MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	CTGGCA	2	12	15078	15089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018068	AAAGGA	2	12	33400	33411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018068	GTCTTC	2	12	91161	91172	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018068	AAGCGA	2	12	94708	94719	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018068	CGCAGG	2	12	96682	96693	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018068	CTTTTT	2	12	98656	98667	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018068	GTCTTC	2	12	104412	104423	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018068	AAGCGA	2	12	108287	108298	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018068	CGCAGG	2	12	110262	110273	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018068	ACAAAA	2	12	114567	114578	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018068	TTAAAA	2	12	121951	121962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018068	AAGCGA	2	12	159128	159139	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018068	CGCAGG	2	12	161103	161114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018068	ATCATG	2	12	171416	171427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018068	GCTTTT	2	12	174671	174682	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018068	GAAAAA	2	12	179692	179703	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018068	AATCAG	2	12	209119	209130	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018068	CAAACC	2	12	245981	245992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018068	GTCTTC	2	12	253191	253202	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018068	CTTTTT	2	12	257055	257066	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018068	ATAAAA	2	12	270790	270801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018068	GCTAAA	2	12	316802	316813	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018068	GTCCTC	2	12	337205	337216	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018068	GTCTTC	2	12	338233	338244	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018068	TACCAA	2	12	342012	342023	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018068	CTCAGA	2	12	383081	383092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018068	TCGAAC	2	12	406303	406314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018068	AAGATA	2	12	433318	433329	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018068	CTGAAC	3	18	455697	455714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018068	TTTTGG	2	12	520128	520139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018068	AAGCTC	2	12	521171	521182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018068	AAAGGA	2	12	534916	534927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018068	TGTCGC	2	12	541344	541355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018068	CTCTAT	2	12	542857	542868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018068	AAATAA	2	12	549788	549799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018068	GAAAAA	2	12	552129	552140	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018068	CAAAAT	2	12	554295	554306	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018068	AGGAAT	2	12	564175	564186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018068	TATAAA	2	12	580250	580261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018068	GTCTTC	2	12	584797	584808	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018068	GGAGAT	2	12	619074	619085	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018068	TGAAAA	2	12	646870	646881	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018068	GAAAAA	2	12	666751	666762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018068	AATATT	2	12	667422	667433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018068	ATTAAA	2	12	677319	677330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018068	GGTACT	2	12	684191	684202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018068	CTCTTA	2	12	684847	684858	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018068	AAAGCC	3	18	692013	692030	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018068	GAAAAA	2	12	699864	699875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018068	ATCAGC	2	12	702504	702515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018068	TTTTAT	2	12	712256	712267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018068	TGCTGT	2	12	718262	718273	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018068	ATTAGA	2	12	737903	737914	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018068	GTCTTC	2	12	748385	748396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018068	TCTACT	2	12	795313	795324	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018068	AAATGA	2	12	809277	809288	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018068	GGATAA	2	12	809378	809389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018068	ATAACA	2	12	821967	821978	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018068	ACGAAA	2	12	824351	824362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018068	TTTATC	2	12	827941	827952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018068	AAGCGA	2	12	835821	835832	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018068	CGCAGG	2	12	837795	837806	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018068	GGGAAA	2	12	838908	838919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018068	AAATGT	2	12	851386	851397	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018068	CGAAGA	2	12	876496	876507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018068	AGCTTT	2	12	910213	910224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018068	ATTACA	2	12	945077	945088	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018068	TAAGTA	2	12	962319	962330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018068	GGGATT	2	12	984317	984328	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018068	GAAATT	2	12	992593	992604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018068	AAAATG	2	12	995712	995723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018068	CAGGAG	2	12	1009542	1009553	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018068	ATAAAT	2	12	1014699	1014710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018068	ATACTT	2	12	1017823	1017834	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018068	GGTTTT	2	12	1026879	1026890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018068	ATGACA	2	12	1047290	1047301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018068	AATATA	2	12	1049815	1049826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018068	AGTAAT	2	12	1129790	1129801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018068	GTCTTC	2	12	1137075	1137086	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018068	ACCTGA	4	24	1138301	1138324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018068	CTTGGG	2	12	1138338	1138349	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018068	GTCTTC	2	12	1166482	1166493	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018068	GGTTCC	2	12	1174239	1174250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018068	TCGAGT	2	12	1182337	1182348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018068	CTTAAC	2	12	1202194	1202205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018068	TATTTA	2	12	1260035	1260046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018068	GTTTTT	2	12	1265520	1265531	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018068	TAATTA	2	12	1306317	1306328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018068	ACGTAA	2	12	1334235	1334246	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018068	TAAAGT	2	12	1337122	1337133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018068	CAAAAT	2	12	1343788	1343799	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018068	ACTGAA	2	12	1345535	1345546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018068	TAAATA	2	12	1356620	1356631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018068	TCTTTT	2	12	1372555	1372566	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018068	AAAATC	2	12	1377685	1377696	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018068	TTTGGG	2	12	1418985	1418996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018068	GTTATA	2	12	1420458	1420469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018068	TAAGGA	2	12	1420888	1420899	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018068	GCAACT	2	12	1422822	1422833	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018068	CTTTTC	2	12	1450119	1450130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018068	AAAGTG	2	12	1470076	1470087	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018068	CAGCAT	2	12	1529536	1529547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018068	AATATC	2	12	1539764	1539775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018068	TGTGAC	2	12	1540845	1540856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018068	TTAGCT	2	12	1542282	1542293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018068	TACATA	2	12	1552409	1552420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018068	AACGGA	2	12	1560651	1560662	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018068	ACTAAA	2	12	1566459	1566470	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018068	CTTCGG	2	12	1577795	1577806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018068	TCTATG	2	12	1600384	1600395	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018068	GAGGCC	2	12	1610185	1610196	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018068	TAGTAA	2	12	1614083	1614094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018068	TTTTTC	2	12	1678463	1678474	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018068	GTATTA	2	12	1697392	1697403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018068	AACGTT	2	12	1698280	1698291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018068	TGACTT	2	12	1698786	1698797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018068	CACATA	2	12	1702491	1702502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018068	ATAATT	2	12	1702667	1702678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018068	TAATGT	2	12	1720986	1720997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018068	AGCTTT	2	12	1721127	1721138	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018068	CAATTA	2	12	1744642	1744653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018068	ATTGAT	2	12	1765783	1765794	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018068	GTCAGA	2	12	1767752	1767763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018068	GTATTA	2	12	1781382	1781393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018068	TGAAAC	2	12	1860202	1860213	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018068	AGGGAG	2	12	1862228	1862239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018068	GTTTTT	2	12	1868636	1868647	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018068	AACTCT	2	12	1874823	1874834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018068	GCACTT	2	12	1874838	1874849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018068	GAGTCT	2	12	1874862	1874873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018068	AAGTCT	2	12	1874874	1874885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_018068	CGGGAA	2	12	1895215	1895226	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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148	NC_018068	TCCCAT	2	12	2069079	2069090	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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250	NC_018068	GAAATT	2	12	3591278	3591289	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_018068	GAATTT	2	12	3593420	3593431	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_018068	CCTGCG	2	12	3652231	3652242	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
253	NC_018068	TCGCTT	2	12	3654205	3654216	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_018068	CCTGCG	2	12	3669894	3669905	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
255	NC_018068	TCGCTT	2	12	3671868	3671879	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_018068	CGGCTC	2	12	3671880	3671891	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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281	NC_018068	AAAAAT	2	12	4180622	4180633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.