MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	GAGCGG	2	12	1762	1773	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018107	CCAGGC	2	12	3004	3015	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397660808
3	NC_018107	AGCGCG	2	12	8621	8632	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397660812
4	NC_018107	GCTGAT	2	12	22416	22427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397660824
5	NC_018107	TCCGGT	2	12	23411	23422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397660825
6	NC_018107	CACCGT	2	12	29450	29461	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397660832
7	NC_018107	GCGAGG	2	12	32129	32140	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	397660835
8	NC_018107	AGCTTA	2	12	32571	32582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018107	CTGAAT	2	12	35788	35799	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397660838
10	NC_018107	ACCTTA	2	12	38949	38960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397660841
11	NC_018107	GGCTCC	2	12	42380	42391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397660844
12	NC_018107	TGAAGC	2	12	45472	45483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018107	CAGGGG	2	12	46236	46247	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	397660848
14	NC_018107	ATGAAG	2	12	50092	50103	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397660851
15	NC_018107	ACAGAA	2	12	56305	56316	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018107	TCAAGT	2	12	56737	56748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018107	TGAGAA	2	12	59984	59995	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018107	AATTTT	2	12	63573	63584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397660856
19	NC_018107	GGAAAC	2	12	66689	66700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018107	CGTTAA	2	12	68139	68150	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397660858
21	NC_018107	TTAAAG	2	12	69704	69715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397660859
22	NC_018107	ACCGGA	2	12	73885	73896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018107	GCCAAT	2	12	74306	74317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018107	AATGCA	2	12	78909	78920	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018107	TCCCCG	2	12	82019	82030	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018107	TCCTGT	2	12	88347	88358	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397660868
27	NC_018107	GAAAAA	2	12	89725	89736	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397660869
28	NC_018107	TTGATG	5	30	96835	96864	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397660872
29	NC_018107	CTTTGC	2	12	112298	112309	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018107	ATTTTA	2	12	117346	117357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018107	ATCAAA	2	12	118253	118264	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397660885
32	NC_018107	AGGTCG	2	12	125932	125943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397660893
33	NC_018107	TATTAA	2	12	132997	133008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018107	TACTTT	2	12	139113	139124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018107	TTCGCC	2	12	142847	142858	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397660910
36	NC_018107	TCAATA	2	12	143597	143608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397660911
37	NC_018107	TCTCGC	2	12	147236	147247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397660913
38	NC_018107	GGCCGC	2	12	150748	150759	0 %	0 %	50 %	50 %	397660916
39	NC_018107	CGCTGG	2	12	154805	154816	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397660919
40	NC_018107	TATGTA	2	12	157456	157467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018107	ACAGCG	2	12	161784	161795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397660923
42	NC_018107	TGTAGA	2	12	166266	166277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018107	CTGTAC	2	12	167669	167680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397660926
44	NC_018107	TGTTGA	2	12	170252	170263	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397660927
45	NC_018107	AATGAC	2	12	170607	170618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397660927
46	NC_018107	TTAGCC	2	12	172086	172097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018107	GCACCG	2	12	172926	172937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397660928
48	NC_018107	TAAAGG	2	12	173904	173915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397660930
49	NC_018107	AAAGCA	2	12	178276	178287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018107	ACACGT	2	12	180107	180118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018107	TTAAAT	2	12	180208	180219	50 %	50 %	0 %	0 %	397660933
52	NC_018107	GATCAG	2	12	182043	182054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018107	CTTCAA	2	12	182904	182915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397660934
54	NC_018107	CTTCAT	2	12	183084	183095	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397660934
55	NC_018107	ACCAGA	2	12	184075	184086	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018107	AGCTCT	2	12	187277	187288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018107	TAGTAA	2	12	191472	191483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018107	AATCAT	2	12	197920	197931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397660939
59	NC_018107	GTTTTA	2	12	198582	198593	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397660939
60	NC_018107	ACAGCG	2	12	199734	199745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397660939
61	NC_018107	ACTGGG	2	12	202403	202414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018107	TTTGAT	2	12	202461	202472	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018107	TCAGCT	2	12	204729	204740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018107	ACTCTC	2	12	212625	212636	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018107	TGGTAA	2	12	222460	222471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018107	TGAAAA	2	12	226597	226608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397660950
67	NC_018107	TTTTCT	2	12	233794	233805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018107	GAGCTG	2	12	234735	234746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018107	CAGGTA	2	12	240142	240153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397660952
70	NC_018107	CTTCAT	2	12	245402	245413	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397660953
71	NC_018107	GTTTTC	2	12	248362	248373	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018107	AGCAAC	2	12	250670	250681	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018107	TGGTTT	2	12	251667	251678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018107	CATGCT	2	12	256919	256930	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018107	TTTATC	2	12	258410	258421	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018107	CAGAAA	2	12	260527	260538	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018107	CAAAGA	2	12	261019	261030	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018107	ACTTTT	2	12	261353	261364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397660957
79	NC_018107	CAATTT	2	12	267589	267600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018107	CAGTAT	2	12	274178	274189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018107	CAGACT	2	12	276284	276295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018107	TGTTAA	2	12	282156	282167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018107	TATGGT	2	12	290663	290674	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018107	CAAAAA	2	12	294176	294187	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018107	TTTCAT	2	12	295861	295872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018107	TTCATA	2	12	300828	300839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018107	TCCTGC	2	12	304013	304024	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018107	TCGGGA	2	12	309001	309012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397660974
89	NC_018107	TGCCGC	2	12	309144	309155	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018107	CACAGC	2	12	314758	314769	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397660979
91	NC_018107	GCCCAT	2	12	318473	318484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397660981
92	NC_018107	CTGGCG	2	12	319100	319111	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018107	AATATT	2	12	331432	331443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018107	GCGACG	2	12	336394	336405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397660998
95	NC_018107	TCTTGC	2	12	340207	340218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	397661001
96	NC_018107	ATATTG	2	12	343518	343529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397661004
97	NC_018107	GGCGAA	2	12	344269	344280	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	397661005
98	NC_018107	AATGAA	2	12	345503	345514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397661006
99	NC_018107	AAAGTA	2	12	348003	348014	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018107	CTTTAA	2	12	352796	352807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397661012

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.