MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 83313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018078	CAA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018078	CGT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430410
3	NC_018078	CAC	2	6	128	133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430410
4	NC_018078	GTC	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430410
5	NC_018078	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
6	NC_018078	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
7	NC_018078	TCG	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430410
8	NC_018078	AGC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
9	NC_018078	GCC	2	6	361	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430410
10	NC_018078	CCG	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430410
11	NC_018078	CGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
12	NC_018078	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430410
13	NC_018078	ACG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
14	NC_018078	TGA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430410
15	NC_018078	CGC	3	9	662	670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430410
16	NC_018078	GTT	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430410
17	NC_018078	CGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
18	NC_018078	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430410
19	NC_018078	CAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430410
20	NC_018078	AGC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
21	NC_018078	ACC	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430410
22	NC_018078	CGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
23	NC_018078	CAG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430410
24	NC_018078	GCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430410
25	NC_018078	CCG	2	6	1360	1365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430410
26	NC_018078	CAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430410
27	NC_018078	TTC	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018078	CGG	2	6	1744	1749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018078	TCG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018078	ACC	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018078	TCG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018078	ATG	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018078	GTT	3	9	2026	2034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018078	CTG	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018078	CGT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018078	TCG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018078	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430411
38	NC_018078	CCG	2	6	2343	2348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430411
39	NC_018078	TTG	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430411
40	NC_018078	CGA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430411
41	NC_018078	TTG	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430411
42	NC_018078	ATT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392430411
43	NC_018078	CGC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430411
44	NC_018078	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430411
45	NC_018078	GGT	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430411
46	NC_018078	CGT	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430411
47	NC_018078	GCC	2	6	2792	2797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430411
48	NC_018078	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430411
49	NC_018078	GCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430411
50	NC_018078	CTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430411
51	NC_018078	CCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430411
52	NC_018078	GAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430411
53	NC_018078	TTG	3	9	3117	3125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430411
54	NC_018078	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430411
55	NC_018078	TTG	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430412
56	NC_018078	CGA	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430412
57	NC_018078	GTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430412
58	NC_018078	ACG	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430412
59	NC_018078	CAA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430412
60	NC_018078	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430412
61	NC_018078	TGT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430412
62	NC_018078	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430412
63	NC_018078	GAT	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430412
64	NC_018078	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430412
65	NC_018078	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430412
66	NC_018078	AGC	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430412
67	NC_018078	GGC	2	6	4145	4150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430412
68	NC_018078	GGC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430412
69	NC_018078	GAC	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430412
70	NC_018078	GGC	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430412
71	NC_018078	TGG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430412
72	NC_018078	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430412
73	NC_018078	CGA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430412
74	NC_018078	CGG	2	6	4402	4407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430412
75	NC_018078	CCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430412
76	NC_018078	CCG	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430412
77	NC_018078	GGT	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430412
78	NC_018078	TGC	3	9	4633	4641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430413
79	NC_018078	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430413
80	NC_018078	GGT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430413
81	NC_018078	CCA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430413
82	NC_018078	ACG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430413
83	NC_018078	CGC	2	6	4978	4983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430413
84	NC_018078	CGG	2	6	5028	5033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430413
85	NC_018078	GAA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018078	AGA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430414
87	NC_018078	GTG	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430414
88	NC_018078	GCG	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430414
89	NC_018078	GAG	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430414
90	NC_018078	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430414
91	NC_018078	GGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430414
92	NC_018078	CGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430414
93	NC_018078	TGC	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430414
94	NC_018078	CGA	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430414
95	NC_018078	GTG	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430414
96	NC_018078	CGG	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430414
97	NC_018078	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430414
98	NC_018078	GGT	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430414
99	NC_018078	AAG	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430414
100	NC_018078	CAA	2	6	5940	5945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430414
101	NC_018078	CGA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430414
102	NC_018078	GTC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430414
103	NC_018078	TGG	2	6	6110	6115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430414
104	NC_018078	AGC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430414
