MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018078	ACCGCG	2	12	31190	31201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018078	TCGGCT	2	12	61864	61875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018078	CGTCGG	2	12	66837	66848	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018078	CAACGG	2	12	76359	76370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018078	TCACCT	2	12	80525	80536	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018078	GCGGTG	2	12	104873	104884	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018078	CTCGGT	2	12	149505	149516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018078	GCCGCG	2	12	180869	180880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018078	ACAGCC	2	12	218417	218428	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018078	CCCCGA	2	12	293570	293581	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018078	AGATTC	2	12	330302	330313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018078	GGTCGC	2	12	344927	344938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018078	CGACGG	2	12	535346	535357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018078	ATAGTC	2	12	543232	543243	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018078	ACCAGT	2	12	591235	591246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018078	CGCCGT	2	12	720236	720247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018078	CGCGGG	2	12	830827	830838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018078	TACGGG	2	12	861200	861211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018078	AGTCGT	2	12	861222	861233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018078	CCGGCG	2	12	864363	864374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018078	ACCGGG	2	12	871084	871095	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018078	GCGGCC	2	12	907975	907986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018078	ACAGCA	2	12	909348	909359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018078	CTGGGT	2	12	924187	924198	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018078	CTGGTG	2	12	936761	936772	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018078	CAACGG	2	12	956369	956380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018078	GTTGGT	2	12	978067	978078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018078	TGTACA	2	12	983416	983427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018078	CGGCAT	2	12	998674	998685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018078	CGGTCA	2	12	1020862	1020873	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018078	CCTACG	2	12	1032614	1032625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018078	TTCGGA	2	12	1087537	1087548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018078	CCGGCC	2	12	1100386	1100397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018078	GTGGCG	2	12	1106085	1106096	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018078	CGGTGT	2	12	1117059	1117070	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018078	CGGCGA	2	12	1122105	1122116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018078	CGGCGA	2	12	1122162	1122173	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018078	CCGAAC	2	12	1184258	1184269	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018078	CGACGT	2	12	1185290	1185301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018078	GTGATG	2	12	1229146	1229157	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018078	GTCGAT	2	12	1291954	1291965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018078	GCAACG	2	12	1313588	1313599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018078	TGCCGG	2	12	1335961	1335972	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018078	AATATG	2	12	1400038	1400049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018078	CACACC	2	12	1451287	1451298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018078	CCCGAA	2	12	1453862	1453873	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018078	CTTCCG	2	12	1460616	1460627	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018078	GGCGCC	2	12	1468085	1468096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018078	CAACGG	2	12	1487773	1487784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018078	CAATAC	2	12	1497709	1497720	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018078	TCGGGC	2	12	1536146	1536157	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018078	CCGTCG	2	12	1543241	1543252	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018078	GGGTGC	2	12	1591522	1591533	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018078	GTTTGA	2	12	1620820	1620831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018078	GTGGCG	2	12	1622573	1622584	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018078	TGCCGG	2	12	1680759	1680770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018078	CACGTG	2	12	1698422	1698433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018078	TGCGGT	2	12	1784491	1784502	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018078	TGGGCG	2	12	1819798	1819809	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018078	CCGACG	2	12	1924327	1924338	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018078	GGTTGG	2	12	1959873	1959884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018078	CAGCGG	2	12	1985099	1985110	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018078	GGTTGA	2	12	2005701	2005712	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018078	TTCTAT	2	12	2049576	2049587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018078	CGGCCG	2	12	2076877	2076888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018078	GGTGGG	2	12	2077053	2077064	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018078	TGTTGG	2	12	2077097	2077108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018078	TGTTGG	2	12	2077175	2077186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018078	AGTGCA	2	12	2077981	2077992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018078	CGAACT	2	12	2122717	2122728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018078	CCGCGA	2	12	2123980	2123991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018078	CGGAGC	2	12	2159777	2159788	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018078	CTGCGG	2	12	2189091	2189102	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018078	CAACCG	2	12	2191997	2192008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018078	GCTCGC	2	12	2246413	2246424	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018078	CCCAGC	2	12	2277859	2277870	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018078	CCCTCT	2	12	2346963	2346974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018078	AGCCGA	2	12	2367087	2367098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018078	GACGGC	2	12	2369334	2369345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018078	ATCACC	2	12	2382355	2382366	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018078	GGTTGT	2	12	2425432	2425443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018078	TGCGGT	2	12	2493484	2493495	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018078	ACCGCT	2	12	2495420	2495431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018078	TCGGCG	2	12	2504752	2504763	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018078	CTCGTC	2	12	2511819	2511830	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018078	CCGCGG	2	12	2522526	2522537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018078	GTGCTG	2	12	2574259	2574270	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018078	GGCGCC	2	12	2586251	2586262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018078	GCACTC	2	12	2632476	2632487	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018078	AGGGGC	2	12	2775144	2775155	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018078	AGGGGC	2	12	2778734	2778745	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018078	TGAATA	2	12	2852072	2852083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018078	CGGCCG	2	12	2861049	2861060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018078	GCGCGT	2	12	2887101	2887112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018078	ACCCAC	2	12	2937142	2937153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018078	ACTCGG	2	12	2992229	2992240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018078	GCACCG	2	12	3028895	3028906	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018078	CGTTGC	2	12	3066655	3066666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018078	TGGCCT	2	12	3070759	3070770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018078	CTCGTC	2	12	3129055	3129066	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018078	ACTACC	2	12	3150968	3150979	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018078	GGCTCG	2	12	3152040	3152051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018078	GTAACT	2	12	3189993	3190004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018078	CGACGG	2	12	3211592	3211603	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018078	GTGCCG	2	12	3212014	3212025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018078	ATGGCT	2	12	3215463	3215474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018078	ACGGAA	2	12	3249233	3249244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018078	CACCAA	2	12	3259926	3259937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018078	CAGCCG	2	12	3269523	3269534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018078	CTTGGT	2	12	3270945	3270956	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018078	TCGGAC	2	12	3271410	3271421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018078	GCCCGC	2	12	3271992	3272003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018078	GGCATT	2	12	3288060	3288071	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018078	TGCGCC	2	12	3317248	3317259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018078	CGGCGC	2	12	3359044	3359055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018078	GCAGTC	2	12	3377907	3377918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018078	CCGTTG	2	12	3382362	3382373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018078	AACCCG	2	12	3446151	3446162	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018078	GCTCCT	2	12	3488356	3488367	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018078	TCCGCT	2	12	3548947	3548958	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018078	GCCTCC	2	12	3639477	3639488	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018078	TGTCGA	2	12	3699660	3699671	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018078	TGCCGC	2	12	3735121	3735132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018078	GCGCAG	2	12	3775391	3775402	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018078	TGTACA	2	12	3794738	3794749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018078	TCCTCT	2	12	3871008	3871019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018078	TCGGAG	2	12	3895287	3895298	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018078	CCGCTC	2	12	3899316	3899327	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_018078	CGTTGG	2	12	3911956	3911967	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_018078	CGGCCG	2	12	3916096	3916107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018078	GGCGAG	2	12	4098372	4098383	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_018078	GCGCCG	2	12	4138832	4138843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018078	TGGCGG	2	12	4186943	4186954	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_018078	CTGCGG	2	12	4209626	4209637	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018078	AACGCG	2	12	4210336	4210347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018078	CTCATC	2	12	4254484	4254495	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018078	GGGTTG	2	12	4311749	4311760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.