MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium ulcerans 0102

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018101	GAATT	2	10	41	50	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018101	CGTTG	2	10	268	277	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018101	CAGTA	2	10	15086	15095	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018101	TTGCT	2	10	25914	25923	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018101	ATTTT	2	10	38649	38658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018101	TGCGG	2	10	42677	42686	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018101	CATCA	2	10	58834	58843	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018101	TGAGG	2	10	74660	74669	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018101	TGGTG	2	10	89474	89483	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018101	CCGTT	2	10	98942	98951	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_018101	ACGGA	2	10	99102	99111	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018101	CGATG	2	10	100515	100524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018101	ACCCT	2	10	104779	104788	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_018101	TAACA	2	10	116610	116619	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018101	CATGT	2	10	120146	120155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018101	AAAAT	2	10	123130	123139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018101	TAATT	2	10	124914	124923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018101	TGGGG	2	10	139555	139564	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018101	ATATA	2	10	180760	180769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018101	AGGGG	2	10	187960	187969	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018101	CCTGA	2	10	211617	211626	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_018101	CAGTG	2	10	229988	229997	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018101	GAAGT	2	10	235145	235154	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018101	GTACC	2	10	240908	240917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018101	GCATA	2	10	251054	251063	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018101	ATTTT	2	10	259426	259435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018101	TAATA	2	10	276858	276867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018101	TGCGC	2	10	309393	309402	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018101	TGGCA	2	10	310190	310199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018101	GAAAA	2	10	319205	319214	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018101	ATAAA	2	10	319681	319690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018101	AGTTC	2	10	320163	320172	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018101	CGAGA	2	10	320528	320537	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018101	AAATA	2	10	376277	376286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018101	CACAC	2	10	417693	417702	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_018101	GTTTT	2	10	423771	423780	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018101	AAAAG	2	10	440998	441007	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018101	TTCAC	2	10	455085	455094	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018101	AGGGG	2	10	464789	464798	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018101	GGAAA	2	10	478698	478707	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018101	TTTGG	2	10	479185	479194	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018101	GAAAA	2	10	483493	483502	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018101	GCGTT	2	10	499323	499332	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018101	GTGAT	2	10	501401	501410	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018101	AGGAA	2	10	507115	507124	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018101	TTAGA	2	10	509562	509571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018101	AGGAA	2	10	512024	512033	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018101	ATTTC	2	10	520583	520592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018101	TGCCA	2	10	527739	527748	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018101	CGTAG	2	10	587818	587827	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018101	TGGGG	2	10	599495	599504	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018101	TTGCT	2	10	608589	608598	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018101	ACAGT	2	10	608869	608878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018101	TGCCT	2	10	616836	616845	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018101	ATTTT	2	10	625243	625252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018101	AGGGG	2	10	650498	650507	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018101	CGCGG	2	10	656518	656527	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018101	AATAA	2	10	662425	662434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018101	AAAAT	2	10	685951	685960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018101	CGTTG	2	10	698515	698524	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018101	AATGC	2	10	706377	706386	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018101	CTCAT	2	10	731724	731733	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_018101	TTGGG	2	10	739865	739874	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018101	CTAAT	2	10	741783	741792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018101	CATTT	2	10	741856	741865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018101	TTTCC	2	10	759642	759651	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_018101	TGTGG	2	10	764519	764528	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018101	TCGTG	2	10	765800	765809	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018101	CGTCA	2	10	766136	766145	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_018101	GTTGT	2	10	766559	766568	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018101	GGGAG	2	10	767223	767232	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018101	TGACA	2	10	769816	769825	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018101	TGGGG	2	10	786982	786991	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018101	CTCTT	2	10	792029	792038	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018101	GTGAA	2	10	792075	792084	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018101	GGGGT	2	10	794225	794234	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018101	TCAAA	2	10	806813	806822	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_018101	AAAAC	2	10	831029	831038	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018101	GTTTT	2	10	836081	836090	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018101	TGGGG	2	10	836156	836165	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018101	TGCGC	2	10	843795	843804	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_018101	