MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018027	CCGTCC	2	12	26368	26379	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018027	ACGCCC	2	12	87739	87750	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018027	CCGGCG	2	12	175542	175553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018027	TCGACG	2	12	361374	361385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018027	TGTAGG	2	12	387040	387051	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018027	TCGCCG	2	12	397933	397944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018027	AAAGTT	2	12	438322	438333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018027	ATTCGG	2	12	441094	441105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018027	GGCGCT	2	12	545576	545587	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018027	CAGCGG	2	12	559235	559246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018027	GGCTGC	2	12	559595	559606	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018027	TCCGCG	2	12	559661	559672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018027	CCCGGC	2	12	709600	709611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018027	CGTTTT	2	12	719550	719561	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018027	GATCGG	2	12	729826	729837	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018027	TGCCGC	2	12	740490	740501	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018027	GAAAAC	2	12	762670	762681	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018027	ACGATT	2	12	762707	762718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018027	TGACGT	2	12	894598	894609	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018027	CGCAGG	2	12	896005	896016	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018027	CTTGAT	2	12	910668	910679	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018027	GCCGAC	2	12	947025	947036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018027	CGGGCA	2	12	960220	960231	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018027	ATCCGT	2	12	1066944	1066955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018027	ACCATG	2	12	1175024	1175035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018027	CCGGGA	2	12	1180773	1180784	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018027	TCACCG	2	12	1260598	1260609	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018027	GCCGCA	2	12	1304118	1304129	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018027	CGTGGT	2	12	1325619	1325630	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018027	CGCCGA	2	12	1470148	1470159	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018027	CAGCGC	2	12	1484224	1484235	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018027	GCGATC	2	12	1529809	1529820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018027	CCGCGC	2	12	1671038	1671049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018027	GTGGGG	2	12	1709678	1709689	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018027	CTGGGC	2	12	1710604	1710615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018027	GATGTC	3	18	1725189	1725206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018027	CGACAT	2	12	1727461	1727472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018027	TCCGGG	2	12	1741160	1741171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018027	AAGGGC	2	12	1793364	1793375	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018027	GTGTCG	2	12	1863657	1863668	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018027	GCGCGG	2	12	1863844	1863855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018027	GGGGGT	2	12	1864255	1864266	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018027	GCCGGT	2	12	1864374	1864385	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018027	TCGATT	2	12	1868162	1868173	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018027	GCGGCA	2	12	1919523	1919534	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018027	GAGCCA	2	12	1955597	1955608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018027	GTCGCC	2	12	1989314	1989325	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018027	GGGGGA	2	12	2045619	2045630	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018027	CGGTGA	2	12	2078484	2078495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018027	CCGGGG	2	12	2185562	2185573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018027	TTCGTC	2	12	2259472	2259483	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018027	TCGTCA	2	12	2282478	2282489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018027	GGTTGT	2	12	2290367	2290378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018027	CTGCCG	2	12	2312799	2312810	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018027	CTGGCG	2	12	2335697	2335708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018027	CTGGCG	2	12	2335811	2335822	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018027	CTCCCG	2	12	2336207	2336218	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_018027	CGTGGT	2	12	2460930	2460941	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018027	CACCGG	2	12	2461196	2461207	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018027	GGCCTC	2	12	2461463	2461474	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018027	GCCCGC	2	12	2461726	2461737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018027	TATCGA	2	12	2461888	2461899	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018027	TGGAAA	2	12	2476554	2476565	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018027	CCGCGA	2	12	2478042	2478053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018027	TCGATG	2	12	2478621	2478632	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018027	TGTCGC	2	12	2507813	2507824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018027	TGTCGC	2	12	2507864	2507875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018027	TGTCGC	2	12	2507890	2507901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018027	TGTCGC	2	12	2507916	2507927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018027	CGACGT	2	12	2543611	2543622	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018027	ATCGCT	2	12	2650902	2650913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018027	CGGCGC	2	12	2651261	2651272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018027	TCCCAC	2	12	2689537	2689548	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018027	TCGGCT	3	18	2759303	2759320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018027	CGGACG	2	12	2769446	2769457	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018027	GACGGC	2	12	2769557	2769568	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018027	CGGCGA	2	12	2770273	2770284	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018027	