MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Klebsiella oxytoca E718 plasmid pKOX_R1

Total Repeats: 427

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018107	CATA	2	8	423	430	50 %	25 %	0 %	25 %	397660805
2	NC_018107	CAAT	2	8	465	472	50 %	25 %	0 %	25 %	397660805
3	NC_018107	GCTG	2	8	920	927	0 %	25 %	50 %	25 %	397660806
4	NC_018107	ATGG	2	8	2104	2111	25 %	25 %	50 %	0 %	397660807
5	NC_018107	CAGC	2	8	3582	3589	25 %	0 %	25 %	50 %	397660808
6	NC_018107	TCCC	2	8	3824	3831	0 %	25 %	0 %	75 %	397660808
7	NC_018107	CCGC	2	8	4452	4459	0 %	0 %	25 %	75 %	397660809
8	NC_018107	CAGC	2	8	4539	4546	25 %	0 %	25 %	50 %	397660809
9	NC_018107	GCCT	2	8	5384	5391	0 %	25 %	25 %	50 %	397660810
10	NC_018107	GTGG	2	8	5866	5873	0 %	25 %	75 %	0 %	397660810
11	NC_018107	GATA	2	8	6202	6209	50 %	25 %	25 %	0 %	397660810
12	NC_018107	CCGG	2	8	7155	7162	0 %	0 %	50 %	50 %	397660811
13	NC_018107	TCAT	2	8	7304	7311	25 %	50 %	0 %	25 %	397660812
14	NC_018107	GCGT	2	8	7400	7407	0 %	25 %	50 %	25 %	397660812
15	NC_018107	CGCC	2	8	7835	7842	0 %	0 %	25 %	75 %	397660812
16	NC_018107	GCCG	2	8	8389	8396	0 %	0 %	50 %	50 %	397660812
17	NC_018107	CCAG	2	8	8670	8677	25 %	0 %	25 %	50 %	397660812
18	NC_018107	GAAA	2	8	9306	9313	75 %	0 %	25 %	0 %	397660813
19	NC_018107	ACCG	2	8	9367	9374	25 %	0 %	25 %	50 %	397660813
20	NC_018107	TGAC	2	8	10970	10977	25 %	25 %	25 %	25 %	397660814
21	NC_018107	CGGT	2	8	11519	11526	0 %	25 %	50 %	25 %	397660815
22	NC_018107	TCAG	2	8	12161	12168	25 %	25 %	25 %	25 %	397660815
23	NC_018107	GGCG	2	8	12665	12672	0 %	0 %	75 %	25 %	397660816
24	NC_018107	CAGC	2	8	12982	12989	25 %	0 %	25 %	50 %	397660816
25	NC_018107	ATTA	2	8	13239	13246	50 %	50 %	0 %	0 %	397660817
26	NC_018107	AATA	2	8	13666	13673	75 %	25 %	0 %	0 %	397660817
27	NC_018107	GGCG	2	8	14870	14877	0 %	0 %	75 %	25 %	397660818
28	NC_018107	TGTT	2	8	16280	16287	0 %	75 %	25 %	0 %	397660819
29	NC_018107	TTAA	2	8	16615	16622	50 %	50 %	0 %	0 %	397660819
30	NC_018107	CTTT	2	8	16970	16977	0 %	75 %	0 %	25 %	397660819
31	NC_018107	AATG	2	8	17694	17701	50 %	25 %	25 %	0 %	397660819
32	NC_018107	AGTC	2	8	18473	18480	25 %	25 %	25 %	25 %	397660820
33	NC_018107	TGAT	2	8	18661	18668	25 %	50 %	25 %	0 %	397660820
34	NC_018107	CTGG	2	8	19007	19014	0 %	25 %	50 %	25 %	397660820
35	NC_018107	CTGA	2	8	19025	19032	25 %	25 %	25 %	25 %	397660820
36	NC_018107	ATCG	2	8	19357	19364	25 %	25 %	25 %	25 %	397660821
37	NC_018107	AGGC	2	8	19546	19553	25 %	0 %	50 %	25 %	397660821
38	NC_018107	GCAG	2	8	19938	19945	25 %	0 %	50 %	25 %	397660822
39	NC_018107	CAGT	2	8	20102	20109	25 %	25 %	25 %	25 %	397660822
40	NC_018107	TTTC	2	8	20317	20324	0 %	75 %	0 %	25 %	397660822
41	NC_018107	TCCC	2	8	22248	22255	0 %	25 %	0 %	75 %	397660824
42	NC_018107	CTGG	2	8	22271	22278	0 %	25 %	50 %	25 %	397660824
43	NC_018107	GCCA	2	8	22549	22556	25 %	0 %	25 %	50 %	397660824
44	NC_018107	ACGG	2	8	22906	22913	25 %	0 %	50 %	25 %	397660825
45	NC_018107	ATCG	2	8	23181	23188	25 %	25 %	25 %	25 %	397660825