GCCTC	2	10	848683	848692	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_018101	ATGTC	2	10	850888	850897	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018101	GGGAA	2	10	880655	880664	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018101	TTTTC	2	10	880956	880965	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018101	AAAAG	2	10	903551	903560	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018101	TAGGT	2	10	908430	908439	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018101	GGCTG	2	10	948811	948820	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018101	GAATC	2	10	968895	968904	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018101	CAGCG	2	10	1001858	1001867	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_018101	TTTCC	2	10	1006035	1006044	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_018101	AAGGA	2	10	1012253	1012262	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018101	AAAAG	2	10	1016590	1016599	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018101	AGTCT	2	10	1026671	1026680	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018101	ATAAG	2	10	1027989	1027998	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018101	GGGCT	2	10	1050485	1050494	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018101	AGTGC	2	10	1070827	1070836	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018101	CTCAT	2	10	1099493	1099502	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_018101	CGTAA	2	10	1102014	1102023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018101	CGTGA	2	10	1114448	1114457	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018101	GTTCC	2	10	1136060	1136069	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_018101	CTAGC	2	10	1147640	1147649	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_018101	CTTTG	2	10	1150100	1150109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018101	AGCAC	2	10	1152206	1152215	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018101	TGGTG	2	10	1167022	1167031	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018101	TTTCA	2	10	1170631	1170640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018101	GAACA	2	10	1170908	1170917	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018101	GGTGC	2	10	1175070	1175079	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018101	CGAGT	2	10	1181554	1181563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018101	GGAAT	2	10	1182595	1182604	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018101	ATTCA	2	10	1199015	1199024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018101	TGTGG	2	10	1203917	1203926	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018101	TCGTG	2	10	1205198	1205207	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018101	CGTCA	2	10	1205534	1205543	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018101	GTTGT	2	10	1205957	1205966	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018101	GGGAG	2	10	1206621	1206630	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018101	TGACA	2	10	1209214	1209223	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018101	GTGTT	2	10	1209225	1209234	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018101	TCACA	2	10	1232812	1232821	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_018101	GCAAA	2	10	1237036	1237045	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_018101	GTTTT	2	10	1248840	1248849	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018101	GGAAG	2	10	1264731	1264740	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018101	CCTAC	2	10	1265020	1265029	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_018101	AAAGT	2	10	1271882	1271891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018101	TTACT	2	10	1281527	1281536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018101	CTGTG	2	10	1285503	1285512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018101	TAACG	2	10	1303475	1303484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018101	CTTAC	2	10	1306630	1306639	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_018101	TTAGC	2	10	1306794	1306803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018101	CGGGG	2	10	1312305	1312314	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018101	ATCGC	2	10	1331410	1331419	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_018101	CAATG	2	10	1331463	1331472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018101	GTTGT	2	10	1331508	1331517	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018101	CCCGG	2	10	1331755	1331764	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_018101	TGATC	2	10	1332042	1332051	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018101	AGCTG	2	10	1332059	1332068	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018101	ACCCC	2	10	1350600	1350609	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_018101	AAAAT	2	10	1361045	1361054	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018101	CTGTG	2	10	1385810	1385819	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018101	TCTTT	2	10	1388118	1388127	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018101	GGTTT	2	10	1395597	1395606	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018101	TTCTT	2	10	1397670	1397679	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018101	CACTT	2	10	1400037	1400046	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_018101	ACCCC	2	10	1430755	1430764	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
145	NC_018101	ACAAG	2	10	1447943	1447952	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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147	NC_018101	CCATG	2	10	1460022	1460031	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_018101	TACCG	2	10	1491683	1491692	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_018101	TGCCA	2	10	1492214	1492223	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_018101	GTTTT	2	10	1645476	1645485	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_018101	CAATC	2	10	1866288	1866297	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_018101	GTTCT	2	10	1896699	1896708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_018101	ATATA	2	10	1899885	1899894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_018101	GTAAA	2	10	1969746	1969755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_018101	TGACG	2	10	2070692	2070701	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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245	NC_018101	GGGAG	2	10	2518980	2518989	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
246	NC_018101	GTACA	2	10	2536261	2536270	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
247	NC_018101	ATTGC	2	10	2538477	2538486	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
248	NC_018101	CAGAG	2	10	2544658	2544667	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
249	NC_018101	CGTTT	2	10	2544680	2544689	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.