MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 78978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018028	GAC	2	6	8	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018028	TGG	2	6	20	25	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018028	GCA	2	6	260	265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018028	TGT	2	6	535	540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018028	GCC	2	6	570	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018028	GCA	2	6	625	630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018028	TGA	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018028	TTG	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018028	CTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018028	CCG	2	6	861	866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018028	GCT	3	9	878	886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018028	GTA	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018028	AGC	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
14	NC_018028	TCG	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
15	NC_018028	CGG	2	6	1162	1167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419089
16	NC_018028	CTG	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
17	NC_018028	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419089
18	NC_018028	GCT	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
19	NC_018028	CGA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
20	NC_018028	TTC	2	6	1364	1369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419089
21	NC_018028	AAG	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419089
22	NC_018028	GCT	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
23	NC_018028	CAG	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
24	NC_018028	GCC	2	6	1534	1539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419089
25	NC_018028	TGA	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419089
26	NC_018028	ACG	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
27	NC_018028	TTC	2	6	1616	1621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419089
28	NC_018028	TAC	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419089
29	NC_018028	GCG	2	6	1840	1845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419089
30	NC_018028	CAC	2	6	1951	1956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419089
31	NC_018028	TGC	2	6	2031	2036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
32	NC_018028	CGT	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
33	NC_018028	GCC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419090
34	NC_018028	GAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419090
35	NC_018028	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419090
36	NC_018028	GAA	2	6	2444	2449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419090
37	NC_018028	GCA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
38	NC_018028	GCA	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
39	NC_018028	CTA	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419090
40	NC_018028	TGC	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
41	NC_018028	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
42	NC_018028	CCA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419090
43	NC_018028	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419090
44	NC_018028	TGC	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
45	NC_018028	TGC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
46	NC_018028	AAC	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419090
47	NC_018028	GAA	2	6	2987	2992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419090
48	NC_018028	TGA	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419090
49	NC_018028	CAG	2	6	3121	3126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
50	NC_018028	ACG	2	6	3150	3155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
51	NC_018028	CTC	2	6	3262	3267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419091
52	NC_018028	TCA	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419091
53	NC_018028	TCT	2	6	3571	3576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419091
54	NC_018028	GCA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
55	NC_018028	TGA	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419091
56	NC_018028	TTA	2	6	3862	3867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392419091
57	NC_018028	CAG	2	6	4022	4027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
58	NC_018028	TGG	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419091
59	NC_018028	CGA	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
60	NC_018028	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419091
61	NC_018028	TCG	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
62	NC_018028	CGA	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
63	NC_018028	GTC	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
64	NC_018028	CGG	2	6	4577	4582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
65	NC_018028	TCA	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419092
66	NC_018028	CGG	2	6	4611	4616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
67	NC_018028	GGT	2	6	4674	4679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419092
68	NC_018028	GAG	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419092
69	NC_018028	CCG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
70	NC_018028	CGT	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
71	NC_018028	GAC	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
72	NC_018028	CAA	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419092
73	NC_018028	CGG	2	6	5139	5144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
74	NC_018028	AAG	2	6	5218	5223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419092
75	NC_018028	CGA	2	6	5244	5249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
76	NC_018028	TCC	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419092
77	NC_018028	GAT	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
78	NC_018028	CGC	2	6	5439	5444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
79	NC_018028	CGT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
80	NC_018028	GAT	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
81	NC_018028	ACA	2	6	5756	5761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419092
82	NC_018028	CAT	4	12	5784	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419092
83	NC_018028	GCT	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
84	NC_018028	CTT	3	9	5844	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419092
85	NC_018028	GCC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
86	NC_018028	GAC	2	6	5950	5955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
87	NC_018028	GGA	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419092
88	NC_018028	TGG	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419092
89	NC_018028	TGA	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
90	NC_018028	CGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
91	NC_018028	TTC	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419092
92	NC_018028	TGA	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
93	NC_018028	CGC	2	6	6502	6507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
94	NC_018028	ACC	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419092
95	NC_018028	GTT	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018028	ATG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018028	ACT	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018028	CAT	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018028	GGA	2	6	6911	6916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018028	CGA	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018028	CAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018028	GCA	2	6	7089	7094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419093
103	NC_018028	AAC	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419093
104	NC_018028	TCC	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419093
105	NC_018028	TGA	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419093
106	NC_018028	GCG	2	6	7363	7368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419093
107	NC_018028	CTG	2	6	7376	7381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419093
108	NC_018028	GAG	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419093
109	NC_018028	TAC	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419093
110	NC_018028	AGA	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419093
111	NC_018028	CCA	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419093
112	NC_018028	CTG	2	6	8068	8073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419094
113	NC_018028	CTG	2	6	8189	8194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419094
114	NC_018028	GCT	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419094
115	NC_018028	ATT	2	6	8279	8284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392419094
116	NC_018028	ATC	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419094
117	NC_018028	TGG	2	6	8595	8600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419094
118	NC_018028	CGT	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419095