46	NC_018107	AGAA	2	8	23436	23443	75 %	0 %	25 %	0 %	397660825
47	NC_018107	GTCT	2	8	24006	24013	0 %	50 %	25 %	25 %	397660825
48	NC_018107	ATAA	2	8	24208	24215	75 %	25 %	0 %	0 %	397660825
49	NC_018107	TCAG	2	8	25047	25054	25 %	25 %	25 %	25 %	397660826
50	NC_018107	CGCT	2	8	25171	25178	0 %	25 %	25 %	50 %	397660826
51	NC_018107	TTTC	2	8	25192	25199	0 %	75 %	0 %	25 %	397660826
52	NC_018107	AGCG	2	8	25265	25272	25 %	0 %	50 %	25 %	397660826
53	NC_018107	CACC	2	8	25637	25644	25 %	0 %	0 %	75 %	397660827
54	NC_018107	CGAA	2	8	25737	25744	50 %	0 %	25 %	25 %	397660827
55	NC_018107	CAGC	2	8	25807	25814	25 %	0 %	25 %	50 %	397660827
56	NC_018107	CCAA	2	8	26475	26482	50 %	0 %	0 %	50 %	397660828
57	NC_018107	AAAG	2	8	26735	26742	75 %	0 %	25 %	0 %	397660828
58	NC_018107	AACT	2	8	27134	27141	50 %	25 %	0 %	25 %	397660828
59	NC_018107	ACTC	2	8	27469	27476	25 %	25 %	0 %	50 %	397660828
60	NC_018107	GCTG	2	8	28722	28729	0 %	25 %	50 %	25 %	397660829
61	NC_018107	ACAA	2	8	29138	29145	75 %	0 %	0 %	25 %	397660831
62	NC_018107	GCCG	2	8	29194	29201	0 %	0 %	50 %	50 %	397660831
63	NC_018107	CGGC	2	8	30076	30083	0 %	0 %	50 %	50 %	397660833
64	NC_018107	GCCG	2	8	30140	30147	0 %	0 %	50 %	50 %	397660833
65	NC_018107	GCCG	2	8	30188	30195	0 %	0 %	50 %	50 %	397660833
66	NC_018107	CCGG	2	8	30305	30312	0 %	0 %	50 %	50 %	397660833
67	NC_018107	CGTG	2	8	30346	30353	0 %	25 %	50 %	25 %	397660833
68	NC_018107	CTGG	2	8	30389	30396	0 %	25 %	50 %	25 %	397660833
69	NC_018107	TCGC	2	8	30594	30601	0 %	25 %	25 %	50 %	397660833
70	NC_018107	GTGG	2	8	30888	30895	0 %	25 %	75 %	0 %	397660833
71	NC_018107	CGTT	2	8	31104	31111	0 %	50 %	25 %	25 %	397660833
72	NC_018107	CGAG	2	8	32208	32215	25 %	0 %	50 %	25 %	397660836
73	NC_018107	AATT	2	8	32618	32625	50 %	50 %	0 %	0 %	397660837
74	NC_018107	ATTT	2	8	34707	34714	25 %	75 %	0 %	0 %	397660838
75	NC_018107	ATTC	2	8	34754	34761	25 %	50 %	0 %	25 %	397660838
76	NC_018107	GACG	2	8	35401	35408	25 %	0 %	50 %	25 %	397660838
77	NC_018107	GACA	2	8	35532	35539	50 %	0 %	25 %	25 %	397660838
78	NC_018107	CAGC	2	8	36493	36500	25 %	0 %	25 %	50 %	397660839
79	NC_018107	TTCA	2	8	36571	36578	25 %	50 %	0 %	25 %	397660839
80	NC_018107	CAGC	2	8	38881	38888	25 %	0 %	25 %	50 %	397660841
81	NC_018107	CTGA	2	8	39146	39153	25 %	25 %	25 %	25 %	397660841
82	NC_018107	CAGT	2	8	39168	39175	25 %	25 %	25 %	25 %	397660841
83	NC_018107	CATC	2	8	39741	39748	25 %	25 %	0 %	50 %	397660841
84	NC_018107	CATC	2	8	39879	39886	25 %	25 %	0 %	50 %	397660842
85	NC_018107	GACG	2	8	40250	40257	25 %	0 %	50 %	25 %	397660842
86	NC_018107	ACGG	2	8	40535	40542	25 %	0 %	50 %	25 %	397660842
87	NC_018107	TGAA	2	8	40631	40638	50 %	25 %	25 %	0 %	397660842
88	NC_018107	CGAT	2	8	41677	41684	25 %	25 %	25 %	25 %	397660843
89	NC_018107	ACTG	2	8	42076	42083	25 %	25 %	25 %	25 %	397660844
90	NC_018107	ATGG	2	8	42569	42576	25 %	25 %	50 %	0 %	397660844
91	NC_018107	ACGG	2	8	42594	42601	25 %	0 %	50 %	25 %	397660844
92	NC_018107	ATCA	2	8	42614	42621	50 %	25 %	0 %	25 %	397660844
