MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018073	TAGAAA	2	12	1310	1321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392427892
2	NC_018073	AAAGAT	2	12	3976	3987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392427895
3	NC_018073	TTAATT	2	12	5654	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
4	NC_018073	TGCTTA	2	12	8022	8033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392427897
5	NC_018073	TAGAAA	2	12	11001	11012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392427900
6	NC_018073	AGCTCA	2	12	27741	27752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392427907
7	NC_018073	TGAAAA	2	12	27813	27824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392427907
8	NC_018073	GTAGAT	2	12	34994	35005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427913
9	NC_018073	CAGGTG	2	12	35160	35171	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392427913
10	NC_018073	GCAATG	2	12	35556	35567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392427913
11	NC_018073	TTACGA	2	12	39851	39862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392427915
12	NC_018073	GCTGGT	2	12	40358	40369	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392427916
13	NC_018073	ATATTG	2	12	42520	42531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392427919
14	NC_018073	TGGATT	2	12	44619	44630	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392427920
15	NC_018073	TCCTTA	2	12	50833	50844	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	392427925
16	NC_018073	ACAGTG	2	12	51420	51431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392427925
17	NC_018073	TGCAGG	2	12	52096	52107	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392427926
18	NC_018073	AAGACC	2	12	52314	52325	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392427926
19	NC_018073	TTCCTT	2	12	61610	61621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427935
20	NC_018073	TGACGA	2	12	65127	65138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392427938
21	NC_018073	ATTACA	2	12	66954	66965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	392427941
22	NC_018073	CAGATT	2	12	69478	69489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392427943
23	NC_018073	GATGTG	2	12	72253	72264	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	392427946
24	NC_018073	TTTGCT	2	12	79972	79983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	392427952
25	NC_018073	CCAGAT	2	12	82754	82765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392427953
26	NC_018073	TGAATT	2	12	88219	88230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392427958
27	NC_018073	GAGCAG	2	12	98134	98145	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392427968
28	NC_018073	GTATTG	2	12	99005	99016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392427968
29	NC_018073	AATTTT	2	12	99510	99521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427969
30	NC_018073	TGAAAA	2	12	100021	100032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392427970
31	NC_018073	CTATGC	2	12	106591	106602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392427976
32	NC_018073	AGGAGA	2	12	107684	107695	50 %	0 %	50 %	0 %	392427977
33	NC_018073	TTTGGG	2	12	108411	108422	0 %	50 %	50 %	0 %	392427977
34	NC_018073	TGGGCT	2	12	108640	108651	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392427977
35	NC_018073	AAGACA	2	12	110884	110895	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392427980
36	NC_018073	ATAAAA	2	12	111742	111753	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	392427980
37	NC_018073	TTTGAG	2	12	112609	112620	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392427980
38	NC_018073	TTTGAG	2	12	112951	112962	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392427980
39	NC_018073	AAGTCA	2	12	113123	113134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	392427980
40	NC_018073	GAGTTT	2	12	113290	113301	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392427980
41	NC_018073	GAATTT	2	12	114679	114690	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392427980
42	NC_018073	GAGTTT	2	12	115018	115029	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392427980
43	NC_018073	AACCGT	2	12	115200	115211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392427980
44	NC_018073	GGTCAA	2	12	115222	115233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392427980
45	NC_018073	TGAATT	2	12	115695	115706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392427980
46	NC_018073	AGTTCC	2	12	121636	121647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392427985
47	NC_018073	ATGAAA	2	12	122369	122380	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392427986
48	NC_018073	GATCAT	2	12	122488	122499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392427986
49	NC_018073	ATATCA	2	12	123290	123301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	392427986
50	NC_018073	TTGGTT	2	12	128098	128109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392427990
51	NC_018073	CTGGTG	2	12	133717	133728	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392427995
52	NC_018073	ACCTTG	2	12	140175	140186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392428001
53	NC_018073	TGATTT	2	12	146060	146071	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	392428006
54	NC_018073	TAAATG	2	12	146575	146586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392428006
55	NC_018073	AATTTA	2	12	148286	148297	50 %	50 %	0 %	0 %	392428008
56	NC_018073	TTGTGT	2	12	149352	149363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392428009
57	NC_018073	TTTGAA	2	12	150299	150310	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392428010
58	NC_018073	AAGGAA	2	12	151527	151538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392428012
59	NC_018073	AAAAAT	2	12	155739	155750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	392428016
60	NC_018073	TTTAGT	2	12	158249	158260	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	392428018
61	NC_018073	GACTTG	2	12	159644	159655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392428019
62	NC_018073	TTGTAT	2	12	161790	161801	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	392428021
63	NC_018073	TCATTT	2	12	164756	164767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	392428023
64	NC_018073	GATTGG	2	12	165593	165604	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	392428024
65	NC_018073	GTCTTT	2	12	169579	169590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	392428027
66	NC_018073	AAAAGC	2	12	169704	169715	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392428027
67	NC_018073	TCAATG	2	12	170609	170620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392428028
68	NC_018073	AATGTT	2	12	176019	176030	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392428035
69	NC_018073	GGTGAA	2	12	181529	181540	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	392428040
70	NC_018073	GATAAA	2	12	183419	183430	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392428043
71	NC_018073	TCACGT	2	12	183751	183762	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392428043
72	NC_018073	ACAAGA	2	12	184210	184221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392428044
