MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018140	AATGCA	2	12	4543	4554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018140	TCGAAT	2	12	11393	11404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018140	GTTTAT	2	12	31991	32002	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018140	TTTTTA	2	12	64767	64778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018140	TTAATA	2	12	139650	139661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018140	TTTTAT	2	12	181232	181243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018140	TGGACT	2	12	215716	215727	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018140	TCAACA	2	12	216365	216376	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018140	TAAATA	2	12	222044	222055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018140	AAGTCC	2	12	225976	225987	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018140	ATTTCA	2	12	246430	246441	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018140	TAAAAA	2	12	258010	258021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018140	TTATTT	2	12	260109	260120	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018140	TAAAAA	2	12	275734	275745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018140	TATTTT	2	12	276429	276440	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018140	TAGAAA	2	12	321523	321534	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018140	TAAAAT	2	12	343203	343214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018140	GCCTTG	2	12	360392	360403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018140	CATTTG	2	12	368813	368824	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018140	TGAAAT	2	12	417932	417943	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018140	AATTTA	2	12	421921	421932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018140	ATTTAA	2	12	421947	421958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018140	TAAATC	2	12	467437	467448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018140	CACTAA	2	12	495277	495288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018140	TTATTT	2	12	531112	531123	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018140	CTTGGT	2	12	565600	565611	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018140	GATTAA	2	12	566769	566780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018140	TTAAAT	2	12	567895	567906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018140	AATTTA	2	12	573305	573316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018140	TAAAAT	2	12	582169	582180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018140	AATTCT	2	12	617134	617145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018140	AATCAA	2	12	640653	640664	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018140	TTTAAA	2	12	645851	645862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018140	TGAAAT	2	12	662185	662196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018140	AAGATT	2	12	663633	663644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018140	TAAAAT	2	12	672275	672286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018140	ATTTAT	2	12	675322	675333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018140	GCAATT	2	12	721769	721780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018140	AAAAGG	2	12	724418	724429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018140	AAATGG	2	12	922391	922402	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018140	TTTTTA	2	12	960720	960731	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018140	TCCTGT	2	12	971480	971491	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018140	GCCTGA	2	12	971749	971760	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018140	AAAGAG	2	12	1042530	1042541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018140	TTTCGT	2	12	1059639	1059650	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018140	AAGTGC	2	12	1060880	1060891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018140	GAAATG	2	12	1061030	1061041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018140	TTAAAA	2	12	1114105	1114116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018140	ATTTTT	2	12	1124332	1124343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018140	ATTTTC	2	12	1134234	1134245	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018140	ATTTTA	2	12	1136043	1136054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018140	GTTCTT	2	12	1194065	1194076	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018140	ACCTGG	2	12	1210330	1210341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018140	CTTTAT	2	12	1222133	1222144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018140	TGTTTT	2	12	1268434	1268445	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018140	GATTTA	2	12	1273149	1273160	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018140	TTTTGG	2	12	1355879	1355890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018140	TTTTAT	2	12	1371383	1371394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018140	GACTTT	2	12	1393860	1393871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018140	GACACT	2	12	1436501	1436512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018140	AATGAT	2	12	1450372	1450383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018140	ATCATT	2	12	1451578	1451589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018140	TAATTG	2	12	1455254	1455265	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018140	AAATTG	2	12	1460972	1460983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018140	AAAATA	2	12	1463490	1463501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018140	TAAAAA	2	12	1492570	1492581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018140	TTAAAA	2	12	1496804	1496815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018140	TAAAAA	2	12	1500735	1500746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018140	TTTTTA	2	12	1504534	1504545	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018140	AATCAT	2	12	1526122	1526133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018140	CAAAAT	2	12	1568522	1568533	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018140	TTGATA	2	12	1589149	1589160	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018140	ATATCA	2	12	1609633	