MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	TGCTC	2	10	1259	1268	0 %	40 %	20 %	40 %	397660806
2	NC_018107	AGGCC	2	10	1448	1457	20 %	0 %	40 %	40 %	397660806
3	NC_018107	GGTCA	2	10	7054	7063	20 %	20 %	40 %	20 %	397660811
4	NC_018107	GGCCT	2	10	12452	12461	0 %	20 %	40 %	40 %	397660816
5	NC_018107	GAGCA	2	10	12641	12650	40 %	0 %	40 %	20 %	397660816
6	NC_018107	GGCCT	2	10	14657	14666	0 %	20 %	40 %	40 %	397660818
7	NC_018107	GAGCA	2	10	14846	14855	40 %	0 %	40 %	20 %	397660818
8	NC_018107	TTAAT	2	10	15252	15261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018107	GCTTG	2	10	15677	15686	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018107	CTTCA	2	10	18531	18540	20 %	40 %	0 %	40 %	397660820
11	NC_018107	CCAGG	2	10	20354	20363	20 %	0 %	40 %	40 %	397660822
12	NC_018107	TGGCA	2	10	20773	20782	20 %	20 %	40 %	20 %	397660822
13	NC_018107	CGCTG	2	10	20790	20799	0 %	20 %	40 %	40 %	397660822
14	NC_018107	CGCTG	2	10	22649	22658	0 %	20 %	40 %	40 %	397660825
15	NC_018107	GCCGG	2	10	23196	23205	0 %	0 %	60 %	40 %	397660825
16	NC_018107	GCTCT	2	10	23304	23313	0 %	40 %	20 %	40 %	397660825
17	NC_018107	AGCAA	2	10	25544	25553	60 %	0 %	20 %	20 %	397660827
18	NC_018107	TTAAG	2	10	26258	26267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018107	AACAT	2	10	26494	26503	60 %	20 %	0 %	20 %	397660828
20	NC_018107	ACACC	2	10	26788	26797	40 %	0 %	0 %	60 %	397660828
21	NC_018107	CAATC	2	10	26996	27005	40 %	20 %	0 %	40 %	397660828
22	NC_018107	GTGAT	2	10	27843	27852	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018107	CGGTT	2	10	29352	29361	0 %	40 %	40 %	20 %	397660832
24	NC_018107	AGGCC	2	10	31524	31533	20 %	0 %	40 %	40 %	397660834
25	NC_018107	TTTGG	2	10	32559	32568	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018107	AATGG	2	10	33463	33472	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018107	GTTCA	2	10	38131	38140	20 %	40 %	20 %	20 %	397660840
28	NC_018107	CCTGA	2	10	39865	39874	20 %	20 %	20 %	40 %	397660842
29	NC_018107	ATTTC	2	10	40697	40706	20 %	60 %	0 %	20 %	397660842
30	NC_018107	TAATT	2	10	40985	40994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018107	ATGAT	2	10	41067	41076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018107	TGGGA	2	10	41218	41227	20 %	20 %	60 %	0 %	397660843
33	NC_018107	GTACT	2	10	43706	43715	20 %	40 %	20 %	20 %	397660846
34	NC_018107	ATTTT	2	10	44654	44663	20 %	80 %	0 %	0 %	397660847
35	NC_018107	CTGGG	2	10	45216	45225	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018107	TTCGC	2	10	47837	47846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018107	TCATT	2	10	48223	48232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018107	TGAGT	2	10	52965	52974	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018107	AAGTT	2	10	53180	53189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018107	TCATT	2	10	54379	54388	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018107	TTTGT	2	10	57251	57260	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018107	ATCAC	2	10	57329	57338	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_018107	AAAAC	2	10	58189	58198	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018107	TATAA	2	10	58249	58258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018107	TAAAA	2	10	61293	61302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018107	TTTGA	2	10	62182	62191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018107	ATCGT	2	10	62210	62219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018107	GAAGG	2	10	62597	62606	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018107	ACTGT	2	10	62645	62654	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018107	GGCAT	2	10	64678	64687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018107	AACAA	2	10	65479	65488	80 %	0 %	0 %	20 %	397660857
52	NC_018107	TTAAT	2	10	67851	67860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018107	GAAGG	2	10	68519	68528	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018107	CTTCC	2	10	70346	70355	0 %	40 %	0 %	60 %	397660860
