MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila

Total Repeats: 972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018139	AATGGC	2	12	1504	1515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397662557
2	NC_018139	TGATAG	2	12	3508	3519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397662559
3	NC_018139	TATTCA	2	12	7972	7983	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397662561
4	NC_018139	CAATAA	2	12	9366	9377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397662562
5	NC_018139	AAGGCA	2	12	17412	17423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397662570
6	NC_018139	TTTATG	2	12	27396	27407	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397662579
7	NC_018139	TTTTGC	2	12	29472	29483	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397662580
8	NC_018139	TTATTT	2	12	32003	32014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397662583
9	NC_018139	TTTCTT	2	12	42183	42194	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397662591
10	NC_018139	ATTTCA	2	12	46951	46962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397662597
11	NC_018139	TTTTGA	2	12	47872	47883	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397662598
12	NC_018139	CTTAGT	2	12	53009	53020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397662605
13	NC_018139	ATGGAT	2	12	53217	53228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397662606
14	NC_018139	TTGGAG	2	12	54232	54243	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397662606
15	NC_018139	ACTCCT	2	12	58581	58592	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397662612
16	NC_018139	CTCCTG	2	12	59122	59133	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397662612
17	NC_018139	TCACTG	2	12	59990	60001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397662613
18	NC_018139	GGGTAT	2	12	61809	61820	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397662615
19	NC_018139	TGCAGC	2	12	66395	66406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397662620
20	NC_018139	GCCATT	2	12	67858	67869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397662621
21	NC_018139	TATACT	2	12	67965	67976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397662621
22	NC_018139	GGATTG	2	12	73640	73651	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397662625
23	NC_018139	ATGCTC	2	12	76393	76404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397662626
24	NC_018139	TTTGAA	2	12	80917	80928	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397662630
25	NC_018139	CGATGA	2	12	80940	80951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397662630
26	NC_018139	TAATGA	2	12	91448	91459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397662640
27	NC_018139	AAACCA	2	12	93049	93060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397662640
28	NC_018139	GGATTT	2	12	95832	95843	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397662644
29	NC_018139	TCAGAA	2	12	96558	96569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397662644
30	NC_018139	ATCCCG	2	12	101481	101492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397662646
31	NC_018139	TTGCAA	2	12	105144	105155	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397662649
32	NC_018139	TCATTA	2	12	106096	106107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397662650
33	NC_018139	TACGAT	2	12	106157	106168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397662650
34	NC_018139	ATTTAA	2	12	110711	110722	50 %	50 %	0 %	0 %	397662653
35	NC_018139	CAAATC	2	12	110726	110737	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	397662653
36	NC_018139	TTGCTT	2	12	114058	114069	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397662656
37	NC_018139	TAAGAA	2	12	118216	118227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397662660
38	NC_018139	AGGAAA	2	12	120641	120652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397662663
39	NC_018139	ATGACT	2	12	121708	121719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397662663
40	NC_018139	AGTTTT	2	12	122415	122426	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397662664
41	NC_018139	CAACAG	2	12	129213	129224	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397662667
42	NC_018139	CATTTC	2	12	131579	131590	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397662669
43	NC_018139	TTTAAT	2	12	136556	136567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397662674
44	NC_018139	GGTTAT	2	12	139579	139590	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397662678
45	NC_018139	AAAAAT	2	12	142292	142303	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397662679
46	NC_018139	CAGTTT	2	12	144155	144166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397662680
47	NC_018139	AAGAAA	2	12	152909	152920	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397662688
48	NC_018139	ATAAAT	2	12	155270	155281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397662691
49	NC_018139	AGTATA	2	12	166079	166090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397662695
50	NC_018139	TTTTAA	2	12	167423	167434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397662696
51	NC_018139	GAAAAA	2	12	167464	167475	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397662696
52	NC_018139	GCCATG	2	12	169831	169842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397662697
53	NC_018139	GATTTT	2	12	171720	171731	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397662698
54	NC_018139	AATTAA	2	12	172195	172206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397662699
55	NC_018139	TCAAAT	2	12	178118	178129	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397662707
56	NC_018139	AATTGA	2	12	185062	185073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397662710
57	NC_018139	ACACTT	2	12	185312	185323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397662710
58	NC_018139	TGTTCT	2	12	197265	197276	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397662718
59	NC_018139	GTAATC	2	12	201608	201619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397662723
60	NC_018139	TGGTAC	2	12	202076	202087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397662723
61	NC_018139	ATAAGG	2	12	202796	202807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397662725
62	NC_018139	ATTAAT	2	12	208758	208769	50 %	50 %	0 %	0 %	397662731
63	NC_018139	TGACTT	2	12	211015	211026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397662734
64	NC_018139	TATCAT	2	12	213881	213892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397662738
65	NC_018139	GGGGAT	2	12	217816	217827	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	397662741
