MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Taylorella equigenitalis ATCC 35865 chromosome

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018108	CCTAG	2	10	31470	31479	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_018108	GTTTT	2	10	88254	88263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018108	ATTCT	2	10	111084	111093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018108	ATTTT	2	10	111231	111240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018108	AATTA	2	10	114033	114042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018108	ATTTA	2	10	114881	114890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018108	ATTAC	2	10	115044	115053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018108	TTATT	2	10	116624	116633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018108	AATGA	2	10	116673	116682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018108	TTATT	2	10	117114	117123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018108	TTCCC	2	10	117274	117283	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_018108	TTAAT	2	10	130219	130228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018108	AATTG	2	10	138291	138300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018108	GACAA	2	10	138915	138924	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018108	ATTGT	2	10	144450	144459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018108	AAAAG	2	10	161966	161975	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018108	TTGAT	2	10	200004	200013	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018108	AGTCT	2	10	216192	216201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018108	ATCTT	2	10	228017	228026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018108	ATATT	2	10	234185	234194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018108	AAAAT	2	10	234261	234270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018108	TCGAT	2	10	239055	239064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018108	ATTTA	2	10	243539	243548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018108	ATGTA	2	10	243932	243941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018108	AAATT	2	10	274804	274813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018108	GTCCA	2	10	279761	279770	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_018108	TCGTG	2	10	284248	284257	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018108	GGGAG	2	10	286126	286135	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018108	GCGAA	2	10	286254	286263	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018108	TGAAG	2	10	287112	287121	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018108	CTCAT	2	10	288188	288197	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018108	TTCAC	2	10	295993	296002	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_018108	ATTTT	2	10	300694	300703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018108	CATAA	2	10	312810	312819	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018108	TTATC	2	10	316450	316459	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018108	TAAAA	2	10	317614	317623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018108	TTGCT	2	10	319347	319356	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018108	TTTTG	2	10	351462	351471	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018108	ATATT	2	10	360437	360446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018108	GTTTT	2	10	367462	367471	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018108	AAATG	2	10	371588	371597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018108	ATTTT	2	10	377026	377035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018108	AGAAA	2	10	377351	377360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018108	AACAT	2	10	377423	377432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018108	ATAGA	2	10	378060	378069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018108	AATCT	2	10	378522	378531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018108	AAATC	2	10	383430	383439	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018108	TTATT	2	10	408720	408729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018108	TCGTG	2	10	420097	420106	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018108	GGGAG	2	10	421976	421985	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018108	GCGAA	2	10	422104	422113	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018108	TGAAG	2	10	422962	422971	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018108	CTCAT	2	10	424037	424046	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018108	ATATT	2	10	449624	449633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018108	TAAAA	2	10	476663	476672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018108	TGGCT	2	10	492137	492146	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018108	ATTTT	2	10	513119	513128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018108	ACCCA	2	10	554142	554151	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_018108	AACTT	2	10	580551	580560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018108	ATTGC	2	10	623965	623974	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018108	TAATA	2	10	629582	629591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018108	AAATA	2	10	634742	634751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018108	TACAA	2	10	646625	646634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018108	TAAAA	2	10	668966	668975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018108	AATTT	2	10	672357	672366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018108	TTTAA	2	10	707360	707369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018108	TTTAT	2	10	723421	723430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018108	AAACT	2	10	729491	729500	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018108	ATTTG	2	10	731419	731428	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018108	AATTA	2	10	731524	731533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018108	TTATT	2	10	733247	733256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018108	TTTGA	2	10	761663	761672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018108	TCGTG	2	10	798771	798780	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018108	GGGAG	2	10	800555	800564	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018108	GCGAA	2	10	800683	800692	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018108	TGAAG	2	10	801541	801550	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018108	CTCAT	2	10	802616	802625	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_018108	CTTTC	2	10	808539	808548	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_018108	