MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	CGAGC	2	10	3655	3664	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_018023	GCGCT	2	10	6184	6193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018023	CAAAT	2	10	8797	8806	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018023	CGGAC	2	10	37967	37976	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_018023	CCGAC	2	10	47727	47736	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_018023	CTTGC	2	10	48387	48396	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018023	GTTCG	2	10	51381	51390	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018023	TTCGG	2	10	59949	59958	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018023	AGCAC	2	10	63389	63398	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018023	ATTGA	2	10	65513	65522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018023	TACGA	2	10	65557	65566	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018023	CGGCA	2	10	65687	65696	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_018023	CCCAG	2	10	65856	65865	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_018023	CCGCC	2	10	67185	67194	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_018023	CGGCG	2	10	76362	76371	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_018023	TGCGC	2	10	76593	76602	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018023	CCGAA	2	10	76692	76701	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018023	CCGTC	2	10	86741	86750	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_018023	ACCGT	2	10	108143	108152	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018023	GCCCC	2	10	120883	120892	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_018023	CAGCG	2	10	121927	121936	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_018023	TTGAG	2	10	124919	124928	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018023	CGCGG	2	10	129561	129570	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.