MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Lorraine plasmid pLELO

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018141	AT	3	6	375	380	50 %	50 %	0 %	0 %	397668687
2	NC_018141	GA	3	6	1051	1056	50 %	0 %	50 %	0 %	397668688
3	NC_018141	AT	3	6	1616	1621	50 %	50 %	0 %	0 %	397668688
4	NC_018141	TA	3	6	2846	2851	50 %	50 %	0 %	0 %	397668690
5	NC_018141	GC	3	6	3867	3872	0 %	0 %	50 %	50 %	397668691
6	NC_018141	GA	3	6	5613	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	397668693
7	NC_018141	TG	3	6	8864	8869	0 %	50 %	50 %	0 %	397668698
8	NC_018141	CT	3	6	9359	9364	0 %	50 %	0 %	50 %	397668698
9	NC_018141	CG	3	6	10743	10748	0 %	0 %	50 %	50 %	397668701
10	NC_018141	AG	3	6	11199	11204	50 %	0 %	50 %	0 %	397668701
11	NC_018141	CT	3	6	11621	11626	0 %	50 %	0 %	50 %	397668702
12	NC_018141	AT	3	6	13362	13367	50 %	50 %	0 %	0 %	397668706
13	NC_018141	TG	3	6	13956	13961	0 %	50 %	50 %	0 %	397668706
14	NC_018141	TC	3	6	15572	15577	0 %	50 %	0 %	50 %	397668708
15	NC_018141	AG	3	6	15744	15749	50 %	0 %	50 %	0 %	397668708
16	NC_018141	GA	3	6	16433	16438	50 %	0 %	50 %	0 %	397668709
17	NC_018141	CT	3	6	17334	17339	0 %	50 %	0 %	50 %	397668711
18	NC_018141	GT	3	6	18722	18727	0 %	50 %	50 %	0 %	397668712
19	NC_018141	AT	3	6	19036	19041	50 %	50 %	0 %	0 %	397668712
20	NC_018141	GT	3	6	19733	19738	0 %	50 %	50 %	0 %	397668713
21	NC_018141	CT	3	6	20652	20657	0 %	50 %	0 %	50 %	397668715
22	NC_018141	CA	3	6	21412	21417	50 %	0 %	0 %	50 %	397668715
23	NC_018141	AT	3	6	21747	21752	50 %	50 %	0 %	0 %	397668715
24	NC_018141	CT	3	6	22176	22181	0 %	50 %	0 %	50 %	397668716
25	NC_018141	CT	3	6	23825	23830	0 %	50 %	0 %	50 %	397668718
26	NC_018141	AC	3	6	24235	24240	50 %	0 %	0 %	50 %	397668718
27	NC_018141	TG	3	6	24758	24763	0 %	50 %	50 %	0 %	397668719
28	NC_018141	TG	3	6	26141	26146	0 %	50 %	50 %	0 %	397668720
29	NC_018141	AT	3	6	26197	26202	50 %	50 %	0 %	0 %	397668720
30	NC_018141	TA	3	6	26422	26427	50 %	50 %	0 %	0 %	397668720
31	NC_018141	GT	3	6	28167	28172	0 %	50 %	50 %	0 %	397668723
32	NC_018141	GC	3	6	29459	29464	0 %	0 %	50 %	50 %	397668725
33	NC_018141	CG	3	6	31500	31505	0 %	0 %	50 %	50 %	397668728
34	NC_018141	CT	3	6	31730	31735	0 %	50 %	0 %	50 %	397668728
35	NC_018141	AC	3	6	31943	31948	50 %	0 %	0 %	50 %	397668728
36	NC_018141	AT	3	6	35332	35337	50 %	50 %	0 %	0 %	397668730
37	NC_018141	TA	3	6	35548	35553	50 %	50 %	0 %	0 %	397668730
38	NC_018141	AT	4	8	35844	35851	50 %	50 %	0 %	0 %	397668731
39	NC_018141	TA	3	6	37000	37005	50 %	50 %	0 %	0 %	397668732
40	NC_018141	TC	3	6	37177	37182	0 %	50 %	0 %	50 %	397668732
41	NC_018141	TG	3	6	37524	37529	0 %	50 %	50 %	0 %	397668732