55	NC_018107	GTGAG	2	10	70872	70881	20 %	20 %	60 %	0 %	397660860
56	NC_018107	GTTCA	2	10	70934	70943	20 %	40 %	20 %	20 %	397660860
57	NC_018107	TGAAG	2	10	75051	75060	40 %	20 %	40 %	0 %	397660863
58	NC_018107	ATGTT	2	10	75946	75955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018107	GTTTT	2	10	76116	76125	0 %	80 %	20 %	0 %	397660864
60	NC_018107	GACGT	2	10	78544	78553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018107	GTCTG	2	10	80425	80434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018107	TCCTG	2	10	80650	80659	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_018107	TAATC	2	10	83431	83440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018107	TGCTT	2	10	84563	84572	0 %	60 %	20 %	20 %	397660867
65	NC_018107	CCCCA	2	10	87340	87349	20 %	0 %	0 %	80 %	397660867
66	NC_018107	GGTTT	2	10	87948	87957	0 %	60 %	40 %	0 %	397660868
67	NC_018107	TGAAT	2	10	88253	88262	40 %	40 %	20 %	0 %	397660868
68	NC_018107	CAGCG	2	10	88788	88797	20 %	0 %	40 %	40 %	397660868
69	NC_018107	CAGAC	2	10	91285	91294	40 %	0 %	20 %	40 %	397660870
70	NC_018107	AAACC	2	10	96815	96824	60 %	0 %	0 %	40 %	397660872
71	NC_018107	GCCCT	2	10	97514	97523	0 %	20 %	20 %	60 %	397660873
72	NC_018107	CGGTT	2	10	100746	100755	0 %	40 %	40 %	20 %	397660875
73	NC_018107	AAACC	2	10	100978	100987	60 %	0 %	0 %	40 %	397660875
74	NC_018107	ATGTC	2	10	103705	103714	20 %	40 %	20 %	20 %	397660878
75	NC_018107	TGTGA	2	10	103925	103934	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018107	TGTTT	2	10	107431	107440	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018107	TCCCC	2	10	110117	110126	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_018107	GTACG	2	10	112781	112790	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018107	AGCAA	2	10	115114	115123	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018107	CAGAA	2	10	117098	117107	60 %	0 %	20 %	20 %	397660884
81	NC_018107	AAAAT	2	10	117299	117308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018107	ATAAA	2	10	118597	118606	80 %	20 %	0 %	0 %	397660885
83	NC_018107	CAGTG	2	10	121396	121405	20 %	20 %	40 %	20 %	397660886
84	NC_018107	CGCTT	2	10	122139	122148	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_018107	TGCTC	2	10	123399	123408	0 %	40 %	20 %	40 %	397660888
86	NC_018107	AGGCC	2	10	123588	123597	20 %	0 %	40 %	40 %	397660888
87	NC_018107	CGAAA	2	10	124169	124178	60 %	0 %	20 %	20 %	397660889
88	NC_018107	GCGAT	2	10	124526	124535	20 %	20 %	40 %	20 %	397660890
89	NC_018107	GCTTC	2	10	126030	126039	0 %	40 %	20 %	40 %	397660893
90	NC_018107	AGAAT	2	10	126110	126119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018107	TGCTC	2	10	129724	129733	0 %	40 %	20 %	40 %	397660898
92	NC_018107	AGGCC	2	10	129913	129922	20 %	0 %	40 %	40 %	397660898
93	NC_018107	TCAGC	2	10	130389	130398	20 %	20 %	20 %	40 %	397660899
94	NC_018107	CGGTG	2	10	130540	130549	0 %	20 %	60 %	20 %	397660899
95	NC_018107	GGACG	2	10	130701	130710	20 %	0 %	60 %	20 %	397660899
96	NC_018107	GGCCT	2	10	134089	134098	0 %	20 %	40 %	40 %	397660903
97	NC_018107	GAGCA	2	10	134278	134287	40 %	0 %	40 %	20 %	397660903
98	NC_018107	GTTAA	2	10	135563	135572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018107	CAGAA	2	10	136101	136110	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018107	ATATT	2	10	137642	137651	40 %	60 %	0 %	0 %	397660906
101	NC_018107	GTGTT	2	10	139830	139839	0 %	60 %	40 %	0 %	397660907
102	NC_018107	GATCA	2	10	140536	140545	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018107	ATTTT	2	10	140579	140588	20 %	80 %	0 %	0 %	397660908
104	NC_018107	GGAAA	2	10	144549	144558	60 %	0 %	40 %	0 %	397660911
105	NC_018107	ATCCC	2	10	145652	145661	20 %	20 %	0 %	60 %	397660912
106	NC_018107	CGCTG	2	10	145795	145804	0 %	20 %	40 %	40 %	397660912
107	NC_018107	TTAAA	2	10	148587	148596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018107	TACAG	2	10	150903	150912	40 %	20 %	20 %	20 %	397660916
109	NC_018107	GATCA	2	10	155838	155847	40 %	20 %	20 %	20 %	397660919
