MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 26591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018073	CTT	2	6	130	135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427892
2	NC_018073	ATT	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427892
3	NC_018073	TCA	2	6	182	187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427892
4	NC_018073	AAT	2	6	211	216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427892
5	NC_018073	AAG	2	6	242	247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427892
6	NC_018073	CAA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427892
7	NC_018073	TCC	2	6	306	311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392427892
8	NC_018073	CAA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427892
9	NC_018073	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427892
10	NC_018073	TGG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392427892
11	NC_018073	CTA	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427892
12	NC_018073	CTG	2	6	536	541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427892
13	NC_018073	AAG	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427892
14	NC_018073	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427892
15	NC_018073	CCA	2	6	820	825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392427892
16	NC_018073	AGA	2	6	864	869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427892
17	NC_018073	TGC	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427892
18	NC_018073	GAT	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427892
19	NC_018073	GAT	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427892
20	NC_018073	ACT	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018073	TAA	2	6	1469	1474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018073	ATA	2	6	1482	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018073	TAA	2	6	1517	1522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427893
24	NC_018073	ACC	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392427893
25	NC_018073	TAA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427893
26	NC_018073	CTT	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427893
27	NC_018073	TGT	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392427893
28	NC_018073	ATT	2	6	1932	1937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427893
29	NC_018073	GTC	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427893
30	NC_018073	AGA	2	6	2062	2067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427893
31	NC_018073	GAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427893
32	NC_018073	TGT	2	6	2099	2104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392427893
33	NC_018073	GAT	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427893
34	NC_018073	AAT	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427893
35	NC_018073	TCT	2	6	2336	2341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427893
36	NC_018073	GAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427893
37	NC_018073	TTA	2	6	2574	2579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427893
38	NC_018073	TGA	2	6	2585	2590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427893
39	NC_018073	ATG	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018073	TTG	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018073	ATT	2	6	2723	2728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018073	ATC	2	6	2877	2882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427894
43	NC_018073	TCT	2	6	3127	3132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427894
44	NC_018073	TAG	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427894
45	NC_018073	ACA	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427894
46	NC_018073	TAA	2	6	3205	3210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427894
47	NC_018073	TGA	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427894
48	NC_018073	CAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427894
49	NC_018073	AAT	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427894
50	NC_018073	CCT	2	6	3364	3369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018073	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018073	AAT	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018073	CAG	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427895
54	NC_018073	CAA	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427895
55	NC_018073	TCA	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427895
56	NC_018073	CAA	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427895
57	NC_018073	TGA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427895
58	NC_018073	AGA	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427895
59	NC_018073	ATT	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427895
60	NC_018073	ATA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427895
61	NC_018073	GCA	2	6	4201	4206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427895
62	NC_018073	GTA	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427895
63	NC_018073	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427895
64	NC_018073	GAT	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427895
65	NC_018073	AGC	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427895
66	NC_018073	TTA	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427895
67	NC_018073	AAG	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427895
68	NC_018073	CAC	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392427895
69	NC_018073	AGC	2	6	4434	4439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427895
70	NC_018073	ATG	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427895
71	NC_018073	GAA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427895
72	NC_018073	AAT	2	6	4651	4656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018073	GAT	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427896
74	NC_018073	GAA	2	6	4851	4856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427896
75	NC_018073	CAA	2	6	4876	4881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427896
76	NC_018073	CTG	2	6	5014	5019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427896
77	NC_018073	ATT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427896
78	NC_018073	GTC	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427896
79	NC_018073	ACA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427896
80	NC_018073	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427896
81	NC_018073	AGA	2	6	5150	5155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427896
82	NC_018073	ATT	2	6	5206	5211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427896
83	NC_018073	CAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427896
84	NC_018073	ATT	2	6	5269	5274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
85	NC_018073	ATT	2	6	5371	5376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
86	NC_018073	GAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427897
87	NC_018073	GAT	2	6	5506	5511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427897
88	NC_018073	CAA	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427897
89	NC_018073	GCT	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427897
90	NC_018073	TGA	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427897
91	NC_018073	TAC	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427897
92	NC_018073	GAA	2	6	6034	6039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427897
93	NC_018073	TAT	2	6	6089	6094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
94	NC_018073	TGA	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427897
95	NC_018073	AGC	2	6	6207	6212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392427897
96	NC_018073	TGT	2	6	6249	6254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392427897
97	NC_018073	CTT	2	6	6312	6317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427897
98	NC_018073	AGA	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427897
99	NC_018073	TTC	2	6	6474	6479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427897
100	NC_018073	ATA	2	6	6545	6550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392427897
101	NC_018073	TGT	2	6	6741	6746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392427897
102	NC_018073	GTG	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392427897
103	NC_018073	TGA	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427897
104	NC_018073	CAA	2	6	7063	7068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427897
105	NC_018073	AGA	2	6	7101	7106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427897
106	NC_018073	GCT	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392427897
107	NC_018073	CTA	2	6	7265	7270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427897
108	NC_018073	ATT	3	9	7411	7419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
109	NC_018073	TGA	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427897
110	NC_018073	AAC	2	6	7487	7492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427897
111	NC_018073	CTC	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392427897
112	NC_018073	CAA	2	6	7634	7639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427897
113	NC_018073	TTA	2	6	7685	7690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
114	NC_018073	AGG	2	6	7719	7724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392427897
115	NC_018073	CTT	2	6	7840	7845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392427897
116	NC_018073	ACA	3	9	7894	7902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427897
117	NC_018073	ATT	2	6	7903	7908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
118	NC_018073	ATC	2	6	8042	8047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392427897
119	NC_018073	GTG	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392427897
120	NC_018073	GGA	2	6	8232	8237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392427897
121	NC_018073	TGA	2	6	8337	8342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392427897
122	NC_018073	TGT	2	6	8448	8453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392427897
123	NC_018073	ACA	2	6	8526	8531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392427897
124	NC_018073	ATT	2	6	8585	8590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392427897
125	NC_018073	AGA	2	6	8631	8636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427897
126	NC_018073	AGA	2	6	8694	8699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427897
127	NC_018073	AAG	2	6	8743	8748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392427897
128	NC_018073	ATA	2	6	8816	8821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018073	TAT	2	6	8869	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018073	CGT	2	6	8879	8884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018073	AAG	2	6	8895	8900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018073	ATG	2	6	8967	8972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018073	TGC	2	6	9049	9054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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