MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Taylorella equigenitalis ATCC 35865 chromosome

Total Repeats: 1319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018108	TGGCA	2	10	498	507	20 %	20 %	40 %	20 %	397661014
2	NC_018108	TTGTA	2	10	920	929	20 %	60 %	20 %	0 %	397661014
3	NC_018108	GAAGA	2	10	1517	1526	60 %	0 %	40 %	0 %	397661014
4	NC_018108	TCAAA	2	10	2768	2777	60 %	20 %	0 %	20 %	397661016
5	NC_018108	ATGAG	2	10	3201	3210	40 %	20 %	40 %	0 %	397661016
6	NC_018108	CACTA	2	10	6911	6920	40 %	20 %	0 %	40 %	397661018
7	NC_018108	TTATC	2	10	8788	8797	20 %	60 %	0 %	20 %	397661020
8	NC_018108	TTAGA	2	10	10077	10086	40 %	40 %	20 %	0 %	397661022
9	NC_018108	TCAAA	2	10	11252	11261	60 %	20 %	0 %	20 %	397661022
10	NC_018108	AGAGG	2	10	13975	13984	40 %	0 %	60 %	0 %	397661024
11	NC_018108	CAAAA	2	10	15481	15490	80 %	0 %	0 %	20 %	397661026
12	NC_018108	TATGA	2	10	15701	15710	40 %	40 %	20 %	0 %	397661026
13	NC_018108	TGATT	2	10	18019	18028	20 %	60 %	20 %	0 %	397661027
14	NC_018108	CAAAA	2	10	18448	18457	80 %	0 %	0 %	20 %	397661027
15	NC_018108	GTTTT	2	10	21865	21874	0 %	80 %	20 %	0 %	397661030
16	NC_018108	TTTCT	2	10	21993	22002	0 %	80 %	0 %	20 %	397661030
17	NC_018108	AAGTG	2	10	22256	22265	40 %	20 %	40 %	0 %	397661030
18	NC_018108	TAATT	2	10	23733	23742	40 %	60 %	0 %	0 %	397661033
19	NC_018108	TTCTG	2	10	24905	24914	0 %	60 %	20 %	20 %	397661034
20	NC_018108	AGCCT	2	10	26338	26347	20 %	20 %	20 %	40 %	397661035
21	NC_018108	AATTG	2	10	27557	27566	40 %	40 %	20 %	0 %	397661037
22	NC_018108	CCTAG	2	10	31470	31479	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018108	ATCTG	2	10	32301	32310	20 %	40 %	20 %	20 %	397661041
24	NC_018108	GAAAG	2	10	33141	33150	60 %	0 %	40 %	0 %	397661042
25	NC_018108	AAACC	2	10	35013	35022	60 %	0 %	0 %	40 %	397661044
26	NC_018108	AAACA	2	10	35948	35957	80 %	0 %	0 %	20 %	397661045
27	NC_018108	GAAGT	2	10	37679	37688	40 %	20 %	40 %	0 %	397661046
28	NC_018108	CAGGT	2	10	39121	39130	20 %	20 %	40 %	20 %	397661047
29	NC_018108	AAGTA	2	10	39692	39701	60 %	20 %	20 %	0 %	397661049
30	NC_018108	AATGC	2	10	39944	39953	40 %	20 %	20 %	20 %	397661050
31	NC_018108	GCACC	2	10	42185	42194	20 %	0 %	20 %	60 %	397661052
32	NC_018108	GTATG	2	10	42901	42910	20 %	40 %	40 %	0 %	397661053
33	NC_018108	ATTTT	2	10	45255	45264	20 %	80 %	0 %	0 %	397661057
34	NC_018108	ACTGA	2	10	48795	48804	40 %	20 %	20 %	20 %	397661060
35	NC_018108	AAGAA	2	10	48908	48917	80 %	0 %	20 %	0 %	397661060
36	NC_018108	ATATG	2	10	49352	49361	40 %	40 %	20 %	0 %	397661060
37	NC_018108	CAAAG	2	10	49419	49428	60 %	0 %	20 %	20 %	397661060
38	NC_018108	TGGAT	2	10	49532	49541	20 %	40 %	40 %	0 %	397661060
39	NC_018108	GGGTA	2	10	50399	50408	20 %	20 %	60 %	0 %	397661062
40	NC_018108	TAATT	2	10	50582	50591	40 %	60 %	0 %	0 %	397661062