1609644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018140	TAATGC	2	12	1628497	1628508	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018140	GATATT	2	12	1650013	1650024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018140	AAAATT	2	12	1690268	1690279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018140	TATTTT	2	12	1748437	1748448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018140	CATAAT	2	12	1764063	1764074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018140	AAGGAT	2	12	1768551	1768562	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018140	TTTAAA	2	12	1862286	1862297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018140	AATTAA	2	12	1866507	1866518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018140	AAAAAT	2	12	1940141	1940152	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018140	AGACTT	2	12	1960113	1960124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018140	CTTAAA	2	12	1978196	1978207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018140	TCCAAA	2	12	2091730	2091741	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018140	AAAAAT	2	12	2136729	2136740	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018140	TCAAAA	2	12	2173593	2173604	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018140	CTTTTT	2	12	2178553	2178564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018140	ATTTAG	2	12	2182203	2182214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018140	ACTTTT	2	12	2202634	2202645	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018140	TTAAAT	2	12	2232409	2232420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018140	CTGTAT	2	12	2307550	2307561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018140	TTGCAT	2	12	2332707	2332718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018140	TGTAAT	2	12	2356711	2356722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018140	TAAATA	2	12	2439780	2439791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018140	AATCCA	2	12	2441121	2441132	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018140	ATTAAT	2	12	2451366	2451377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018140	ATTCTG	2	12	2455986	2455997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018140	AATTTA	2	12	2464017	2464028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018140	AGATGA	2	12	2481766	2481777	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018140	ACTTTG	2	12	2487009	2487020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018140	AGAATA	2	12	2495814	2495825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018140	CCAAGG	2	12	2558402	2558413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018140	TCAAGG	2	12	2575165	2575176	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018140	CATTTT	2	12	2576675	2576686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018140	TCTTTT	2	12	2583585	2583596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018140	TCAAAG	2	12	2604151	2604162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018140	ATTTTT	2	12	2607950	2607961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018140	AAATGA	2	12	2630745	2630756	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018140	AAAAAT	2	12	2737376	2737387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018140	CTCTTT	2	12	2745106	2745117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018140	GAATCA	2	12	2745542	2745553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018140	CAAAGC	2	12	2823974	2823985	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018140	TTAGTC	2	12	2833411	2833422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018140	TTAATG	2	12	2837997	2838008	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018140	TGAATT	2	12	2945935	2945946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018140	GACAGG	2	12	2947614	2947625	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018140	TAAAAC	2	12	2949341	2949352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018140	AGAAAC	2	12	2986825	2986836	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018140	GAATAA	2	12	3049815	3049826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018140	AAATGA	2	12	3077959	3077970	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018140	TATTTG	2	12	3084130	3084141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018140	ATCAAG	2	12	3111678	3111689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018140	AAAATC	2	12	3134921	3134932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018140	TTCTGA	2	12	3143746	3143757	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018140	ATAAAA	2	12	3151019	3151030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018140	AATTAT	2	12	3156274	3156285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018140	ATACTA	2	12	3163823	3163834	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018140	TCCTTA	2	12	3172709	3172720	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018140	ATTTCA	2	12	3186234	3186245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018140	TTATTT	2	12	3229112	3229123	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018140	TCATTT	2	12	3264077	3264088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_018140	CAAGGT	2	12	3281591	3281602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_018140	TGAGCC	2	12	3307420	3307431	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018140	TTAGGT	2	12	3308507	3308518	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018140	CAAGGT	2	12	3351220	3351231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_018140	AATTAT	2	12	3369477	3369488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018140	TTTTCT	2	12	3374553	3374564	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_018140	ATTATA	2	12	3379325	3379336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018140	TATTTT	2	12	3384767	3384778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018140	TTTAAA	2	12	3386919	3386930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018140	AACAAA	2	12	3392815	3392826	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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144	NC_018140	TAAAAA	2	12	3412508	3412519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_018140	AAATCA	2	12	3492524	3492535	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.