AGCCGG	2	12	2851490	2851501	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018027	ACGGCG	2	12	2851656	2851667	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018027	CCGGCA	2	12	2855733	2855744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018027	GCCGCG	2	12	2931241	2931252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018027	TGGGTG	2	12	2946652	2946663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018027	CGCGGC	2	12	3007398	3007409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018027	CCGATC	2	12	3101913	3101924	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018027	GTCCGC	2	12	3119147	3119158	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018027	CACCGC	2	12	3119704	3119715	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018027	ACGTCG	2	12	3120571	3120582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018027	CTGGTC	2	12	3120915	3120926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018027	TGGCGC	2	12	3132156	3132167	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018027	CAGAGT	2	12	3247138	3247149	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018027	GCAGAT	2	12	3257765	3257776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018027	CGACCC	2	12	3265838	3265849	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018027	CCGCTG	2	12	3269419	3269430	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018027	CTCGAC	2	12	3410204	3410215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018027	AGGTCG	2	12	3410235	3410246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018027	ACTCGG	2	12	3458319	3458330	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018027	TCGGCG	2	12	3458336	3458347	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018027	TCGGCC	2	12	3465400	3465411	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018027	GCCCGG	2	12	3469645	3469656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018027	TGACGA	2	12	3523422	3523433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018027	CGTCAT	2	12	3529698	3529709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018027	CCAGCG	2	12	3610555	3610566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018027	CATGTA	2	12	3631017	3631028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018027	CACCGG	2	12	3650068	3650079	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018027	TGTCCA	2	12	3731349	3731360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018027	CACGGG	2	12	3892658	3892669	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018027	CGCCGG	2	12	3911585	3911596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018027	GCCGTC	2	12	3912762	3912773	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018027	CTTCCT	2	12	3933706	3933717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018027	ATACCG	2	12	3970702	3970713	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018027	GAACCG	2	12	3984364	3984375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018027	GTGCTC	2	12	4000866	4000877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018027	GTGCCG	2	12	4001232	4001243	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018027	CCGGTG	2	12	4001301	4001312	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018027	TGATCA	2	12	4077190	4077201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018027	TTCACC	2	12	4101057	4101068	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018027	GTTCCG	2	12	4208350	4208361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018027	GGTAGC	2	12	4247640	4247651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018027	CGAACG	2	12	4253213	4253224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018027	GCCGCG	2	12	4296519	4296530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018027	TGATCG	2	12	4338742	4338753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018027	GCGCCG	2	12	4346612	4346623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018027	CAACCG	2	12	4354708	4354719	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018027	GTCGAT	2	12	4493012	4493023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018027	CCTCCG	2	12	4516331	4516342	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018027	TCACTG	2	12	4532963	4532974	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018027	GCACCG	2	12	4533073	4533084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018027	GTGCCG	2	12	4581385	4581396	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018027	TCATCG	2	12	4590767	4590778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018027	GACCAC	2	12	4718475	4718486	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018027	CACGGC	2	12	4718718	4718729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018027	TGACCA	2	12	4914024	4914035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018027	ACACTG	2	12	4975651	4975662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018027	GAGGTG	2	12	5004619	5004630	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018027	TGCCAG	2	12	5006522	5006533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018027	GGTCCT	2	12	5014331	5014342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018027	CTGCGG	4	24	5079224	5079247	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018027	CGCACT	2	12	5085145	5085156	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018027	CCCGAA	2	12	5113655	5113666	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018027	TGGCGG	2	12	5176649	5176660	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_018027	GCGGCT	2	12	5197972	5197983	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018027	CCTACA	2	12	5198680	5198691	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018027	GCCGAG	2	12	5198709	5198720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018027	GGCGCG	2	12	5216272	5216283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018027	TCGACG	2	12	5216445	5216456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018027	CCGGAG	2	12	5217072	5217083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018027	CCCGGC	2	12	5306892	5306903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_018027	AGGACC	2	12	5348732	5348743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018027	CACCCG	2	12	5372228	5372239	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_018027	CGGAAG	2	12	5375868	5375879	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_018027	TGCCGG	2	12	5448014	5448025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018027	CGGCGT	2	12	5454891	5454902	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_018027	GCCGGG	2	12	5462075	5462086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018027	GCCGGC	2	12	5466444	5466455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.