41	NC_018108	GGTTT	2	10	51988	51997	0 %	60 %	40 %	0 %	397661064
42	NC_018108	CTTTT	2	10	52824	52833	0 %	80 %	0 %	20 %	397661064
43	NC_018108	GGAAG	2	10	55322	55331	40 %	0 %	60 %	0 %	397661068
44	NC_018108	AAATT	2	10	58830	58839	60 %	40 %	0 %	0 %	397661072
45	NC_018108	TAATT	2	10	59145	59154	40 %	60 %	0 %	0 %	397661073
46	NC_018108	TTTGC	2	10	64444	64453	0 %	60 %	20 %	20 %	397661078
47	NC_018108	ATGTA	2	10	65775	65784	40 %	40 %	20 %	0 %	397661079
48	NC_018108	CTATC	2	10	68576	68585	20 %	40 %	0 %	40 %	397661081
49	NC_018108	TATGA	2	10	69270	69279	40 %	40 %	20 %	0 %	397661081
50	NC_018108	TTGGA	2	10	70359	70368	20 %	40 %	40 %	0 %	397661082
51	NC_018108	TTACT	2	10	73979	73988	20 %	60 %	0 %	20 %	397661085
52	NC_018108	AGTTA	2	10	75758	75767	40 %	40 %	20 %	0 %	397661087
53	NC_018108	TAATC	2	10	78838	78847	40 %	40 %	0 %	20 %	397661089
54	NC_018108	AATAA	2	10	79505	79514	80 %	20 %	0 %	0 %	397661090
55	NC_018108	AGTGT	2	10	84088	84097	20 %	40 %	40 %	0 %	397661093
56	NC_018108	GTATG	2	10	85067	85076	20 %	40 %	40 %	0 %	397661094
57	NC_018108	GCTAT	2	10	85970	85979	20 %	40 %	20 %	20 %	397661094
58	NC_018108	CCATA	2	10	86415	86424	40 %	20 %	0 %	40 %	397661094
59	NC_018108	TTTGG	2	10	87114	87123	0 %	60 %	40 %	0 %	397661094
60	NC_018108	GTTTT	2	10	88254	88263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018108	AAAGT	2	10	88836	88845	60 %	20 %	20 %	0 %	397661097
62	NC_018108	TAAAT	2	10	89344	89353	60 %	40 %	0 %	0 %	397661097
63	NC_018108	AATTT	2	10	89552	89561	40 %	60 %	0 %	0 %	397661097
64	NC_018108	GAGAT	2	10	90808	90817	40 %	20 %	40 %	0 %	397661098
65	NC_018108	CGATT	2	10	91246	91255	20 %	40 %	20 %	20 %	397661098
66	NC_018108	TACAC	2	10	92153	92162	40 %	20 %	0 %	40 %	397661099
67	NC_018108	AATTT	2	10	92876	92885	40 %	60 %	0 %	0 %	397661099
68	NC_018108	TCAAT	2	10	93445	93454	40 %	40 %	0 %	20 %	397661099
69	NC_018108	ATGGG	2	10	95738	95747	20 %	20 %	60 %	0 %	397661100
70	NC_018108	AGATG	2	10	100694	100703	40 %	20 %	40 %	0 %	397661104
71	NC_018108	AATCG	2	10	103020	103029	40 %	20 %	20 %	20 %	397661106
72	NC_018108	TCAAA	2	10	104427	104436	60 %	20 %	0 %	20 %	397661108
73	NC_018108	CAAAT	2	10	107521	107530	60 %	20 %	0 %	20 %	397661110
74	NC_018108	TTTGA	2	10	108952	108961	20 %	60 %	20 %	0 %	397661110
75	NC_018108	ATTAT	2	10	109444	109453	40 %	60 %	0 %	0 %	397661111
76	NC_018108	AATGA	2	10	109759	109768	60 %	20 %	20 %	0 %	397661111
77	NC_018108	TTTAT	2	10	110455	110464	20 %	80 %	0 %	0 %	397661112
78	NC_018108	ATTCT	2	10	111084	111093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018108	ATTTT	2	10	111231	111240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018108	GTTTG	2	10	111720	111729	0 %	60 %	40 %	0 %	397661113
81	NC_018108	AATAA	2	10	112903	112912	80 %	20 %	0 %	0 %	397661115
