MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 4885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018027	GATCT	2	10	1763	1772	20 %	40 %	20 %	20 %	392413906
2	NC_018027	GATCG	2	10	3865	3874	20 %	20 %	40 %	20 %	392413907
3	NC_018027	ACCGC	2	10	5626	5635	20 %	0 %	20 %	60 %	392413909
4	NC_018027	CGTCG	2	10	5900	5909	0 %	20 %	40 %	40 %	392413909
5	NC_018027	CCAGC	2	10	7565	7574	20 %	0 %	20 %	60 %	392413911
6	NC_018027	GCAGC	2	10	8471	8480	20 %	0 %	40 %	40 %	392413911
7	NC_018027	GCAGC	2	10	8878	8887	20 %	0 %	40 %	40 %	392413912
8	NC_018027	CCAGT	2	10	10279	10288	20 %	20 %	20 %	40 %	392413912
9	NC_018027	CGGCT	2	10	11951	11960	0 %	20 %	40 %	40 %	392413913
10	NC_018027	CCGGT	2	10	12131	12140	0 %	20 %	40 %	40 %	392413913
11	NC_018027	CGTGC	2	10	14434	14443	0 %	20 %	40 %	40 %	392413915
12	NC_018027	CGGGC	2	10	15443	15452	0 %	0 %	60 %	40 %	392413917
13	NC_018027	CGGCC	2	10	16544	16553	0 %	0 %	40 %	60 %	392413919
14	NC_018027	CTCGG	2	10	18340	18349	0 %	20 %	40 %	40 %	392413922
15	NC_018027	CGCTG	2	10	19091	19100	0 %	20 %	40 %	40 %	392413922
16	NC_018027	CGGGG	2	10	20100	20109	0 %	0 %	80 %	20 %	392413923
17	NC_018027	GGTCG	2	10	20420	20429	0 %	20 %	60 %	20 %	392413923
18	NC_018027	CGGCG	2	10	20489	20498	0 %	0 %	60 %	40 %	392413923
19	NC_018027	CGGCG	2	10	20840	20849	0 %	0 %	60 %	40 %	392413923
20	NC_018027	CCGTG	2	10	21601	21610	0 %	20 %	40 %	40 %	392413924
21	NC_018027	CGCGG	2	10	22155	22164	0 %	0 %	60 %	40 %	392413924
22	NC_018027	GCATC	2	10	22447	22456	20 %	20 %	20 %	40 %	392413924
23	NC_018027	GGGCG	2	10	24982	24991	0 %	0 %	80 %	20 %	392413926
24	NC_018027	TGGCG	2	10	26040	26049	0 %	20 %	60 %	20 %	392413927
25	NC_018027	GCCCA	2	10	30368	30377	20 %	0 %	20 %	60 %	392413932
26	NC_018027	CACCG	2	10	31674	31683	20 %	0 %	20 %	60 %	392413933
27	NC_018027	TCGTC	2	10	32283	32292	0 %	40 %	20 %	40 %	392413934
28	NC_018027	GCCCG	2	10	32311	32320	0 %	0 %	40 %	60 %	392413934
29	NC_018027	GTGGC	2	10	35338	35347	0 %	20 %	60 %	20 %	392413936
30	NC_018027	CAGGA	2	10	36552	36561	40 %	0 %	40 %	20 %	392413937
31	NC_018027	CTGGA	2	10	39439	39448	20 %	20 %	40 %	20 %	392413939
32	NC_018027	GCCCG	2	10	43475	43484	0 %	0 %	40 %	60 %	392413945
33	NC_018027	TCGAC	2	10	43645	43654	20 %	20 %	20 %	40 %	392413945
34	NC_018027	CCGTC	2	10	43900	43909	0 %	20 %	20 %	60 %	392413945
35	NC_018027	CAGCG	2	10	44562	44571	20 %	0 %	40 %	40 %	392413946
36	NC_018027	CGCGG	2	10	46178	46187	0 %	0 %	60 %	40 %	392413947
37	NC_018027	GCGAT	2	10	46691	46700	20 %	20 %	40 %	20 %	392413948
38	NC_018027	CGCGC	2	10	46983	46992	0 %	0 %	40 %	60 %	392413948
39	NC_018027	GCCGG	2	10	47085	47094	0 %	0 %	60 %	40 %	392413948
40	NC_018027	GTGCG	2	10	47621	47630	0 %	20 %	60 %	20 %	392413949
41	NC_018027	TCGGC	2	10	48823	48832	0 %	20 %	40 %	40 %	392413950
42	NC_018027	CCGCG	2	10	49682	49691	0 %	0 %	40 %	60 %	392413951
43	NC_018027	GCAGT	2	10	49824	49833	20 %	20 %	40 %	20 %	392413951
44	NC_018027	CTCCG	2	10	50013	50022	0 %	20 %	20 %	60 %	392413951
45	NC_018027	TGCGG	2	10	50764	50773	0 %	20 %	60 %	20 %	392413952