42	NC_018141	GA	3	6	39407	39412	50 %	0 %	50 %	0 %	397668734
43	NC_018141	GA	3	6	39765	39770	50 %	0 %	50 %	0 %	397668734
44	NC_018141	AT	3	6	39784	39789	50 %	50 %	0 %	0 %	397668734
45	NC_018141	AT	3	6	42306	42311	50 %	50 %	0 %	0 %	397668738
46	NC_018141	GA	3	6	42972	42977	50 %	0 %	50 %	0 %	397668739
47	NC_018141	CT	3	6	43895	43900	0 %	50 %	0 %	50 %	397668740
48	NC_018141	GA	3	6	45767	45772	50 %	0 %	50 %	0 %	397668742
49	NC_018141	AG	4	8	47852	47859	50 %	0 %	50 %	0 %	397668744
50	NC_018141	GT	3	6	48086	48091	0 %	50 %	50 %	0 %	397668744
51	NC_018141	AT	3	6	48286	48291	50 %	50 %	0 %	0 %	397668744
52	NC_018141	CT	3	6	49653	49658	0 %	50 %	0 %	50 %	397668745
53	NC_018141	AT	3	6	50308	50313	50 %	50 %	0 %	0 %	397668746
54	NC_018141	GT	3	6	50654	50659	0 %	50 %	50 %	0 %	397668746
55	NC_018141	CA	3	6	52716	52721	50 %	0 %	0 %	50 %	397668747
56	NC_018141	GT	3	6	56398	56403	0 %	50 %	50 %	0 %	397668749
57	NC_018141	TA	3	6	57395	57400	50 %	50 %	0 %	0 %	397668750
58	NC_018141	AG	3	6	57561	57566	50 %	0 %	50 %	0 %	397668750
59	NC_018141	TA	3	6	57942	57947	50 %	50 %	0 %	0 %	397668751
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61	NC_018141	TC	3	6	60130	60135	0 %	50 %	0 %	50 %	397668754
62	NC_018141	TC	4	8	61069	61076	0 %	50 %	0 %	50 %	397668755
63	NC_018141	TG	3	6	61967	61972	0 %	50 %	50 %	0 %	397668756
64	NC_018141	CT	3	6	62408	62413	0 %	50 %	0 %	50 %	397668756
65	NC_018141	TG	3	6	63272	63277	0 %	50 %	50 %	0 %	397668756
66	NC_018141	TC	3	6	64512	64517	0 %	50 %	0 %	50 %	397668757
67	NC_018141	CT	3	6	68054	68059	0 %	50 %	0 %	50 %	397668762
68	NC_018141	TC	3	6	69370	69375	0 %	50 %	0 %	50 %	397668763
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70	NC_018141	CT	3	6	73350	73355	0 %	50 %	0 %	50 %	397668766
71	NC_018141	CT	3	6	73497	73502	0 %	50 %	0 %	50 %	397668767
72	NC_018141	TC	3	6	74694	74699	0 %	50 %	0 %	50 %	397668769
73	NC_018141	TA	3	6	75022	75027	50 %	50 %	0 %	0 %	397668769
74	NC_018141	AT	4	8	76320	76327	50 %	50 %	0 %	0 %	397668769
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77	NC_018141	TG	3	6	81470	81475	0 %	50 %	50 %	0 %	397668772
78	NC_018141	CT	3	6	81498	81503	0 %	50 %	0 %	50 %	397668772
79	NC_018141	GT	3	6	82054	82059	0 %	50 %	50 %	0 %	397668773
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81	NC_018141	CA	3	6	85093	85098	50 %	0 %	0 %	50 %	397668775
82	NC_018141	GA	3	6	85753	85758	50 %	0 %	50 %	0 %	397668776
83	NC_018141	GA	3	6	86604	86609	50 %	0 %	50 %	0 %	397668777
84	NC_018141	GT	3	6	87584	87589	0 %	50 %	50 %	0 %	397668778
85	NC_018141	AG	4	8	87614	87621	50 %	0 %	50 %	0 %	397668778
