MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma bovis HB0801 chromosome

Total Repeats: 482

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018077	AATT	2	8	1472	1479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018077	TCCC	2	8	3005	3012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_018077	ATTT	2	8	3127	3134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018077	TGAA	3	12	22689	22700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018077	TTTA	2	8	24676	24683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018077	ATTA	2	8	26638	26645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018077	CATT	2	8	31177	31184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018077	ATTT	2	8	51262	51269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018077	TAAA	2	8	51270	51277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018077	AAGA	2	8	51405	51412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018077	TGCT	2	8	51548	51555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018077	TAAT	2	8	51992	51999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018077	ATAA	2	8	52172	52179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018077	AAGT	2	8	56414	56421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018077	ACTT	2	8	56424	56431	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018077	GTTT	2	8	56432	56439	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018077	ACAA	2	8	56543	56550	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018077	ATGT	2	8	56554	56561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018077	AATT	2	8	56567	56574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018077	TAAT	2	8	58995	59002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018077	AGAA	2	8	60196	60203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018077	ATTT	2	8	60211	60218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018077	AAAT	2	8	63170	63177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018077	ATTG	2	8	63888	63895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018077	AATT	2	8	74332	74339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018077	AATT	2	8	79228	79235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018077	TAAA	2	8	81098	81105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018077	TTTA	2	8	104786	104793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018077	ATAA	2	8	107327	107334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018077	ATTA	2	8	107856	107863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018077	TTTA	2	8	110791	110798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018077	AACT	2	8	111609	111616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018077	ATTT	2	8	113942	113949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018077	AATA	2	8	113981	113988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018077	CTTT	2	8	118117	118124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018077	TAAT	2	8	120169	120176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018077	TTTA	2	8	120345	120352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018077	TACA	2	8	120423	120430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018077	AAAG	2	8	120525	120532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018077	GCTT	2	8	130428	130435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018077	CAAA	2	8	130986	130993	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018077	GCAT	2	8	134811	134818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018077	TTTA	2	8	148680	148687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018077	TTTA	2	8	157270	157277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018077	ATAA	3	12	157629	157640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018077	AATG	2	8	161218	161225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018077	AGTT	2	8	161231	161238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018077	GCTT	2	8	161310	161317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018077	GTAA	2	8	162172	162179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018077	ATTT	2	8	162299	162306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018077	TAAT	2	8	162723	162730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018077	ATGA	2	8	162825	162832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018077	TTAT	2	8	162924	162931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018077	TAAT	2	8	164397	164404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018077	ACAA	2	8	164684	164691	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018077	TAAT	2	8	171053	171060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018077	ATTA	2	8	178450	178457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018077	AATT	2	8	182476	182483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018077	AAAT	2	8	184008	184015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018077	TGCT	2	8	184091	184098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018077	ATTG	2	8	184331	184338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018077	TCAA	2	8	184460	184467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018077	ATAA	2	8	184669	184676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018077	ATAA	2	8	185616	185623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018077	ATTT	2	8	185644	185651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018077	GCAA	2	8	185665	185672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018077	TCAA	2	8	188407	188414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018077	TTGT	2	8	188498	188505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018077	CATA	2	8	188855	188862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018077	CAAT	2	8	189031	189038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018077	GATA	2	8	189402	189409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018077	AATT	2	8	191555	191562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018077	GTTT	2	8	191621	191628	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018077	CTTT	2	8	195939	195946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018077	TTTA	2	8	197594	197601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018077	AGAA	2	8	200500	200507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018077	ATAA	2	8	204534	204541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018077	GTAT	2	8	206450	206457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018077	TACA	2	8	206708	206715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018077	TAAT	2	8	206719	206726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018077	TTAA	2	8	210551	210558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018077	ATAA	2	8	211328	211335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018077	GTAT	2	8	217877	217884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018077	TTAA	2	8	221969	221976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018077	ACTA	2	8	222976	222983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018077	TTAT	2	8	227172	227179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018077	ATTA	2	8	228898	228905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018077	ATTA	2	8	235633	235640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018077	TTAA	2	8	237352	237359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018077	ATAA	2	8	239450	239457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018077	AAAT	2	8	240074	240081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018077	TTTA	2	8	242856	242863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018077	TTTA	2	8	243030	243037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018077	ATAA	2	8	244645	244652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018077	ACTT	2	8	247922	247929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018077	TAAA	2	8	248878	248885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018077	TTTA	2	8	249590	249597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018077	AGCT	2	8	249604	249611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018077	TATT	2	8	253635	253642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018077	TTTA	2	8	254380	254387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018077	TAAA	2	8	254404	254411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018077	ATTT	2	8	254580	254587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018077	CTAA	2	8	254608	254615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018077	AATA	2	8	254961	254968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018077	TGAA	2	8	254971	254978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018077	ATTT	2	8	261771	261778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018077	TAAA	2	8	266626	266633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018077	TTGA	2	8	266732	266739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018077	ATTG	2	8	266902	266909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018077	TTTA	2	8	268563	268570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018077	CTAT	2	8	271013	271020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018077	ATTT	2	8	271021	271028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018077	ATAA	2	8	272585	272592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018077	ATAA	2	8	272648	272655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018077	TAAT	2	8	282688	282695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018077	ATTA	3	12	289369	289380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018077	ATTT	2	8	289462	289469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018077	GCCT	2	8	289621	289628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018077	GTAG	2	8	290157	290164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018077	GCAA	2	8	292053	292060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018077	AATT	2	8	295672	295679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018077	AATT	2	8	297898	297905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018077	TTAT	2	8	297954	297961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018077	TATT	2	8	299585	299592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018077	AAAT	2	8	301578	301585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018077	CATG	2	8	301768	301775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018077	TCCC	2	8	302038	302045	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_018077	TAAT	2	8	302128	302135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018077	CTTT	2	8	302150	302157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018077	ACCA	2	8	303015	303022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018077	ATTT	2	8	309056	309063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018077	TAAT	2	8	309090	309097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018077	CATA	2	8	309463	309470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018077	AAAT	2	8	310519	310526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018077	ATTA	2	8	311202	311209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018077	TAAA	2	8	311658	311665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018077	AAAT	2	8	311700	311707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018077	ATTT	2	8	322263	322270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018077	ACTT	2	8	323455	323462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018077	TGCT	2	8	325609	325616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018077	TAAT	2	8	333430	333437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018077	TAAA	2	8	339639	339646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018077	AAAT	2	8	341099	341106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018077	TCAA	2	8	341174	341181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018077	TTAA	2	8	342575	342582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018077	TAAA	2	8	343652	343659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018077	TATT	2	8	347055	347062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018077	CTTG	2	8	348778	348785	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018077	TTAA	2	8	349258	349265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018077	TTTA	2	8	350725	350732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_018077	TTAT	2	8	358587	358594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.