73	NC_018073	ATTACA	2	12	184229	184240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	392428044
74	NC_018073	CGTGCT	2	12	189419	189430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392428047
75	NC_018073	TCCAAC	2	12	189532	189543	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392428047
76	NC_018073	AAGTGC	2	12	191362	191373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392428048
77	NC_018073	TTTTCC	2	12	193924	193935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392428052
78	NC_018073	TTAATG	2	12	195943	195954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392428055
79	NC_018073	GCAGGA	2	12	196678	196689	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392428056
80	NC_018073	AAAGAA	2	12	199381	199392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	392428058
81	NC_018073	ATTAGA	2	12	203078	203089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	392428062
82	NC_018073	CAATAT	2	12	203228	203239	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	392428063
83	NC_018073	CAGGTC	2	12	209218	209229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392428067
84	NC_018073	CTCCAC	2	12	217731	217742	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	392428076
85	NC_018073	AGAAAA	2	12	220241	220252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	392428079
86	NC_018073	TCGTAG	2	12	221464	221475	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392428080
87	NC_018073	GTGACA	2	12	224515	224526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392428081
88	NC_018073	GCAAAG	2	12	224958	224969	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	392428082
89	NC_018073	ATGAAG	2	12	233894	233905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	392428089
90	NC_018073	TGGATG	2	12	233921	233932	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	392428089
91	NC_018073	TATTTT	2	12	236081	236092	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	392428092
92	NC_018073	GTCTAC	2	12	236598	236609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392428093
93	NC_018073	GCCATG	2	12	237136	237147	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392428093
94	NC_018073	CTTAGG	2	12	237756	237767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392428093
95	NC_018073	TCAGCT	2	12	239859	239870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392428095
96	NC_018073	AGTAGA	2	12	243672	243683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	392428099
97	NC_018073	TCAATG	2	12	243761	243772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392428099
98	NC_018073	TGGTTG	2	12	243987	243998	0 %	50 %	50 %	0 %	392428099
99	NC_018073	GGCTAT	2	12	244210	244221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392428099
100	NC_018073	TTTGAT	2	12	247800	247811	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	392428102
101	NC_018073	TGGCGG	2	12	252052	252063	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	392428105
102	NC_018073	AAAGAA	2	12	256610	256621	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	392428111
103	NC_018073	TTTCAG	2	12	257674	257685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392428111
104	NC_018073	TAATCA	2	12	259757	259768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	392428113
105	NC_018073	ATCTTT	2	12	262361	262372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	392428115
106	NC_018073	TTGCAA	2	12	275105	275116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392428127
107	NC_018073	AAAGGT	2	12	275900	275911	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	392428127
108	NC_018073	CTTTGC	2	12	277973	277984	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	392428129
109	NC_018073	AACACC	2	12	280743	280754	50 %	0 %	0 %	50 %	392428130
110	NC_018073	AGTGTA	2	12	280866	280877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392428131
111	NC_018073	GGCAAG	2	12	282463	282474	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392428133
112	NC_018073	TAAAGA	2	12	283112	283123	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392428134
113	NC_018073	TTTGTC	2	12	283907	283918	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	392428135
114	NC_018073	AGCATA	2	12	284056	284067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	392428135
115	NC_018073	TAAAGA	2	12	286807	286818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392428138
116	NC_018073	TTTGAA	2	12	289505	289516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	392428140
117	NC_018073	TATCAA	2	12	292359	292370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	392428141
118	NC_018073	CCTATT	2	12	294436	294447	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	392428141
119	NC_018073	AACTTC	2	12	295064	295075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392428141
120	NC_018073	TATTAC	2	12	298113	298124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	392428146
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123	NC_018073	TATTGC	2	12	309330	309341	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392428158
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217	NC_018073	CCAAGT	2	12	596471	596482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392428415
218	NC_018073	AGCAAA	2	12	597307	597318	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392428416
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221	NC_018073	GGCAGC	2	12	600783	600794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392428418
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224	NC_018073	TATGCC	2	12	610574	610585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392428425
225	NC_018073	ATTGCA	2	12	613123	613134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392428427
226	NC_018073	TAAAAA	2	12	614581	614592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	392428429
227	NC_018073	ATGAGT	2	12	614793	614804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392428429
228	NC_018073	ACAGAA	2	12	616180	616191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	392428430
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230	NC_018073	ATCGTT	2	12	624765	624776	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392428436
231	NC_018073	GATAAA	2	12	627942	627953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392428439
232	NC_018073	TTCATG	2	12	628153	628164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392428439
233	NC_018073	TCGTAA	2	12	628355	628366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392428439
234	NC_018073	TGGTAG	2	12	633599	633610	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	392428444
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454	NC_018073	GTTTCT	2	12	1241731	1241742	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	392428981
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456	NC_018073	TTCATT	2	12	1242996	1243007	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	392428981
457	NC_018073	ATGAAA	2	12	1247177	1247188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392428984
458	NC_018073	TTCTCC	2	12	1249587	1249598	0 %	50 %	0 %	50 %	392428987
459	NC_018073	GAAGCA	2	12	1251318	1251329	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	392428988
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