46	NC_018027	GCTGC	2	10	51415	51424	0 %	20 %	40 %	40 %	392413953
47	NC_018027	GCCGT	2	10	52392	52401	0 %	20 %	40 %	40 %	392413954
48	NC_018027	CGCGG	2	10	53128	53137	0 %	0 %	60 %	40 %	392413955
49	NC_018027	CGGCC	2	10	54544	54553	0 %	0 %	40 %	60 %	392413958
50	NC_018027	CGTCG	2	10	54678	54687	0 %	20 %	40 %	40 %	392413958
51	NC_018027	GACCG	2	10	54852	54861	20 %	0 %	40 %	40 %	392413958
52	NC_018027	CCGGC	2	10	57466	57475	0 %	0 %	40 %	60 %	392413964
53	NC_018027	GCGGA	2	10	58256	58265	20 %	0 %	60 %	20 %	392413965
54	NC_018027	AGCGC	2	10	59294	59303	20 %	0 %	40 %	40 %	392413967
55	NC_018027	GTCCT	2	10	59311	59320	0 %	40 %	20 %	40 %	392413967
56	NC_018027	GGCCG	2	10	59968	59977	0 %	0 %	60 %	40 %	392413967
57	NC_018027	CCGAT	2	10	61391	61400	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018027	CGCGG	2	10	61500	61509	0 %	0 %	60 %	40 %	392413969
59	NC_018027	ACCGA	2	10	62862	62871	40 %	0 %	20 %	40 %	392413970
60	NC_018027	CGGCC	2	10	63269	63278	0 %	0 %	40 %	60 %	392413970
61	NC_018027	GACGC	2	10	64089	64098	20 %	0 %	40 %	40 %	392413971
62	NC_018027	CTGGG	2	10	64505	64514	0 %	20 %	60 %	20 %	392413971
63	NC_018027	GACCA	2	10	64931	64940	40 %	0 %	20 %	40 %	392413971
64	NC_018027	GGGCA	2	10	65170	65179	20 %	0 %	60 %	20 %	392413972
65	NC_018027	CTCGA	2	10	65958	65967	20 %	20 %	20 %	40 %	392413973
66	NC_018027	CCCCG	2	10	66194	66203	0 %	0 %	20 %	80 %	392413973
67	NC_018027	GCGCG	3	15	66908	66922	0 %	0 %	60 %	40 %	392413974
68	NC_018027	TGCAG	2	10	69110	69119	20 %	20 %	40 %	20 %	392413976
69	NC_018027	TCGGG	2	10	70083	70092	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018027	TCATG	2	10	70604	70613	20 %	40 %	20 %	20 %	392413978
71	NC_018027	GCTGT	2	10	72391	72400	0 %	40 %	40 %	20 %	392413979
72	NC_018027	CGTGC	2	10	77926	77935	0 %	20 %	40 %	40 %	392413983
73	NC_018027	CTCAC	2	10	82804	82813	20 %	20 %	0 %	60 %	392413988
74	NC_018027	CCGGC	2	10	82878	82887	0 %	0 %	40 %	60 %	392413988
75	NC_018027	ACCGA	2	10	83716	83725	40 %	0 %	20 %	40 %	392413988
76	NC_018027	GACCG	2	10	87648	87657	20 %	0 %	40 %	40 %	392413993
77	NC_018027	CGGTG	2	10	87662	87671	0 %	20 %	60 %	20 %	392413993
78	NC_018027	CCGAC	2	10	90218	90227	20 %	0 %	20 %	60 %	392413995
79	NC_018027	GGCCA	2	10	90801	90810	20 %	0 %	40 %	40 %	392413996
80	NC_018027	CCGCC	2	10	92771	92780	0 %	0 %	20 %	80 %	392413998
81	NC_018027	CGGCG	2	10	93576	93585	0 %	0 %	60 %	40 %	392414000
82	NC_018027	AGCGG	2	10	94312	94321	20 %	0 %	60 %	20 %	392414001
83	NC_018027	CGGGG	2	10	97195	97204	0 %	0 %	80 %	20 %	392414005
84	NC_018027	ACGTC	2	10	99290	99299	20 %	20 %	20 %	40 %	392414006
85	NC_018027	CGCGC	2	10	99800	99809	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_018027	CGATC	2	10	100468	100477	20 %	20 %	20 %	40 %	392414007
87	NC_018027	CCAGC	2	10	103635	103644	20 %	0 %	20 %	60 %	392414010
88	NC_018027	CGCGG	2	10	105024	105033	0 %	0 %	60 %	40 %	392414011
89	NC_018027	CGATC	2	10	105824	105833	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_018027	GGCCC	2	10	106285	106294	0 %	0 %	40 %	60 %	392414012
