MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 50425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	TTC	2	6	187	192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423460
2	NC_018068	CCA	2	6	583	588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423461
3	NC_018068	TAA	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423461
4	NC_018068	TCC	2	6	781	786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423461
5	NC_018068	TGC	3	9	984	992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423461
6	NC_018068	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
7	NC_018068	TGA	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423461
8	NC_018068	ATT	2	6	1324	1329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
9	NC_018068	TCA	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423461
10	NC_018068	CCG	2	6	1342	1347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423461
11	NC_018068	TTA	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
12	NC_018068	ATT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
13	NC_018068	TCG	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423461
14	NC_018068	ACA	2	6	1837	1842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423461
15	NC_018068	AGA	2	6	1898	1903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423461
16	NC_018068	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423462
17	NC_018068	TAA	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423462
18	NC_018068	GAA	2	6	2374	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
19	NC_018068	ATT	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
20	NC_018068	GTT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423462
21	NC_018068	ATT	2	6	2473	2478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
22	NC_018068	GAA	2	6	2524	2529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
23	NC_018068	GAA	2	6	2629	2634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
24	NC_018068	ATT	2	6	2767	2772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
25	NC_018068	TAA	2	6	2841	2846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423462
26	NC_018068	GTT	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423462
27	NC_018068	TAT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
28	NC_018068	ATT	2	6	3307	3312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
29	NC_018068	ATG	3	9	3341	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
30	NC_018068	TAT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
31	NC_018068	AGA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423463
32	NC_018068	GAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
33	NC_018068	TTA	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
34	NC_018068	TAA	2	6	3759	3764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423463
35	NC_018068	TTC	2	6	3875	3880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423463
36	NC_018068	TGA	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
37	NC_018068	TGA	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
38	NC_018068	TTA	2	6	3969	3974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
39	NC_018068	TTA	2	6	4024	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
40	NC_018068	TTG	2	6	4070	4075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423463
41	NC_018068	TGA	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
42	NC_018068	ATT	2	6	4101	4106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
43	NC_018068	GAT	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
44	NC_018068	CTT	2	6	4219	4224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423463
45	NC_018068	TTA	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
46	NC_018068	TAA	2	6	4274	4279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423463
47	NC_018068	AAC	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423463
48	NC_018068	AGG	3	9	4381	4389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423463
49	NC_018068	TGG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423464
50	NC_018068	TAA	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423464
51	NC_018068	GTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423464
52	NC_018068	ATA	2	6	4505	4510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423464
53	NC_018068	ACT	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423464
54	NC_018068	TCA	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423464
55	NC_018068	ACA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423464
56	NC_018068	GAT	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
57	NC_018068	CAA	2	6	4920	4925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423465
58	NC_018068	GCA	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423465
59	NC_018068	TCA	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423465
60	NC_018068	TTG	2	6	4959	4964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423465
61	NC_018068	ATA	2	6	4965	4970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
62	NC_018068	TGA	2	6	4975	4980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
63	NC_018068	ATA	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
64	NC_018068	CGG	2	6	5131	5136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423465
65	NC_018068	CGG	2	6	5143	5148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423465
66	NC_018068	GTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423465
67	NC_018068	TAA	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
68	NC_018068	AAT	2	6	5645	5650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
69	NC_018068	TTA	2	6	5709	5714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423465
70	NC_018068	GAT	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
71	NC_018068	CAG	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423465
72	NC_018068	TCA	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423465
73	NC_018068	GGT	2	6	6119	6124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423465
74	NC_018068	CGT	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423465
75	NC_018068	GAT	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
76	NC_018068	TAA	2	6	6301	6306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
77	NC_018068	TAT	2	6	6357	6362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423465
78	NC_018068	TAA	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
79	NC_018068	AAC	2	6	6577	6582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423465
80	NC_018068	TTC	2	6	6779	6784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423466
81	NC_018068	ATG	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
82	NC_018068	ATG	2	6	7202	7207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
83	NC_018068	AAG	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
84	NC_018068	TTC	2	6	7266	7271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423466
85	NC_018068	CTC	2	6	7304	7309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423466
86	NC_018068	ATG	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
87	NC_018068	TTG	2	6	7532	7537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
88	NC_018068	TAA	2	6	7560	7565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
89	NC_018068	ATT	2	6	7699	7704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
90	NC_018068	TTG	2	6	7756	7761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
91	NC_018068	TAA	2	6	7770	7775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
92	NC_018068	ATT	2	6	7811	7816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
93	NC_018068	TGA	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
94	NC_018068	AAT	2	6	7978	7983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
95	NC_018068	ATT	2	6	8155	8160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
96	NC_018068	GAA	2	6	8260	8265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
97	NC_018068	GTA	2	6	8272	8277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
98	NC_018068	AGA	3	9	8373	8381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
99	NC_018068	TTA	2	6	8399	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
100	NC_018068	ATT	2	6	8582	8587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
101	NC_018068	GAA	2	6	8619	8624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
102	NC_018068	TCC	2	6	8647	8652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423466
103	NC_018068	TGA	2	6	8691	8696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
104	NC_018068	TTG	2	6	8737	8742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
105	NC_018068	GAA	3	9	8776	8784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
106	NC_018068	GAA	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
107	NC_018068	ATG	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
108	NC_018068	GGC	2	6	8953	8958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423466
109	NC_018068	TGA	2	6	8972	8977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
110	NC_018068	AGT	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
111	NC_018068	TTA	2	6	9044	9049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
112	NC_018068	TAT	2	6	9060	9065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
113	NC_018068	ACG	2	6	9121	9126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423466
114	NC_018068	CGA	2	6	9135	9140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423466
115	NC_018068	TGA	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
116	NC_018068	GTT	2	6	9151	9156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
117	NC_018068	GGC	2	6	9391	9396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423467
118	NC_018068	TCA	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423467
119	NC_018068	GAC	2	6	9411	9416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423467
120	NC_018068	GAA	2	6	9439	9444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423467
121	NC_018068	ATT	2	6	9532	9537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423467
122	NC_018068	TGT	2	6	9552	9557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423467
123	NC_018068	TTG	2	6	9596	9601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423467
124	NC_018068	CGG	2	6	9662	9667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423467
125	NC_018068	TAA	2	6	9684	9689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423467
126	NC_018068	AGC	2	6	9762	9767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423467
127	NC_018068	GTT	2	6	9805	9810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423467
128	NC_018068	GAA	2	6	9874	9879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423467
129	NC_018068	GCT	2	6	9889	9894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423467
130	NC_018068	GTT	2	6	9955	9960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423467
131	NC_018068	GCA	2	6	9967	9972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423467
132	NC_018068	TGC	2	6	9996	10001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423467
133	NC_018068	ATG	2	6	10006	10011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423467
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135	NC_018068	ATT	2	6	10353	10358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423468
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252	NC_018068	GGC	2	6	22165	22170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423477
253	NC_018068	GAT	2	6	22195	22200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423477
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