MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Solibacillus silvestris StLB046 plasmid pSSIL1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018069	TTTA	2	8	1	8	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018069	ATTA	2	8	56	63	50 %	50 %	0 %	0 %	393202539
3	NC_018069	TAAT	2	8	223	230	50 %	50 %	0 %	0 %	393202539
4	NC_018069	TTTC	2	8	282	289	0 %	75 %	0 %	25 %	393202539
5	NC_018069	TCCA	2	8	325	332	25 %	25 %	0 %	50 %	393202539
6	NC_018069	TTTA	2	8	584	591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018069	GCTA	2	8	1414	1421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018069	ACTT	2	8	1763	1770	25 %	50 %	0 %	25 %	393202541
9	NC_018069	ATCA	2	8	1784	1791	50 %	25 %	0 %	25 %	393202541
10	NC_018069	TTCT	2	8	1859	1866	0 %	75 %	0 %	25 %	393202541
11	NC_018069	ACTG	2	8	2394	2401	25 %	25 %	25 %	25 %	393202541
12	NC_018069	TAAA	2	8	2816	2823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018069	TTTA	2	8	2864	2871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018069	ATGG	2	8	2941	2948	25 %	25 %	50 %	0 %	393202542
15	NC_018069	TCAC	2	8	3289	3296	25 %	25 %	0 %	50 %	393202542
16	NC_018069	ACAT	2	8	3453	3460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018069	TTCA	2	8	3753	3760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018069	GATG	2	8	4907	4914	25 %	25 %	50 %	0 %	393202544
19	NC_018069	GCTT	2	8	5029	5036	0 %	50 %	25 %	25 %	393202544
20	NC_018069	AGCG	2	8	5113	5120	25 %	0 %	50 %	25 %	393202544
21	NC_018069	TGGT	2	8	5260	5267	0 %	50 %	50 %	0 %	393202544
22	NC_018069	TTAA	2	8	5343	5350	50 %	50 %	0 %	0 %	393202544
23	NC_018069	CATC	2	8	5357	5364	25 %	25 %	0 %	50 %	393202544
24	NC_018069	TTTG	2	8	5660	5667	0 %	75 %	25 %	0 %	393202544
25	NC_018069	GTTA	2	8	6221	6228	25 %	50 %	25 %	0 %	393202544
26	NC_018069	TGGT	2	8	6233	6240	0 %	50 %	50 %	0 %	393202544
27	NC_018069	TGTA	2	8	6457	6464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018069	TTTC	2	8	6792	6799	0 %	75 %	0 %	25 %	393202545
29	NC_018069	AATG	2	8	7365	7372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018069	TAAA	2	8	7424	7431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018069	ATTA	2	8	7467	7474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018069	TGCT	2	8	7934	7941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018069	CTAT	2	8	8028	8035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018069	GCGA	2	8	8102	8109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018069	GAAA	2	8	8422	8429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018069	ATAA	2	8	8779	8786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018069	TACA	2	8	9099	9106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018069	CTAT	2	8	9145	9152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018069	AAGC	2	8	9194	9201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018069	CAGA	2	8	9787	9794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018069	TTCT	2	8	9822	9829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018069	CATT	2	8	9998	10005	25 %	50 %	0 %	25 %	393202548
43	NC_018069	TTAA	2	8	11260	11267	50 %	50 %	0 %	0 %	393202550
44	NC_018069	ATTG	2	8	11628	11635	25 %	50 %	25 %	0 %	393202550
45	NC_018069	CAAT	2	8	11890	11897	50 %	25 %	0 %	25 %	393202550
46	NC_018069	CAAA	2	8	12478	12485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018069	CTAT	2	8	12562	12569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018069	TTGT	2	8	12765	12772	0 %	75 %	25 %	0 %	393202551
49	NC_018069	GCAA	2	8	12945	12952	50 %	0 %	25 %	25 %	393202551
50	NC_018069	GCCA	2	8	13118	13125	25 %	0 %	25 %	50 %	393202551
51	NC_018069	CCCT	2	8	13344	13351	0 %	25 %	0 %	75 %	393202551
52	NC_018069	GAAT	2	8	13573	13580	50 %	25 %	25 %	0 %	393202551
53	NC_018069	GAAT	2	8	14347	14354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018069	ATCA	2	8	14411	14418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.