93	NC_018107	GTCG	2	8	43444	43451	0 %	25 %	50 %	25 %	397660846
94	NC_018107	AGAA	2	8	43962	43969	75 %	0 %	25 %	0 %	397660846
95	NC_018107	AAAG	2	8	44417	44424	75 %	0 %	25 %	0 %	397660846
96	NC_018107	CAGA	2	8	44887	44894	50 %	0 %	25 %	25 %	397660847
97	NC_018107	CTGA	2	8	44911	44918	25 %	25 %	25 %	25 %	397660847
98	NC_018107	CCTG	2	8	45901	45908	0 %	25 %	25 %	50 %	397660848
99	NC_018107	GATG	2	8	46556	46563	25 %	25 %	50 %	0 %	397660848
100	NC_018107	ACAA	2	8	46692	46699	75 %	0 %	0 %	25 %	397660848
101	NC_018107	ATGA	2	8	46713	46720	50 %	25 %	25 %	0 %	397660848
102	NC_018107	CTGG	2	8	47006	47013	0 %	25 %	50 %	25 %	397660848
103	NC_018107	AAGG	2	8	47511	47518	50 %	0 %	50 %	0 %	397660849
104	NC_018107	TTTC	2	8	47531	47538	0 %	75 %	0 %	25 %	397660849
105	NC_018107	GCCA	2	8	48918	48925	25 %	0 %	25 %	50 %	397660850
106	NC_018107	GGCA	2	8	50455	50462	25 %	0 %	50 %	25 %	397660851
107	NC_018107	ACTG	2	8	51836	51843	25 %	25 %	25 %	25 %	397660852
108	NC_018107	AACA	2	8	52197	52204	75 %	0 %	0 %	25 %	397660852
109	NC_018107	TGGT	2	8	52315	52322	0 %	50 %	50 %	0 %	397660852
110	NC_018107	CGTC	2	8	52506	52513	0 %	25 %	25 %	50 %	397660852
111	NC_018107	GCCA	2	8	55074	55081	25 %	0 %	25 %	50 %	397660853
112	NC_018107	AATG	2	8	56035	56042	50 %	25 %	25 %	0 %	397660854
113	NC_018107	CTTT	2	8	62974	62981	0 %	75 %	0 %	25 %	397660856
114	NC_018107	TACG	2	8	65152	65159	25 %	25 %	25 %	25 %	397660857
115	NC_018107	TCTA	2	8	65746	65753	25 %	50 %	0 %	25 %	397660857
116	NC_018107	GAGT	2	8	68118	68125	25 %	25 %	50 %	0 %	397660858
117	NC_018107	GCAA	2	8	68156	68163	50 %	0 %	25 %	25 %	397660858
118	NC_018107	TGAA	2	8	69653	69660	50 %	25 %	25 %	0 %	397660859
119	NC_018107	TCAT	2	8	69671	69678	25 %	50 %	0 %	25 %	397660859
120	NC_018107	CAGA	2	8	69889	69896	50 %	0 %	25 %	25 %	397660859
121	NC_018107	CTGT	2	8	69907	69914	0 %	50 %	25 %	25 %	397660859
122	NC_018107	GTTC	2	8	70108	70115	0 %	50 %	25 %	25 %	397660859
123	NC_018107	GTCG	2	8	70504	70511	0 %	25 %	50 %	25 %	397660860
124	NC_018107	AACA	2	8	71105	71112	75 %	0 %	0 %	25 %	397660860
125	NC_018107	AGCC	2	8	71290	71297	25 %	0 %	25 %	50 %	397660860
126	NC_018107	GTCA	2	8	74891	74898	25 %	25 %	25 %	25 %	397660863
127	NC_018107	TCAT	2	8	75216	75223	25 %	50 %	0 %	25 %	397660863
128	NC_018107	CAGC	2	8	76183	76190	25 %	0 %	25 %	50 %	397660864
129	NC_018107	GAAG	2	8	76243	76250	50 %	0 %	50 %	0 %	397660864
130	NC_018107	GGCT	2	8	76787	76794	0 %	25 %	50 %	25 %	397660864
131	NC_018107	CGTT	2	8	76842	76849	0 %	50 %	25 %	25 %	397660864
132	NC_018107	GATT	2	8	76866	76873	25 %	50 %	25 %	0 %	397660864
133	NC_018107	ACTG	2	8	77325	77332	25 %	25 %	25 %	25 %	397660865
134	NC_018107	TTTA	2	8	84095	84102	25 %	75 %	0 %	0 %	397660867
135	NC_018107	TCTG	2	8	84902	84909	0 %	50 %	25 %	25 %	397660867
136	NC_018107	TTGA	2	8	85060	85067	25 %	50 %	25 %	0 %	397660867
137	NC_018107	TATT	2	8	85804	85811	25 %	75 %	0 %	0 %	397660867
138	NC_018107	TTCA	2	8	87176	87183	25 %	50 %	0 %	25 %	397660867
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.