119	NC_018028	GTC	2	6	8871	8876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419095
120	NC_018028	ACG	2	6	9019	9024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419095
121	NC_018028	TGC	2	6	9030	9035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419095
122	NC_018028	CAA	2	6	9036	9041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419095
123	NC_018028	TTG	2	6	9044	9049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419095
124	NC_018028	ACT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419095
125	NC_018028	CAC	2	6	9229	9234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419095
126	NC_018028	GGC	2	6	9347	9352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419095
127	NC_018028	GCC	2	6	9355	9360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419095
128	NC_018028	GCG	2	6	9373	9378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419095
129	NC_018028	GCC	2	6	9435	9440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419095
130	NC_018028	CGC	2	6	9498	9503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419095
131	NC_018028	GTA	2	6	9586	9591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419095
132	NC_018028	CGG	2	6	9698	9703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419096
133	NC_018028	GAC	2	6	9755	9760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419096
134	NC_018028	CTG	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419096
135	NC_018028	ATC	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419096
136	NC_018028	TTC	2	6	9924	9929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419096
137	NC_018028	CCT	2	6	9955	9960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018028	GCC	2	6	10024	10029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018028	CTG	2	6	10124	10129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018028	GTT	2	6	10152	10157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419097
141	NC_018028	CCG	2	6	10242	10247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419097
142	NC_018028	ACT	2	6	10367	10372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419097
143	NC_018028	ACA	2	6	10442	10447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419097
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146	NC_018028	CAT	2	6	10817	10822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018028	CAG	2	6	11178	11183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018028	GGC	2	6	11372	11377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018028	TGA	2	6	11554	11559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018028	CTG	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018028	CGC	2	6	11917	11922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419098
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158	NC_018028	CAG	2	6	12294	12299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419098
159	NC_018028	GTT	2	6	12337	12342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419098
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174	NC_018028	GTT	2	6	13964	13969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_018028	GTG	2	6	14929	14934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419102
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220	NC_018028	TCC	2	6	17440	17445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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223	NC_018028	AAT	2	6	17569	17574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_018028	CGC	2	6	17658	17663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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226	NC_018028	TCA	2	6	17809	17814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
227	NC_018028	CCA	2	6	17834	17839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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248	NC_018028	ACG	2	6	19156	19161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419103
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250	NC_018028	ATC	2	6	19263	19268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419103
251	NC_018028	TGC	2	6	19307	19312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419103
252	NC_018028	GTC	2	6	19406	19411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419103
253	NC_018028	AAG	2	6	19438	19443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_018028	AGC	2	6	19447	19452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_018028	GCA	2	6	19570	19575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419104
256	NC_018028	TTG	2	6	19710	19715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419104
257	NC_018028	CAG	2	6	19736	19741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419104
258	NC_018028	CGC	2	6	19750	19755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419104
259	NC_018028	CAG	2	6	19796	19801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419104
260	NC_018028	CTG	2	6	19811	19816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419104
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270	NC_018028	TTC	2	6	20768	20773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419104
271	NC_018028	GCT	2	6	20796	20801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419104
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282	NC_018028	AGG	2	6	21661	21666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419105
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285	NC_018028	CGG	2	6	21731	21736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419106
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322	NC_018028	TTC	2	6	24228	24233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419107
323	NC_018028	CGA	2	6	24245	24250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419107
324	NC_018028	CAG	2	6	24347	24352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419108
325	NC_018028	CGG	2	6	24429	24434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419108
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329	NC_018028	CGC	2	6	24748	24753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419108
330	NC_018028	CTG	2	6	24758	24763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419108
331	NC_018028	CGA	2	6	24856	24861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419108
332	NC_018028	CGT	2	6	24868	24873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419108
333	NC_018028	GCG	2	6	24896	24901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419108
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338	NC_018028	GCG	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419108
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341	NC_018028	CGA	2	6	25548	25553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419109
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343	NC_018028	GGC	2	6	25599	25604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419109
344	NC_018028	GGA	2	6	25635	25640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419109
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346	NC_018028	GCC	2	6	25713	25718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419109
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348	NC_018028	TCG	2	6	25775	25780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419109
349	NC_018028	ACC	2	6	25829	25834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419109
350	NC_018028	CGT	2	6	25909	25914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
351	NC_018028	TGC	2	6	25915	25920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
352	NC_018028	TCG	3	9	26009	26017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419110
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357	NC_018028	TGC	2	6	26294	26299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419110
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359	NC_018028	ATC	2	6	26398	26403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419110
360	NC_018028	CTG	2	6	26440	26445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419110
361	NC_018028	TCA	2	6	26510	26515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419110
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365	NC_018028	CTT	2	6	26592	26597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419110
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367	NC_018028	GGA	2	6	26685	26690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419110
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369	NC_018028	GCG	2	6	26764	26769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419110
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371	NC_018028	ACA	4	12	26885	26896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
372	NC_018028	TGG	2	6	27012	27017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419111
373	NC_018028	TGG	2	6	27041	27046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419111
374	NC_018028	TGC	2	6	27047	27052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419111
375	NC_018028	CGA	2	6	27060	27065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419111
376	NC_018028	TGG	2	6	27116	27121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419111
377	NC_018028	CGC	2	6	27275	27280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419112
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