MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus hirae ATCC 9790 chromosome

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018081	ATCAGC	2	12	43	54	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018081	GCATCA	2	12	71	82	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018081	TCAGCA	2	12	92	103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018081	TCAGCA	2	12	110	121	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018081	GCGTCA	2	12	143	154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018081	TCAGCA	3	18	170	187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018081	GGTTAA	2	12	1077	1088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018081	TAAAAA	2	12	1801	1812	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018081	CATTCT	2	12	10817	10828	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018081	AAATGT	2	12	11596	11607	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018081	TATTTT	2	12	27172	27183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018081	GGCAAA	2	12	58627	58638	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018081	ATAAAA	2	12	104867	104878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018081	ATTAAT	2	12	106242	106253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018081	TTGAAA	2	12	106427	106438	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018081	ATTATA	2	12	106875	106886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018081	TTTGTT	2	12	106910	106921	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018081	TTAAAT	2	12	134540	134551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018081	TAATGT	2	12	136652	136663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018081	ATAAAA	2	12	137984	137995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018081	TTTTTG	2	12	148720	148731	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018081	TAGACT	2	12	155566	155577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018081	GGTTTT	2	12	159073	159084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018081	ACTGCT	2	12	175376	175387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018081	AATACA	2	12	192387	192398	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018081	TATTCA	2	12	192453	192464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018081	ATCTTG	2	12	217239	217250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018081	ATTCTA	2	12	229209	229220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018081	ACAAAA	2	12	240237	240248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018081	TTTCTA	2	12	276183	276194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018081	GAAAAC	2	12	278211	278222	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018081	AAAAAC	2	12	300421	300432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018081	TTATCA	2	12	309462	309473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018081	GGTTTC	2	12	320628	320639	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018081	CATTTT	2	12	326508	326519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018081	AACTGC	2	12	334281	334292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018081	CTATTT	2	12	359684	359695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018081	ATAACA	2	12	359808	359819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018081	AGAATA	2	12	372758	372769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018081	GATTGT	2	12	381073	381084	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018081	AAGATA	2	12	390644	390655	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018081	CAAAAG	2	12	399516	399527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018081	TTGAAT	2	12	408945	408956	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018081	ATCCCA	2	12	438341	438352	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018081	ACCTAA	2	12	457376	457387	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018081	TAAATA	2	12	468980	468991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018081	ATAAAA	2	12	473490	473501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018081	AAATAT	2	12	495704	495715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018081	TAAAAA	2	12	496061	496072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018081	CAAAAA	2	12	497082	497093	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018081	TGAGCC	2	12	522207	522218	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018081	CTTCTA	2	12	542205	542216	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018081	TAATCA	2	12	578676	578687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018081	TTTGCT	2	12	584411	584422	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018081	GTTTAT	2	12	594554	594565	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018081	CTTTTA	2	12	599684	599695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018081	AAAAGA	2	12	606235	606246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018081	AAAGGA	2	12	609026	609037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018081	TGTATT	2	12	650832	650843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018081	ACTTCT	2	12	651118	651129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018081	ATAAAA	2	12	701335	701346	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018081	ACTTTT	2	12	729995	730006	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018081	TTTCAT	2	12	781972	781983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018081	TATTCT	2	12	783205	783216	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018081	ATTTGA	2	12	792685	792696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018081	GACCGT	2	12	800988	800999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018081	ACTTAT	2	12	812474	812485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018081	GGATAC	2	12	826441	826452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018081	TTTTTA	2	12	835774	835785	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018081	ATATGA	2	12	836038	836049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018081	TGTTAC	2	12	837428	837439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018081	CTTTTT	2	12	840606	840617	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018081	TAATAC	2	12	875485	875496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018081	GATCCT	2	12	894008	894019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018081	TTTTCG	2	12	896106	896117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018081	GTGTTT	2	12	931969	931980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018081	AATAAA	2	12	955923	955934	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018081	GTTATT	2	12	959146	959157	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018081	AGTAAT	2	12	962607	962618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018081	TTATTT	2	12	976963	976974	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018081	GAAAAA	2	12	998471	998482	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018081	TATTTT	2	12	1020410	1020421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018081	AAAATC	2	12	1031071	1031082	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018081	AGTAAA	2	12	1031769	1031780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018081	AGCAAA	2	12	1032226	1032237	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018081	TACCAA	2	12	1032543	1032554	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018081	TTTAAT	2	12	1035348	1035359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018081	ATATTC	2	12	1065241	1065252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018081	TGATAG	2	12	1102263	1102274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018081	AAATGA	2	12	1105263	1105274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018081	GCTAGG	2	12	1132752	1132763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018081	TTATTT	2	12	1155000	1155011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018081	ACAAGG	2	12	1159859	1159870	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018081	GCATTT	2	12	1159899	1159910	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018081	TTTTTA	2	12	1175704	1175715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018081	GCCAAA	2	12	1199278	1199289	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018081	AAAAAT	2	12	1203144	1203155	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018081	AGAAAA	2	12	1203346	1203357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018081	GATTTT	2	12	1235409	1235420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018081	AAGATA	2	12	1238397	1238408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018081	TGACAG	2	12	1242728	1242739	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018081	TTTATC	2	12	1252568	1252579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018081	TCTGAT	2	12	1268693	1268704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018081	ATTGCA	2	12	1278817	1278828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018081	AAGCAA	2	12	1294421	1294432	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018081	TTTTCT	2	12	1300851	1300862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018081	TAAAAT	2	12	1307692	1307703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018081	AATAGA	2	12	1321884	1321895	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018081	AAATTA	2	12	1340847	1340858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018081	ATGGAA	2	12	1356500	1356511	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018081	TACATT	2	12	1385191	1385202	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018081	AAAAGA	2	12	1408232	1408243	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018081	TGATAA	2	12	1432251	1432262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018081	AATAGT	2	12	1432264	1432275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018081	TAAACA	2	12	1442955	1442966	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018081	GACATA	2	12	1481109	1481120	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018081	TAAAAT	2	12	1481471	1481482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018081	AAAATA	2	12	1552957	1552968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018081	ATTTTC	2	12	1566826	1566837	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018081	TTTCTG	2	12	1571020	1571031	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018081	ATGTTA	2	12	1571140	1571151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018081	GAAATC	2	12	1575865	1575876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018081	TATAAA	2	12	1620305	1620316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018081	TGGAAA	2	12	1624595	1624606	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018081	TACTAA	2	12	1672039	1672050	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018081	TCCTTC	2	12	1695751	1695762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018081	GCTGAA	2	12	1699350	1699361	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018081	TTCTTT	2	12	1723563	1723574	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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221	NC_018081	CAGCAT	28	168	2827189	2827356	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
222	NC_018081	CATCAG	58	348	2827360	2827707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.