MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 10298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018078	CGAC	2	8	412	419	25 %	0 %	25 %	50 %	392430410
2	NC_018078	CGTT	2	8	628	635	0 %	50 %	25 %	25 %	392430410
3	NC_018078	CCCG	2	8	690	697	0 %	0 %	25 %	75 %	392430410
4	NC_018078	GGCA	2	8	761	768	25 %	0 %	50 %	25 %	392430410
5	NC_018078	CCCA	2	8	1019	1026	25 %	0 %	0 %	75 %	392430410
6	NC_018078	GTGG	2	8	2233	2240	0 %	25 %	75 %	0 %	392430411
7	NC_018078	GCCA	2	8	2251	2258	25 %	0 %	25 %	50 %	392430411
8	NC_018078	TCAG	2	8	2595	2602	25 %	25 %	25 %	25 %	392430411
9	NC_018078	CGTT	2	8	2821	2828	0 %	50 %	25 %	25 %	392430411
10	NC_018078	ACGG	2	8	3173	3180	25 %	0 %	50 %	25 %	392430411
11	NC_018078	GCCT	2	8	3235	3242	0 %	25 %	25 %	50 %	392430411
12	NC_018078	CGTC	2	8	3386	3393	0 %	25 %	25 %	50 %	392430412
13	NC_018078	GGTA	2	8	3566	3573	25 %	25 %	50 %	0 %	392430412
14	NC_018078	GGTT	2	8	3748	3755	0 %	50 %	50 %	0 %	392430412
15	NC_018078	CCGC	2	8	3976	3983	0 %	0 %	25 %	75 %	392430412
16	NC_018078	CCAC	2	8	5600	5607	25 %	0 %	0 %	75 %	392430414
17	NC_018078	ACCG	2	8	5619	5626	25 %	0 %	25 %	50 %	392430414
18	NC_018078	CAAG	2	8	5814	5821	50 %	0 %	25 %	25 %	392430414
19	NC_018078	CGCC	2	8	5910	5917	0 %	0 %	25 %	75 %	392430414
20	NC_018078	CGGC	2	8	6725	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	392430414
21	NC_018078	GACA	2	8	7405	7412	50 %	0 %	25 %	25 %	392430415
22	NC_018078	CGGT	2	8	7625	7632	0 %	25 %	50 %	25 %	392430415
23	NC_018078	CGAG	2	8	8557	8564	25 %	0 %	50 %	25 %	392430415
24	NC_018078	CCAC	2	8	9087	9094	25 %	0 %	0 %	75 %	392430415
25	NC_018078	CGAC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	25 %	50 %	392430415
26	NC_018078	GGTT	2	8	9684	9691	0 %	50 %	50 %	0 %	392430415
27	NC_018078	CCCG	2	8	10233	10240	0 %	0 %	25 %	75 %	392430416
28	NC_018078	GAGC	2	8	12193	12200	25 %	0 %	50 %	25 %	392430417
29	NC_018078	CTCA	2	8	12404	12411	25 %	25 %	0 %	50 %	392430417
30	NC_018078	AACC	2	8	13439	13446	50 %	0 %	0 %	50 %	392430419
31	NC_018078	CCCG	2	8	13548	13555	0 %	0 %	25 %	75 %	392430419
32	NC_018078	ACCC	2	8	14199	14206	25 %	0 %	0 %	75 %	392430421
33	NC_018078	TGAT	2	8	14236	14243	25 %	50 %	25 %	0 %	392430421
34	NC_018078	TGCT	2	8	14283	14290	0 %	50 %	25 %	25 %	392430421
35	NC_018078	GCCC	2	8	14770	14777	0 %	0 %	25 %	75 %	392430421
36	NC_018078	GGGC	2	8	15551	15558	0 %	0 %	75 %	25 %	392430422
37	NC_018078	CTGA	2	8	16006	16013	25 %	25 %	25 %	25 %	392430423
38	NC_018078	GCTT	2	8	16208	16215	0 %	50 %	25 %	25 %	392430423
39	NC_018078	CAGT	2	8	16236	16243	25 %	25 %	25 %	25 %	392430423
40	NC_018078	CGGT	2	8	16607	16614	0 %	25 %	50 %	25 %	392430423
41	NC_018078	GCCG	2	8	16666	16673	0 %	0 %	50 %	50 %	392430423
42	NC_018078	CGGG	2	8	17901	17908	0 %	0 %	75 %	25 %	392430424
43	NC_018078	CTGG	2	8	18009	18016	0 %	25 %	50 %	25 %	392430424
44	NC_018078	GTGC	2	8	18509	18516	0 %	25 %	50 %	25 %	392430424
45	NC_018078	GCCG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	392430424
