MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila

Total Repeats: 976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018140	AATGGC	2	12	2118	2129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397665628
2	NC_018140	TGATAG	2	12	4122	4133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665630
3	NC_018140	TCCTTG	2	12	7900	7911	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397665632
4	NC_018140	TATTCA	2	12	8588	8599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397665632
5	NC_018140	CAATAA	2	12	9982	9993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397665633
6	NC_018140	AAGGCA	2	12	18033	18044	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397665641
7	NC_018140	TTTATG	2	12	28020	28031	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665651
8	NC_018140	TTATTT	2	12	32621	32632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397665655
9	NC_018140	TTTTGA	2	12	47756	47767	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665668
10	NC_018140	TAGATT	2	12	53270	53281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397665672
11	NC_018140	TTGTGC	2	12	54410	54421	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397665673
12	NC_018140	CTTAGT	2	12	56660	56671	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397665676
13	NC_018140	ATGGAT	2	12	56868	56879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665677
14	NC_018140	TTGGAG	2	12	57883	57894	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397665677
15	NC_018140	CTCCTG	2	12	60996	61007	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397665680
16	NC_018140	TCACTG	2	12	61865	61876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397665682
17	NC_018140	GGGTAT	2	12	63684	63695	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397665684
18	NC_018140	TGCAGC	2	12	67333	67344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397665690
19	NC_018140	CCATAA	2	12	73368	73379	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	397665695
20	NC_018140	AAAAAG	2	12	75033	75044	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397665697
21	NC_018140	ATGAGT	2	12	76697	76708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665698
22	NC_018140	TAAAAA	2	12	77341	77352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397665699
23	NC_018140	GATTGA	2	12	80627	80638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665702
24	NC_018140	AAAAGT	2	12	82258	82269	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397665703
25	NC_018140	ATGCTC	2	12	83379	83390	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397665703
26	NC_018140	TTTTGA	2	12	87897	87908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665707
27	NC_018140	CGATGA	2	12	87927	87938	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397665707
28	NC_018140	TAATGA	2	12	98434	98445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397665717
29	NC_018140	AAACCA	2	12	100035	100046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397665717
30	NC_018140	GGATTT	2	12	102818	102829	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397665721
31	NC_018140	ATCCCG	2	12	108467	108478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397665723
32	NC_018140	TTGCAA	2	12	112130	112141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397665726
33	NC_018140	CAAATC	2	12	118226	118237	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	397665731
34	NC_018140	GTTTCT	2	12	121359	121370	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397665734
35	NC_018140	TTGCTT	2	12	121558	121569	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397665734
36	NC_018140	TAAGAA	2	12	125738	125749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397665738
37	NC_018140	AGGAAA	2	12	128166	128177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397665741
38	NC_018140	ATGACT	2	12	129233	129244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397665741
39	NC_018140	AGTTTT	2	12	129940	129951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665742
40	NC_018140	CATTTC	2	12	139106	139117	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397665747
41	NC_018140	TTTAAT	2	12	144084	144095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397665752
42	NC_018140	GGTTAT	2	12	147107	147118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397665756
43	NC_018140	AAAAAT	2	12	149820	149831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397665757
44	NC_018140	CAGTTT	2	12	151686	151697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397665758
45	NC_018140	ATAAAT	2	12	161792	161803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397665767
46	NC_018140	ATTTTT	2	12	162173	162184	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397665767
47	NC_018140	CTCTTT	2	12	166619	166630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397665767
48	NC_018140	AGTATA	2	12	172600	172611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397665771
49	NC_018140	TTTTAA	2	12	173944	173955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397665772
50	NC_018140	GCCATG	2	12	176352	176363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397665773
51	NC_018140	AATTGC	2	12	179036	179047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397665774
52	NC_018140	TTATTG	2	12	179542	179553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665774
53	NC_018140	ATATTG	2	12	182623	182634	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397665779
54	NC_018140	TATTTG	2	12	185232	185243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665781
55	NC_018140	ACCCAA	2	12	193229	193240	50 %	0 %	0 %	50 %	397665789
56	NC_018140	ATTTAA	2	12	195450	195461	50 %	50 %	0 %	0 %	397665792
57	NC_018140	GAATCA	2	12	196277	196288	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397665793
58	NC_018140	GCATAA	2	12	196529	196540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397665793
59	NC_018140	TTAGAA	2	12	196898	196909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397665793
60	NC_018140	AACACA	2	12	198796	198807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397665794
61	NC_018140	TTGGGT	2	12	200262	200273	0 %	50 %	50 %	0 %	397665796
62	NC_018140	AAACGT	2	12	204797	204808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397665803
63	NC_018140	TTTTTA	2	12	206771	206782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397665806
64	NC_018140	ATAAAA	2	12	220418	220429	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397665820
65	NC_018140	TGTTCT	2	12	235089	235100	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397665836
66	NC_018140	AGGAAA	2	12	236658	236669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397665838
67	NC_018140	ATAAGG	2	12	240619	240630	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397665842
68	NC_018140	ATTAAT	2	12	246102	246113	50 %	50 %	0 %	0 %	397665849
69	NC_018140	TGACTT	2	12	248358	248369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397665852
70	NC_018140	TATCAT	2	12	251225	251236	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397665856
71	NC_018140	GGGGAT	2	12	255160	255171	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	397665859
72	NC_018140	CTTGGG	2	12	256473	256484	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397665860
