MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus mutans GS-5 chromosome

Total Repeats: 408

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018089	GGAAA	2	10	4662	4671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018089	ATAAA	2	10	8831	8840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018089	GGTAA	2	10	17153	17162	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018089	TCGTG	2	10	17970	17979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018089	GTTAA	2	10	18832	18841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018089	GTGAG	2	10	20329	20338	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018089	CTTTT	2	10	23390	23399	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018089	GATGA	2	10	23655	23664	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018089	TATCT	2	10	26417	26426	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018089	TGAAG	2	10	31826	31835	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018089	CTTTT	2	10	44463	44472	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018089	AGCAA	2	10	44553	44562	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018089	TAAAA	2	10	51183	51192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018089	AAGAT	2	10	58361	58370	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018089	TTATT	2	10	58666	58675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018089	AACTA	2	10	62420	62429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018089	TTGCT	2	10	68730	68739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018089	TAAAA	2	10	70441	70450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018089	AAATT	2	10	84917	84926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018089	GGAAA	2	10	85080	85089	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018089	TTATA	2	10	91364	91373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018089	TCGCT	2	10	93951	93960	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018089	TTGAT	2	10	94148	94157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018089	TTCAA	2	10	96821	96830	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018089	TAGTT	2	10	97199	97208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018089	ATAAA	2	10	97767	97776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018089	TATAA	2	10	98945	98954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018089	ACTTT	2	10	107127	107136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018089	AGTCA	2	10	115512	115521	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018089	AAACT	2	10	115860	115869	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018089	ATTTG	2	10	118044	118053	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018089	AGTAA	2	10	120036	120045	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018089	TTTTA	2	10	124682	124691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018089	TAAAA	2	10	124832	124841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018089	AATAA	2	10	126214	126223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018089	ATTTT	2	10	134334	134343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018089	AAGAA	2	10	150245	150254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018089	CTTAT	2	10	150927	150936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018089	ATGGA	2	10	151506	151515	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018089	TATAT	2	10	151895	151904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018089	TAATA	2	10	153549	153558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018089	TAAAA	2	10	153600	153609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018089	GAATA	2	10	158325	158334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018089	TCTAT	2	10	163696	163705	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018089	TAGAA	2	10	163709	163718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018089	ATTTA	2	10	163780	163789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018089	ATTTT	2	10	165636	165645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018089	AGGAA	2	10	165718	165727	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018089	ATAAA	2	10	168356	168365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018089	GGTAA	2	10	183489	183498	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018089	TCGTG	2	10	184306	184315	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018089	GTTAA	2	10	185168	185177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018089	GTGAG	2	10	186665	186674	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018089	CTTTT	2	10	188517	188526	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018089	CAGTT	2	10	192382	192391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018089	TTCCA	2	10	204149	204158	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018089	TCTTT	2	10	205190	205199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018089	ATAAA	2	10	207801	207810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018089	AAGTA	2	10	209754	209763	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018089	AGAGA	2	10	220493	220502	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018089	TAAAA	2	10	220655	220664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018089	AGCTG	2	10	226408	226417	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018089	ATTTT	2	10	227675	227684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018089	CTTAT	2	10	252920	252929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018089	CTTAT	2	10	252996	253005	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018089	AATAA	2	10	253007	253016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018089	ATAAA	2	10	266949	266958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018089	CAAAG	2	10	278897	278906	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018089	AAGGG	2	10	280652	280661	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018089	AAATA	2	10	280705	280714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018089	TAAAT	2	10	284399	284408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018089	TAAGA	2	10	291259	291268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018089	AAAAG	2	10	294073	294082	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018089	AAGGA	2	10	304991	305000	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018089	TTATA	2	10	305335	305344	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018089	AAACA	2	10	311965	311974	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018089	AATTT	2	10	318413	318422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018089	CTAAT	2	10	336429	336438	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018089	TAACA	2	10	336597	336606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018089	GAAAG	2	10	350387	350396	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018089	AAGAA	2	10	358210	358219	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018089	GCAGT	2	10	358952	358961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018089	TAAAC	2	10	366288	366297	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018089	ATTTT	2	10	371928	371937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018089	TGCGA	2	10	386605	386614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018089	TATAA	2	10	401843	401852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018089	GTGTT	2	10	407773	407782	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018089	GAAGT	2	10	409992	410001	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018089	CTTTA	2	10	414902	414911	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018089	ATCAT	2	10	432549	432558	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018089	CTTTT	2	10	444352	444361	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018089	ACTTT	2	10	452787	452796	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018089	AAAAG	2	10	453943	453952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018089	TATTT	2	10	461524	461533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018089	CTTTT	2	10	462216	462225	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018089	AAATG	2	10	462268	462277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018089	TAAAA	2	10	462409	462418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018089	TCATT	2	10	465226	465235	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018089	ATTGA	2	10	473344	473353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018089	ATTGA	2	10	476170	476179	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018089	TAAAA	2	10	478521	478530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018089	GTTTA	2	10	486630	486639	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018089	TTTGA	2	10	496673	496682	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018089	CCTTT	2	10	512244	512253	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018089	ATTAT	2	10	512388	512397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018089	TCTTT	2	10	515903	515912	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018089	TAATA	2	10	520892	520901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018089	TTTTA	2	10	531408	531417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018089	AGGTT	2	10	531469	531478	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018089	TTTTG	2	10	537136	537145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018089	AGAAA	2	10	537286	537295	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018089	CCTTT	2	10	544116	544125	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018089	TAAAA	2	10	544212	544221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018089	ATAAA	2	10	545169	545178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018089	TTTTA	2	10	550049	550058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018089	TGAAT	2	10	552639	552648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018089	TTGGT	2	10	557338	557347	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018089	CAAAT	2	10	559850	559859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018089	ACATT	2	10	564629	564638	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018089	AATAA	2	10	567800	567809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018089	TGATT	2	10	568792	568801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018089	AAAAG	2	10	569433	569442	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018089	TCGCT	2	10	569738	569747	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018089	TTGCC	2	10	583983	583992	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_018089	TGATA	2	10	591718	591727	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018089	GAAAG	2	10	599657	599666	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018089	GAAAA	2	10	608145	608154	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018089	TTTAT	2	10	611087	611096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018089	TTTGT	2	10	611275	611284	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018089	ATAAA	2	10	612565	612574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018089	ACATA	2	10	621428	621437	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018089	ACTTT	2	10	630180	630189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018089	TTTAA	2	10	631878	631887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018089	CTTTG	2	10	631960	631969	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018089	TCATT	2	10	632084	632093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018089	TCGCT	2	10	632205	632214	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018089	ACTTG	2	10	632374	632383	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018089	GATGA	2	10	634440	634449	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018089	GTATT	2	10	635689	635698	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018089	CAGGT	2	10	657702	657711	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_018089	TGATA	2	10	658783	658792	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018089	GATAA	2	10	663213	663222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018089	TTCAT	2	10	665656	665665	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018089	TATCA	2	10	665717	665726	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018089	GGTCT	2	10	677224	677233	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018089	AGTAG	2	10	680506	680515	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018089	AGATT	2	10	681200	681209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018089	ATGCT	2	10	683370	683379	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.