MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 1051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018078	CCGA	2	8	1826	1833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018078	GCAC	2	8	11709	11716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018078	GCCC	2	8	12554	12561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_018078	ATTC	2	8	13792	13799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018078	TCAA	2	8	25615	25622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018078	GAGC	2	8	25643	25650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018078	GGCC	2	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018078	ACCA	2	8	31225	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018078	GCTA	2	8	33956	33963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018078	CTAC	2	8	47321	47328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018078	CTGG	2	8	52818	52825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018078	CAGC	2	8	61621	61628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018078	TGGC	3	12	62249	62260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018078	CGGT	2	8	79308	79315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018078	CGGT	2	8	79493	79500	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018078	CTGG	2	8	87329	87336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018078	CGCA	2	8	89630	89637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018078	CGCT	2	8	97760	97767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018078	CCTG	2	8	97807	97814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018078	GCGA	2	8	97851	97858	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018078	ACCG	2	8	99574	99581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018078	ATCC	2	8	125709	125716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018078	GCGA	2	8	130797	130804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018078	CGGG	2	8	130840	130847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018078	GCTC	2	8	131352	131359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018078	CGGG	2	8	134064	134071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018078	TTCT	2	8	139980	139987	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018078	ACGC	2	8	140052	140059	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018078	GGGC	2	8	140144	140151	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018078	AGCA	2	8	141224	141231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018078	GCCG	2	8	144030	144037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018078	GCGT	2	8	148574	148581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018078	GCCG	2	8	152548	152555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018078	CCGG	2	8	155861	155868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018078	GCGT	3	12	155889	155900	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018078	GGCT	2	8	158035	158042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018078	CGCA	2	8	158061	158068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018078	TCGT	2	8	161752	161759	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018078	CCGG	2	8	161760	161767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018078	CCCG	2	8	161972	161979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_018078	ACTT	2	8	171449	171456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018078	TTGA	2	8	186659	186666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018078	CTGG	2	8	196644	196651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018078	CTGT	2	8	212196	212203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018078	GGCC	2	8	218284	218291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018078	CGGT	2	8	218620	218627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018078	GATG	2	8	219367	219374	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018078	AACT	2	8	230562	230569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018078	GGAA	2	8	230737	230744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018078	ACGT	2	8	231489	231496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018078	ACAT	2	8	231556	231563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018078	GTGC	2	8	241269	241276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018078	GAAC	2	8	248956	248963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018078	CGCA	2	8	253565	253572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018078	GACG	2	8	255974	255981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018078	GCGG	2	8	272855	272862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018078	CGGC	2	8	274221	274228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018078	TAGA	2	8	288330	288337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018078	ACTT	2	8	292035	292042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018078	TCGT	2	8	293661	293668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018078	AACT	2	8	295711	295718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018078	AACC	2	8	295719	295726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018078	ATGC	2	8	296709	296716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018078	GACG	2	8	302027	302034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018078	TTGC	2	8	309667	309674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018078	GGTC	2	8	309839	309846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018078	GGTA	2	8	336301	336308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018078	GCCG	2	8	336388	336395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018078	TGGC	2	8	336400	336407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018078	GCCG	2	8	339377	339384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018078	TGGC	2	8	339389	339396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018078	CTGT	2	8	367374	367381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018078	AATC	2	8	378644	378651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018078	GGCC	2	8	389004	389011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018078	AAGG	2	8	390020	390027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018078	TGAC	2	8	398989	398996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018078	GTCA	2	8	399000	399007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018078	ATCG	2	8	419971	419978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018078	GCCA	2	8	420062	420069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018078	GTCC	2	8	420088	420095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018078	ACGG	2	8	420174	420181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018078	GAGC	2	8	426956	426963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018078	GAGC	2	8	427007	427014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018078	GAGC	2	8	427058	427065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018078	TCCG	2	8	456150	456157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018078	GGAT	2	8	468433	468440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018078	CGAG	2	8	468576	468583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018078	CAAC	2	8	480525	480532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018078	AGAA	2	8	491032	491039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018078	