110	NC_018107	CGAAC	2	10	158734	158743	40 %	0 %	20 %	40 %	397660921
111	NC_018107	ACGGC	2	10	163344	163353	20 %	0 %	40 %	40 %	397660923
112	NC_018107	AGCCA	2	10	165050	165059	40 %	0 %	20 %	40 %	397660925
113	NC_018107	AGGTT	2	10	166303	166312	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018107	ACATC	2	10	167179	167188	40 %	20 %	0 %	40 %	397660926
115	NC_018107	TCATT	2	10	170312	170321	20 %	60 %	0 %	20 %	397660927
116	NC_018107	ATATG	2	10	172256	172265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018107	AAATG	2	10	172865	172874	60 %	20 %	20 %	0 %	397660928
118	NC_018107	CCTTC	2	10	172888	172897	0 %	40 %	0 %	60 %	397660928
119	NC_018107	AAGTT	2	10	173923	173932	40 %	40 %	20 %	0 %	397660930
120	NC_018107	GAAAC	2	10	174018	174027	60 %	0 %	20 %	20 %	397660930
121	NC_018107	TTTGC	2	10	176634	176643	0 %	60 %	20 %	20 %	397660931
122	NC_018107	TGATC	2	10	176676	176685	20 %	40 %	20 %	20 %	397660931
123	NC_018107	TGCTT	2	10	178189	178198	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018107	GAACA	2	10	181498	181507	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018107	TTTAT	2	10	183875	183884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018107	CTTTG	2	10	184306	184315	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018107	GAAAT	2	10	185737	185746	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018107	TGATG	2	10	186325	186334	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018107	TCAAC	2	10	186348	186357	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_018107	GTTGT	2	10	187970	187979	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018107	TGGTC	2	10	188274	188283	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018107	CTAAA	2	10	189671	189680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018107	TCCAG	2	10	191116	191125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_018107	TTTTC	2	10	191717	191726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018107	TGTTA	2	10	192892	192901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018107	ACCTT	2	10	194589	194598	20 %	40 %	0 %	40 %	397660937
137	NC_018107	ATTTT	2	10	194790	194799	20 %	80 %	0 %	0 %	397660937
138	NC_018107	AACAC	2	10	197049	197058	60 %	0 %	0 %	40 %	397660939
139	NC_018107	GTCCT	2	10	197196	197205	0 %	40 %	20 %	40 %	397660939
140	NC_018107	ACTGC	2	10	197628	197637	20 %	20 %	20 %	40 %	397660939
141	NC_018107	GCTGG	2	10	200463	200472	0 %	20 %	60 %	20 %	397660939
142	NC_018107	ACAGA	2	10	200553	200562	60 %	0 %	20 %	20 %	397660939
143	NC_018107	GATCA	2	10	202745	202754	40 %	20 %	20 %	20 %	397660942
144	NC_018107	GCAAA	2	10	202787	202796	60 %	0 %	20 %	20 %	397660942
145	NC_018107	CTTTT	2	10	206272	206281	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018107	TTTCC	2	10	207692	207701	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_018107	TTTTC	2	10	214126	214135	0 %	80 %	0 %	20 %	397660948
148	NC_018107	CTTTG	2	10	215137	215146	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018107	AAAGA	2	10	218484	218493	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018107	ACAAT	2	10	219759	219768	60 %	20 %	0 %	20 %	397660949
151	NC_018107	ATATT	2	10	220148	220157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018107	CCAGA	2	10	221702	221711	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_018107	TGCTT	2	10	223806	223815	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_018107	TGCTT	2	10	224140	224149	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_018107	TGCTT	2	10	224407	224416	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_018107	AGACA	2	10	225047	225056	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_018107	AGACA	2	10	225784	225793	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_018107	GACAA	2	10	225919	225928	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_018107	AATTG	2	10	226438	226447	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018107	ATTGT	2	10	228237	228246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018107	