105	NC_018078	GGC	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430414
106	NC_018078	GGT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430414
107	NC_018078	GCG	2	6	6621	6626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430414
108	NC_018078	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430414
109	NC_018078	ATC	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430414
110	NC_018078	ACG	2	6	6881	6886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430414
111	NC_018078	TGT	2	6	6968	6973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430414
112	NC_018078	GTT	3	9	6978	6986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430414
113	NC_018078	CCG	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430414
114	NC_018078	CTG	2	6	7108	7113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430414
115	NC_018078	GAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430414
116	NC_018078	CAA	2	6	7143	7148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430414
117	NC_018078	ACC	2	6	7210	7215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430414
118	NC_018078	GAC	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430414
119	NC_018078	GCC	4	12	7261	7272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430414
120	NC_018078	GTT	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430414
121	NC_018078	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430415
122	NC_018078	GAC	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
123	NC_018078	CAG	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
124	NC_018078	TCG	2	6	7509	7514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430415
125	NC_018078	ACC	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430415
126	NC_018078	TGG	2	6	7728	7733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430415
127	NC_018078	CGG	2	6	7773	7778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430415
128	NC_018078	CGA	2	6	7837	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
129	NC_018078	ACG	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
130	NC_018078	CTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430415
131	NC_018078	GGC	2	6	7937	7942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430415
132	NC_018078	CGC	2	6	7971	7976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430415
133	NC_018078	ACG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
134	NC_018078	CGA	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
135	NC_018078	CCG	2	6	8091	8096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430415
136	NC_018078	TCG	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430415
137	NC_018078	GTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430415
138	NC_018078	AGA	2	6	8179	8184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430415
139	NC_018078	TCA	2	6	8250	8255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430415
140	NC_018078	GGT	2	6	8377	8382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430415
141	NC_018078	TCG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430415
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143	NC_018078	GCG	2	6	8524	8529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430415
144	NC_018078	CAC	2	6	8530	8535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430415
145	NC_018078	GCT	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430415
146	NC_018078	CGA	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
147	NC_018078	GCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430415
148	NC_018078	CAT	2	6	8752	8757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430415
149	NC_018078	CGA	2	6	8758	8763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
150	NC_018078	CGA	2	6	8842	8847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
151	NC_018078	CGA	2	6	8875	8880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
152	NC_018078	ATC	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430415
153	NC_018078	CGA	2	6	8920	8925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
154	NC_018078	CGT	2	6	8947	8952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430415
155	NC_018078	CGG	2	6	9019	9024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430415
156	NC_018078	GAC	2	6	9056	9061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
157	NC_018078	TCG	2	6	9063	9068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430415
158	NC_018078	CTT	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430415
159	NC_018078	TTC	2	6	9107	9112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430415
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162	NC_018078	ACG	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
163	NC_018078	CGA	3	9	9403	9411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
164	NC_018078	CTG	3	9	9413	9421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430415
165	NC_018078	CGA	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430415
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170	NC_018078	CCG	2	6	9670	9675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430415
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176	NC_018078	CGA	3	9	9931	9939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_018078	GAG	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_018078	CGC	2	6	10142	10147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430416
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200	NC_018078	TCG	2	6	11131	11136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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207	NC_018078	CCG	2	6	11738	11743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
208	NC_018078	CGA	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
209	NC_018078	ACT	2	6	11842	11847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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211	NC_018078	GAC	2	6	11964	11969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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224	NC_018078	ACG	2	6	12765	12770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430418
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237	NC_018078	CAA	2	6	13836	13841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392430420
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240	NC_018078	GAC	2	6	14133	14138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_018078	GCT	3	9	14297	14305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430421
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246	NC_018078	GGC	2	6	14477	14482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430421
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248	NC_018078	GGC	2	6	14516	14521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430421
249	NC_018078	TGG	2	6	14548	14553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430421
250	NC_018078	CAT	2	6	14705	14710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430421
251	NC_018078	TGC	2	6	14746	14751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430421
252	NC_018078	CGC	2	6	14786	14791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430421
253	NC_018078	CGC	3	9	14801	14809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430421
254	NC_018078	GCT	2	6	14817	14822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430421
255	NC_018078	GAA	2	6	14889	14894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430421
256	NC_018078	ACT	2	6	14971	14976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430421
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258	NC_018078	ACC	2	6	15115	15120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430422
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382	NC_018078	TCA	2	6	22133	22138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430427
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500	NC_018078	CGA	2	6	28859	28864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430433

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