MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 1249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018027	GCCT	2	8	6719	6726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018027	GAAT	2	8	16317	16324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018027	GCCT	2	8	21405	21412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018027	CGAC	2	8	26409	26416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018027	CCTC	2	8	27900	27907	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_018027	GTCA	2	8	29190	29197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018027	GCCG	2	8	31766	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018027	ACGA	2	8	44494	44501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018027	GCGG	2	8	56560	56567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018027	GCCC	2	8	60713	60720	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_018027	CGGA	2	8	61198	61205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018027	GTCT	2	8	63353	63360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018027	CTAC	2	8	63370	63377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018027	CAGG	2	8	64951	64958	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018027	GCCG	2	8	71160	71167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018027	GCCG	2	8	71217	71224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018027	CGGC	2	8	71279	71286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018027	GGCT	2	8	71308	71315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018027	CGGT	2	8	71480	71487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018027	GGAC	2	8	71737	71744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018027	CATG	2	8	71914	71921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018027	GTGC	2	8	72075	72082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018027	CCAT	2	8	72276	72283	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018027	CCAG	2	8	78419	78426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018027	AATC	2	8	84784	84791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018027	GAAT	2	8	86967	86974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018027	ACGC	2	8	93836	93843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018027	TGGA	2	8	99791	99798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018027	GCGG	2	8	99907	99914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018027	GCGG	2	8	100004	100011	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018027	AGGA	2	8	100051	100058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018027	AACC	2	8	107889	107896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018027	CGGT	2	8	135711	135718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018027	CGAT	2	8	142851	142858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018027	CCGG	2	8	155369	155376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018027	CGGC	2	8	155764	155771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018027	GCTC	2	8	168435	168442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018027	ACCA	2	8	168464	168471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018027	CTCC	2	8	180059	180066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_018027	GCGT	2	8	180075	180082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018027	TGCG	2	8	184339	184346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018027	GCCG	2	8	203105	203112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018027	TGCG	2	8	206483	206490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018027	TGCG	2	8	206975	206982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018027	CGCA	2	8	214814	214821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018027	CGGG	2	8	222628	222635	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018027	GTTC	2	8	223927	223934	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018027	TCGC	2	8	225481	225488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018027	GCCC	2	8	229815	229822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_018027	TTCC	2	8	229836	229843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018027	AACC	2	8	231943	231950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018027	CCGC	2	8	232039	232046	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_018027	CTGC	2	8	263552	263559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018027	GCCG	2	8	272174	272181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018027	TAGC	2	8	273871	273878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018027	CGGC	2	8	275986	275993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018027	TCGA	2	8	280033	280040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018027	CGGG	2	8	281527	281534	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018027	CTAA	2	8	285510	285517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018027	ATCA	2	8	303936	303943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018027	CGAC	2	8	311979	311986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018027	GGCA	2	8	312321	312328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018027	CTTC	2	8	315880	315887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018027	GCCG	2	8	326190	326197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018027	AGCC	2	8	326790	326797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018027	GGTT	2	8	332522	332529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018027	CGGA	2	8	348188	348195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018027	GCCC	2	8	356084	356091	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_018027	CGGA	2	8	357813	357820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018027	AGGC	2	8	357913	357920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018027	TCGA	2	8	374029	374036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018027	CGAC	2	8	381800	381807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018027	TTGG	2	8	386258	386265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018027	GTCA	2	8	390474	390481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018027	GGCC	2	8	390489	390496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018027	GCCG	2	8	392827	392834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018027	GGCA	2	8	393199	393206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018027	GCGA	2	8	393564	393571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018027	CGCC	2	8	393757	393764	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_018027	CGGG	2	8	393964	393971	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018027	GGCG	2	8	398359	398366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018027	AGCA	2	8	398405	398412	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018027	TCAT	2	8	400267	400274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018027	CGCA	2	8	400304	400311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018027	TCGG	2	8	413461	413468	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018027	CGGA	2	8	414985	414992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018027	CCGG	2	8	428341	428348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018027	CCGG	2	8	435636	435643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018027	GCCG	2	8	451188	451195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018027	CGCC	2	8	452651	452658	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_018027	TCGT	2	8	452717	452724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018027	ACGC	2	8	456711	456718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018027	CCTC	2	8	488920	488927	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_018027	GCTG	2	8	489046	489053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018027	CGGT	2	8	489173	489180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018027	GACC	2	8	495264	495271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018027	CGGT	2	8	506558	506565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018027	AAGC	2	8	507104	507111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018027	ATCT	2	8	507271	507278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018027	GACT	2	8	535022	535029	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018027	GCGG	2	8	537384	537391	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018027	GACG	2	8	544726	544733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018027	GGCT	2	8	545646	545653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018027	GTGG	2	8	545858	545865	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018027	CCGG	2	8	545886	545893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018027	TGGC	2	8	559201	559208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018027	GATC	2	8	559263	559270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018027	GGCG	2	8	559503	559510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018027	GCCG	2	8	559826	559833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018027	GATC	2	8	565702	565709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018027	CGGC	2	8	565729	565736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018027	TGCC	2	8	585940	585947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018027	CGGG	2	8	598332	598339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018027	TGCG	2	8	599273	599280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018027	ACGC	2	8	600192	600199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018027	CGCC	2	8	600259	600266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_018027	GACG	2	8	601906	601913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018027	CGGG	2	8	608893	608900	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018027	TGCG	2	8	613594	613601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018027	GTCG	2	8	626421	626428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018027	CGCC	2	8	639952	639959	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_018027	CGTG	2	8	667507	667514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018027	GGTC	2	8	667653	667660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018027	TCAG	2	8	682950	682957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018027	GAGG	2	8	684372	684379	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018027	GACT	2	8	688321	688328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018027	GCCG	2	8	690035	690042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018027	GCGT	2	8	702425	702432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018027	CGTG	2	8	703599	703606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018027	GCGA	2	8	703610	703617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018027	CACG	2	8	703641	703648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018027	GCCC	2	8	704102	704109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_018027	TCCC	2	8	712595	712602	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_018027	CCGC	2	8	712636	712643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_018027	CAGG	2	8	712743	712750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018027	GGAA	2	8	714188	714195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018027	TGGC	2	8	715355	715362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018027	GGAA	2	8	715373	715380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018027	TGCG	2	8	718031	718038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018027	TCGC	2	8	719462	719469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018027	CTGC	2	8	719521	719528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018027	CGCC	2	8	729796	729803	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_018027	GGGT	2	8	730035	730042	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018027	CCGT	2	8	735662	735669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018027	AGGC	2	8	735795	735802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018027	CGGC	2	8	737275	737282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018027	AGCA	2	8	737636	737643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018027	GGGT	2	8	737735	737742	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018027	CACC	2	8	743903	743910	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_018027	TAAC	2	8	746421	746428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018027	CGAA	2	8	746494	746501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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475	NC_018027	TCGA	2	8	2141253	2141260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_018027	CGAC	2	8	2208745	2208752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_018027	CGGA	2	8	2208852	2208859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_018027	CCCG	2	8	2208958	2208965	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
488	NC_018027	GGTC	2	8	2208985	2208992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_018027	CCGG	2	8	2233395	2233402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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495	NC_018027	GTGC	2	8	2254401	2254408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_018027	GACG	2	8	2257656	2257663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_018027	GCCG	2	8	2257664	2257671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
498	NC_018027	GCCG	2	8	2259575	2259582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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