742	36751	60 %	20 %	0 %	20 %	397668732
29	NC_018141	AATTA	2	10	38589	38598	60 %	40 %	0 %	0 %	397668733
30	NC_018141	TAATT	2	10	39895	39904	40 %	60 %	0 %	0 %	397668734
31	NC_018141	TCTTA	2	10	40403	40412	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018141	AAAAG	2	10	40477	40486	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018141	ATTTT	2	10	41520	41529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018141	GAAAA	2	10	41857	41866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018141	TTGTT	2	10	42126	42135	0 %	80 %	20 %	0 %	397668738
36	NC_018141	TTTTA	2	10	44820	44829	20 %	80 %	0 %	0 %	397668742
37	NC_018141	TTTGA	2	10	45759	45768	20 %	60 %	20 %	0 %	397668742
38	NC_018141	TCCGG	2	10	46544	46553	0 %	20 %	40 %	40 %	397668743
39	NC_018141	TTTCT	2	10	46970	46979	0 %	80 %	0 %	20 %	397668743
40	NC_018141	CAAAT	2	10	49770	49779	60 %	20 %	0 %	20 %	397668745
41	NC_018141	CAATA	2	10	54782	54791	60 %	20 %	0 %	20 %	397668749
42	NC_018141	TTTCA	2	10	55676	55685	20 %	60 %	0 %	20 %	397668749
43	NC_018141	AAATT	2	10	56103	56112	60 %	40 %	0 %	0 %	397668749
44	NC_018141	GACAT	2	10	56580	56589	40 %	20 %	20 %	20 %	397668749
45	NC_018141	ATGGA	2	10	57428	57437	40 %	20 %	40 %	0 %	397668750
46	NC_018141	CTTGC	2	10	62705	62714	0 %	40 %	20 %	40 %	397668756
47	NC_018141	AACAA	2	10	62900	62909	80 %	0 %	0 %	20 %	397668756
48	NC_018141	TTTAA	2	10	64302	64311	40 %	60 %	0 %	0 %	397668757
49	NC_018141	CATTG	2	10	64412	64421	20 %	40 %	20 %	20 %	397668757
50	NC_018141	CATTT	2	10	67523	67532	20 %	60 %	0 %	20 %	397668761
51	NC_018141	AACAT	2	10	68314	68323	60 %	20 %	0 %	20 %	397668762
52	NC_018141	AGCAT	2	10	68713	68722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018141	GCAAT	2	10	70605	70614	40 %	20 %	20 %	20 %	397668764
54	NC_018141	CTACC	2	10	72341	72350	20 %	20 %	0 %	60 %	397668766
55	NC_018141	GGTAA	2	10	73126	73135	40 %	20 %	40 %	0 %	397668766
56	NC_018141	AATAC	2	10	73833	73842	60 %	20 %	0 %	20 %	397668767
57	NC_018141	AATCT	2	10	77098	77107	40 %	40 %	0 %	20 %	397668769
58	NC_018141	TGCCA	2	10	77874	77883	20 %	20 %	20 %	40 %	397668769
59	NC_018141	TCGCT	2	10	78206	78215	0 %	40 %	20 %	40 %	397668770
60	NC_018141	CCAAT	2	10	84774	84783	40 %	20 %	0 %	40 %	397668775
61	NC_018141	GGGTT	2	10	86289	86298	0 %	40 %	60 %	0 %	397668776
62	NC_018141	TCATT	2	10	86758	86767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018141	AAAGT	2	10	87511	87520	60 %	20 %	20 %	0 %	397668778
64	NC_018141	ACCTA	2	10	89237	89246	40 %	20 %	0 %	40 %	397668779
65	NC_018141	CTTCT	2	10	89448	89457	0 %	60 %	0 %	40 %	397668779
66	NC_018141	CCAAT	2	10	90990	90999	40 %	20 %	0 %	40 %	397668781
67	NC_018141	TGGTA	2	10	92034	92043	20 %	40 %	40 %	0 %	397668782
68	NC_018141	TCCTA	2	10	94166	94175	20 %	40 %	0 %	40 %	397668782
69	NC_018141	CAAAT	2	10	96184	96193	60 %	20 %	0 %	20 %	397668784
70	NC_018141	GTCAA	2	10	99400	99409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018141	TTACA	2	10	99410	99419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018141	ATTTT	2	10	99727	99736	20 %	80 %	0 %	0 %	397668788
73	NC_018141	TTAAT	2	10	101951	101960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018141	CAAGA	2	10	103031	103040	60 %	0 %	20 %	20 %	397668791
75	NC_018141	TTCAT	2	10	103253	103262	20 %	60 %	0 %	20 %	397668792
76	NC_018141	ATATA	3	15	103454	103468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018141	CGGTT	2	10	104748	104757	0 %	40 %	40 %	20 %	397668794
78	NC_018141	AGGCA	2	10	104976	104985	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018141	GATTT	2	10	106980	106989	20 %	60 %	20 %	0 %	397668797
80	NC_018141	ATTAT	2	10	109916	109925	40 %	60 %	0 %	0 %	397668801
81	NC_018141	TTTTC	2	10	115243	115252	0 %	80 %	0 %	20 %	397668808
82	NC_018141	TTGAA	2	10	115882	115891	40 %	40 %	20 %	0 %	397668808
83	NC_018141	CAATT	2	10	116107	116116	40 %	40 %	0 %	20 %	397668808
84	NC_018141	TCCAT	2	10	119682	119691	20 %	40 %	0 %	40 %	397668808
85	NC_018141	CAAAC	2	10	119963	119972	60 %	0 %	0 %	40 %	397668808
86	NC_018141	GCCGT	2	10	121156	121165	0 %	20 %	40 %	40 %	397668809
87	NC_018141	TGTTT	2	10	122199	122208	0 %	80 %	20 %	0 %	397668810
88	NC_018141	CCTAT	2	10	122286	122295	20 %	40 %	0 %	40 %	397668810
89	NC_018141	GCATG	2	10	126695	126704	20 %	20 %	40 %	20 %	397668812
90	NC_018141	CTGTA	2	10	128264	128273	20 %	40 %	20 %	20 %	397668814
91	NC_018141	CAGCC	2	10	128797	128806	20 %	0 %	20 %	60 %	397668815
92	NC_018141	TTGGA	2	10	129229	129238	20 %	40 %	40 %	0 %	397668815
93	NC_018141	AGTCC	2	10	129591	129600	20 %	20 %	20 %	40 %	397668815
94	NC_018141	ACATC	2	10	131347	131356	40 %	20 %	0 %	40 %	397668817
95	NC_018141	CAAAT	2	10	136171	136180	60 %	20 %	0 %	20 %	397668822
96	NC_018141	GTTGA	2	10	139785	139794	20 %	40 %	40 %	0 %	397668828
97	NC_018141	TGAAT	2	10	141022	141031	40 %	40 %	20 %	0 %	397668831
98	NC_018141	TCGAA	2	10	141055	141064	40 %	20 %	20 %	20 %	397668831
99	NC_018141	GAGTT	2	10	141778	141787	20 %	40 %	40 %	0 %	397668833
100	NC_018141	GTTTT	2	10	142002	142011	0 %	80 %	20 %	0 %	397668833
101	NC_018141	CCTAT	2	10	144002	144011	20 %	40 %	0 %	40 %	397668835
102	NC_018141	ATATT	2	10	147074	147083	40 %	60 %	0 %	0 %	397668837
103	NC_018141	AATTC	2	10	148500	148509	40 %	40 %	0 %	20 %	397668838
104	NC_018141	CAAAA	2	10	149303	149312	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.