82	NC_018108	AATTA	2	10	114033	114042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018108	ATTTA	2	10	114881	114890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018108	ATTAC	2	10	115044	115053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018108	TTATT	2	10	116624	116633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018108	AATGA	2	10	116673	116682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018108	TTATT	2	10	117114	117123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018108	TTCCC	2	10	117274	117283	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_018108	AAATT	2	10	121273	121282	60 %	40 %	0 %	0 %	397661123
90	NC_018108	GATTG	2	10	121365	121374	20 %	40 %	40 %	0 %	397661123
91	NC_018108	AAGCT	2	10	121426	121435	40 %	20 %	20 %	20 %	397661123
92	NC_018108	CAATA	2	10	122043	122052	60 %	20 %	0 %	20 %	397661124
93	NC_018108	ACATT	2	10	123710	123719	40 %	40 %	0 %	20 %	397661124
94	NC_018108	ATTAA	2	10	123871	123880	60 %	40 %	0 %	0 %	397661124
95	NC_018108	TGGTA	2	10	124189	124198	20 %	40 %	40 %	0 %	397661124
96	NC_018108	TAAAT	2	10	124584	124593	60 %	40 %	0 %	0 %	397661125
97	NC_018108	GTTTA	2	10	124776	124785	20 %	60 %	20 %	0 %	397661125
98	NC_018108	AAGTT	2	10	124796	124805	40 %	40 %	20 %	0 %	397661125
99	NC_018108	AAATT	2	10	125919	125928	60 %	40 %	0 %	0 %	397661126
100	NC_018108	TACTT	2	10	126229	126238	20 %	60 %	0 %	20 %	397661127
101	NC_018108	TTAAT	2	10	130219	130228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018108	TGAAA	2	10	130932	130941	60 %	20 %	20 %	0 %	397661135
103	NC_018108	AATCA	2	10	131121	131130	60 %	20 %	0 %	20 %	397661136
104	NC_018108	GTAAT	2	10	131185	131194	40 %	40 %	20 %	0 %	397661136
105	NC_018108	TGAAT	2	10	133747	133756	40 %	40 %	20 %	0 %	397661139
106	NC_018108	TTATT	2	10	135559	135568	20 %	80 %	0 %	0 %	397661140
107	NC_018108	AATGA	2	10	135608	135617	60 %	20 %	20 %	0 %	397661140
108	NC_018108	TTTAT	2	10	136304	136313	20 %	80 %	0 %	0 %	397661141
109	NC_018108	ATTCA	2	10	137449	137458	40 %	40 %	0 %	20 %	397661142
110	NC_018108	AATTG	2	10	138291	138300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018108	GACAA	2	10	138915	138924	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018108	AACAA	2	10	139426	139435	80 %	0 %	0 %	20 %	397661145
113	NC_018108	TAGAT	2	10	139648	139657	40 %	40 %	20 %	0 %	397661145
114	NC_018108	CTTTT	2	10	140837	140846	0 %	80 %	0 %	20 %	397661148
115	NC_018108	ATTGT	2	10	144450	144459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018108	AGATG	2	10	146561	146570	40 %	20 %	40 %	0 %	397661157
117	NC_018108	TCGAT	2	10	146750	146759	20 %	40 %	20 %	20 %	397661157
118	NC_018108	GTGAT	2	10	148587	148596	20 %	40 %	40 %	0 %	397661158
119	NC_018108	TAAAT	2	10	150531	150540	60 %	40 %	0 %	0 %	397661160
120	NC_018108	GGTCA	2	10	150707	150716	20 %	20 %	40 %	20 %	397661160
121	NC_018108	TTTGA	2	10	151108	151117	20 %	60 %	20 %	0 %	397661160
