MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus mutans GS-5 chromosome

Total Repeats: 28694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018089	ATC	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018089	TTA	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018089	ATT	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648809
4	NC_018089	CTT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648809
5	NC_018089	GAT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648809
6	NC_018089	TGT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648809
7	NC_018089	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648809
8	NC_018089	TGA	2	6	565	570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648809
9	NC_018089	AAC	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648809
10	NC_018089	GGA	2	6	647	652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397648809
11	NC_018089	TTA	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648809
12	NC_018089	TGT	2	6	763	768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648809
13	NC_018089	AGA	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648809
14	NC_018089	TGA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648809
15	NC_018089	AAG	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648809
16	NC_018089	ATA	3	9	915	923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648809
17	NC_018089	CCT	2	6	1025	1030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397648809
18	NC_018089	TTA	2	6	1200	1205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648809
19	NC_018089	GCA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648809
20	NC_018089	GAT	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648809
21	NC_018089	TAA	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648809
22	NC_018089	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018089	TGA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018089	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018089	ACT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018089	TTA	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018089	TAA	2	6	1725	1730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648810
28	NC_018089	GAA	3	9	1888	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648810
29	NC_018089	CTT	2	6	1916	1921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648810
30	NC_018089	TTA	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648810
31	NC_018089	GAA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648810
32	NC_018089	AAC	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648810
33	NC_018089	GTT	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648810
34	NC_018089	AAT	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648810
35	NC_018089	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648810
36	NC_018089	TGC	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397648810
37	NC_018089	GAT	2	6	2296	2301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648810
38	NC_018089	GTC	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397648810
39	NC_018089	GAT	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648810
40	NC_018089	TTG	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648810
41	NC_018089	CAA	2	6	2592	2597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648810
42	NC_018089	GAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648810
43	NC_018089	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018089	GTT	2	6	2864	2869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018089	GCT	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018089	GAC	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648811
47	NC_018089	TTG	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648811
48	NC_018089	ATG	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648811
49	NC_018089	GCC	2	6	3268	3273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397648811
50	NC_018089	TAT	2	6	3375	3380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018089	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648812
52	NC_018089	CAA	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648812
53	NC_018089	TGT	2	6	3777	3782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648812
54	NC_018089	ATG	2	6	3794	3799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648812
55	NC_018089	TTG	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648812
56	NC_018089	TAA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648812
57	NC_018089	TTC	2	6	3977	3982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648812
58	NC_018089	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648812
59	NC_018089	TGA	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648812
60	NC_018089	CAA	2	6	4153	4158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648812
61	NC_018089	GCA	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648812
62	NC_018089	GTT	3	9	4192	4200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648812
63	NC_018089	GAA	3	9	4216	4224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648812
64	NC_018089	TGA	3	9	4236	4244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648812
65	NC_018089	TTG	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648812
66	NC_018089	CAC	2	6	4397	4402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397648812
67	NC_018089	ATG	2	6	4466	4471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648812
68	NC_018089	AAG	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648812
69	NC_018089	GAA	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648812
70	NC_018089	CTT	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018089	TTG	2	6	4687	4692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648813
72	NC_018089	CAG	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648813
73	NC_018089	TTA	2	6	4828	4833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648813
74	NC_018089	TTA	2	6	4910	4915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648813
75	NC_018089	GAT	2	6	4950	4955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648813
76	NC_018089	CTG	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397648813
77	NC_018089	AGA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648813
78	NC_018089	CTA	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648814
79	NC_018089	AGC	2	6	5364	5369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
80	NC_018089	AGC	2	6	5378	5383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
81	NC_018089	GAA	2	6	5467	5472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
82	NC_018089	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
83	NC_018089	GCA	3	9	5500	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
84	NC_018089	TTG	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648814
85	NC_018089	AGC	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
86	NC_018089	GAA	2	6	5677	5682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
87	NC_018089	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
88	NC_018089	TGA	2	6	5919	5924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
89	NC_018089	ATC	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648814
90	NC_018089	TTA	2	6	5981	5986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648814
91	NC_018089	TCA	2	6	6051	6056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648814
92	NC_018089	GAT	2	6	6142	6147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
93	NC_018089	ATT	2	6	6157	6162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648814
94	NC_018089	AGA	2	6	6207	6212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
95	NC_018089	TAA	2	6	6255	6260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648814
96	NC_018089	TGA	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
97	NC_018089	CAG	2	6	6460	6465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
98	NC_018089	TGA	2	6	6594	6599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
99	NC_018089	CGT	3	9	6655	6663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397648814
100	NC_018089	TGT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648814
101	NC_018089	ATT	2	6	6797	6802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648814
102	NC_018089	ATG	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
103	NC_018089	TGA	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
104	NC_018089	TGA	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
105	NC_018089	GAA	2	6	7048	7053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
106	NC_018089	AAG	2	6	7106	7111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
107	NC_018089	TCT	2	6	7149	7154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648814
108	NC_018089	GCT	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397648814
109	NC_018089	ATG	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
110	NC_018089	CAA	2	6	7247	7252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648814
111	NC_018089	ATG	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
112	NC_018089	ATT	2	6	7396	7401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648814
113	NC_018089	TGA	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
114	NC_018089	TAT	2	6	7680	7685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648814
115	NC_018089	ACA	2	6	7724	7729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648814
116	NC_018089	GTG	2	6	7853	7858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397648814
117	NC_018089	ACA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648814
118	NC_018089	ATC	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648814
119	NC_018089	GTG	2	6	8135	8140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397648814
120	NC_018089	TTA	2	6	8209	8214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648814
121	NC_018089	GAA	2	6	8215	8220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
122	NC_018089	GCA	2	6	8227	8232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
123	NC_018089	TGA	2	6	8319	8324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
124	NC_018089	GAT	2	6	8476	8481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
125	NC_018089	AGT	3	9	8517	8525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
126	NC_018089	ATT	2	6	8567	8572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648814
127	NC_018089	AGA	2	6	8676	8681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
128	NC_018089	GAA	2	6	8706	8711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
129	NC_018089	TTA	2	6	8738	8743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018089	TGT	2	6	8785	8790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018089	TAT	2	6	8895	8900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648815
132	NC_018089	TAA	2	6	9018	9023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648815
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