MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Taylorella equigenitalis ATCC 35865 chromosome

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018108	GTATTT	2	12	40855	40866	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018108	TGATAA	2	12	50177	50188	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018108	TATAAA	2	12	113885	113896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018108	AGATAT	2	12	116852	116863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018108	AAACAT	2	12	126723	126734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018108	TATATT	2	12	131870	131881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018108	CAAGCA	2	12	133615	133626	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018108	GATGTT	2	12	142502	142513	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018108	AAAATG	2	12	162262	162273	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018108	AATTGT	2	12	174541	174552	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018108	TAGAGA	2	12	196523	196534	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018108	CAATTT	2	12	225411	225422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018108	GTAGGA	2	12	243468	243479	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018108	TTAGAT	2	12	284750	284761	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018108	GTTTAA	2	12	337888	337899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018108	GGGCAC	2	12	360354	360365	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018108	ACCATA	2	12	380005	380016	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018108	TTAGAT	2	12	420599	420610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018108	ATATTC	2	12	424837	424848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018108	CTGTTG	2	12	545573	545584	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018108	CAAAAT	2	12	562989	563000	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018108	TTTACC	2	12	681805	681816	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018108	TTTTAA	2	12	725573	725584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018108	AAACTT	2	12	725770	725781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018108	GAAATA	2	12	728841	728852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018108	GAAGGG	2	12	731301	731312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018108	ATTCAT	2	12	740685	740696	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018108	AAATGA	2	12	750715	750726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018108	AAATTG	2	12	797443	797454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018108	TATATT	2	12	816671	816682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018108	TTTAAA	2	12	823709	823720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018108	ATAAAA	2	12	861999	862010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018108	TCTATT	2	12	896732	896743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018108	TGATTT	2	12	1060932	1060943	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018108	GAGTCT	2	12	1060954	1060965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018108	AGTCAT	2	12	1061936	1061947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018108	TAGTCA	2	12	1069496	1069507	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018108	TTAAAT	2	12	1070104	1070115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018108	AGTCAT	2	12	1072559	1072570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018108	TTATAT	2	12	1072873	1072884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018108	ATTTTT	2	12	1073123	1073134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018108	ATCTTC	2	12	1163623	1163634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018108	CATCCC	2	12	1241951	1241962	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018108	AACCCT	2	12	1242001	1242012	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018108	TTGTTT	2	12	1242127	1242138	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018108	TTATAT	2	12	1242192	1242203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018108	TTATAA	2	12	1340847	1340858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018108	TGAAAA	2	12	1342505	1342516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018108	TTTAAG	2	12	1370120	1370131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018108	TTAGTT	2	12	1382727	1382738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018108	TCATCT	2	12	1385811	1385822	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018108	TTAAAT	2	12	1436224	1436235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018108	AAAATT	2	12	1503708	1503719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018108	TTTTAA	2	12	1510691	1510702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018108	AGTCAT	2	12	1536903	1536914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018108	AGTCAT	2	12	1537657	1537668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018108	TTCAAA	2	12	1539218	1539229	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018108	ATCCAG	2	12	1540027	1540038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018108	ATAAAA	2	12	1542101	1542112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018108	CAATTT	2	12	1563701	1563712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018108	TAAAAA	2	12	1571200	1571211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018108	ATTCTC	2	12	1614928	1614939	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018108	AATTTT	2	12	1656336	1656347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018108	TTTTGT	2	12	1684843	1684854	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018108	AAAATT	2	12	1690979	1690990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018108	GTAAAA	2	12	1709494	1709505	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018108	TATAAA	2	12	1722900	1722911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018108	TATCTA	2	12	1728756	1728767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.