MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 61733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	TTC	2	6	187	192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423460
2	NC_018068	CCT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018068	AAC	2	6	239	244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018068	AAT	2	6	369	374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018068	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018068	CTA	2	6	441	446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018068	TAT	2	6	468	473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018068	CCA	2	6	583	588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423461
9	NC_018068	TAA	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423461
10	NC_018068	TCC	2	6	781	786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423461
11	NC_018068	TGC	3	9	984	992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423461
12	NC_018068	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
13	NC_018068	TGA	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423461
14	NC_018068	ATT	2	6	1324	1329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
15	NC_018068	TCA	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423461
16	NC_018068	CCG	2	6	1342	1347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423461
17	NC_018068	TTA	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
18	NC_018068	ATT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
19	NC_018068	TCG	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423461
20	NC_018068	ACA	2	6	1837	1842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423461
21	NC_018068	AGA	2	6	1898	1903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423461
22	NC_018068	ATA	2	6	2025	2030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018068	CTG	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018068	TAC	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018068	ACT	2	6	2123	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018068	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018068	TTA	3	9	2139	2147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018068	AGG	2	6	2178	2183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018068	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423462
30	NC_018068	TAA	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423462
31	NC_018068	GAA	2	6	2374	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
32	NC_018068	ATT	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
33	NC_018068	GTT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423462
34	NC_018068	ATT	2	6	2473	2478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
35	NC_018068	GAA	2	6	2524	2529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
36	NC_018068	GAA	2	6	2629	2634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
37	NC_018068	ATT	2	6	2767	2772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
38	NC_018068	TAA	2	6	2841	2846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423462
39	NC_018068	GTT	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423462
40	NC_018068	TAT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
41	NC_018068	ATT	2	6	3307	3312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
42	NC_018068	ATG	3	9	3341	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
43	NC_018068	TAT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
44	NC_018068	AGA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423463
45	NC_018068	GAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
46	NC_018068	TTA	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
47	NC_018068	TAA	2	6	3759	3764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423463
48	NC_018068	TTC	2	6	3875	3880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423463
49	NC_018068	TGA	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
50	NC_018068	TGA	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
51	NC_018068	TTA	2	6	3969	3974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
52	NC_018068	TTA	2	6	4024	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
53	NC_018068	TTG	2	6	4070	4075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423463
54	NC_018068	TGA	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
55	NC_018068	ATT	2	6	4101	4106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
56	NC_018068	GAT	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
57	NC_018068	CTT	2	6	4219	4224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423463
58	NC_018068	TTA	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
59	NC_018068	TAA	2	6	4274	4279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423463
60	NC_018068	AAC	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423463
61	NC_018068	AGG	3	9	4381	4389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423463
62	NC_018068	TGG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423464
63	NC_018068	TAA	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423464
64	NC_018068	GTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423464
65	NC_018068	ATA	2	6	4505	4510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423464
66	NC_018068	ACT	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423464
67	NC_018068	TCA	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423464
68	NC_018068	ACA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423464
69	NC_018068	ATT	2	6	4664	4669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018068	AAT	2	6	4763	4768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018068	TAT	2	6	4780	4785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018068	GGA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018068	GAT	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
74	NC_018068	CAA	2	6	4920	4925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423465
75	NC_018068	GCA	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423465
76	NC_018068	TCA	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423465
77	NC_018068	TTG	2	6	4959	4964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423465
78	NC_018068	ATA	2	6	4965	4970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
79	NC_018068	TGA	2	6	4975	4980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
80	NC_018068	ATA	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
81	NC_018068	CGG	2	6	5131	5136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423465
82	NC_018068	CGG	2	6	5143	5148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423465
83	NC_018068	GTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423465
84	NC_018068	TAA	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
85	NC_018068	AAT	2	6	5645	5650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
86	NC_018068	TTA	2	6	5709	5714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423465
87	NC_018068	GAT	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
88	NC_018068	CAG	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423465
89	NC_018068	TCA	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423465
90	NC_018068	GGT	2	6	6119	6124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423465
91	NC_018068	CGT	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423465
92	NC_018068	GAT	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
93	NC_018068	TAA	2	6	6301	6306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
94	NC_018068	TAT	2	6	6357	6362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423465
95	NC_018068	TAA	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
96	NC_018068	AAC	2	6	6577	6582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423465
97	NC_018068	TTC	2	6	6779	6784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423466
98	NC_018068	ATG	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
99	NC_018068	ATG	2	6	7202	7207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
100	NC_018068	AAG	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
101	NC_018068	TTC	2	6	7266	7271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423466
102	NC_018068	CTC	2	6	7304	7309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423466
103	NC_018068	ATG	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
104	NC_018068	TTG	2	6	7532	7537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
105	NC_018068	TAA	2	6	7560	7565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
106	NC_018068	ATT	2	6	7699	7704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
107	NC_018068	TTG	2	6	7756	7761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
108	NC_018068	TAA	2	6	7770	7775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
109	NC_018068	ATT	2	6	7811	7816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
110	NC_018068	TGA	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
111	NC_018068	AAT	2	6	7978	7983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
112	NC_018068	ATT	2	6	8155	8160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
113	NC_018068	GAA	2	6	8260	8265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
114	NC_018068	GTA	2	6	8272	8277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
115	NC_018068	AGA	3	9	8373	8381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
116	NC_018068	TTA	2	6	8399	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
117	NC_018068	ATT	2	6	8582	8587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
118	NC_018068	GAA	2	6	8619	8624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
119	NC_018068	TCC	2	6	8647	8652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423466
120	NC_018068	TGA	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
121	NC_018068	TTG	2	6	8737	8742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
122	NC_018068	GAA	3	9	8776	8784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
123	NC_018068	GAA	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
124	NC_018068	ATG	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
125	NC_018068	GGC	2	6	8953	8958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423466
126	NC_018068	TGA	2	6	8972	8977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
127	NC_018068	AGT	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
128	NC_018068	TTA	2	6	9044	9049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
129	NC_018068	TAT	2	6	9060	9065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
130	NC_018068	ACG	2	6	9121	9126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423466
131	NC_018068	CGA	2	6	9135	9140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423466
132	NC_018068	TGA	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
133	NC_018068	GTT	2	6	9151	9156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
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256	NC_018068	CAA	2	6	19024	19029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_018068	AGT	2	6	19082	19087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018068	TTC	2	6	19129	19134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_018068	GAA	2	6	19160	19165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_018068	AGC	2	6	19278	19283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423477
262	NC_018068	GCT	2	6	19372	19377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423477
263	NC_018068	TGC	2	6	19440	19445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423477
264	NC_018068	TGA	2	6	19517	19522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423477
265	NC_018068	ATC	2	6	19619	19624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423477
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