MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptococcus mutans GS-5 chromosome

Total Repeats: 892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018089	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018089	CTATTC	2	12	1787	1798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648810
3	NC_018089	ATCAAA	2	12	3225	3236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397648811
4	NC_018089	CTTGAC	2	12	7530	7541	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397648814
5	NC_018089	TGCTTA	2	12	8004	8015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397648814
6	NC_018089	AAATTG	2	12	8627	8638	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397648814
7	NC_018089	GATTTT	2	12	9232	9243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397648816
8	NC_018089	TAATGT	2	12	9647	9658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397648818
9	NC_018089	ATAGCT	2	12	11007	11018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648819
10	NC_018089	CAGGAA	2	12	13381	13392	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397648821
11	NC_018089	GGAATA	2	12	14702	14713	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018089	TTTTGG	2	12	15785	15796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648822
13	NC_018089	TTACGT	2	12	19447	19458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018089	GCACAA	2	12	25246	25257	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397648825
15	NC_018089	CAAGCA	2	12	25858	25869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397648825
16	NC_018089	AGCTGT	2	12	26223	26234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397648825
17	NC_018089	TTCAAG	2	12	26294	26305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648825
18	NC_018089	AACAGA	2	12	33227	33238	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397648833
19	NC_018089	GTAGAT	2	12	33516	33527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648833
20	NC_018089	CAGGTG	2	12	33682	33693	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397648833
21	NC_018089	GCAATG	2	12	34078	34089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648833
22	NC_018089	GTTTTG	2	12	38663	38674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648835
23	NC_018089	GCTGGT	2	12	39367	39378	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397648836
24	NC_018089	GGTAAA	2	12	40575	40586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018089	ATGCGG	2	12	41752	41763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397648839
26	NC_018089	ATTTTA	2	12	43061	43072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018089	AATAAA	2	12	45886	45897	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397648844
28	NC_018089	TCCTTA	2	12	50341	50352	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648847
29	NC_018089	ACAGTG	2	12	50928	50939	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648847
30	NC_018089	ACGACA	2	12	51216	51227	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018089	TGCAGG	2	12	51605	51616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397648848
32	NC_018089	CAAGCC	2	12	52834	52845	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397648849
33	NC_018089	GTAATG	2	12	61562	61573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648858
34	NC_018089	TTATGC	2	12	67602	67613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397648864
35	NC_018089	TGGATT	2	12	68601	68612	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018089	AGTCTG	2	12	69068	69079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397648865
37	NC_018089	AATGGA	2	12	76448	76459	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397648871
38	NC_018089	CAAAAA	2	12	78192	78203	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	397648871
39	NC_018089	AAGCTC	2	12	84581	84592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397648875
40	NC_018089	TGATTC	2	12	84666	84677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397648875
41	NC_018089	GCTGAA	2	12	87842	87853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648878
42	NC_018089	AATAAG	2	12	89280	89291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018089	AAAAGC	2	12	91100	91111	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397648882
44	NC_018089	TGAACG	2	12	91979	91990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648883
45	NC_018089	AAATAA	2	12	92829	92840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397648883
46	NC_018089	TGACCT	2	12	95255	95266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397648886
47	NC_018089	CCGTCA	2	12	96425	96436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397648886
48	NC_018089	TAGAAT	2	12	106462	106473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018089	TTTTCC	2	12	119094	119105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648907
50	NC_018089	GTTTGG	2	12	120696	120707	0 %	50 %	50 %	0 %	397648908
51	NC_018089	TGCGTG	2	12	121139	121150	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397648908
52	NC_018089	CTCAGG	2	12	127814	127825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397648912
53	NC_018089	ATGAGA	2	12	128466	128477	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018089	TGACAT	2	12	129308	129319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648913
55	NC_018089	AATTGG	2	12	132541	132552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648915
56	NC_018089	GGCCTA	2	12	132822	132833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397648915
57	NC_018089	CTTGGG	2	12	139741	139752	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397648921
58	NC_018089	GGTGAT	2	12	141006	141017	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397648922
59	NC_018089	GATAAG	2	12	142374	142385	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397648923
60	NC_018089	TATGAT	2	12	142448	142459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397648924
61	NC_018089	GAAGCA	2	12	143117	143128	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397648924
62	NC_018089	CTAATT	2	12	145490	145501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397648927
63	NC_018089	CTTATC	2	12	146122	146133	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648928
64	NC_018089	TTTGGG	2	12	146941	146952	0 %	50 %	50 %	0 %	397648928
65	NC_018089	TTGATT	2	12	147101	147112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397648928
