MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	TTAAT	2	10	15252	15261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018107	GCTTG	2	10	15677	15686	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018107	TTAAG	2	10	26258	26267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018107	GTGAT	2	10	27843	27852	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018107	TTTGG	2	10	32559	32568	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018107	AATGG	2	10	33463	33472	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018107	TAATT	2	10	40985	40994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018107	ATGAT	2	10	41067	41076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018107	CTGGG	2	10	45216	45225	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018107	TTCGC	2	10	47837	47846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018107	TCATT	2	10	48223	48232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018107	TGAGT	2	10	52965	52974	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018107	AAGTT	2	10	53180	53189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018107	TCATT	2	10	54379	54388	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018107	TTTGT	2	10	57251	57260	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018107	ATCAC	2	10	57329	57338	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018107	AAAAC	2	10	58189	58198	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018107	TATAA	2	10	58249	58258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018107	TAAAA	2	10	61293	61302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018107	TTTGA	2	10	62182	62191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018107	ATCGT	2	10	62210	62219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018107	GAAGG	2	10	62597	62606	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018107	ACTGT	2	10	62645	62654	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018107	GGCAT	2	10	64678	64687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018107	TTAAT	2	10	67851	67860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018107	GAAGG	2	10	68519	68528	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018107	ATGTT	2	10	75946	75955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018107	GACGT	2	10	78544	78553	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018107	GTCTG	2	10	80425	80434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018107	TCCTG	2	10	80650	80659	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018107	TAATC	2	10	83431	83440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018107	TGTGA	2	10	103925	103934	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018107	TGTTT	2	10	107431	107440	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018107	TCCCC	2	10	110117	110126	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
35	NC_018107	GTACG	2	10	112781	112790	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018107	AGCAA	2	10	115114	115123	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018107	AAAAT	2	10	117299	117308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018107	CGCTT	2	10	122139	122148	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018107	AGAAT	2	10	126110	126119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018107	GTTAA	2	10	135563	135572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018107	CAGAA	2	10	136101	136110	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018107	GATCA	2	10	140536	140545	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018107	TTAAA	2	10	148587	148596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018107	AGGTT	2	10	166303	166312	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018107	ATATG	2	10	172256	172265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018107	TGCTT	2	10	178189	178198	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018107	GAACA	2	10	181498	181507	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018107	TTTAT	2	10	183875	183884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018107	CTTTG	2	10	184306	184315	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018107	GAAAT	2	10	185737	185746	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018107	TGATG	2	10	186325	186334	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018107	TCAAC	2	10	186348	186357	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018107	GTTGT	2	10	187970	187979	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018107	TGGTC	2	10	188274	188283	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018107	CTAAA	2	10	189671	189680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018107	TCCAG	2	10	191116	191125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018107	TTTTC	2	10	191717	191726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018107	TGTTA	2	10	192892	192901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018107	CTTTT	2	10	206272	206281	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018107	TTTCC	2	10	207692	207701	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018107	CTTTG	2	10	215137	215146	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018107	AAAGA	2	10	218484	218493	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018107	ATATT	2	10	220148	220157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018107	CCAGA	2	10	221702	221711	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_018107	TGCTT	2	10	223806	223815	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018107	TGCTT	2	10	224140	224149	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018107	TGCTT	2	10	224407	224416	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018107	AGACA	2	10	225047	225056	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018107	GACAA	2	10	225182	225191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018107	AGACA	2	10	225784	225793	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018107	GACAA	2	10	225919	225928	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018107	AATTG	2	10	226438	226447	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018107	ATTGT	2	10	228237	228246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018107	ATGGT	2	10	228828	228837	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018107	AGCAA	2	10	228876	228885	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018107	TCCGT	2	10	233638	233647	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_018107	ATTTT	2	10	233726	233735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018107	GTCAT	2	10	234535	234544	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018107	GGGAT	2	10	241066	241075	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018107	AAAAT	2	10	242628	242637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018107	TATCA	2	10	242657	242666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018107	GAAAG	2	10	244023	244032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018107	GTTTA	2	10	247191	247200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018107	AAAGA	2	10	248037	248046	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018107	TTCGG	2	10	248075	248084	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018107	GAACA	2	10	249414	249423	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018107	GATGA	2	10	249730	249739	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018107	GATGA	2	10	253104	253113	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018107	TGAAT	2	10	253917	253926	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018107	GAAAA	2	10	254951	254960	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018107	AAATA	2	10	256740	256749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018107	ACAAT	2	10	257060	257069	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018107	TCCTT	2	10	257125	257134	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018107	TAGCA	2	10	258101	258110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018107	TATGT	2	10	262494	262503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018107	TTCAA	2	10	262617	262626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018107	AAAAC	2	10	269361	269370	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018107	TTCAG	2	10	270272	270281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018107	CTGTT	2	10	273416	273425	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018107	AGGGC	2	10	274387	274396	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018107	TTTCC	2	10	275089	275098	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_018107	AAATC	2	10	275463	275472	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018107	ATATT	2	10	276822	276831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018107	AAAGT	2	10	279758	279767	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018107	TTCGT	2	10	283934	283943	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018107	CGCCA	2	10	287016	287025	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_018107	ACCGA	2	10	292488	292497	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018107	ATTTC	2	10	292840	292849	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018107	CTGAA	2	10	293383	293392	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018107	TACGA	2	10	302301	302310	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018107	GGCGA	2	10	302352	302361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018107	ATTAT	2	10	302384	302393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018107	TTGAA	2	10	305861	305870	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018107	GTTTT	2	10	306888	306897	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018107	GCACA	2	10	309218	309227	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_018107	GCTAA	2	10	310506	310515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018107	CCTCA	2	10	314963	314972	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_018107	GCCTT	2	10	326495	326504	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018107	TAAAA	2	10	332327	332336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018107	CAACA	2	10	335676	335685	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018107	CAGGG	2	10	338402	338411	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018107	TCATT	2	10	346285	346294	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018107	CTGAT	2	10	346581	346590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018107	ATTTT	2	10	347879	347888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018107	TTAAC	2	10	353839	353848	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.