46	NC_018078	CCGC	2	8	18892	18899	0 %	0 %	25 %	75 %	392430425
47	NC_018078	GCCG	2	8	20356	20363	0 %	0 %	50 %	50 %	392430426
48	NC_018078	CCAG	2	8	20844	20851	25 %	0 %	25 %	50 %	392430426
49	NC_018078	CACC	2	8	21027	21034	25 %	0 %	0 %	75 %	392430426
50	NC_018078	CGGG	2	8	21983	21990	0 %	0 %	75 %	25 %	392430427
51	NC_018078	GCCG	2	8	22074	22081	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
52	NC_018078	GCTG	2	8	22454	22461	0 %	25 %	50 %	25 %	392430427
53	NC_018078	CGGC	2	8	22474	22481	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
54	NC_018078	GCCG	2	8	23145	23152	0 %	0 %	50 %	50 %	392430427
55	NC_018078	CCCA	2	8	23157	23164	25 %	0 %	0 %	75 %	392430427
56	NC_018078	GCTG	2	8	24296	24303	0 %	25 %	50 %	25 %	392430429
57	NC_018078	CGGC	2	8	24344	24351	0 %	0 %	50 %	50 %	392430429
58	NC_018078	GCCG	2	8	24444	24451	0 %	0 %	50 %	50 %	392430429
59	NC_018078	CGGG	2	8	24519	24526	0 %	0 %	75 %	25 %	392430429
60	NC_018078	GCTC	2	8	26606	26613	0 %	25 %	25 %	50 %	392430430
61	NC_018078	CCAA	2	8	26823	26830	50 %	0 %	0 %	50 %	392430430
62	NC_018078	CAGC	2	8	26889	26896	25 %	0 %	25 %	50 %	392430430
63	NC_018078	CGGC	2	8	27709	27716	0 %	0 %	50 %	50 %	392430432
64	NC_018078	CCGG	2	8	28195	28202	0 %	0 %	50 %	50 %	392430432
65	NC_018078	GCTC	2	8	28751	28758	0 %	25 %	25 %	50 %	392430433
66	NC_018078	TGCG	2	8	28890	28897	0 %	25 %	50 %	25 %	392430433
67	NC_018078	CCGG	2	8	29155	29162	0 %	0 %	50 %	50 %	392430433
68	NC_018078	CGTC	2	8	29486	29493	0 %	25 %	25 %	50 %	392430434
69	NC_018078	CACG	2	8	29846	29853	25 %	0 %	25 %	50 %	392430435
70	NC_018078	ACCG	2	8	29927	29934	25 %	0 %	25 %	50 %	392430435
71	NC_018078	CCGG	2	8	30246	30253	0 %	0 %	50 %	50 %	392430435
72	NC_018078	GTCG	2	8	30422	30429	0 %	25 %	50 %	25 %	392430435
73	NC_018078	CCCG	2	8	31044	31051	0 %	0 %	25 %	75 %	392430435
74	NC_018078	CGAG	2	8	31556	31563	25 %	0 %	50 %	25 %	392430436
75	NC_018078	CGAC	2	8	31853	31860	25 %	0 %	25 %	50 %	392430437
76	NC_018078	GCCG	2	8	32580	32587	0 %	0 %	50 %	50 %	392430439
77	NC_018078	CCGA	2	8	33569	33576	25 %	0 %	25 %	50 %	392430440
78	NC_018078	GGCC	2	8	34704	34711	0 %	0 %	50 %	50 %	392430441
79	NC_018078	ATCG	2	8	35197	35204	25 %	25 %	25 %	25 %	392430441
80	NC_018078	GATC	2	8	35535	35542	25 %	25 %	25 %	25 %	392430441
81	NC_018078	CCAC	2	8	36356	36363	25 %	0 %	0 %	75 %	392430441
82	NC_018078	ACCG	2	8	36751	36758	25 %	0 %	25 %	50 %	392430442
83	NC_018078	CTGG	2	8	37095	37102	0 %	25 %	50 %	25 %	392430443
84	NC_018078	GCAT	2	8	37490	37497	25 %	25 %	25 %	25 %	392430444
85	NC_018078	GCTG	2	8	38004	38011	0 %	25 %	50 %	25 %	392430444
86	NC_018078	AACG	2	8	38759	38766	50 %	0 %	25 %	25 %	392430444
87	NC_018078	CCGA	2	8	38820	38827	25 %	0 %	25 %	50 %	392430444
88	NC_018078	CCAC	2	8	38976	38983	25 %	0 %	0 %	75 %	392430444
89	NC_018078	CAGC	2	8	39203	39210	25 %	0 %	25 %	50 %	392430445
90	NC_018078	CCGG	2	8	39699	39706	0 %	0 %	50 %	50 %	392430445
91	NC_018078	GGCC	2	8	40230	40237	0 %	0 %	50 %	50 %	392430446
92	NC_018078	CGAT	2	8	40680	40687	25 %	25 %	25 %	25 %	392430446