91	NC_018027	GATTC	2	10	106985	106994	20 %	40 %	20 %	20 %	392414012
92	NC_018027	GCTCG	2	10	108453	108462	0 %	20 %	40 %	40 %	392414014
93	NC_018027	CGAGA	2	10	108547	108556	40 %	0 %	40 %	20 %	392414014
94	NC_018027	GAGCG	2	10	109180	109189	20 %	0 %	60 %	20 %	392414015
95	NC_018027	GCCGC	2	10	109553	109562	0 %	0 %	40 %	60 %	392414016
96	NC_018027	GCGCA	2	10	110665	110674	20 %	0 %	40 %	40 %	392414018
97	NC_018027	GTGCT	2	10	111500	111509	0 %	40 %	40 %	20 %	392414019
98	NC_018027	GCTCG	2	10	111957	111966	0 %	20 %	40 %	40 %	392414019
99	NC_018027	CGGTC	2	10	114622	114631	0 %	20 %	40 %	40 %	392414023
100	NC_018027	ACGTC	2	10	114887	114896	20 %	20 %	20 %	40 %	392414023
101	NC_018027	GTCCG	2	10	117604	117613	0 %	20 %	40 %	40 %	392414025
102	NC_018027	CCCGA	2	10	117746	117755	20 %	0 %	20 %	60 %	392414025
103	NC_018027	CAGTT	2	10	119444	119453	20 %	40 %	20 %	20 %	392414026
104	NC_018027	ACCGG	2	10	120062	120071	20 %	0 %	40 %	40 %	392414027
105	NC_018027	TCGAC	2	10	120561	120570	20 %	20 %	20 %	40 %	392414027
106	NC_018027	TCGAC	2	10	121620	121629	20 %	20 %	20 %	40 %	392414028
107	NC_018027	CTGCG	2	10	121791	121800	0 %	20 %	40 %	40 %	392414028
108	NC_018027	TCCTG	2	10	122292	122301	0 %	40 %	20 %	40 %	392414028
109	NC_018027	GGCGC	2	10	123554	123563	0 %	0 %	60 %	40 %	392414030
110	NC_018027	CTCGG	2	10	126346	126355	0 %	20 %	40 %	40 %	392414033
111	NC_018027	GCACG	2	10	128739	128748	20 %	0 %	40 %	40 %	392414036
112	NC_018027	TGCTC	2	10	129155	129164	0 %	40 %	20 %	40 %	392414037
113	NC_018027	CGGCG	2	10	131441	131450	0 %	0 %	60 %	40 %	392414039
114	NC_018027	GCTGC	2	10	133816	133825	0 %	20 %	40 %	40 %	392414042
115	NC_018027	CCTGC	2	10	137765	137774	0 %	20 %	20 %	60 %	392414048
116	NC_018027	GCTCG	2	10	139659	139668	0 %	20 %	40 %	40 %	392414049
117	NC_018027	CGCGG	2	10	139836	139845	0 %	0 %	60 %	40 %	392414049
118	NC_018027	GGCAC	2	10	140699	140708	20 %	0 %	40 %	40 %	392414050
119	NC_018027	CCAGT	2	10	142276	142285	20 %	20 %	20 %	40 %	392414052
120	NC_018027	TCCAG	2	10	142650	142659	20 %	20 %	20 %	40 %	392414052
121	NC_018027	CGCGC	2	10	143063	143072	0 %	0 %	40 %	60 %	392414053
122	NC_018027	TGATC	2	10	143251	143260	20 %	40 %	20 %	20 %	392414053
123	NC_018027	CGCAG	2	10	144045	144054	20 %	0 %	40 %	40 %	392414055
124	NC_018027	TCGGT	2	10	149178	149187	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018027	GCCGG	2	10	149298	149307	0 %	0 %	60 %	40 %	392414062
126	NC_018027	GCCGG	2	10	150559	150568	0 %	0 %	60 %	40 %	392414064
127	NC_018027	CCCGG	2	10	152645	152654	0 %	0 %	40 %	60 %	392414066
128	NC_018027	CTGGC	2	10	153825	153834	0 %	20 %	40 %	40 %	392414068
129	NC_018027	ACGGA	2	10	154419	154428	40 %	0 %	40 %	20 %	392414068
130	NC_018027	CGTGG	2	10	154847	154856	0 %	20 %	60 %	20 %	392414068
131	NC_018027	AGGTC	2	10	157893	157902	20 %	20 %	40 %	20 %	392414072
132	NC_018027	CCGAT	2	10	159296	159305	20 %	20 %	20 %	40 %	392414073
133	NC_018027	CCTGC	2	10	160007	160016	0 %	20 %	20 %	60 %	392414075
134	NC_018027	GGGTC	2	10	162250	162259	0 %	20 %	60 %	20 %	392414076
