MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 1550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018073	CAAAT	2	10	1046	1055	60 %	20 %	0 %	20 %	392427892
2	NC_018073	TTTGT	2	10	3179	3188	0 %	80 %	20 %	0 %	392427894
3	NC_018073	ATTGA	2	10	3471	3480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018073	TGATT	2	10	5457	5466	20 %	60 %	20 %	0 %	392427897
5	NC_018073	TGATT	2	10	5709	5718	20 %	60 %	20 %	0 %	392427897
6	NC_018073	AATAT	2	10	6515	6524	60 %	40 %	0 %	0 %	392427897
7	NC_018073	TAAAT	2	10	6924	6933	60 %	40 %	0 %	0 %	392427897
8	NC_018073	TACTT	2	10	7851	7860	20 %	60 %	0 %	20 %	392427897
9	NC_018073	TGGGT	2	10	9196	9205	0 %	40 %	60 %	0 %	392427898
10	NC_018073	TATCT	2	10	10787	10796	20 %	60 %	0 %	20 %	392427899
11	NC_018073	CTTTT	2	10	11839	11848	0 %	80 %	0 %	20 %	392427900
12	NC_018073	GTATG	2	10	14330	14339	20 %	40 %	40 %	0 %	392427902
13	NC_018073	ATACT	2	10	14772	14781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018073	TCTAT	2	10	15418	15427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018073	AACAG	2	10	15517	15526	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018073	TGGTA	2	10	16670	16679	20 %	40 %	40 %	0 %	392427903
17	NC_018073	TCGTG	2	10	20519	20528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018073	GGGAG	2	10	21781	21790	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018073	AGGGA	2	10	23990	23999	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018073	AGTGA	2	10	29522	29531	40 %	20 %	40 %	0 %	392427908
21	NC_018073	TAAGT	2	10	31335	31344	40 %	40 %	20 %	0 %	392427910
22	NC_018073	TGAAA	2	10	31970	31979	60 %	20 %	20 %	0 %	392427910
23	NC_018073	TTGAT	2	10	33084	33093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018073	AAACC	2	10	35825	35834	60 %	0 %	0 %	40 %	392427913
25	NC_018073	CAGCT	2	10	36753	36762	20 %	20 %	20 %	40 %	392427913
26	NC_018073	AAATG	2	10	39398	39407	60 %	20 %	20 %	0 %	392427915
27	NC_018073	TTGGG	2	10	42228	42237	0 %	40 %	60 %	0 %	392427919
28	NC_018073	GGTTT	2	10	45018	45027	0 %	60 %	40 %	0 %	392427920
29	NC_018073	GTACC	2	10	45371	45380	20 %	20 %	20 %	40 %	392427920
30	NC_018073	ATTTT	2	10	46205	46214	20 %	80 %	0 %	0 %	392427921
31	NC_018073	ATCAA	2	10	46280	46289	60 %	20 %	0 %	20 %	392427921
32	NC_018073	GAATT	2	10	48679	48688	40 %	40 %	20 %	0 %	392427923
33	NC_018073	ACAAA	2	10	48765	48774	80 %	0 %	0 %	20 %	392427923
34	NC_018073	TTTTG	2	10	48880	48889	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018073	TATGA	2	10	49060	49069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018073	AAACA	2	10	50292	50301	80 %	0 %	0 %	20 %	392427924
37	NC_018073	TAAAA	2	10	51675	51684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018073	AAGCA	2	10	56594	56603	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018073	ATCTA	2	10	57105	57114	40 %	40 %	0 %	20 %	392427932
40	NC_018073	AGATA	2	10	58829	58838	60 %	20 %	20 %	0 %	392427933
41	NC_018073	TCTTT	2	10	60908	60917	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018073	CTTTT	2	10	60955	60964	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018073	TTGAA	2	10	63510	63519	40 %	40 %	20 %	0 %	392427936
44	NC_018073	GCTTT	2	10	65039	65048	0 %	60 %	20 %	20 %	392427938
45	NC_018073	ACATC	2	10	66503	66512	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_018073	TTGGC	2	10	67255	67264	0 %	40 %	40 %	20 %	392427941
47	NC_018073	TTAAC	2	10	69296	69305	40 %	40 %	0 %	20 %	392427943
48	NC_018073	CTATC	2	10	69363	69372	20 %	40 %	0 %	40 %	392427943
49	NC_018073	AGCAG	2	10	72087	72096	40 %	0 %	40 %	20 %	392427946
50	NC_018073	TCAAA	2	10	72627	72636	60 %	20 %	0 %	20 %	392427946
51	NC_018073	CTTTT	2	10	72745	72754	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018073	ACAAT	2	10	73809	73818	60 %	20 %	0 %	20 %	392427947
53	NC_018073	TTCCA	2	10	76040	76049	20 %	40 %	0 %	40 %	392427948
54	NC_018073	TGCTT	2	10	76902	76911	0 %	60 %	20 %	20 %	392427948
55	NC_018073	AATCC	2	10	78253	78262	40 %	20 %	0 %	40 %	392427950
