MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma bovis HB0801 chromosome

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018077	ATTTAT	2	12	56492	56503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018077	TAAATA	2	12	71846	71857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018077	TAAATT	2	12	111569	111580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018077	TAATAT	2	12	111676	111687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018077	TGCTTC	2	12	161757	161768	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018077	TTTCAT	2	12	161981	161992	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018077	AAGCAA	2	12	164812	164823	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018077	GTTTGC	2	12	164825	164836	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018077	TAAAAT	2	12	175858	175869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018077	ATATAA	2	12	175872	175883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018077	TATCTT	2	12	188250	188261	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018077	AGAAAA	2	12	206807	206818	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018077	TCATTT	2	12	210569	210580	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018077	TCATTT	2	12	221987	221998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018077	AATTTA	2	12	292062	292073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018077	TTCTGG	2	12	310625	310636	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018077	TTTTAG	2	12	313587	313598	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018077	ATTAAA	2	12	316750	316761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018077	TACAAT	2	12	333443	333454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018077	TAAAAA	2	12	333566	333577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018077	ATTCTT	2	12	339479	339490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018077	TTTAAT	2	12	378143	378154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018077	ATTAAT	2	12	389771	389782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018077	ATTCTT	2	12	393464	393475	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018077	GTTGCA	2	12	400976	400987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018077	TTGCAA	2	12	402347	402358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018077	GTTGCA	2	12	414837	414848	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018077	TATGAA	2	12	417483	417494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018077	AAACAT	2	12	419769	419780	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018077	GGAAAT	2	12	424358	424369	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018077	TTAAAT	2	12	445458	445469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018077	AGCAAG	2	12	447987	447998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018077	TAATAT	2	12	453058	453069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018077	ATGAGA	2	12	453930	453941	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018077	TAAAAA	2	12	536789	536800	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018077	ATAAAA	2	12	608705	608716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018077	AAAAGT	2	12	618417	618428	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018077	ACTAAT	2	12	674356	674367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018077	TAATAT	2	12	683527	683538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018077	CTCCAG	2	12	709376	709387	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018077	CTCCAG	2	12	716027	716038	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018077	ATTTTT	2	12	721742	721753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018077	ACCTTT	2	12	724294	724305	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018077	TAAAAA	2	12	725693	725704	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018077	AGCAAA	2	12	777144	777155	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018077	TTAATA	2	12	780710	780721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018077	TTATAA	2	12	782009	782020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018077	TAAAAA	2	12	783272	783283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018077	AAAGCA	2	12	798292	798303	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018077	TTTTTG	2	12	805945	805956	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018077	ATTTTT	2	12	826891	826902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018077	AAAGTT	2	12	844246	844257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018077	GATATT	2	12	862708	862719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018077	GCAATA	2	12	867987	867998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018077	TATGCA	2	12	893084	893095	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018077	ATATTA	2	12	896450	896461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018077	TTATAT	2	12	929691	929702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018077	ATTACT	2	12	936905	936916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018077	CATTAT	2	12	979307	979318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018077	GAAACG	2	12	979632	979643	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018077	ATTTTT	2	12	983970	983981	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018077	TTGCTA	2	12	985134	985145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.