ACCG	2	8	505288	505295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018078	CGGG	2	8	505325	505332	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018078	GAGG	2	8	507281	507288	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018078	GCGT	2	8	507367	507374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018078	ACGG	2	8	510617	510624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018078	GATG	2	8	515591	515598	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018078	CTGA	2	8	516215	516222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018078	GCTG	2	8	521724	521731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018078	CCGT	2	8	528769	528776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018078	CGGC	2	8	534081	534088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018078	AGGT	2	8	534829	534836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018078	CGGC	2	8	538824	538831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018078	GACG	2	8	538834	538841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018078	GTCT	2	8	546139	546146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018078	CCGG	2	8	561075	561082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018078	AGCA	2	8	565219	565226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018078	CGAC	2	8	565889	565896	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018078	CGCC	2	8	577779	577786	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_018078	GCAT	2	8	577862	577869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018078	GTTT	2	8	586572	586579	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018078	GCCG	2	8	591586	591593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018078	GCTA	2	8	596888	596895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018078	GCGT	2	8	604774	604781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018078	CCGA	2	8	604799	604806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018078	CCGA	2	8	608802	608809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018078	GTCC	2	8	611357	611364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018078	GCCC	2	8	625857	625864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_018078	AGCC	2	8	630338	630345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018078	CCGG	2	8	635862	635869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018078	TGCC	2	8	640299	640306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018078	CGCC	2	8	641244	641251	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_018078	GCCG	2	8	651841	651848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018078	TGGC	2	8	655131	655138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018078	CCAG	2	8	657841	657848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018078	CGGT	2	8	658585	658592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018078	CGGC	2	8	663792	663799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018078	GTCG	2	8	665957	665964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018078	CGGC	2	8	668786	668793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018078	GTGG	2	8	668803	668810	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018078	GCCG	2	8	672292	672299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018078	CGGC	2	8	677411	677418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018078	CCGG	2	8	679417	679424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018078	TTCA	2	8	684703	684710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018078	CGGA	2	8	695933	695940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018078	TCCG	2	8	697305	697312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018078	CGGG	2	8	697397	697404	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018078	CCCA	2	8	704532	704539	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_018078	ACCG	2	8	704629	704636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018078	CCGC	2	8	707244	707251	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_018078	CGGC	2	8	710993	711000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018078	GGTC	2	8	714281	714288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018078	CGGC	2	8	728638	728645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018078	CATG	2	8	728652	728659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018078	CACC	2	8	728884	728891	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_018078	GCTG	2	8	730549	730556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018078	GACT	2	8	732216	732223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018078	AGGT	2	8	732224	732231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018078	TGCC	2	8	733819	733826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018078	AAGG	2	8	735312	735319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018078	CGCA	2	8	736565	736572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_018078	AGGA	2	8	749676	749683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_018078	TTCA	2	8	1234585	1234592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
272	NC_018078	CCGA	2	8	1235798	1235805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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283	NC_018078	CTGT	2	8	1296972	1296979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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286	NC_018078	CTGG	2	8	1308810	1308817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_018078	CGGG	2	8	1330404	1330411	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
293	NC_018078	TACA	2	8	1331992	1331999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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452	NC_018078	GATC	2	8	1934760	1934767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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457	NC_018078	TGCG	2	8	1946128	1946135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_018078	GGCC	2	8	1969691	1969698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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470	NC_018078	TTTG	2	8	1985134	1985141	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
471	NC_018078	CGAG	2	8	1992063	1992070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_018078	GCCG	2	8	2051323	2051330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
482	NC_018078	AGGC	2	8	2051336	2051343	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_018078	CGGC	2	8	2056297	2056304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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493	NC_018078	CGGG	3	12	2109369	2109380	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
494	NC_018078	GATG	2	8	2122747	2122754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
495	NC_018078	GGCC	2	8	2122948	2122955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_018078	TACG	2	8	2123349	2123356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_018078	GCGG	2	8	2123607	2123614	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
498	NC_018078	AGCT	2	8	2123748	2123755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_018078	GTGC	2	8	2124011	2124018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_018078	GTTG	2	8	2142050	2142057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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