MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Lorraine plasmid pLELO

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018141	GTT	2	6	4522	4527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018141	ATC	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018141	ATT	2	6	4684	4689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018141	TAA	2	6	4690	4695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018141	TAG	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018141	ACA	2	6	6350	6355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018141	TAA	2	6	6946	6951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018141	TTA	2	6	10180	10185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018141	TAT	2	6	10227	10232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018141	GGA	2	6	10266	10271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018141	TAC	2	6	11891	11896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018141	TGA	2	6	12476	12481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018141	TAA	2	6	14585	14590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018141	ACT	2	6	15499	15504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018141	TCT	2	6	20572	20577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018141	ATA	2	6	21993	21998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018141	ATC	2	6	22113	22118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018141	GAA	2	6	25849	25854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018141	ATA	2	6	25902	25907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018141	ATT	2	6	25969	25974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018141	CAT	2	6	25976	25981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018141	CAT	2	6	28908	28913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018141	CTG	2	6	29611	29616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018141	AGT	2	6	29629	29634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018141	TAA	2	6	29657	29662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018141	GCT	2	6	29663	29668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018141	TAT	2	6	29669	29674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018141	ATT	2	6	29676	29681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018141	AAT	2	6	30824	30829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018141	GTG	2	6	31122	31127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018141	AAT	2	6	31150	31155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018141	ACA	2	6	31173	31178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018141	GAA	2	6	31297	31302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018141	CAG	2	6	31313	31318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018141	CCA	2	6	31346	31351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018141	TAT	2	6	31366	31371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018141	AAG	2	6	31383	31388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018141	TAT	2	6	32124	32129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018141	ATA	2	6	35606	35611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018141	TGG	2	6	35802	35807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018141	TAA	2	6	38079	38084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018141	CAA	2	6	40329	40334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018141	GGT	2	6	40415	40420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018141	TAT	2	6	41158	41163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018141	ATC	2	6	41216	41221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018141	TAG	2	6	41550	41555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018141	TCA	2	6	41660	41665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018141	ATT	2	6	41771	41776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018141	ATT	2	6	41809	41814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018141	TAA	2	6	41842	41847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018141	GAA	2	6	42546	42551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018141	AAG	2	6	42726	42731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018141	AAT	2	6	42749	42754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018141	TAG	2	6	42797	42802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018141	ACC	2	6	43324	43329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018141	GTA	2	6	43448	43453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018141	ATT	2	6	43538	43543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018141	ATA	2	6	43592	43597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018141	TCA	2	6	43760	43765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018141	AGA	2	6	46224	46229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018141	ATG	2	6	46267	46272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018141	TAT	2	6	46311	46316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018141	AAC	2	6	50859	50864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018141	CAT	2	6	50870	50875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018141	CTG	2	6	50908	50913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018141	CTA	2	6	53306	53311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018141	TAG	2	6	53318	53323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018141	TAC	2	6	53325	53330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018141	TAG	2	6	53339	53344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018141	TTG	2	6	53374	53379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018141	TGG	2	6	53482	53487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018141	ATA	2	6	56637	56642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018141	AGA	2	6	56754	56759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018141	CCT	2	6	57781	57786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018141	CAA	2	6	65154	65159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018141	ATT	2	6	65246	65251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018141	GAA	2	6	65398	65403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018141	CTT	2	6	67367	67372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018141	ATA	2	6	67873	67878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018141	CTG	2	6	67950	67955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018141	TAA	2	6	67977	67982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018141	GTT	2	6	68669	68674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018141	AGG	2	6	68769	68774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018141	GGA	2	6	68835	68840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018141	ACA	2	6	68906	68911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018141	AAT	2	6	70149	70154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018141	AGG	2	6	70955	70960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018141	CAT	2	6	71394	71399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018141	ATG	2	6	71464	71469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018141	GAA	2	6	71526	71531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018141	TAA	2	6	73921	73926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018141	CAA	2	6	74652	74657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018141	TCT	2	6	78022	78027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018141	AAG	2	6	78033	78038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018141	TAA	2	6	81832	81837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018141	GTT	2	6	82222	82227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018141	TTA	2	6	82370	82375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018141	AGA	2	6	82388	82393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018141	ATT	2	6	82570	82575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018141	GCC	2	6	83849	83854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018141	GTT	2	6	86735	86740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018141	TAA	2	6	86897	86902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018141	GGA	2	6	88367	88372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018141	CAG	2	6	88417	88422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018141	TGC	2	6	88494	88499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018141	AAG	2	6	88527	88532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018141	TAA	2	6	88668	88673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018141	CTT	3	9	88758	88766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018141	ATG	2	6	88804	88809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018141	CAA	2	6	88913	88918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018141	ATT	2	6	89882	89887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018141	AAC	2	6	90825	90830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018141	ATT	2	6	90874	90879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018141	CTT	2	6	95957	95962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018141	TAC	2	6	96029	96034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018141	TTC	2	6	96072	96077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018141	ATT	2	6	96085	96090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018141	CAC	2	6	96116	96121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018141	CCG	2	6	96746	96751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018141	TAA	2	6	96840	96845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018141	AAG	2	6	96858	96863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018141	ATG	2	6	97474	97479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018141	TCA	2	6	97618	97623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018141	TGT	2	6	97728	97733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018141	TTC	2	6	97767	97772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018141	CTG	2	6	97773	97778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018141	TGT	2	6	97834	97839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018141	TTG	2	6	98221	98226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018141	ATG	2	6	98357	98362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018141	AAT	2	6	98402	98407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018141	ATT	2	6	98422	98427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018141	TAA	2	6	98502	98507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018141	TGA	2	6	98575	98580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018141	TTG	2	6	98596	98601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018141	GAA	2	6	98619	98624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018141	GAA	2	6	98774	98779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018141	GAG	2	6	98780	98785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018141	ATG	2	6	98787	98792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018141	ATC	2	6	99425	99430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018141	TTA	2	6	100137	100142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018141	AAG	2	6	100219	100224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018141	ATC	2	6	100238	100243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018141	ATT	3	9	100256	100264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018141	CTT	2	6	100287	100292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_018141	TTG	2	6	100715	100720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_018141	ATT	2	6	101923	101928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_018141	ATT	2	6	103509	103514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018141	GGT	2	6	103535	103540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_018141	TAA	2	6	110290	110295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018141	AAT	2	6	110321	110326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018141	AAC	2	6	110395	110400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_018141	TGA	2	6	111213	111218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018141	ATT	2	6	113447	113452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018141	ATT	2	6	113463	113468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018141	ATA	2	6	113931	113936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.