MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 2500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	AGATA	2	10	1509	1518	60 %	20 %	20 %	0 %	392423461
2	NC_018068	TCAGA	2	10	6633	6642	40 %	20 %	20 %	20 %	392423465
3	NC_018068	AAATG	2	10	8535	8544	60 %	20 %	20 %	0 %	392423466
4	NC_018068	GTAAA	2	10	10803	10812	60 %	20 %	20 %	0 %	392423468
5	NC_018068	CAAAA	2	10	16048	16057	80 %	0 %	0 %	20 %	392423473
6	NC_018068	ATTAA	2	10	16279	16288	60 %	40 %	0 %	0 %	392423473
7	NC_018068	GTGCA	2	10	19448	19457	20 %	20 %	40 %	20 %	392423477
8	NC_018068	TAATG	2	10	20184	20193	40 %	40 %	20 %	0 %	392423477
9	NC_018068	CTGCC	2	10	21507	21516	0 %	20 %	20 %	60 %	392423477
10	NC_018068	CAGAA	2	10	23330	23339	60 %	0 %	20 %	20 %	392423478
11	NC_018068	ATTAT	2	10	26781	26790	40 %	60 %	0 %	0 %	392423480
12	NC_018068	AAACC	2	10	27043	27052	60 %	0 %	0 %	40 %	392423481
13	NC_018068	AAGAT	2	10	27977	27986	60 %	20 %	20 %	0 %	392423481
14	NC_018068	GTTAA	2	10	28060	28069	40 %	40 %	20 %	0 %	392423481
15	NC_018068	TTTGA	2	10	28716	28725	20 %	60 %	20 %	0 %	392423483
16	NC_018068	GAAGT	2	10	32337	32346	40 %	20 %	40 %	0 %	392423487
17	NC_018068	TAAAT	2	10	37010	37019	60 %	40 %	0 %	0 %	392423491
18	NC_018068	CTGAA	2	10	39128	39137	40 %	20 %	20 %	20 %	392423493
19	NC_018068	AGTTG	2	10	39800	39809	20 %	40 %	40 %	0 %	392423493
20	NC_018068	TCAAA	2	10	43176	43185	60 %	20 %	0 %	20 %	392423496
21	NC_018068	ATGGA	2	10	46552	46561	40 %	20 %	40 %	0 %	392423499
22	NC_018068	AGGGT	2	10	46725	46734	20 %	20 %	60 %	0 %	392423500
23	NC_018068	CTTTA	2	10	49861	49870	20 %	60 %	0 %	20 %	392423503
24	NC_018068	AACAT	2	10	52000	52009	60 %	20 %	0 %	20 %	392423504
25	NC_018068	ATGTT	2	10	54314	54323	20 %	60 %	20 %	0 %	392423506
26	NC_018068	GAGAA	2	10	57090	57099	60 %	0 %	40 %	0 %	392423509
27	NC_018068	AATAT	2	10	58473	58482	60 %	40 %	0 %	0 %	392423511
28	NC_018068	TTTGC	2	10	60377	60386	0 %	60 %	20 %	20 %	392423514
29	NC_018068	TGGGT	2	10	65797	65806	0 %	40 %	60 %	0 %	392423517
30	NC_018068	GTGGA	2	10	71069	71078	20 %	20 %	60 %	0 %	392423525
31	NC_018068	GATGG	2	10	71414	71423	20 %	20 %	60 %	0 %	392423525
32	NC_018068	AAATC	2	10	71701	71710	60 %	20 %	0 %	20 %	392423525
33	NC_018068	TGGAT	2	10	71799	71808	20 %	40 %	40 %	0 %	392423525
34	NC_018068	ATGGA	2	10	78034	78043	40 %	20 %	40 %	0 %	392423531
35	NC_018068	ATGTT	2	10	80741	80750	20 %	60 %	20 %	0 %	392423535
36	NC_018068	ACCCG	2	10	81058	81067	20 %	0 %	20 %	60 %	392423535
37	NC_018068	GAAGG	2	10	82510	82519	40 %	0 %	60 %	0 %	392423537
38	NC_018068	ATGAA	2	10	82861	82870	60 %	20 %	20 %	0 %	392423538
39	NC_018068	AATGA	2	10	88511	88520	60 %	20 %	20 %	0 %	392423544
40	NC_018068	GATAA	2	10	89493	89502	60 %	20 %	20 %	0 %	392423546
41	NC_018068	TGGCA	2	10	101805	101814	20 %	20 %	40 %	20 %	392423549
42	NC_018068	TTCTT	2	10	112151	112160	0 %	80 %	0 %	20 %	392423551
43	NC_018068	CCGTT	2	10	118082	118091	0 %	40 %	20 %	40 %	392423554
44	NC_018068	GGCTT	2	10	119191	119200	0 %	40 %	40 %	20 %	392423555
45	NC_018068	ATTTT	2	10	119235	119244	20 %	80 %	0 %	0 %	392423555