135	NC_018027	GGTGC	2	10	164448	164457	0 %	20 %	60 %	20 %	392414078
136	NC_018027	CCGGC	2	10	166045	166054	0 %	0 %	40 %	60 %	392414080
137	NC_018027	GCCCG	2	10	167371	167380	0 %	0 %	40 %	60 %	392414082
138	NC_018027	TCGGC	2	10	170496	170505	0 %	20 %	40 %	40 %	392414084
139	NC_018027	CGTCG	2	10	171728	171737	0 %	20 %	40 %	40 %	392414085
140	NC_018027	GCTCG	2	10	176947	176956	0 %	20 %	40 %	40 %	392414089
141	NC_018027	CCGGT	2	10	177638	177647	0 %	20 %	40 %	40 %	392414089
142	NC_018027	GCGCG	2	10	177759	177768	0 %	0 %	60 %	40 %	392414089
143	NC_018027	CGCGT	2	10	178318	178327	0 %	20 %	40 %	40 %	392414090
144	NC_018027	GCCCC	2	10	180784	180793	0 %	0 %	20 %	80 %	392414091
145	NC_018027	CGACG	2	10	181810	181819	20 %	0 %	40 %	40 %	392414092
146	NC_018027	CGGCC	2	10	181993	182002	0 %	0 %	40 %	60 %	392414092
147	NC_018027	CAACG	2	10	183360	183369	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_018027	GGCCG	2	10	183501	183510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_018027	CTTGC	2	10	183834	183843	0 %	40 %	20 %	40 %	392414094
150	NC_018027	CGGCA	2	10	186526	186535	20 %	0 %	40 %	40 %	392414096
151	NC_018027	CGTCG	2	10	187382	187391	0 %	20 %	40 %	40 %	392414096
152	NC_018027	GACGC	2	10	188116	188125	20 %	0 %	40 %	40 %	392414097
153	NC_018027	CCCGA	2	10	189499	189508	20 %	0 %	20 %	60 %	392414098
154	NC_018027	CGGCC	2	10	190510	190519	0 %	0 %	40 %	60 %	392414099
155	NC_018027	GCACC	2	10	191458	191467	20 %	0 %	20 %	60 %	392414100
156	NC_018027	GGCTG	2	10	191491	191500	0 %	20 %	60 %	20 %	392414100
157	NC_018027	GAGTG	2	10	192163	192172	20 %	20 %	60 %	0 %	392414100
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162	NC_018027	TCGCG	2	10	194857	194866	0 %	20 %	40 %	40 %	392414102
163	NC_018027	CCGAT	2	10	194920	194929	20 %	20 %	20 %	40 %	392414102
164	NC_018027	TCGCC	2	10	195058	195067	0 %	20 %	20 %	60 %	392414102
165	NC_018027	GGTCT	2	10	195969	195978	0 %	40 %	40 %	20 %	392414103
166	NC_018027	GCTGT	2	10	196945	196954	0 %	40 %	40 %	20 %	392414104
167	NC_018027	CGACG	2	10	197625	197634	20 %	0 %	40 %	40 %	392414104
168	NC_018027	CCGGA	2	10	197821	197830	20 %	0 %	40 %	40 %	392414104
169	NC_018027	CCGCG	2	10	201137	201146	0 %	0 %	40 %	60 %	392414106
170	NC_018027	CGGCG	2	10	202994	203003	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
171	NC_018027	ATGTC	2	10	203086	203095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_018027	CTGGA	2	10	204035	204044	20 %	20 %	40 %	20 %	392414109
173	NC_018027	CTCAC	2	10	204132	204141	20 %	20 %	0 %	60 %	392414110
174	NC_018027	GTTCC	2	10	206237	206246	0 %	40 %	20 %	40 %	392414111
175	NC_018027	GGCGG	2	10	206503	206512	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
176	NC_018027	GCCGG	2	10	208871	208880	0 %	0 %	60 %	40 %	392414114
177	NC_018027	CGATG	2	10	210458	210467	20 %	20 %	40 %	20 %	392414115
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179	NC_018027	GCCGC	2	10	213351	213360	0 %	0 %	40 %	60 %	392414119
180	NC_018027	CGCGC	2	10	213615	213624	0 %	0 %	40 %	60 %	392414119
181	NC_018027	CCGGC	2	10	215877	215886	0 %	0 %	40 %	60 %	392414121