73	NC_018140	GATTTT	2	12	258229	258240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665862
74	NC_018140	AGTTTG	2	12	264632	264643	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397665867
75	NC_018140	AACGTG	2	12	273040	273051	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397665875
76	NC_018140	AATTGA	2	12	273298	273309	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397665875
77	NC_018140	ATTGAT	2	12	273728	273739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397665875
78	NC_018140	TTATAC	2	12	279142	279153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397665879
79	NC_018140	CCCTTG	2	12	281519	281530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397665881
80	NC_018140	AGAACA	2	12	283731	283742	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397665884
81	NC_018140	ATTCAA	2	12	291587	291598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397665889
82	NC_018140	ATTTTT	2	12	295330	295341	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397665892
83	NC_018140	CTCCTA	2	12	295969	295980	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397665893
84	NC_018140	ATTTTC	2	12	301081	301092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397665900
85	NC_018140	TTTGAT	2	12	303427	303438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665901
86	NC_018140	ACATGT	2	12	303555	303566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397665902
87	NC_018140	ATTGGG	2	12	306775	306786	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397665904
88	NC_018140	AAAATT	2	12	309084	309095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397665906
89	NC_018140	TGTCAT	2	12	311472	311483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397665908
90	NC_018140	AAAAGC	2	12	312367	312378	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397665908
91	NC_018140	TGCCCA	2	12	318642	318653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397665911
92	NC_018140	CACTTC	2	12	318761	318772	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397665911
93	NC_018140	TTTAGT	2	12	318920	318931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397665911
94	NC_018140	CACTTT	2	12	322976	322987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397665914
95	NC_018140	TCTTTA	2	12	345982	345993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397665931
96	NC_018140	TCCTGT	2	12	347524	347535	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397665932
97	NC_018140	ATTTAA	2	12	351842	351853	50 %	50 %	0 %	0 %	397665937
98	NC_018140	TTTTTC	2	12	352017	352028	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397665938
99	NC_018140	GATACC	2	12	353728	353739	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397665939
100	NC_018140	TCAGTG	2	12	357247	357258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397665941
101	NC_018140	ATCAAT	2	12	370552	370563	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397665957
102	NC_018140	GAAAAA	2	12	375657	375668	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397665962
103	NC_018140	ATGGAT	2	12	380584	380595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665963
104	NC_018140	AATTCC	2	12	383135	383146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397665965
105	NC_018140	TCATAA	2	12	383928	383939	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397665965
106	NC_018140	TAAGCT	2	12	391518	391529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397665971
107	NC_018140	GCAAAA	2	12	393103	393114	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397665972
108	NC_018140	CTTTGC	2	12	394925	394936	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397665974
109	NC_018140	CAAGCT	2	12	401973	401984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397665981
110	NC_018140	CAAAAT	2	12	406215	406226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397665984
111	NC_018140	ATTTTA	2	12	407323	407334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397665985
112	NC_018140	CAGTTC	2	12	413663	413674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397665990
113	NC_018140	CATTTG	2	12	416062	416073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397665993
114	NC_018140	TTTGCG	2	12	421179	421190	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397665996
115	NC_018140	TTGAAG	2	12	422454	422465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665998
116	NC_018140	AAAATT	2	12	430223	430234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397666003
117	NC_018140	GTGCCG	2	12	433519	433530	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397666005
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345	NC_018140	GACGAT	2	12	1165028	1165039	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397666696
346	NC_018140	ATGGCA	2	12	1165444	1165455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397666696
347	NC_018140	CCAATG	2	12	1166443	1166454	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397666697
348	NC_018140	GTCAAA	2	12	1168209	1168220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397666697
349	NC_018140	ATTACG	2	12	1168948	1168959	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397666698
350	NC_018140	TCCATG	2	12	1171568	1171579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397666699
351	NC_018140	CCTCTT	2	12	1177526	1177537	0 %	50 %	0 %	50 %	397666705
352	NC_018140	TAAGGT	2	12	1178454	1178465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397666706
353	NC_018140	GCGATT	2	12	1180087	1180098	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397666707
354	NC_018140	GCTTTA	2	12	1180615	1180626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397666707
355	NC_018140	GCAATA	2	12	1187491	1187502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397666713
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370	NC_018140	GCTGAT	2	12	1250068	1250079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397666769
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373	NC_018140	CAAGAT	2	12	1263587	1263598	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397666781
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449	NC_018140	TTTTTA	2	12	1537692	1537703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397667022
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451	NC_018140	GGTTCC	2	12	1545920	1545931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397667028
452	NC_018140	GGTACA	2	12	1547362	1547373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397667029
453	NC_018140	GCTCAA	2	12	1549757	1549768	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397667032
454	NC_018140	TGGCAT	2	12	1552618	1552629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397667034
455	NC_018140	TTTGAA	2	12	1554393	1554404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397667035
456	NC_018140	GGCAAA	2	12	1555051	1555062	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397667035
457	NC_018140	TAAAAC	2	12	1565481	1565492	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397667044
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459	NC_018140	CAATGG	2	12	1568330	1568341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397667045
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