46	NC_018068	GGACG	2	10	125248	125257	20 %	0 %	60 %	20 %	392423560
47	NC_018068	AAGCC	2	10	125996	126005	40 %	0 %	20 %	40 %	392423561
48	NC_018068	GAAAG	2	10	128260	128269	60 %	0 %	40 %	0 %	392423562
49	NC_018068	TACAA	2	10	128642	128651	60 %	20 %	0 %	20 %	392423562
50	NC_018068	ATAGA	2	10	128668	128677	60 %	20 %	20 %	0 %	392423562
51	NC_018068	TTTGG	2	10	130802	130811	0 %	60 %	40 %	0 %	392423564
52	NC_018068	AACCC	2	10	131259	131268	40 %	0 %	0 %	60 %	392423564
53	NC_018068	ATGAT	2	10	133815	133824	40 %	40 %	20 %	0 %	392423567
54	NC_018068	ATTGG	2	10	135432	135441	20 %	40 %	40 %	0 %	392423568
55	NC_018068	CAAAA	2	10	135657	135666	80 %	0 %	0 %	20 %	392423568
56	NC_018068	GATTC	2	10	135786	135795	20 %	40 %	20 %	20 %	392423568
57	NC_018068	GCTTG	2	10	138255	138264	0 %	40 %	40 %	20 %	392423570
58	NC_018068	GAAAA	2	10	140332	140341	80 %	0 %	20 %	0 %	392423572
59	NC_018068	TCTTA	2	10	141438	141447	20 %	60 %	0 %	20 %	392423574
60	NC_018068	TGCTC	2	10	143727	143736	0 %	40 %	20 %	40 %	392423576
61	NC_018068	CATTC	2	10	144980	144989	20 %	40 %	0 %	40 %	392423576
62	NC_018068	CTGGA	2	10	147521	147530	20 %	20 %	40 %	20 %	392423578
63	NC_018068	GTTAT	2	10	149704	149713	20 %	60 %	20 %	0 %	392423579
64	NC_018068	AGCTG	2	10	150887	150896	20 %	20 %	40 %	20 %	392423579
65	NC_018068	AATAA	2	10	153499	153508	80 %	20 %	0 %	0 %	392423580
66	NC_018068	ATTTA	2	10	164565	164574	40 %	60 %	0 %	0 %	392423583
67	NC_018068	GTTTT	2	10	168661	168670	0 %	80 %	20 %	0 %	392423588
68	NC_018068	AGAAA	2	10	174405	174414	80 %	0 %	20 %	0 %	392423591
69	NC_018068	TGGAT	2	10	177034	177043	20 %	40 %	40 %	0 %	392423595
70	NC_018068	CTTAA	2	10	177461	177470	40 %	40 %	0 %	20 %	392423595
71	NC_018068	GTCTT	2	10	178518	178527	0 %	60 %	20 %	20 %	392423596
72	NC_018068	GGATT	2	10	181413	181422	20 %	40 %	40 %	0 %	392423600
73	NC_018068	TTAAT	2	10	182736	182745	40 %	60 %	0 %	0 %	392423601
74	NC_018068	TCAAT	2	10	185867	185876	40 %	40 %	0 %	20 %	392423603
75	NC_018068	TCTAT	2	10	185917	185926	20 %	60 %	0 %	20 %	392423603
76	NC_018068	AATAT	2	10	187471	187480	60 %	40 %	0 %	0 %	392423604
77	NC_018068	GAAAA	2	10	195380	195389	80 %	0 %	20 %	0 %	392423610
78	NC_018068	ATTGA	2	10	196461	196470	40 %	40 %	20 %	0 %	392423611
79	NC_018068	AAGCA	2	10	196768	196777	60 %	0 %	20 %	20 %	392423611
80	NC_018068	GATAT	2	10	197230	197239	40 %	40 %	20 %	0 %	392423611
81	NC_018068	AAAAG	2	10	199087	199096	80 %	0 %	20 %	0 %	392423613
82	NC_018068	ATTAT	2	10	200076	200085	40 %	60 %	0 %	0 %	392423614
83	NC_018068	TGGAT	2	10	201271	201280	20 %	40 %	40 %	0 %	392423614
84	NC_018068	AGGAA	2	10	204411	204420	60 %	0 %	40 %	0 %	392423620
85	NC_018068	GTTTT	2	10	205560	205569	0 %	80 %	20 %	0 %	392423621
86	NC_018068	GAAAA	2	10	205742	205751	80 %	0 %	20 %	0 %	392423621
87	NC_018068	AGTCC	2	10	206799	206808	20 %	20 %	20 %	40 %	392423622
88	NC_018068	GGAAG	2	10	208242	208251	40 %	0 %	60 %	0 %	392423623
89	NC_018068	ATCGT	2	10	209661	209670	20 %	40 %	20 %	20 %	392423625
90	NC_018068	ATTAA	2	10	214502	214511	60 %	40 %	0 %	0 %	392423631