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187	NC_018027	GCCGA	2	10	218962	218971	20 %	0 %	40 %	40 %	392414123
188	NC_018027	CGGCG	2	10	219015	219024	0 %	0 %	60 %	40 %	392414123
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191	NC_018027	CGACG	2	10	220587	220596	20 %	0 %	40 %	40 %	392414123
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194	NC_018027	CGTGC	2	10	223962	223971	0 %	20 %	40 %	40 %	392414127
195	NC_018027	TGTCG	2	10	226921	226930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
196	NC_018027	TCGCC	2	10	229270	229279	0 %	20 %	20 %	60 %	392414131
197	NC_018027	GCATC	2	10	229711	229720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
198	NC_018027	GAGTT	2	10	232929	232938	20 %	40 %	40 %	0 %	392414134
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201	NC_018027	GCAGC	2	10	237180	237189	20 %	0 %	40 %	40 %	392414135
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205	NC_018027	CCCGT	2	10	238820	238829	0 %	20 %	20 %	60 %	392414135
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213	NC_018027	TCTGC	2	10	244526	244535	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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217	NC_018027	TCCGT	2	10	246100	246109	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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231	NC_018027	GCGTC	2	10	261211	261220	0 %	20 %	40 %	40 %	392414150
232	NC_018027	GTGCT	2	10	261314	261323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
233	NC_018027	TGCGC	2	10	263078	263087	0 %	20 %	40 %	40 %	392414153
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247	NC_018027	CGGAG	2	10	276350	276359	20 %	0 %	60 %	20 %	392414168
248	NC_018027	CCCGA	2	10	276525	276534	20 %	0 %	20 %	60 %	392414168
249	NC_018027	GTGCG	2	10	279894	279903	0 %	20 %	60 %	20 %	392414171
250	NC_018027	CGCGG	2	10	281436	281445	0 %	0 %	60 %	40 %	392414173
251	NC_018027	GCACC	2	10	285720	285729	20 %	0 %	20 %	60 %	392414180
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253	NC_018027	GGCCG	2	10	287632	287641	0 %	0 %	60 %	40 %	392414182
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255	NC_018027	GCCGA	2	10	292942	292951	20 %	0 %	40 %	40 %	392414186
256	NC_018027	CGGGC	2	10	294247	294256	0 %	0 %	60 %	40 %	392414187
257	NC_018027	CCGCG	2	10	295816	295825	0 %	0 %	40 %	60 %	392414189
258	NC_018027	CGGTG	2	10	299587	299596	0 %	20 %	60 %	20 %	392414192
259	NC_018027	CGCCC	2	10	301381	301390	0 %	0 %	20 %	80 %	392414192
260	NC_018027	CTGGG	2	10	308039	308048	0 %	20 %	60 %	20 %	392414199
261	NC_018027	CGGCC	2	10	308413	308422	0 %	0 %	40 %	60 %	392414200
262	NC_018027	CGCGC	2	10	308516	308525	0 %	0 %	40 %	60 %	392414200
263	NC_018027	CCTCG	2	10	309411	309420	0 %	20 %	20 %	60 %	392414201
264	NC_018027	CTGGC	2	10	309961	309970	0 %	20 %	40 %	40 %	392414201
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266	NC_018027	CCGGA	2	10	311996	312005	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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