MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterobacter cloacae subsp. dissolvens SDM chromosome

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018079	AAACGG	2	12	51735	51746	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018079	AGCGGC	2	12	60256	60267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018079	CGCCAG	2	12	113560	113571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018079	CACGAT	2	12	132310	132321	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018079	TCTCCC	2	12	196193	196204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018079	CTCCCT	2	12	196234	196245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018079	CTCCCT	2	12	203025	203036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018079	GTTGTG	2	12	223293	223304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018079	TCTCCC	2	12	288044	288055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018079	AGCGCC	2	12	305094	305105	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018079	GTCTTT	2	12	339077	339088	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018079	AGGGAG	2	12	347660	347671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018079	TCTCCC	2	12	373739	373750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018079	ATTTTA	2	12	391208	391219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018079	TCTCCC	2	12	456814	456825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018079	TGTTTC	2	12	474414	474425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018079	CCGTCC	2	12	486266	486277	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018079	AGGGAG	2	12	525456	525467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018079	TCTCCC	2	12	533963	533974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018079	GATCCC	2	12	553220	553231	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018079	GGGAGA	2	12	565504	565515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018079	CTCCCT	2	12	575976	575987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018079	AAGGAT	2	12	578442	578453	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018079	ATGATA	2	12	620444	620455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018079	TCTCCC	2	12	623681	623692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018079	GGGAGA	2	12	631909	631920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018079	TTCACA	2	12	680380	680391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018079	AATGAT	2	12	682853	682864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018079	AAATAA	2	12	683925	683936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018079	TGGCGC	2	12	684978	684989	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018079	TCATTA	2	12	715421	715432	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018079	GCATCA	2	12	716528	716539	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018079	TTAACC	2	12	734439	734450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018079	AGGGAG	2	12	845794	845805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018079	AGGGAG	2	12	866995	867006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018079	CTCCCT	2	12	875829	875840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018079	GCAGTA	2	12	878796	878807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018079	AGGGAG	2	12	879208	879219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018079	CCATGT	2	12	1010660	1010671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018079	ATACCG	2	12	1011641	1011652	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018079	ACCGCT	2	12	1027893	1027904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018079	TTCATT	2	12	1028214	1028225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018079	ACCAGC	2	12	1057065	1057076	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018079	GCCTGT	2	12	1075324	1075335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018079	AGCGCC	2	12	1078743	1078754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018079	CAGTGA	2	12	1079663	1079674	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018079	CAGCGT	2	12	1080232	1080243	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018079	GCATGA	2	12	1080831	1080842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018079	CAGCCG	2	12	1088526	1088537	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018079	AAATGT	2	12	1100412	1100423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018079	TCTCCC	2	12	1169306	1169317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018079	GGGGAA	2	12	1200236	1200247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018079	TGTCGC	2	12	1202214	1202225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018079	TCATCC	2	12	1217469	1217480	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018079	TCTCCC	2	12	1233564	1233575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018079	TACTGG	2	12	1241461	1241472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018079	GGATTT	2	12	1296307	1296318	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018079	TGCAAA	2	12	1305854	1305865	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018079	AGGGAG	2	12	1311624	1311635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018079	CTGCAC	2	12	1347824	1347835	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018079	ATGCTG	2	12	1354071	1354082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018079	TGTTTA	2	12	1355772	1355783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018079	ATTTGT	2	12	1414845	1414856	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018079	GCCGTG	2	12	1448454	1448465	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018079	TCTCCC	2	12	1468267	1468278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018079	AAAATG	2	12	1475071	1475082	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018079	TCTCCC	2	12	1537759	1537770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018079	TCTCCC	2	12	1541927	1541938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018079	CTCCCT	2	12	1605511	1605522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018079	TGGCGC	2	12	1611483	1611494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018079	AGGGAG	2	12	1615340	1615351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018079	TCTCCC	2	12	1625493	1625504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018079	ATTATA	2	12	1722362	1722373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018079	AAATAT	2	12	1722605	1722616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018079	ATATTT	2	12	1724024	1724035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018079	TGAAAA	2	12	1809432	1809443	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018079	ATTGTT	2	12	1826748	1826759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018079	AAATGC	2	12	1872724	1872735	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018079	CTGGCG	2	12	1890835	1890846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018079	TTTAAA	2	12	1909612	1909623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018079	AGGGAG	2	12	1937805	1937816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018079	AACCTG	2	12	2023741	2023752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018079	AGTCTT	2	12	2046845	2046856	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018079	CCAGGA	2	12	2087719	2087730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018079	TAACCT	2	12	2117780	2117791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018079	GAAAAG	2	12	2174843	2174854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018079	AACACA	2	12	2224770	2224781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018079	TTCGTC	2	12	2257943	2257954	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018079	AATTTG	2	12	2263570	2263581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018079	GATGCT	2	12	2265636	2265647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018079	CGTTAA	2	12	2307752	2307763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018079	TCTCCC	2	12	2313936	2313947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018079	GCCAAT	2	12	2325993	2326004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018079	ATTGAT	2	12	2354890	2354901	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018079	TCATAT	2	12	2379260	2379271	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018079	CCCTTT	2	12	2387526	2387537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018079	ATGCTT	2	12	2410417	2410428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018079	AAAATG	2	12	2522205	2522216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018079	ACCTGC	2	12	2523688	2523699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018079	ATCAGG	2	12	2541979	2541990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018079	ATATAA	2	12	2548430	2548441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018079	CTCCAT	2	12	2697397	2697408	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018079	TATTGT	2	12	2713831	2713842	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018079	TTAAAA	2	12	2804167	2804178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018079	ATTTTT	2	12	2816366	2816377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018079	ATTTAC	2	12	2856916	2856927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018079	ACCTTG	2	12	2859387	2859398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018079	GGTGAA	2	12	2895346	2895357	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018079	GCGCTT	2	12	2911550	2911561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018079	CAATAT	2	12	2917767	2917778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018079	ATAAAA	2	12	2959786	2959797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018079	TTTCTG	2	12	3014273	3014284	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018079	AGGGAG	2	12	3031554	3031565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018079	ACAAAT	2	12	3044739	3044750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018079	TATAAA	2	12	3048931	3048942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018079	GAAATA	2	12	3142512	3142523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018079	TTTTGC	2	12	3185612	3185623	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018079	GATTCG	2	12	3207264	3207275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018079	AGGGAG	2	12	3257238	3257249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018079	GCATTT	2	12	3290039	3290050	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018079	TCTCCC	2	12	3315603	3315614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018079	AGGGAG	2	12	3328537	3328548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018079	AGTGAA	2	12	3349091	3349102	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018079	GAAAGT	2	12	3353548	3353559	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018079	AAGACA	2	12	3354642	3354653	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.