56	NC_018073	TGGTA	2	10	80656	80665	20 %	40 %	40 %	0 %	392427952
57	NC_018073	AAAAT	2	10	81033	81042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018073	TAAAT	2	10	82087	82096	60 %	40 %	0 %	0 %	392427953
59	NC_018073	CAATT	2	10	82597	82606	40 %	40 %	0 %	20 %	392427953
60	NC_018073	AATCA	2	10	85272	85281	60 %	20 %	0 %	20 %	392427955
61	NC_018073	AATAA	2	10	86298	86307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018073	TTGGA	2	10	86443	86452	20 %	40 %	40 %	0 %	392427956
63	NC_018073	TTATA	2	10	91975	91984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018073	TTGGA	2	10	92006	92015	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018073	TCACC	2	10	93769	93778	20 %	20 %	0 %	60 %	392427964
66	NC_018073	AAATA	2	10	93896	93905	80 %	20 %	0 %	0 %	392427964
67	NC_018073	TTTTA	2	10	98347	98356	20 %	80 %	0 %	0 %	392427968
68	NC_018073	TGAAA	2	10	99758	99767	60 %	20 %	20 %	0 %	392427969
69	NC_018073	AGTTG	2	10	101974	101983	20 %	40 %	40 %	0 %	392427973
70	NC_018073	GAAAT	2	10	102549	102558	60 %	20 %	20 %	0 %	392427973
71	NC_018073	TACCG	2	10	103554	103563	20 %	20 %	20 %	40 %	392427974
72	NC_018073	ATGGG	2	10	103813	103822	20 %	20 %	60 %	0 %	392427974
73	NC_018073	CTAGT	2	10	105532	105541	20 %	40 %	20 %	20 %	392427975
74	NC_018073	AAAAT	2	10	106263	106272	80 %	20 %	0 %	0 %	392427976
75	NC_018073	CTTTT	2	10	109373	109382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018073	TATAA	2	10	110256	110265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018073	AGTTC	2	10	113022	113031	20 %	40 %	20 %	20 %	392427980
78	NC_018073	GATAA	2	10	116078	116087	60 %	20 %	20 %	0 %	392427980
79	NC_018073	ATTGT	2	10	116939	116948	20 %	60 %	20 %	0 %	392427981
80	NC_018073	CTTTG	2	10	117364	117373	0 %	60 %	20 %	20 %	392427981
81	NC_018073	ACTGT	2	10	119078	119087	20 %	40 %	20 %	20 %	392427982
82	NC_018073	GTTTA	2	10	119389	119398	20 %	60 %	20 %	0 %	392427982
83	NC_018073	TTTGG	2	10	119501	119510	0 %	60 %	40 %	0 %	392427982
84	NC_018073	TCTAT	2	10	121828	121837	20 %	60 %	0 %	20 %	392427985
85	NC_018073	CAAAA	2	10	122699	122708	80 %	0 %	0 %	20 %	392427986
86	NC_018073	AAAAG	2	10	124242	124251	80 %	0 %	20 %	0 %	392427987
87	NC_018073	ATGAA	2	10	124325	124334	60 %	20 %	20 %	0 %	392427987
88	NC_018073	AGAAA	2	10	124616	124625	80 %	0 %	20 %	0 %	392427988
89	NC_018073	ATCAA	2	10	126058	126067	60 %	20 %	0 %	20 %	392427988
90	NC_018073	CTCGA	2	10	129560	129569	20 %	20 %	20 %	40 %	392427990
91	NC_018073	AAAGC	2	10	130374	130383	60 %	0 %	20 %	20 %	392427991
92	NC_018073	AGGAA	2	10	130624	130633	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018073	GAAAA	2	10	131485	131494	80 %	0 %	20 %	0 %	392427993
94	NC_018073	TGATA	2	10	132679	132688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018073	GGGGC	2	10	133606	133615	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018073	AAACG	2	10	133949	133958	60 %	0 %	20 %	20 %	392427995
97	NC_018073	GAATT	2	10	135610	135619	40 %	40 %	20 %	0 %	392427997
98	NC_018073	ATTTA	2	10	138725	138734	40 %	60 %	0 %	0 %	392427999
99	NC_018073	GTACG	2	10	139182	139191	20 %	20 %	40 %	20 %	392428000
100	NC_018073	TATTG	2	10	139653	139662	20 %	60 %	20 %	0 %	392428000
101	NC_018073	TTTGG	2	10	141471	141480	0 %	60 %	40 %	0 %	392428002
102	NC_018073	GTTGA	2	10	142254	142263	20 %	40 %	40 %	0 %	392428003
103	NC_018073	AGTTT	2	10	142535	142544	20 %	60 %	20 %	0 %	392428003
104	NC_018073	TAAAA	2	10	143557	143566	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018073	TTTTA	2	10	143595	143604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018073	TATAC	2	10	145874	145883	40 %	40 %	0 %	20 %	392428005
107	NC_018073	AATTA	2	10	147058	147067	60 %	40 %	0 %	0 %	392428006
108	NC_018073	TATAT	2	10	147150	147159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018073	TCTTT	2	10	148299	148308	0 %	80 %	0 %	20 %	392428008
110	NC_018073	TATGG	2	10	148877	148886	20 %	40 %	40 %	0 %	392428008
