MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Taylorella equigenitalis ATCC 35865 chromosome

Total Repeats: 471

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018108	TTGT	2	8	29056	29063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018108	TAGA	2	8	30770	30777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018108	TTAA	2	8	31133	31140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018108	AATT	2	8	31169	31176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018108	TTTA	2	8	31390	31397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018108	TAAA	2	8	39811	39818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018108	GATT	2	8	39827	39834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018108	ATTT	2	8	50201	50208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018108	TCTA	2	8	58914	58921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018108	TATC	2	8	59952	59959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018108	AAGA	2	8	67535	67542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018108	GGTC	2	8	67946	67953	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018108	AGAA	2	8	68096	68103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018108	ATAA	2	8	68183	68190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018108	AGTC	2	8	88130	88137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018108	TAAT	2	8	88147	88154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018108	AGTT	2	8	88296	88303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018108	AAGA	2	8	105870	105877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018108	GAAA	2	8	113863	113870	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018108	CTAA	2	8	115537	115544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018108	TTAT	2	8	115638	115645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018108	TTTC	2	8	115667	115674	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018108	TTTA	2	8	116350	116357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018108	AAGT	2	8	116656	116663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018108	CTAG	2	8	116712	116719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018108	TAAA	2	8	116896	116903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018108	AATT	2	8	116946	116953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018108	GAAA	2	8	117080	117087	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018108	TAAA	2	8	117173	117180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018108	TAAA	2	8	117210	117217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018108	TCAC	2	8	127420	127427	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018108	ATAA	2	8	128103	128110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018108	AAAT	2	8	131639	131646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018108	ATTT	2	8	131809	131816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018108	TGTT	2	8	132125	132132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018108	ACTT	2	8	133547	133554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018108	CTAA	2	8	134472	134479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018108	TTAT	2	8	134573	134580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018108	TTTC	2	8	134602	134609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018108	TTAG	2	8	136726	136733	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018108	GCTA	2	8	138229	138236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018108	TAAA	2	8	138332	138339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018108	ACCT	2	8	138701	138708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018108	AAAT	2	8	139157	139164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018108	ATTT	2	8	139229	139236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018108	CAAA	2	8	139237	139244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018108	CTAC	2	8	142647	142654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018108	TTGC	2	8	142753	142760	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018108	TTTA	2	8	159233	159240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018108	TAAA	2	8	162001	162008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018108	TTAA	2	8	162140	162147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018108	AAAT	2	8	162215	162222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018108	GGTT	2	8	197021	197028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018108	TAGT	2	8	197247	197254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018108	AAAT	2	8	197305	197312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018108	TATG	2	8	199894	199901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018108	TGTA	2	8	210390	210397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018108	TAAT	2	8	210456	210463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018108	CATC	2	8	210789	210796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018108	ACGT	2	8	212822	212829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018108	CAAT	2	8	214792	214799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018108	ATTA	2	8	217341	217348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018108	ATTT	2	8	217383	217390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018108	GCAA	2	8	225352	225359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018108	TAAA	2	8	225393	225400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018108	AGTT	2	8	225853	225860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018108	AGTT	2	8	226116	226123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018108	CGTT	2	8	226512	226519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018108	TTAA	2	8	226710	226717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018108	TTAG	2	8	227032	227039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018108	GATA	2	8	227838	227845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018108	AAAG	2	8	233756	233763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018108	AATA	2	8	233928	233935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018108	TTTC	2	8	237230	237237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018108	ATTA	2	8	237356	237363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018108	ATCC	2	8	243496	243503	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018108	ATGG	2	8	245329	245336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018108	ATTT	2	8	250753	250760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018108	TAAA	2	8	262708	262715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018108	TTTA	2	8	273996	274003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018108	TGCA	2	8	274835	274842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018108	GAAG	2	8	279808	279815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018108	GCTT	2	8	283255	283262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018108	TACC	2	8	284158	284165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018108	AAGA	2	8	285361	285368	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018108	GCGA	2	8	285883	285890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018108	AAAG	2	8	286716	286723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018108	AAGT	2	8	286849	286856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018108	GTTT	2	8	287859	287866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018108	GACA	2	8	288030	288037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018108	TACG	2	8	288402	288409	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018108	TCAA	2	8	288662	288669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018108	AGTC	2	8	288750	288757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018108	GTGG	2	8	288836	288843	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018108	ATAA	2	8	293432	293439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018108	TTTA	2	8	295929	295936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018108	GAAA	2	8	298202	298209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018108	TTAA	2	8	300666	300673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018108	ATTT	2	8	316466	316473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018108	TAAA	2	8	319147	319154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018108	AATA	2	8	319323	319330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018108	TAAA	2	8	319395	319402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018108	TAAA	2	8	319414	319421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018108	CCAG	2	8	322791	322798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018108	ATTT	2	8	350229	350236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018108	ACAT	2	8	352227	352234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018108	GTTT	2	8	367097	367104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018108	ATTT	2	8	367336	367343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018108	GTTT	2	8	367477	367484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018108	ATGA	2	8	371465	371472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018108	TCTA	2	8	371500	371507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018108	ATTT	3	12	376968	376979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018108	AATT	2	8	377043	377050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018108	AGTA	2	8	377176	377183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018108	TCAA	2	8	377725	377732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018108	CAAT	2	8	378159	378166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018108	AATG	2	8	379120	379127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018108	CAAA	2	8	379280	379287	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018108	AAGG	2	8	379412	379419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018108	AATG	2	8	379722	379729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018108	AAAT	2	8	384792	384799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018108	AAAT	2	8	384810	384817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018108	GCGG	2	8	388123	388130	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018108	GCTT	2	8	390011	390018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018108	TAAT	2	8	390138	390145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018108	TTTA	2	8	390938	390945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018108	TAGT	2	8	394320	394327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018108	GTTT	2	8	397998	398005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018108	TTAT	2	8	411236	411243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018108	GCTT	2	8	419103	419110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018108	TACC	2	8	420007	420014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018108	AAGA	2	8	421210	421217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018108	GCGA	2	8	421733	421740	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018108	AAAG	2	8	422566	422573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018108	AAGT	2	8	422699	422706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018108	GTTT	2	8	423709	423716	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018108	GACA	2	8	423880	423887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018108	TACG	2	8	424252	424259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018108	TCAA	2	8	424512	424519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018108	AGTC	2	8	424600	424607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018108	GTGG	2	8	424686	424693	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018108	AAAT	2	8	426923	426930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018108	TTAT	2	8	428291	428298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018108	ATTA	2	8	428351	428358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018108	ATAA	2	8	449535	449542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018108	TTAT	2	8	454420	454427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018108	TTAA	2	8	462428	462435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018108	TTTA	2	8	462465	462472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018108	TTAG	2	8	465798	465805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018108	TTAG	2	8	474555	474562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018108	TTTG	2	8	475327	475334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.