MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.01

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018066	TC	4	8	578	585	0 %	50 %	0 %	50 %	392423389
2	NC_018066	AT	3	6	1917	1922	50 %	50 %	0 %	0 %	392423391
3	NC_018066	AG	3	6	2191	2196	50 %	0 %	50 %	0 %	392423391
4	NC_018066	CT	3	6	2203	2208	0 %	50 %	0 %	50 %	392423391
5	NC_018066	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	392423392
6	NC_018066	CT	3	6	3267	3272	0 %	50 %	0 %	50 %	392423392
7	NC_018066	TA	3	6	3301	3306	50 %	50 %	0 %	0 %	392423392
8	NC_018066	TC	3	6	4930	4935	0 %	50 %	0 %	50 %	392423394
9	NC_018066	TG	3	6	7576	7581	0 %	50 %	50 %	0 %	392423399
10	NC_018066	GT	3	6	8024	8029	0 %	50 %	50 %	0 %	392423400
11	NC_018066	GA	3	6	8778	8783	50 %	0 %	50 %	0 %	392423402
12	NC_018066	AT	3	6	11141	11146	50 %	50 %	0 %	0 %	392423405
13	NC_018066	AT	4	8	12183	12190	50 %	50 %	0 %	0 %	392423406
14	NC_018066	TG	3	6	14492	14497	0 %	50 %	50 %	0 %	392423407
15	NC_018066	TG	3	6	14753	14758	0 %	50 %	50 %	0 %	392423407
16	NC_018066	TA	3	6	15004	15009	50 %	50 %	0 %	0 %	392423407
17	NC_018066	TG	3	6	15196	15201	0 %	50 %	50 %	0 %	392423407
18	NC_018066	CA	3	6	17936	17941	50 %	0 %	0 %	50 %	392423407
19	NC_018066	TG	3	6	18803	18808	0 %	50 %	50 %	0 %	392423408
20	NC_018066	GA	3	6	18809	18814	50 %	0 %	50 %	0 %	392423408
21	NC_018066	GC	3	6	20324	20329	0 %	0 %	50 %	50 %	392423410
22	NC_018066	CT	3	6	20901	20906	0 %	50 %	0 %	50 %	392423411
23	NC_018066	TA	3	6	21540	21545	50 %	50 %	0 %	0 %	392423411
24	NC_018066	TA	3	6	23277	23282	50 %	50 %	0 %	0 %	392423414
25	NC_018066	CA	3	6	25632	25637	50 %	0 %	0 %	50 %	392423418
26	NC_018066	AG	3	6	26520	26525	50 %	0 %	50 %	0 %	392423419
27	NC_018066	AT	3	6	26546	26551	50 %	50 %	0 %	0 %	392423419
28	NC_018066	AT	3	6	26838	26843	50 %	50 %	0 %	0 %	392423419
29	NC_018066	GA	3	6	26897	26902	50 %	0 %	50 %	0 %	392423419
30	NC_018066	AG	3	6	27409	27414	50 %	0 %	50 %	0 %	392423420
31	NC_018066	TA	3	6	27944	27949	50 %	50 %	0 %	0 %	392423421
32	NC_018066	AT	3	6	28420	28425	50 %	50 %	0 %	0 %	392423421
33	NC_018066	GA	3	6	28770	28775	50 %	0 %	50 %	0 %	392423422
34	NC_018066	GA	3	6	29326	29331	50 %	0 %	50 %	0 %	392423422
35	NC_018066	TA	3	6	29477	29482	50 %	50 %	0 %	0 %	392423423
36	NC_018066	GA	3	6	30577	30582	50 %	0 %	50 %	0 %	392423424
37	NC_018066	CT	4	8	31345	31352	0 %	50 %	0 %	50 %	392423425
38	NC_018066	AT	4	8	31576	31583	50 %	50 %	0 %	0 %	392423425
39	NC_018066	CT	3	6	31680	31685	0 %	50 %	0 %	50 %	392423425
40	NC_018066	TA	3	6	33545	33550	50 %	50 %	0 %	0 %	392423427
41	NC_018066	CT	3	6	34961	34966	0 %	50 %	0 %	50 %	392423429
42	NC_018066	GA	4	8	37182	37189	50 %	0 %	50 %	0 %	392423431
43	NC_018066	AT	3	6	39978	39983	50 %	50 %	0 %	0 %	392423435
44	NC_018066	AT	3	6	40109	40114	50 %	50 %	0 %	0 %	392423435
45	NC_018066	AG	3	6	40208	40213	50 %	0 %	50 %	0 %	392423435
46	NC_018066	AG	3	6	41950	41955	50 %	0 %	50 %	0 %	392423438
47	NC_018066	AT	3	6	42186	42191	50 %	50 %	0 %	0 %	392423439
48	NC_018066	AT	3	6	42547	42552	50 %	50 %	0 %	0 %	392423439
49	NC_018066	GA	3	6	42563	42568	50 %	0 %	50 %	0 %	392423439
50	NC_018066	TA	3	6	42913	42918	50 %	50 %	0 %	0 %	392423440
51	NC_018066	TG	3	6	43510	43515	0 %	50 %	50 %	0 %	392423441
52	NC_018066	GA	3	6	43593	43598	50 %	0 %	50 %	0 %	392423441
53	NC_018066	AT	3	6	45701	45706	50 %	50 %	0 %	0 %	392423444
54	NC_018066	TC	3	6	46962	46967	0 %	50 %	0 %	50 %	392423446
55	NC_018066	AT	3	6	47301	47306	50 %	50 %	0 %	0 %	392423446
56	NC_018066	AT	3	6	48615	48620	50 %	50 %	0 %	0 %	392423448
57	NC_018066	GA	3	6	49793	49798	50 %	0 %	50 %	0 %	392423450
58	NC_018066	CT	3	6	50722	50727	0 %	50 %	0 %	50 %	392423450
59	NC_018066	GA	3	6	50963	50968	50 %	0 %	50 %	0 %	392423450
60	NC_018066	CA	3	6	53675	53680	50 %	0 %	0 %	50 %	392423453
61	NC_018066	GA	3	6	53732	53737	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
62	NC_018066	GA	3	6	54709	54714	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
63	NC_018066	GA	4	8	54830	54837	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
64	NC_018066	AG	3	6	55333	55338	50 %	0 %	50 %	0 %	392423453
65	NC_018066	AT	3	6	57199	57204	50 %	50 %	0 %	0 %	392423455
66	NC_018066	TA	3	6	59566	59571	50 %	50 %	0 %	0 %	392423457
67	NC_018066	CT	3	6	59797	59802	0 %	50 %	0 %	50 %	392423458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.