MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium ulcerans 0102

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018101	TTGTAT	2	12	20327	20338	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018101	GGAATT	2	12	54510	54521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018101	TTCCTG	2	12	81438	81449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018101	CTCACT	2	12	170920	170931	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018101	TGTTGG	2	12	173385	173396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018101	TTCGCG	2	12	218890	218901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018101	GTCTAT	2	12	225915	225926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018101	GTTTTC	2	12	440481	440492	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018101	GTCCAC	2	12	465274	465285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018101	GCAATG	2	12	483432	483443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018101	CAACAG	2	12	514074	514085	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018101	GTAGCA	2	12	514710	514721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018101	ATTTTT	2	12	625399	625410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018101	GTGCCT	2	12	630116	630127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018101	GATAAG	2	12	760077	760088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018101	AGCGAA	2	12	767363	767374	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018101	TGCCTG	2	12	782456	782467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018101	CAAGCT	2	12	876107	876118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018101	GAAGGT	2	12	880973	880984	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018101	CGTGGC	2	12	881154	881165	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018101	ACGAAA	2	12	895681	895692	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018101	AATGAC	2	12	1078982	1078993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018101	GTGGTT	2	12	1123091	1123102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018101	TAGCGT	2	12	1147693	1147704	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018101	GATTGT	2	12	1170846	1170857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018101	AGCGAA	2	12	1206761	1206772	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018101	CAGAAG	2	12	1226853	1226864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018101	TCAACT	2	12	1253422	1253433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018101	CTGCCG	2	12	1265802	1265813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018101	GCAATA	2	12	1488005	1488016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018101	GCTAAT	2	12	1534499	1534510	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018101	TTCCTT	2	12	1602401	1602412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018101	TGTGCT	2	12	1616594	1616605	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018101	TATTTC	2	12	1649069	1649080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018101	GACGGT	2	12	1674543	1674554	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018101	CAAAGA	2	12	1707996	1708007	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018101	CGTCAT	2	12	1765690	1765701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018101	TCGTGT	2	12	1795257	1795268	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018101	CCTGTG	2	12	1847687	1847698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018101	TTCCCA	2	12	1861122	1861133	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018101	GTAATG	2	12	1956427	1956438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018101	CCAAAC	2	12	2001651	2001662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018101	TCCTTC	2	12	2020407	2020418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018101	AAAAGA	2	12	2023418	2023429	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018101	ACCTTT	2	12	2048649	2048660	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018101	TTCGCT	2	12	2069463	2069474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018101	AAAACA	2	12	2080404	2080415	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018101	TCCCCA	2	12	2135503	2135514	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018101	TCCCCC	2	12	2135911	2135922	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
50	NC_018101	CCACAC	2	12	2187751	2187762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018101	GCCTTA	2	12	2247208	2247219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018101	AGAAAA	2	12	2261191	2261202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018101	CCCCCA	2	12	2263699	2263710	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
54	NC_018101	AAAAGA	2	12	2281743	2281754	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018101	TTCAAT	2	12	2290148	2290159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018101	TTTAGT	2	12	2316630	2316641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018101	CAAAAG	2	12	2382897	2382908	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018101	CATCCA	2	12	2421944	2421955	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018101	GCCCAC	2	12	2422010	2422021	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_018101	CTTGAA	2	12	2430680	2430691	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018101	TTCGCT	2	12	2453869	2453880	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018101	CGTCCC	2	12	2462219	2462230	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018101	CTAAAC	2	12	2524789	2524800	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018101	CCATTA	2	12	2561080	2561091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018101	TTTTCT	2	12	2569142	2569153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.