MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018139	TCGAAT	2	12	10776	10787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018139	GTTTAT	2	12	31373	31384	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018139	TAATTG	2	12	47319	47330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018139	TTTTTA	2	12	62892	62903	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018139	TTATAT	2	12	69981	69992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018139	TTAATA	2	12	132123	132134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018139	TAAAAC	2	12	185899	185910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018139	AATACT	2	12	188657	188668	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018139	TCAACA	2	12	198983	198994	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018139	ATTTCA	2	12	209086	209097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018139	TTATTT	2	12	223736	223747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018139	TTTTTC	2	12	301884	301895	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018139	TAAAAT	2	12	309988	309999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018139	TCCATG	2	12	333752	333763	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018139	TGAAAT	2	12	387094	387105	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018139	AATTTA	2	12	391081	391092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018139	ATTTTA	2	12	435696	435707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018139	TAAATC	2	12	436107	436118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018139	TTATAT	2	12	497855	497866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018139	TTATTT	2	12	501441	501452	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018139	CTTGGT	2	12	535982	535993	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018139	GATTAA	2	12	537151	537162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018139	TTAAAT	2	12	538277	538288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018139	TAAAAT	2	12	553923	553934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018139	GAAATA	2	12	601520	601531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018139	AATCAA	2	12	612428	612439	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018139	TTTAAA	2	12	617627	617638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018139	TGAAAT	2	12	635295	635306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018139	TAAAAT	2	12	643704	643715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018139	GATAGC	2	12	746793	746804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018139	AAATGG	2	12	891419	891430	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018139	TTTTTA	2	12	929966	929977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018139	GCCTTG	2	12	940699	940710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018139	ACGTTT	2	12	952915	952926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018139	AAAGAG	2	12	1013177	1013188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018139	TTTCGT	2	12	1030297	1030308	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018139	AAGTGC	2	12	1031538	1031549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018139	GAAATG	2	12	1031689	1031700	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018139	TTAAAA	2	12	1084834	1084845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018139	ACAATA	2	12	1091667	1091678	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018139	ATTTTT	2	12	1096688	1096699	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018139	ATGCAT	2	12	1113204	1113215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018139	TTGCTA	2	12	1115796	1115807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018139	TGTTTT	2	12	1158728	1158739	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018139	GATTTA	2	12	1163444	1163455	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018139	TTTTGG	2	12	1252299	1252310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018139	TTTTAT	2	12	1267804	1267815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018139	GACTTT	2	12	1293574	1293585	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018139	AATGAT	2	12	1345644	1345655	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018139	ATCATT	2	12	1346850	1346861	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018139	AAATTG	2	12	1357299	1357310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018139	AAAATA	2	12	1359822	1359833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018139	TTAAAA	2	12	1389929	1389940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018139	TAAAAA	2	12	1393848	1393859	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018139	TTTTTA	2	12	1397647	1397658	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018139	CAGTAC	2	12	1416797	1416808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018139	AATCAT	2	12	1417937	1417948	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018139	CAAAAT	2	12	1462206	1462217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018139	TTGATA	2	12	1482832	1482843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018139	TAATGC	2	12	1520804	1520815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018139	CAATAA	2	12	1534886	1534897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018139	GATATT	2	12	1543834	1543845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018139	AAAATT	2	12	1583004	1583015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018139	TATTTT	2	12	1645971	1645982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018139	AAAAAT	2	12	1742107	1742118	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018139	ATTGAT	2	12	1761000	1761011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018139	AGACTT	2	12	1761087	1761098	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018139	AAAAAT	2	12	1932984	1932995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018139	TCAAAA	2	12	1976843	1976854	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018139	ACTTTT	2	12	2005865	2005876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018139	TATAAT	2	12	2029752	2029763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018139	TTAAAT	2	12	2040824	2040835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018139	TGATAA	2	12	2099524	2099535	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018139	CTGAAT	2	12	2130378	2130389	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018139	TTATAT	2	12	2133096	2133107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018139	TTGCAT	2	12	2134788	2134799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018139	AAATTA	2	12	2145309	2145320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018139	AATTAT	2	12	2162222	2162233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018139	TGTAAT	2	12	2164419	2164430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018139	TTAATT	2	12	2200071	2200082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018139	ATTCTG	2	12	2294375	2294386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018139	AATTTA	2	12	2302409	2302420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018139	ACTTTG	2	12	2329388	2329399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018139	ATTTTA	2	12	2405211	2405222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018139	TCAAGG	2	12	2416672	2416683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018139	TCAAAG	2	12	2438529	2438540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018139	AAATGA	2	12	2463831	2463842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018139	CGCTGG	2	12	2490700	2490711	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018139	TAAAAA	2	12	2502406	2502417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018139	CTTTTT	2	12	2536747	2536758	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018139	TTTATT	2	12	2637588	2637599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018139	TATTCC	2	12	2655925	2655936	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018139	TTTTTA	2	12	2669783	2669794	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018139	AAAGAA	2	12	2689660	2689671	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018139	ACATAA	2	12	2690444	2690455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018139	CAAAGC	2	12	2716916	2716927	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018139	TTAGTC	2	12	2729495	2729506	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018139	AAACTG	2	12	2733823	2733834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018139	CATAAA	2	12	2787765	2787776	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018139	TATATT	2	12	2802980	2802991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018139	TGAATT	2	12	2842604	2842615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018139	GACAGG	2	12	2844284	2844295	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018139	GAAAAA	2	12	2918659	2918670	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018139	TTTTTA	2	12	2943367	2943378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018139	ATTAAT	2	12	2951925	2951936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018139	GAATAA	2	12	3019961	3019972	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018139	TATTTG	2	12	3052678	3052689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018139	ATCAAG	2	12	3081176	3081187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018139	AAAATC	2	12	3105742	3105753	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018139	TTCTGA	2	12	3114568	3114579	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018139	ATAAAA	2	12	3121842	3121853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018139	ATACTA	2	12	3134788	3134799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018139	TCCTTA	2	12	3143672	3143683	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018139	ATTTCA	2	12	3157197	3157208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018139	TTATTT	2	12	3201114	3201125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018139	GCAATA	2	12	3219197	3219208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018139	TCATTT	2	12	3234756	3234767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018139	CAAGGT	2	12	3252351	3252362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018139	TGAGCC	2	12	3279182	3279193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018139	TTAGGT	2	12	3280257	3280268	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018139	CTTATT	2	12	3287808	3287819	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018139	CAAGGT	2	12	3323971	3323982	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018139	AATTAT	2	12	3343235	3343246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018139	TTTTCT	2	12	3348313	3348324	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018139	GACATG	2	12	3353242	3353253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018139	TATTTT	2	12	3359522	3359533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018139	TTTAAA	2	12	3360202	3360213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018139	TAAAAA	2	12	3386454	3386465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018139	TTCATT	2	12	3391395	3391406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_018139	TACTGA	2	12	3393226	3393237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018139	CTTATT	2	12	3428546	3428557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.