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88	NC_018141	TC	3	6	89770	89775	0 %	50 %	0 %	50 %	397668779
89	NC_018141	AT	3	6	93304	93309	50 %	50 %	0 %	0 %	397668782
90	NC_018141	TA	3	6	95014	95019	50 %	50 %	0 %	0 %	397668783
91	NC_018141	CT	3	6	95475	95480	0 %	50 %	0 %	50 %	397668783
92	NC_018141	TA	3	6	97005	97010	50 %	50 %	0 %	0 %	397668785
93	NC_018141	TA	3	6	98091	98096	50 %	50 %	0 %	0 %	397668786
94	NC_018141	CT	3	6	98119	98124	0 %	50 %	0 %	50 %	397668786
95	NC_018141	AT	3	6	99061	99066	50 %	50 %	0 %	0 %	397668787
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102	NC_018141	TA	3	6	106527	106532	50 %	50 %	0 %	0 %	397668797
103	NC_018141	TA	4	8	107912	107919	50 %	50 %	0 %	0 %	397668797
104	NC_018141	TA	3	6	108039	108044	50 %	50 %	0 %	0 %	397668797
105	NC_018141	AC	3	6	108757	108762	50 %	0 %	0 %	50 %	397668799
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107	NC_018141	AC	3	6	110139	110144	50 %	0 %	0 %	50 %	397668801
108	NC_018141	TG	3	6	110170	110175	0 %	50 %	50 %	0 %	397668801
109	NC_018141	CA	3	6	110454	110459	50 %	0 %	0 %	50 %	397668802
110	NC_018141	TG	3	6	110727	110732	0 %	50 %	50 %	0 %	397668802
111	NC_018141	AC	3	6	113732	113737	50 %	0 %	0 %	50 %	397668807
112	NC_018141	AT	3	6	113879	113884	50 %	50 %	0 %	0 %	397668807
113	NC_018141	AT	3	6	114418	114423	50 %	50 %	0 %	0 %	397668808
114	NC_018141	AT	3	6	114600	114605	50 %	50 %	0 %	0 %	397668808
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118	NC_018141	GT	3	6	119032	119037	0 %	50 %	50 %	0 %	397668808
119	NC_018141	CA	3	6	126575	126580	50 %	0 %	0 %	50 %	397668812
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122	NC_018141	CT	3	6	130580	130585	0 %	50 %	0 %	50 %	397668816
123	NC_018141	GC	3	6	132960	132965	0 %	0 %	50 %	50 %	397668820
124	NC_018141	GC	3	6	133490	133495	0 %	0 %	50 %	50 %	397668820
125	NC_018141	TC	3	6	133684	133689	0 %	50 %	0 %	50 %	397668820
126	NC_018141	CA	3	6	133765	133770	50 %	0 %	0 %	50 %	397668820
127	NC_018141	TA	3	6	134649	134654	50 %	50 %	0 %	0 %	397668820
128	NC_018141	TC	3	6	134935	134940	0 %	50 %	0 %	50 %	397668820
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133	NC_018141	AC	3	6	137665	137670	50 %	0 %	0 %	50 %	397668823
134	NC_018141	AC	3	6	138219	138224	50 %	0 %	0 %	50 %	397668824
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138	NC_018141	GT	3	6	142220	142225	0 %	50 %	50 %	0 %	397668833
139	NC_018141	CT	3	6	143300	143305	0 %	50 %	0 %	50 %	397668834
140	NC_018141	TA	3	6	143604	143609	50 %	50 %	0 %	0 %	397668835
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.