MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.01

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018066	TTTGG	2	10	105	114	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018066	ATTTT	2	10	3793	3802	20 %	80 %	0 %	0 %	392423392
3	NC_018066	AAGTA	2	10	5469	5478	60 %	20 %	20 %	0 %	392423396
4	NC_018066	AAATT	2	10	8857	8866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018066	GTATT	2	10	13411	13420	20 %	60 %	20 %	0 %	392423407
6	NC_018066	GGTCA	2	10	13951	13960	20 %	20 %	40 %	20 %	392423407
7	NC_018066	GTAAT	2	10	14668	14677	40 %	40 %	20 %	0 %	392423407
8	NC_018066	TAATA	2	10	14690	14699	60 %	40 %	0 %	0 %	392423407
9	NC_018066	CATTT	2	10	16295	16304	20 %	60 %	0 %	20 %	392423407
10	NC_018066	CTATT	2	10	16430	16439	20 %	60 %	0 %	20 %	392423407
11	NC_018066	CTATT	2	10	17048	17057	20 %	60 %	0 %	20 %	392423407
12	NC_018066	CTAAT	2	10	18027	18036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018066	ACTAA	2	10	18393	18402	60 %	20 %	0 %	20 %	392423408
14	NC_018066	CAAGC	2	10	19348	19357	40 %	0 %	20 %	40 %	392423409
15	NC_018066	TTGAA	2	10	20823	20832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018066	TATGC	2	10	22054	22063	20 %	40 %	20 %	20 %	392423413
17	NC_018066	CTATA	2	10	24228	24237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018066	AAAAG	2	10	25728	25737	80 %	0 %	20 %	0 %	392423418
19	NC_018066	TATTT	3	15	26009	26023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018066	CTTTT	2	10	26040	26049	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018066	TAGAT	2	10	30541	30550	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018066	TTTGG	2	10	32174	32183	0 %	60 %	40 %	0 %	392423426
23	NC_018066	AACTC	2	10	32603	32612	40 %	20 %	0 %	40 %	392423426
24	NC_018066	ACTTT	2	10	32883	32892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018066	TTCTT	2	10	33732	33741	0 %	80 %	0 %	20 %	392423427
26	NC_018066	TCTCA	2	10	34183	34192	20 %	40 %	0 %	40 %	392423428
27	NC_018066	CTCCC	2	10	34759	34768	0 %	20 %	0 %	80 %	392423429
28	NC_018066	GATAA	2	10	35282	35291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018066	TTACT	2	10	35558	35567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018066	CTCGT	2	10	35766	35775	0 %	40 %	20 %	40 %	392423430
31	NC_018066	CTTTT	2	10	37081	37090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018066	AAATA	2	10	43868	43877	80 %	20 %	0 %	0 %	392423441
33	NC_018066	ATTAA	2	10	44452	44461	60 %	40 %	0 %	0 %	392423442
34	NC_018066	AGGGG	2	10	45540	45549	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018066	TTTGT	2	10	48857	48866	0 %	80 %	20 %	0 %	392423449
36	NC_018066	GAATG	2	10	51870	51879	40 %	20 %	40 %	0 %	392423452
37	NC_018066	TTTTA	2	10	53930	53939	20 %	80 %	0 %	0 %	392423453
38	NC_018066	TTATG	2	10	56396	56405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018066	TTTAG	2	10	56410	56419	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018066	GGAGT	2	10	57156	57165	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.