MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pyrococcus furiosus COM1 chromosome

Total Repeats: 25918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018092	TTG	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650688
2	NC_018092	AGC	2	6	120	125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
3	NC_018092	CAG	2	6	203	208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
4	NC_018092	ACC	2	6	290	295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650688
5	NC_018092	ACC	2	6	367	372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650688
6	NC_018092	AAG	2	6	373	378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
7	NC_018092	CTA	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
8	NC_018092	CTC	2	6	586	591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650688
9	NC_018092	GAA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
10	NC_018092	GTA	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650688
11	NC_018092	AAG	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
12	NC_018092	TTG	2	6	740	745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650688
13	NC_018092	AAG	2	6	859	864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
14	NC_018092	GAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
15	NC_018092	TTA	2	6	914	919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397650688
16	NC_018092	TGT	2	6	1131	1136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650688
17	NC_018092	CAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
18	NC_018092	TGA	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650688
19	NC_018092	AGA	2	6	1253	1258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
20	NC_018092	TGG	2	6	1284	1289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650688
21	NC_018092	AAG	2	6	1357	1362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
22	NC_018092	TCA	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
23	NC_018092	CAT	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
24	NC_018092	TCC	2	6	1442	1447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650688
25	NC_018092	GTG	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650688
26	NC_018092	AAG	2	6	1633	1638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
27	NC_018092	AAG	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
28	NC_018092	TAC	2	6	1723	1728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
29	NC_018092	AGA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
30	NC_018092	TTA	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397650688
31	NC_018092	TAC	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
32	NC_018092	AGA	2	6	1980	1985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
33	NC_018092	TAC	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
34	NC_018092	CAG	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
35	NC_018092	TGC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397650688
36	NC_018092	CAG	2	6	2222	2227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
37	NC_018092	TTC	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397650688
38	NC_018092	CAA	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650688
39	NC_018092	CAG	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650688
40	NC_018092	ACT	2	6	2362	2367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
41	NC_018092	ACC	2	6	2368	2373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650688
42	NC_018092	ACC	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650688
43	NC_018092	ACT	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650688
44	NC_018092	GGA	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650688
45	NC_018092	TTG	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650688
46	NC_018092	AGT	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650688
47	NC_018092	CTC	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650688
48	NC_018092	AAG	2	6	2524	2529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650688
49	NC_018092	TGC	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018092	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018092	GAT	3	9	2666	2674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018092	TAG	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650689
53	NC_018092	CAA	2	6	2879	2884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650689
54	NC_018092	AAT	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397650689
55	NC_018092	CTG	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397650689
56	NC_018092	GCT	2	6	3155	3160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397650689
57	NC_018092	TGG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650689
58	NC_018092	TCA	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650689
59	NC_018092	TGG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650689
60	NC_018092	GTG	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650689
61	NC_018092	TCA	2	6	3669	3674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650689
62	NC_018092	TAA	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397650689
63	NC_018092	GGT	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018092	AGA	2	6	3831	3836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650690
65	NC_018092	ACC	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650690
66	NC_018092	GTG	2	6	3994	3999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650690
67	NC_018092	GAA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650690
68	NC_018092	ATT	2	6	4074	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397650690
69	NC_018092	ACA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650690
70	NC_018092	ATG	2	6	4102	4107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650690
71	NC_018092	ACA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650690
72	NC_018092	GCG	2	6	4270	4275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397650690
73	NC_018092	GAA	2	6	4510	4515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650690
74	NC_018092	GAT	2	6	4536	4541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650690
75	NC_018092	CAG	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650690
76	NC_018092	GCA	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650690
77	NC_018092	GGA	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650690
78	NC_018092	ATG	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650690
79	NC_018092	GGA	2	6	4758	4763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650690
80	NC_018092	CTG	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397650690
81	NC_018092	AAT	2	6	4907	4912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397650690
82	NC_018092	ATG	2	6	4923	4928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650690
83	NC_018092	TGG	3	9	5094	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650690
84	NC_018092	CCA	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650690
85	NC_018092	GGT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018092	AAG	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
87	NC_018092	GAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
88	NC_018092	AGA	2	6	5457	5462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
89	NC_018092	AGA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
90	NC_018092	CTC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650691
91	NC_018092	CGA	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650691
92	NC_018092	ACA	2	6	5758	5763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650691
93	NC_018092	GTA	2	6	5773	5778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650691
94	NC_018092	TGA	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650691
95	NC_018092	AGA	2	6	5816	5821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650691
96	NC_018092	CTA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650691
97	NC_018092	CCA	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650691
98	NC_018092	GCA	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650691
99	NC_018092	GTT	2	6	6165	6170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650691
100	NC_018092	GGT	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018092	AAG	2	6	6218	6223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650692
102	NC_018092	AAG	2	6	6235	6240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650692
103	NC_018092	AGC	2	6	6318	6323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397650692
104	NC_018092	ACA	3	9	6362	6370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650692
105	NC_018092	TGA	2	6	6381	6386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650692
106	NC_018092	AGG	2	6	6453	6458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650692
107	NC_018092	AGA	3	9	6473	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650692
108	NC_018092	GAT	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650692
109	NC_018092	GAG	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650692
110	NC_018092	GAA	2	6	6903	6908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650692
111	NC_018092	GGC	2	6	6976	6981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397650692
112	NC_018092	CCA	2	6	7064	7069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650692
113	NC_018092	AAG	2	6	7121	7126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650692
114	NC_018092	TTG	2	6	7241	7246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650693
115	NC_018092	CTT	2	6	7255	7260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397650693
116	NC_018092	TAG	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650693
117	NC_018092	AGA	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650693
118	NC_018092	TTA	2	6	7508	7513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397650693
119	NC_018092	TGG	2	6	7692	7697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650693
120	NC_018092	AAT	2	6	7747	7752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397650694
121	NC_018092	AAG	2	6	7774	7779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650694
122	NC_018092	TGA	2	6	7807	7812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650694
123	NC_018092	AGG	2	6	7839	7844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650694
124	NC_018092	TTC	2	6	7946	7951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397650694
125	NC_018092	CTT	2	6	8027	8032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397650694
126	NC_018092	AGT	2	6	8080	8085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650694
127	NC_018092	TGA	2	6	8128	8133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650694
128	NC_018092	GAG	2	6	8222	8227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650694
129	NC_018092	GTT	2	6	8243	8248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397650694
130	NC_018092	AGT	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650694
131	NC_018092	AAT	2	6	8291	8296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_018092	CCA	2	6	26424	26429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397650709
384	NC_018092	TCT	2	6	26455	26460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397650709
385	NC_018092	TCC	2	6	26515	26520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650709
386	NC_018092	CAT	2	6	26540	26545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397650709
387	NC_018092	ACA	2	6	26640	26645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397650709
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390	NC_018092	GAG	2	6	26804	26809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397650709
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394	NC_018092	GAA	3	9	27015	27023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397650710
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428	NC_018092	CTA	2	6	29958	29963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_018092	CTC	2	6	32510	32515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397650714
464	NC_018092	ATT	2	6	32695	32700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397650714
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482	NC_018092	AGG	2	6	33641	33646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_018092	GTG	2	6	34712	34717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397650719
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499	NC_018092	AAT	2	6	35187	35192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397650719
500	NC_018092	AGT	2	6	35193	35198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397650719

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