93	NC_018078	GCCG	2	8	40980	40987	0 %	0 %	50 %	50 %	392430446
94	NC_018078	CACC	2	8	41005	41012	25 %	0 %	0 %	75 %	392430446
95	NC_018078	ACCG	2	8	41228	41235	25 %	0 %	25 %	50 %	392430446
96	NC_018078	GCGT	2	8	41254	41261	0 %	25 %	50 %	25 %	392430446
97	NC_018078	CCAC	2	8	41983	41990	25 %	0 %	0 %	75 %	392430447
98	NC_018078	CGAT	2	8	41992	41999	25 %	25 %	25 %	25 %	392430447
99	NC_018078	GGCC	2	8	42688	42695	0 %	0 %	50 %	50 %	392430449
100	NC_018078	CCCG	2	8	43279	43286	0 %	0 %	25 %	75 %	392430449
101	NC_018078	CGGG	2	8	43308	43315	0 %	0 %	75 %	25 %	392430449
102	NC_018078	CGAC	2	8	43947	43954	25 %	0 %	25 %	50 %	392430450
103	NC_018078	GAGC	2	8	44327	44334	25 %	0 %	50 %	25 %	392430450
104	NC_018078	GGGC	2	8	45486	45493	0 %	0 %	75 %	25 %	392430450
105	NC_018078	CGGC	2	8	45581	45588	0 %	0 %	50 %	50 %	392430450
106	NC_018078	GCCG	2	8	46544	46551	0 %	0 %	50 %	50 %	392430450
107	NC_018078	TTGC	2	8	46708	46715	0 %	50 %	25 %	25 %	392430451
108	NC_018078	CCGC	2	8	46856	46863	0 %	0 %	25 %	75 %	392430451
109	NC_018078	CCGC	2	8	46889	46896	0 %	0 %	25 %	75 %	392430451
110	NC_018078	GGTC	2	8	46997	47004	0 %	25 %	50 %	25 %	392430451
111	NC_018078	CGGG	2	8	47548	47555	0 %	0 %	75 %	25 %	392430452
112	NC_018078	GCAG	2	8	47621	47628	25 %	0 %	50 %	25 %	392430452
113	NC_018078	GTGC	2	8	48521	48528	0 %	25 %	50 %	25 %	392430453
114	NC_018078	GCCG	2	8	48805	48812	0 %	0 %	50 %	50 %	392430453
115	NC_018078	CAGC	2	8	49990	49997	25 %	0 %	25 %	50 %	392430454
116	NC_018078	CGGG	2	8	50179	50186	0 %	0 %	75 %	25 %	392430455
117	NC_018078	GCCG	2	8	50279	50286	0 %	0 %	50 %	50 %	392430455
118	NC_018078	GGTG	2	8	50602	50609	0 %	25 %	75 %	0 %	392430455
119	NC_018078	CTCA	2	8	51218	51225	25 %	25 %	0 %	50 %	392430455
120	NC_018078	CGCT	2	8	51357	51364	0 %	25 %	25 %	50 %	392430456
121	NC_018078	GGTA	2	8	52223	52230	25 %	25 %	50 %	0 %	392430457
122	NC_018078	GCCG	2	8	53672	53679	0 %	0 %	50 %	50 %	392430459
123	NC_018078	ACCA	2	8	53843	53850	50 %	0 %	0 %	50 %	392430459
124	NC_018078	GTGC	2	8	54728	54735	0 %	25 %	50 %	25 %	392430459
125	NC_018078	ACCG	2	8	55606	55613	25 %	0 %	25 %	50 %	392430459
126	NC_018078	CCCG	2	8	55768	55775	0 %	0 %	25 %	75 %	392430459
127	NC_018078	GGCC	2	8	56442	56449	0 %	0 %	50 %	50 %	392430460
128	NC_018078	CGCT	2	8	57169	57176	0 %	25 %	25 %	50 %	392430460
129	NC_018078	GCGG	2	8	58926	58933	0 %	0 %	75 %	25 %	392430463
130	NC_018078	GTTC	2	8	59145	59152	0 %	50 %	25 %	25 %	392430463
131	NC_018078	AGCG	2	8	59350	59357	25 %	0 %	50 %	25 %	392430464
132	NC_018078	CGGC	2	8	60092	60099	0 %	0 %	50 %	50 %	392430466
133	NC_018078	GCGG	2	8	60104	60111	0 %	0 %	75 %	25 %	392430466
134	NC_018078	AAGG	2	8	63992	63999	50 %	0 %	50 %	0 %	392430467
135	NC_018078	AACC	2	8	64769	64776	50 %	0 %	0 %	50 %	392430468
136	NC_018078	CGGA	2	8	65133	65140	25 %	0 %	50 %	25 %	392430469
137	NC_018078	GCTG	2	8	66398	66405	0 %	25 %	50 %	25 %	392430470
138	NC_018078	CGGA	2	8	66707	66714	25 %	0 %	50 %	25 %	392430470
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