ATGGT	2	10	228828	228837	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018107	AGCAA	2	10	228876	228885	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_018107	TCCGT	2	10	233638	233647	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_018107	ATTTT	2	10	233726	233735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018107	GTCAT	2	10	234535	234544	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_018107	GGGAT	2	10	241066	241075	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018107	TATCA	2	10	242657	242666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_018107	GAAAG	2	10	244023	244032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018107	GTTTA	2	10	247191	247200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018107	TTACT	2	10	247566	247575	20 %	60 %	0 %	20 %	397660954
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174	NC_018107	TTCGG	2	10	248075	248084	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_018107	GAACA	2	10	249414	249423	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_018107	GATGA	2	10	249730	249739	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018107	GATGA	2	10	253104	253113	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018107	TGAAT	2	10	253917	253926	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
179	NC_018107	GAAAA	2	10	254951	254960	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018107	AAATA	2	10	256740	256749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018107	ACAAT	2	10	257060	257069	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_018107	TCCTT	2	10	257125	257134	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_018107	TCATA	2	10	257203	257212	40 %	40 %	0 %	20 %	397660955
184	NC_018107	TAGCA	2	10	258101	258110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_018107	AAAGG	2	10	261408	261417	60 %	0 %	40 %	0 %	397660957
186	NC_018107	TATGT	2	10	262494	262503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018107	TTCAA	2	10	262617	262626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_018107	TCGCT	2	10	263946	263955	0 %	40 %	20 %	40 %	397660958
189	NC_018107	AAAGA	2	10	264453	264462	80 %	0 %	20 %	0 %	397660958
190	NC_018107	GTCTG	2	10	268032	268041	0 %	40 %	40 %	20 %	397660959
191	NC_018107	AAAAC	2	10	269361	269370	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_018107	TTCAG	2	10	270272	270281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
193	NC_018107	TCGCA	2	10	272054	272063	20 %	20 %	20 %	40 %	397660960
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196	NC_018107	AGGGC	2	10	274387	274396	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_018107	AAATC	2	10	275463	275472	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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204	NC_018107	CGCCA	2	10	287016	287025	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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223	NC_018107	TGCTC	2	10	315726	315735	0 %	40 %	20 %	40 %	397660980
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240	NC_018107	GTTCG	2	10	338059	338068	0 %	40 %	40 %	20 %	397660999
241	NC_018107	CAGGG	2	10	338402	338411	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
242	NC_018107	CGAAG	2	10	339923	339932	40 %	0 %	40 %	20 %	397661001
243	NC_018107	CGGCG	2	10	339951	339960	0 %	0 %	60 %	40 %	397661001
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249	NC_018107	TCATT	2	10	346285	346294	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
250	NC_018107	TAAAA	2	10	346538	346547	80 %	20 %	0 %	0 %	397661007
251	NC_018107	CTGAT	2	10	346581	346590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
252	NC_018107	ATTTT	2	10	347879	347888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_018107	CTCAC	2	10	351630	351639	20 %	20 %	0 %	60 %	397661011
254	NC_018107	GGAAG	2	10	352156	352165	40 %	0 %	60 %	0 %	397661011
255	NC_018107	TTAAC	2	10	353839	353848	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.