111	NC_018073	GGTTT	2	10	149480	149489	0 %	60 %	40 %	0 %	392428009
112	NC_018073	TAAAA	2	10	149749	149758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018073	AGATA	2	10	151308	151317	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018073	GAATG	2	10	151693	151702	40 %	20 %	40 %	0 %	392428012
115	NC_018073	ACAGC	2	10	152013	152022	40 %	0 %	20 %	40 %	392428012
116	NC_018073	GAGTT	2	10	153479	153488	20 %	40 %	40 %	0 %	392428013
117	NC_018073	AAGCA	2	10	153671	153680	60 %	0 %	20 %	20 %	392428013
118	NC_018073	AGAAC	2	10	155340	155349	60 %	0 %	20 %	20 %	392428016
119	NC_018073	AAAAG	2	10	155837	155846	80 %	0 %	20 %	0 %	392428016
120	NC_018073	TTTTG	2	10	156162	156171	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018073	TTGAA	2	10	156541	156550	40 %	40 %	20 %	0 %	392428017
122	NC_018073	TTTGA	2	10	156714	156723	20 %	60 %	20 %	0 %	392428017
123	NC_018073	GAGTA	2	10	157387	157396	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018073	TGATA	2	10	159162	159171	40 %	40 %	20 %	0 %	392428018
125	NC_018073	GTTCT	2	10	159766	159775	0 %	60 %	20 %	20 %	392428019
126	NC_018073	TTAAA	2	10	160893	160902	60 %	40 %	0 %	0 %	392428019
127	NC_018073	TTATT	2	10	161007	161016	20 %	80 %	0 %	0 %	392428020
128	NC_018073	AGGAT	2	10	162242	162251	40 %	20 %	40 %	0 %	392428021
129	NC_018073	GGAAA	2	10	163855	163864	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018073	CAAAT	2	10	165561	165570	60 %	20 %	0 %	20 %	392428024
131	NC_018073	GAGTT	2	10	168617	168626	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018073	AAAAG	2	10	168974	168983	80 %	0 %	20 %	0 %	392428026
133	NC_018073	TTGAA	2	10	173763	173772	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018073	AGAAC	2	10	174179	174188	60 %	0 %	20 %	20 %	392428033
135	NC_018073	GAAAT	2	10	174573	174582	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018073	AGCAA	2	10	174925	174934	60 %	0 %	20 %	20 %	392428034
137	NC_018073	GCAGT	2	10	176403	176412	20 %	20 %	40 %	20 %	392428035
138	NC_018073	AAGGA	2	10	176820	176829	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018073	TTTCG	2	10	178025	178034	0 %	60 %	20 %	20 %	392428036
140	NC_018073	GTTAT	2	10	179374	179383	20 %	60 %	20 %	0 %	392428038
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145	NC_018073	CGAAG	2	10	182264	182273	40 %	0 %	40 %	20 %	392428041
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152	NC_018073	GCCAA	2	10	194272	194281	40 %	0 %	20 %	40 %	392428052
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251	NC_018073	TCAGT	2	10	295973	295982	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
252	NC_018073	ATTTT	2	10	297998	298007	20 %	80 %	0 %	0 %	392428146
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256	NC_018073	TAGCT	2	10	303834	303843	20 %	40 %	20 %	20 %	392428154
257	NC_018073	ATCCA	2	10	305811	305820	40 %	20 %	0 %	40 %	392428154
258	NC_018073	GGGAT	2	10	305951	305960	20 %	20 %	60 %	0 %	392428154
259	NC_018073	ATAAA	2	10	308564	308573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_018073	GAAGT	2	10	308956	308965	40 %	20 %	40 %	0 %	392428157
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262	NC_018073	TCGTG	2	10	311901	311910	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
263	NC_018073	GGGAG	2	10	313163	313172	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
264	NC_018073	AGGGA	2	10	315372	315381	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_018073	AAAAT	2	10	315977	315986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_018073	TGGAA	2	10	316786	316795	40 %	20 %	40 %	0 %	392428161
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268	NC_018073	TAATT	2	10	317628	317637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018073	ATTTG	2	10	319299	319308	20 %	60 %	20 %	0 %	392428164
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401	NC_018073	CTTTA	2	10	497226	497235	20 %	60 %	0 %	20 %	392428323
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