91	NC_018068	AGATG	2	10	214873	214882	40 %	20 %	40 %	0 %	392423631
92	NC_018068	AGAAA	2	10	215680	215689	80 %	0 %	20 %	0 %	392423631
93	NC_018068	ATGGA	2	10	219811	219820	40 %	20 %	40 %	0 %	392423633
94	NC_018068	GAAAA	2	10	222483	222492	80 %	0 %	20 %	0 %	392423635
95	NC_018068	AAACA	2	10	223996	224005	80 %	0 %	0 %	20 %	392423636
96	NC_018068	AACGT	2	10	227363	227372	40 %	20 %	20 %	20 %	392423640
97	NC_018068	GGCCA	2	10	232229	232238	20 %	0 %	40 %	40 %	392423645
98	NC_018068	TTATA	2	10	234122	234131	40 %	60 %	0 %	0 %	392423647
99	NC_018068	TTCCC	2	10	235152	235161	0 %	40 %	0 %	60 %	392423649
100	NC_018068	AATCA	2	10	235709	235718	60 %	20 %	0 %	20 %	392423649
101	NC_018068	GGTCA	2	10	238221	238230	20 %	20 %	40 %	20 %	392423650
102	NC_018068	GATAA	2	10	238557	238566	60 %	20 %	20 %	0 %	392423650
103	NC_018068	CAGGG	2	10	239056	239065	20 %	0 %	60 %	20 %	392423651
104	NC_018068	AACAA	2	10	239122	239131	80 %	0 %	0 %	20 %	392423651
105	NC_018068	TGTAT	2	10	240889	240898	20 %	60 %	20 %	0 %	392423652
106	NC_018068	TCGAT	2	10	243221	243230	20 %	40 %	20 %	20 %	392423655
107	NC_018068	CAAGG	2	10	243453	243462	40 %	0 %	40 %	20 %	392423655
108	NC_018068	TCTAT	2	10	249057	249066	20 %	60 %	0 %	20 %	392423658
109	NC_018068	AATAA	2	10	250261	250270	80 %	20 %	0 %	0 %	392423659
110	NC_018068	TTCTC	2	10	255116	255125	0 %	60 %	0 %	40 %	392423664
111	NC_018068	TTGGA	2	10	255207	255216	20 %	40 %	40 %	0 %	392423664
112	NC_018068	AGTAA	2	10	255579	255588	60 %	20 %	20 %	0 %	392423664
113	NC_018068	CTATC	2	10	256119	256128	20 %	40 %	0 %	40 %	392423665
114	NC_018068	CAAGA	2	10	258231	258240	60 %	0 %	20 %	20 %	392423667
115	NC_018068	ATCAC	2	10	261887	261896	40 %	20 %	0 %	40 %	392423671
116	NC_018068	TGAAC	2	10	268745	268754	40 %	20 %	20 %	20 %	392423677
117	NC_018068	ATTCG	2	10	269745	269754	20 %	40 %	20 %	20 %	392423677
118	NC_018068	TGAAA	2	10	271760	271769	60 %	20 %	20 %	0 %	392423679
119	NC_018068	CTCAG	2	10	271810	271819	20 %	20 %	20 %	40 %	392423679
120	NC_018068	CGAAA	2	10	272236	272245	60 %	0 %	20 %	20 %	392423679
121	NC_018068	CAACT	2	10	273826	273835	40 %	20 %	0 %	40 %	392423681
122	NC_018068	CTTTT	2	10	274063	274072	0 %	80 %	0 %	20 %	392423682
123	NC_018068	AGTTT	2	10	275911	275920	20 %	60 %	20 %	0 %	392423683
124	NC_018068	AGGGC	2	10	276648	276657	20 %	0 %	60 %	20 %	392423684
125	NC_018068	CAAAG	2	10	280611	280620	60 %	0 %	20 %	20 %	392423689
126	NC_018068	TATGT	2	10	283072	283081	20 %	60 %	20 %	0 %	392423690
127	NC_018068	TCCTT	2	10	293179	293188	0 %	60 %	0 %	40 %	392423699
128	NC_018068	TGATT	2	10	293490	293499	20 %	60 %	20 %	0 %	392423699
129	NC_018068	TCTTT	2	10	294530	294539	0 %	80 %	0 %	20 %	392423701
130	NC_018068	CTCTG	2	10	295357	295366	0 %	40 %	20 %	40 %	392423702
131	NC_018068	TCAAT	2	10	299436	299445	40 %	40 %	0 %	20 %	392423706
132	NC_018068	AGCTC	2	10	300400	300409	20 %	20 %	20 %	40 %	392423708
133	NC_018068	CCTGG	2	10	300733	300742	0 %	20 %	40 %	40 %	392423708
134	NC_018068	AATCC	2	10	304090	304099	40 %	20 %	0 %	40 %	392423710
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