66	NC_018089	AAGATA	2	12	147697	147708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397648929
67	NC_018089	TGAAAC	2	12	148925	148936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397648929
68	NC_018089	TCATAT	2	12	150502	150513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397648930
69	NC_018089	AGAAAA	2	12	152857	152868	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397648934
70	NC_018089	TCTTTT	2	12	154462	154473	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018089	GTTGAT	2	12	156398	156409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397648937
72	NC_018089	ATTGAT	2	12	156479	156490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397648937
73	NC_018089	ATCGTT	2	12	160095	160106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018089	TTTTCT	2	12	163113	163124	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397648945
75	NC_018089	TCTTGT	2	12	165904	165915	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397648948
76	NC_018089	TGTTAT	2	12	167446	167457	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397648951
77	NC_018089	GCACAA	2	12	167756	167767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397648952
78	NC_018089	AATTAC	2	12	168534	168545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397648953
79	NC_018089	TGCTTT	2	12	171503	171514	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397648958
80	NC_018089	ATTGAT	2	12	174176	174187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397648961
81	NC_018089	AGGTGG	2	12	174436	174447	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	397648961
82	NC_018089	TATCCA	2	12	182728	182739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648967
83	NC_018089	TTTAAG	2	12	182888	182899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018089	TTACGT	2	12	185783	185794	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018089	TTCGGG	2	12	189044	189055	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397648969
86	NC_018089	GTTCAT	2	12	194912	194923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397648976
87	NC_018089	GTTAAA	2	12	194975	194986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397648976
88	NC_018089	ACGATG	2	12	199120	199131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648979
89	NC_018089	TAAAAT	2	12	201280	201291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648981
90	NC_018089	GCTGAG	2	12	201308	201319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397648981
91	NC_018089	GTTCAA	2	12	202453	202464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648983
92	NC_018089	AACAAT	2	12	202598	202609	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397648983
93	NC_018089	GTCTAA	2	12	202733	202744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648983
94	NC_018089	CTTGAG	2	12	203110	203121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397648983
95	NC_018089	TAATCT	2	12	205250	205261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018089	TTGATG	2	12	206348	206359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397648986
97	NC_018089	ATCCTT	2	12	208625	208636	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648987
98	NC_018089	CGGAGG	2	12	209707	209718	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	397648987
99	NC_018089	CAATGC	2	12	209920	209931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397648988
100	NC_018089	TTTATA	2	12	215917	215928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648993
101	NC_018089	TAAAGG	2	12	217976	217987	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018089	GGATTG	2	12	225962	225973	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397649002
103	NC_018089	CGATTT	2	12	226711	226722	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018089	TATAGA	2	12	228810	228821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397649005
105	NC_018089	AACACG	2	12	229237	229248	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397649006
106	NC_018089	AAAAAC	2	12	231625	231636	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	397649008
107	NC_018089	CAATTT	2	12	236002	236013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397649010
108	NC_018089	CTTTCT	2	12	236265	236276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397649010
109	NC_018089	TGCAGT	2	12	239400	239411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018089	AAGTTC	2	12	240320	240331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397649013
111	NC_018089	GAAGGA	2	12	243262	243273	50 %	0 %	50 %	0 %	397649017
112	NC_018089	AAATTT	2	12	245415	245426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018089	GATCCT	2	12	247865	247876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397649025
114	NC_018089	AAGAAA	2	12	250107	250118	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397649026
115	NC_018089	TAAACA	2	12	251972	251983	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397649027
116	NC_018089	AATGTT	2	12	253061	253072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018089	GGTGAT	2	12	255139	255150	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397649029
118	NC_018089	GCTTCC	2	12	257590	257601	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397649030
119	NC_018089	ATATTG	2	12	263961	263972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397649036
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231	NC_018089	AAGATG	2	12	506373	506384	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397649278
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468	NC_018089	TAACGA	2	12	1019516	1019527	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397649750
469	NC_018089	ATATCA	2	12	1023238	1023249	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397649753
470	NC_018089	TCTCCT	2	12	1024850	1024861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
471	NC_018089	GAACAA	2	12	1025824	1025835	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397649755
472	NC_018089	TTTCAA	2	12	1025846	1025857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397649755
473	NC_018089	AAATTA	2	12	1027950	1027961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_018089	TTGATG	2	12	1040705	1040716	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397649768
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487	NC_018089	ACCATT	2	12	1063934	1063945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397649790
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