MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfomonile tiedjei DSM 6799 chromosome

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018025	AAAGAA	2	12	1551	1562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018025	TGAAAC	2	12	16684	16695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018025	CAATGC	2	12	81386	81397	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018025	TCCCGG	2	12	133997	134008	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018025	CCAGAT	2	12	134531	134542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018025	ATTCAG	2	12	140132	140143	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018025	ACTGAC	2	12	143284	143295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018025	CTTTTT	2	12	198760	198771	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018025	TTGGCT	2	12	215278	215289	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018025	GTTCGC	2	12	216302	216313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018025	CATTCA	2	12	224342	224353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018025	CTTTGT	2	12	224675	224686	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018025	ATGTTG	2	12	238616	238627	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018025	TTGGCC	2	12	321288	321299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018025	CGAGTC	2	12	338303	338314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018025	TCGGAT	2	12	395247	395258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018025	CGCCCC	2	12	404876	404887	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
18	NC_018025	TGCGAA	2	12	422678	422689	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018025	CTTGTC	2	12	438611	438622	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018025	CTGCAA	2	12	456424	456435	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018025	ACCTCA	2	12	496325	496336	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018025	TCGGTA	2	12	612858	612869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018025	TACGAT	2	12	624767	624778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018025	AATCCC	2	12	647215	647226	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018025	TTTTAA	2	12	691376	691387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018025	GCTGAG	2	12	699671	699682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018025	CCAATG	2	12	700384	700395	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018025	TCCTGG	2	12	771423	771434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018025	AAGAAC	2	12	975936	975947	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018025	GAATCC	2	12	984710	984721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018025	GGATCT	2	12	1022339	1022350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018025	ATGTCA	2	12	1093768	1093779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018025	CATGGT	2	12	1101711	1101722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018025	TTGTAA	2	12	1122325	1122336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018025	GAATGC	2	12	1150785	1150796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018025	TGAAGT	2	12	1165010	1165021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018025	TCACCT	2	12	1376764	1376775	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018025	GTCCCT	2	12	1411933	1411944	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018025	TCTATA	2	12	1420331	1420342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018025	AGAACA	2	12	1437464	1437475	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018025	AAATGA	2	12	1495558	1495569	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018025	AGGGGG	2	12	1495668	1495679	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018025	AATGAA	2	12	1523957	1523968	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018025	AATGGA	2	12	1556714	1556725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018025	TGCTGT	2	12	1562505	1562516	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018025	TGTACT	2	12	1607532	1607543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018025	AGTAAT	2	12	1627738	1627749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018025	GTAGTC	2	12	1638819	1638830	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018025	CCAATC	2	12	1729930	1729941	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018025	GTCCTT	2	12	1852849	1852860	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018025	ATGATT	2	12	1856174	1856185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018025	CCGGAA	2	12	1888209	1888220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018025	TTCATC	2	12	1972987	1972998	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018025	AAACGG	2	12	1976906	1976917	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018025	GGATTT	2	12	2008895	2008906	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018025	ATCTTG	2	12	2192126	2192137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018025	TCGAGA	2	12	2263718	2263729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018025	ATTTGT	2	12	2359796	2359807	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018025	TTGGAA	2	12	2430786	2430797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018025	TGATTA	2	12	2462731	2462742	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018025	ATTTTT	2	12	2465238	2465249	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018025	TACTGC	2	12	2556143	2556154	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018025	GCATGG	2	12	2574192	2574203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018025	TCTTGA	2	12	2620737	2620748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018025	ACCCCC	2	12	2632677	2632688	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
66	NC_018025	TGCTCA	2	12	2638104	2638115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018025	TGTGGG	2	12	2640799	2640810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018025	GATTTC	2	12	2674095	2674106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018025	AATTAG	2	12	2700774	2700785	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018025	TCAGAG	2	12	2759290	2759301	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018025	TGCCTG	2	12	2781085	2781096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018025	TTTGGT	2	12	2799509	2799520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018025	TTCACG	2	12	2799737	2799748	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018025	ATTCCC	2	12	2814788	2814799	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018025	TTTTGT	2	12	2851338	2851349	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018025	AACAAA	2	12	2857475	2857486	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018025	TGTTCG	2	12	2864041	2864052	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018025	CGAATC	2	12	2966625	2966636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018025	GGACAA	2	12	3021657	3021668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018025	TGTGAA	2	12	3039081	3039092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018025	CAAAAA	2	12	3094969	3094980	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018025	ACAAAA	2	12	3147061	3147072	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018025	GGGTCA	2	12	3214313	3214324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018025	ACCTGA	2	12	3219808	3219819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018025	CACTTC	2	12	3286440	3286451	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018025	TCATCT	2	12	3293278	3293289	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018025	AATGGG	2	12	3356655	3356666	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018025	AAATAA	2	12	3392941	3392952	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018025	CAATTC	2	12	3412057	3412068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018025	AAGGGA	2	12	3412095	3412106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018025	TTCGCT	2	12	3444394	3444405	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018025	GAAGAT	2	12	3486139	3486150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018025	TCTCTT	2	12	3489778	3489789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018025	TCGAAA	2	12	3505188	3505199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018025	ACTACG	2	12	3539908	3539919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018025	CCGATG	2	12	3540445	3540456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018025	GATATC	2	12	3608725	3608736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018025	TTTCCT	2	12	3623171	3623182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018025	TTTTCA	2	12	3633504	3633515	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018025	ATTGTT	2	12	3699457	3699468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018025	GAAAAA	2	12	3715639	3715650	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018025	CAGGAT	2	12	3796462	3796473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018025	GCAAAA	2	12	3825727	3825738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018025	CCGATT	2	12	3887540	3887551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018025	GACCCG	2	12	3915636	3915647	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018025	GGATAC	2	12	3925645	3925656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018025	TTCCCC	2	12	3925764	3925775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018025	GCCTCT	2	12	3987950	3987961	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018025	CCCGGA	2	12	3990514	3990525	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018025	TGGGCT	2	12	4020419	4020430	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018025	GGTAGA	2	12	4030394	4030405	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018025	TTCCGA	2	12	4032106	4032117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018025	GCCCAG	2	12	4033401	4033412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018025	ACCCCC	2	12	4034773	4034784	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
115	NC_018025	TACAAT	2	12	4129192	4129203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018025	TTTTGT	2	12	4221089	4221100	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018025	ACTTAT	2	12	4250017	4250028	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_018025	TTTTCG	2	12	4258581	4258592	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018025	CTGTTG	2	12	4402061	4402072	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018025	TGAAAG	2	12	4424932	4424943	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018025	GATTCC	2	12	4450043	4450054	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018025	TGTTTT	2	12	4464199	4464210	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018025	ACATTC	2	12	4493372	4493383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018025	ACAAAA	2	12	4520775	4520786	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018025	GTCGAG	2	12	4541955	4541966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_018025	TATCCA	2	12	4544389	4544400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018025	ACGCGT	2	12	4555226	4555237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018025	TCGCGT	2	12	4687167	4687178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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130	NC_018025	TTGGAT	2	12	4735794	4735805	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_018025	ACCAAT	2	12	4893914	4893925	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_018025	ACTGAT	2	12	5068087	5068098	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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143	NC_018025	CCGTGA	2	12	5108779	5108790	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_018025	TGTGGA	2	12	5319490	5319501	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_018025	TGCTCA	2	12	5361664	5361675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.