MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 5888

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018078	CAA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018078	TTC	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018078	CGG	2	6	1744	1749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018078	TCG	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018078	ACC	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018078	TCG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018078	ATG	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018078	GTT	3	9	2026	2034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018078	CTG	2	6	2038	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018078	CGT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018078	TCG	2	6	2080	2085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018078	GAA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018078	CGA	3	9	9931	9939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018078	GAG	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018078	TCG	2	6	10963	10968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018078	TCC	2	6	11048	11053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018078	ACG	2	6	11078	11083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018078	GGC	2	6	11123	11128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018078	TCG	2	6	11131	11136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018078	CCT	2	6	11184	11189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018078	CGG	2	6	11421	11426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018078	ACG	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018078	ACC	2	6	11526	11531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018078	ACC	3	9	11596	11604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018078	GCC	2	6	11633	11638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_018078	CCG	2	6	11738	11743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018078	CGA	2	6	11795	11800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018078	ACT	2	6	11842	11847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018078	CAT	2	6	11903	11908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018078	GAC	2	6	11964	11969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018078	GCC	2	6	12416	12421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018078	CGG	2	6	12496	12501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018078	TCG	2	6	13135	13140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018078	CAC	2	6	13678	13683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018078	CGG	2	6	13803	13808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018078	GAC	2	6	14133	14138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018078	TCG	2	6	23355	23360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018078	GGT	2	6	23917	23922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018078	TCG	2	6	25577	25582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018078	CCG	2	6	25678	25683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018078	CTA	2	6	25713	25718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018078	TCC	2	6	25730	25735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018078	GTT	2	6	25737	25742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018078	TCG	3	9	25857	25865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018078	GCC	2	6	25871	25876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018078	AAC	2	6	26983	26988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018078	CGT	2	6	27001	27006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018078	CTT	2	6	27052	27057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018078	CCT	2	6	27551	27556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018078	GTA	2	6	27666	27671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018078	GCG	2	6	31184	31189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018078	CGG	2	6	31236	31241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018078	CAA	2	6	31271	31276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018078	GAG	2	6	31277	31282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018078	CAC	2	6	32106	32111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_018078	GAT	2	6	32135	32140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018078	TGG	2	6	33300	33305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018078	CGG	2	6	34015	34020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018078	GCG	2	6	34036	34041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018078	TGG	2	6	34097	34102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018078	CGG	2	6	34168	34173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018078	GGT	2	6	34230	34235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018078	CCA	2	6	34252	34257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018078	TCA	2	6	39065	39070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018078	CAC	2	6	39932	39937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018078	TCG	2	6	39954	39959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018078	GCC	2	6	41328	41333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018078	GGT	2	6	41389	41394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018078	GAT	2	6	41397	41402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018078	CCG	3	9	42021	42029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018078	AGC	2	6	42040	42045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018078	GCC	2	6	42470	42475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_018078	CGT	2	6	43505	43510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018078	GTG	2	6	43582	43587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018078	CGG	2	6	46581	46586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018078	CGC	2	6	46636	46641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018078	CGG	2	6	46648	46653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018078	GCT	2	6	47438	47443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018078	GTG	2	6	50102	50107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018078	CCT	2	6	51837	51842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018078	ACG	2	6	51868	51873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018078	ACA	2	6	51916	51921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018078	TAG	2	6	52808	52813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018078	CCG	2	6	52842	52847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018078	CAA	2	6	52856	52861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018078	GGT	2	6	52880	52885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018078	CGT	2	6	52894	52899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018078	CGC	2	6	58128	58133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018078	TCG	2	6	58137	58142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018078	GGT	2	6	58165	58170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018078	CCT	2	6	58237	58242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018078	AGG	2	6	58275	58280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018078	TGA	2	6	58281	58286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018078	GAA	3	9	58638	58646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018078	GCC	2	6	58655	58660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018078	AGG	2	6	58677	58682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018078	CTC	2	6	60533	60538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018078	ACC	2	6	60566	60571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018078	CGC	2	6	60581	60586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018078	ACG	2	6	60694	60699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018078	GCC	2	6	60750	60755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018078	GCT	2	6	60773	60778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018078	CGG	2	6	60788	60793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018078	GCC	2	6	60834	60839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018078	CTA	2	6	60848	60853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018078	GCT	2	6	60878	60883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018078	GTG	2	6	60912	60917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018078	GGT	2	6	60959	60964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018078	ACG	2	6	60988	60993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018078	CGG	2	6	61002	61007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018078	CTG	2	6	61038	61043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018078	CGA	2	6	61048	61053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018078	GGC	2	6	61083	61088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018078	CGA	2	6	61124	61129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018078	GGC	2	6	61169	61174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018078	TCT	2	6	61255	61260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018078	CTG	2	6	61296	61301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018078	CGG	2	6	61303	61308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018078	GAC	2	6	61356	61361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018078	GCG	2	6	61376	61381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018078	CGA	2	6	61415	61420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018078	ATG	2	6	61437	61442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018078	TGA	2	6	61516	61521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018078	AAG	2	6	61530	61535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018078	AGC	2	6	61644	61649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018078	CCA	2	6	61707	61712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_018078	TGG	2	6	61812	61817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018078	GAT	2	6	61825	61830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018078	GCA	2	6	61973	61978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018078	GAA	2	6	62071	62076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018078	CGG	2	6	62133	62138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018078	CGA	2	6	62164	62169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018078	CGT	2	6	62190	62195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018078	GCG	2	6	62243	62248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018078	GTT	2	6	62338	62343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018078	TGG	2	6	62365	62370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018078	CTA	2	6	62410	62415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018078	CGA	2	6	62440	62445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018078	TGC	2	6	62457	62462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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