122	NC_018108	TTAGA	2	10	154010	154019	40 %	40 %	20 %	0 %	397661163
123	NC_018108	ATTGG	2	10	155162	155171	20 %	40 %	40 %	0 %	397661164
124	NC_018108	GATTT	2	10	156360	156369	20 %	60 %	20 %	0 %	397661167
125	NC_018108	AAGCT	2	10	158235	158244	40 %	20 %	20 %	20 %	397661168
126	NC_018108	ATTGG	2	10	161228	161237	20 %	40 %	40 %	0 %	397661172
127	NC_018108	CTTTT	2	10	161238	161247	0 %	80 %	0 %	20 %	397661172
128	NC_018108	AAAAG	2	10	161966	161975	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018108	CTTCT	2	10	162420	162429	0 %	60 %	0 %	40 %	397661175
130	NC_018108	GTTAA	2	10	163280	163289	40 %	40 %	20 %	0 %	397661175
131	NC_018108	TGAAA	2	10	164227	164236	60 %	20 %	20 %	0 %	397661175
132	NC_018108	TCTCA	2	10	164798	164807	20 %	40 %	0 %	40 %	397661175
133	NC_018108	TTCTA	2	10	165266	165275	20 %	60 %	0 %	20 %	397661176
134	NC_018108	AGATG	2	10	166063	166072	40 %	20 %	40 %	0 %	397661177
135	NC_018108	GAATC	2	10	166954	166963	40 %	20 %	20 %	20 %	397661178
136	NC_018108	GAACA	2	10	171812	171821	60 %	0 %	20 %	20 %	397661182
137	NC_018108	GTTCG	2	10	173923	173932	0 %	40 %	40 %	20 %	397661186
138	NC_018108	ATCAA	2	10	175357	175366	60 %	20 %	0 %	20 %	397661187
139	NC_018108	CAAAA	2	10	176872	176881	80 %	0 %	0 %	20 %	397661187
140	NC_018108	GCTAA	2	10	179128	179137	40 %	20 %	20 %	20 %	397661187
141	NC_018108	CTGCA	2	10	180320	180329	20 %	20 %	20 %	40 %	397661188
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171	NC_018108	ATTCC	2	10	213332	213341	20 %	40 %	0 %	40 %	397661223
172	NC_018108	ACCTT	2	10	213448	213457	20 %	40 %	0 %	40 %	397661223
173	NC_018108	ACTGT	2	10	213479	213488	20 %	40 %	20 %	20 %	397661223
174	NC_018108	GCAAT	2	10	213795	213804	40 %	20 %	20 %	20 %	397661223
175	NC_018108	TTAAC	2	10	215217	215226	40 %	40 %	0 %	20 %	397661225
176	NC_018108	AGTCT	2	10	216192	216201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_018108	GGATT	2	10	216466	216475	20 %	40 %	40 %	0 %	397661226
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179	NC_018108	TACGT	2	10	216897	216906	20 %	40 %	20 %	20 %	397661226
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183	NC_018108	ATCTT	2	10	228017	228026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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202	NC_018108	ATGTA	2	10	243932	243941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_018108	AATTT	2	10	314027	314036	40 %	60 %	0 %	0 %	397661317
252	NC_018108	TTATC	2	10	315399	315408	20 %	60 %	0 %	20 %	397661319
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255	NC_018108	GACGT	2	10	316949	316958	20 %	20 %	40 %	20 %	397661322
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257	NC_018108	GCAAT	2	10	318265	318274	40 %	20 %	20 %	20 %	397661324
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