66	NC_018139	CTTGGG	2	12	219129	219140	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397662742
67	NC_018139	TAAAAA	2	12	220666	220677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397662744
68	NC_018139	GATTTT	2	12	220884	220895	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397662744
69	NC_018139	AAGAAA	2	12	229564	229575	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397662753
70	NC_018139	AGTTTG	2	12	231348	231359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397662755
71	NC_018139	AACGTG	2	12	238654	238665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397662761
72	NC_018139	AATTGA	2	12	238912	238923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397662761
73	NC_018139	ATTGAT	2	12	239342	239353	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397662761
74	NC_018139	TTATAC	2	12	244247	244258	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397662765
75	NC_018139	CCCTTG	2	12	246624	246635	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397662767
76	NC_018139	AGAACA	2	12	248836	248847	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397662770
77	NC_018139	ATTCAA	2	12	256692	256703	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397662775
78	NC_018139	ATTTTT	2	12	260435	260446	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	397662777
79	NC_018139	GGCTTG	2	12	260705	260716	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397662777
80	NC_018139	CTCCTA	2	12	261074	261085	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397662778
81	NC_018139	GCTCAC	2	12	265404	265415	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397662784
82	NC_018139	ACATGT	2	12	268659	268670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397662787
83	NC_018139	CCAAAA	2	12	269978	269989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397662787
84	NC_018139	ATTGGG	2	12	271879	271890	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397662789
85	NC_018139	AAAATT	2	12	274188	274199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397662791
86	NC_018139	TGTCAT	2	12	277587	277598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397662795
87	NC_018139	AAAAGC	2	12	278482	278493	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397662795
88	NC_018139	TGCCCA	2	12	284880	284891	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397662798
89	NC_018139	CACTTT	2	12	289214	289225	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397662801
90	NC_018139	GCGCGG	2	12	294776	294787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397662803
91	NC_018139	ATATAG	2	12	299388	299399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397662806
92	NC_018139	GTAATC	2	12	302725	302736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397662808
93	NC_018139	AGGGTC	2	12	308677	308688	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397662812
94	NC_018139	TCTTTA	2	12	313447	313458	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397662816
95	NC_018139	TCCTGT	2	12	314989	315000	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397662817
96	NC_018139	ATTTAA	2	12	319307	319318	50 %	50 %	0 %	0 %	397662822
97	NC_018139	TTTTTC	2	12	319482	319493	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397662823
98	NC_018139	GATACC	2	12	321193	321204	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397662824
99	NC_018139	ACAAAT	2	12	321366	321377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397662824
100	NC_018139	TCAGTG	2	12	324711	324722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397662826
101	NC_018139	TTTATC	2	12	335293	335304	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397662839
102	NC_018139	ATCAAT	2	12	338015	338026	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397662842
103	NC_018139	ATAAAA	2	12	339938	339949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397662843
104	NC_018139	GAAAAA	2	12	343124	343135	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397662847
105	NC_018139	TGGATG	2	12	348048	348059	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397662848
106	NC_018139	TGCCAT	2	12	350465	350476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397662850
107	NC_018139	AATTCC	2	12	350604	350615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397662850
108	NC_018139	TCATAA	2	12	351397	351408	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397662850
109	NC_018139	TTTAAT	2	12	356503	356514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397662854
110	NC_018139	TTTCTT	2	12	358687	358698	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397662856
111	NC_018139	TAAGCT	2	12	359994	360005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397662859
112	NC_018139	GCAAAA	2	12	361580	361591	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397662860
113	NC_018139	TCCGCC	2	12	365502	365513	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	397662864
114	NC_018139	TTAACT	2	12	366335	366346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397662865
115	NC_018139	CAAGCT	2	12	371136	371147	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397662869
116	NC_018139	CAAAAT	2	12	375378	375389	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397662872
117	NC_018139	ATTTTA	2	12	376486	376497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397662873
118	NC_018139	CAGTTC	2	12	382827	382838	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397662878
119	NC_018139	CATTTG	2	12	385224	385235	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397662881
120	NC_018139	TTGAAG	2	12	391589	391600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397662886
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123	NC_018139	AGCGTT	2	12	403923	403934	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397662894
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227	NC_018139	CAGTGC	2	12	716211	716222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397663213
228	NC_018139	TGCGGC	2	12	716382	716393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397663213
229	NC_018139	CAGTGC	2	12	716715	716726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397663213
230	NC_018139	ATTTGG	2	12	718211	718222	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397663213
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232	NC_018139	TAATGG	2	12	722466	722477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397663213
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340	NC_018139	AAGAAA	2	12	1090783	1090794	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397663528
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