GTTTT	2	10	823388	823397	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018108	TAATA	2	10	823456	823465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018108	ACCAT	2	10	831123	831132	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_018108	TTAAA	2	10	861940	861949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018108	CATTT	2	10	879654	879663	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018108	TATTT	2	10	903953	903962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018108	TTTTA	2	10	929877	929886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018108	CTTTT	2	10	969077	969086	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018108	CTAAA	2	10	970626	970635	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018108	AAACA	2	10	970705	970714	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018108	TACAA	2	10	980717	980726	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018108	TAAAC	2	10	986101	986110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018108	ATTAA	2	10	1028176	1028185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018108	ATAAG	2	10	1028307	1028316	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018108	AAATA	2	10	1035890	1035899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018108	ACCCT	2	10	1039397	1039406	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_018108	TATCT	2	10	1060661	1060670	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018108	TCTCC	2	10	1061411	1061420	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_018108	AACCC	2	10	1067967	1067976	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_018108	TCATA	2	10	1067996	1068005	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018108	TACTT	2	10	1068530	1068539	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018108	GTTAA	2	10	1070001	1070010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018108	AAATT	2	10	1070072	1070081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018108	ATCCT	2	10	1071625	1071634	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_018108	TCTCC	2	10	1072034	1072043	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_018108	CTTAA	2	10	1090119	1090128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018108	CAAAA	2	10	1090186	1090195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018108	AATTT	2	10	1094166	1094175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018108	AAGAT	2	10	1103641	1103650	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018108	TTAAT	2	10	1113903	1113912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018108	TTTTA	2	10	1113937	1113946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018108	AACTT	2	10	1116491	1116500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018108	AGAAT	2	10	1163163	1163172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018108	TCTGA	2	10	1163528	1163537	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018108	TTTAT	2	10	1170933	1170942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018108	ATTTA	4	20	1170991	1171010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018108	AAATC	2	10	1172621	1172630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018108	AATGA	2	10	1182423	1182432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018108	TAAAA	2	10	1195659	1195668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018108	TAAAT	2	10	1217828	1217837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018108	GTTTT	2	10	1235382	1235391	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018108	GTTTT	2	10	1235912	1235921	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018108	CTTTT	2	10	1241081	1241090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018108	ACAAA	2	10	1243462	1243471	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018108	ACAAA	2	10	1245787	1245796	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018108	AACGA	2	10	1246551	1246560	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018108	AAATA	2	10	1248794	1248803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018108	AACGA	2	10	1249107	1249116	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018108	GAAAT	2	10	1251037	1251046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018108	TAATA	2	10	1251125	1251134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018108	TATTT	2	10	1251900	1251909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018108	ATTAA	2	10	1252845	1252854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018108	AATTA	2	10	1252983	1252992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018108	TTGAT	2	10	1318547	1318556	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018108	TTTAT	2	10	1318816	1318825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018108	CTTTT	2	10	1320157	1320166	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018108	AAATC	2	10	1320329	1320338	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018108	GCATG	2	10	1320626	1320635	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018108	CTAAT	2	10	1320810	1320819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018108	TAAAA	2	10	1324768	1324777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018108	TGCTA	2	10	1342349	1342358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018108	AAATT	2	10	1342818	1342827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018108	AGCAT	2	10	1342923	1342932	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018108	TATAG	2	10	1342967	1342976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018108	TTAAT	2	10	1349681	1349690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018108	ATCTT	2	10	1352518	1352527	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018108	TAAAG	2	10	1354769	1354778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018108	TTTTG	2	10	1355225	1355234	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018108	CCTCA	2	10	1415873	1415882	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
148	NC_018108	TTTAA	2	10	1460246	1460255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018108	TCCGC	2	10	1474975	1474984	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
150	NC_018108	AATTA	2	10	1499445	1499454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018108	TAATA	2	10	1500931	1500940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018108	TAATA	2	10	1526203	1526212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_018108	ATCCT	2	10	1535969	1535978	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_018108	ATTCT	2	10	1686368	1686377	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_018108	ATAAA	2	10	1717991	1718000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018108	AAAAT	2	10	1732037	1732046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.