MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	CGTTG	2	10	4141	4150	0 %	40 %	40 %	20 %	392406272
2	NC_018023	AGCGC	2	10	4306	4315	20 %	0 %	40 %	40 %	392406272
3	NC_018023	GACCA	2	10	8234	8243	40 %	0 %	20 %	40 %	392406276
4	NC_018023	CAGCG	2	10	8304	8313	20 %	0 %	40 %	40 %	392406276
5	NC_018023	CATCG	2	10	11836	11845	20 %	20 %	20 %	40 %	392406279
6	NC_018023	CGAGC	2	10	13350	13359	20 %	0 %	40 %	40 %	392406281
7	NC_018023	CAATC	2	10	15246	15255	40 %	20 %	0 %	40 %	392406281
8	NC_018023	CGGCA	2	10	15427	15436	20 %	0 %	40 %	40 %	392406281
9	NC_018023	GGACT	2	10	16606	16615	20 %	20 %	40 %	20 %	392406282
10	NC_018023	CAACG	2	10	16621	16630	40 %	0 %	20 %	40 %	392406282
11	NC_018023	GATCA	2	10	17994	18003	40 %	20 %	20 %	20 %	392406283
12	NC_018023	GGTCA	2	10	18213	18222	20 %	20 %	40 %	20 %	392406283
13	NC_018023	GCCCG	2	10	19878	19887	0 %	0 %	40 %	60 %	392406285
14	NC_018023	CGGCA	2	10	20053	20062	20 %	0 %	40 %	40 %	392406285
15	NC_018023	GGCTG	2	10	22187	22196	0 %	20 %	60 %	20 %	392406287
16	NC_018023	CTGGC	2	10	23575	23584	0 %	20 %	40 %	40 %	392406288
17	NC_018023	CTCAC	2	10	24692	24701	20 %	20 %	0 %	60 %	392406290
18	NC_018023	ACCTC	2	10	25920	25929	20 %	20 %	0 %	60 %	392406291
19	NC_018023	TCAGC	2	10	26075	26084	20 %	20 %	20 %	40 %	392406292
20	NC_018023	CGCAC	2	10	30818	30827	20 %	0 %	20 %	60 %	392406295
21	NC_018023	CCCGA	2	10	34603	34612	20 %	0 %	20 %	60 %	392406299
22	NC_018023	CGCAA	2	10	34744	34753	40 %	0 %	20 %	40 %	392406299
23	NC_018023	CCGGC	2	10	39771	39780	0 %	0 %	40 %	60 %	392406303
24	NC_018023	CGTCG	2	10	46573	46582	0 %	20 %	40 %	40 %	392406306
25	NC_018023	AGTTG	2	10	50988	50997	20 %	40 %	40 %	0 %	392406309
26	NC_018023	CGGGC	2	10	51660	51669	0 %	0 %	60 %	40 %	392406310
27	NC_018023	TGTCG	2	10	52621	52630	0 %	40 %	40 %	20 %	392406311
28	NC_018023	CAGGA	2	10	53558	53567	40 %	0 %	40 %	20 %	392406311
29	NC_018023	ACCGC	2	10	59157	59166	20 %	0 %	20 %	60 %	392406320
30	NC_018023	GCGAT	2	10	60362	60371	20 %	20 %	40 %	20 %	392406321
31	NC_018023	CACCG	2	10	62559	62568	20 %	0 %	20 %	60 %	392406322
32	NC_018023	CGGCG	2	10	64725	64734	0 %	0 %	60 %	40 %	392406325
33	NC_018023	CTCAG	2	10	66022	66031	20 %	20 %	20 %	40 %	392406326
34	NC_018023	CCGCA	2	10	66639	66648	20 %	0 %	20 %	60 %	392406327
35	NC_018023	ACACC	2	10	66797	66806	40 %	0 %	0 %	60 %	392406327
36	NC_018023	TGTGA	2	10	68193	68202	20 %	40 %	40 %	0 %	392406329
37	NC_018023	GGCGT	2	10	70415	70424	0 %	20 %	60 %	20 %	392406329
38	NC_018023	ATCGA	2	10	71335	71344	40 %	20 %	20 %	20 %	392406329
39	NC_018023	ACTCG	2	10	72708	72717	20 %	20 %	20 %	40 %	392406329
40	NC_018023	ACACC	2	10	73339	73348	40 %	0 %	0 %	60 %	392406329
41	NC_018023	GCCGT	2	10	73593	73602	0 %	20 %	40 %	40 %	392406329
42	NC_018023	TCGCC	2	10	77086	77095	0 %	20 %	20 %	60 %	392406331
43	NC_018023	GCCCC	2	10	77153	77162	0 %	0 %	20 %	80 %	392406331
44	NC_018023	TCGCC	2	10	77452	77461	0 %	20 %	20 %	60 %	392406331
45	NC_018023	AGCGA	2	10	77841	77850	40 %	0 %	40 %	20 %	392406331
46	NC_018023	GAATC	2	10	78969	78978	40 %	20 %	20 %	20 %	392406332
47	NC_018023	GGTCT	2	10	81819	81828	0 %	40 %	40 %	20 %	392406334
48	NC_018023	GGTCG	2	10	81886	81895	0 %	20 %	60 %	20 %	392406334
49	NC_018023	GCCGG	2	10	82856	82865	0 %	0 %	60 %	40 %	392406334
50	NC_018023	CCAGC	2	10	83596	83605	20 %	0 %	20 %	60 %	392406334
51	NC_018023	AGGGC	2	10	86096	86105	20 %	0 %	60 %	20 %	392406335
52	NC_018023	ACCGT	2	10	92499	92508	20 %	20 %	20 %	40 %	392406345
53	NC_018023	GGTGA	2	10	92635	92644	20 %	20 %	60 %	0 %	392406345
54	NC_018023	GCCGC	2	10	93264	93273	0 %	0 %	40 %	60 %	392406345
55	NC_018023	GGCGC	2	10	93332	93341	0 %	0 %	60 %	40 %	392406345
56	NC_018023	GGCGA	2	10	93994	94003	20 %	0 %	60 %	20 %	392406346
57	NC_018023	CGGGC	2	10	94461	94470	0 %	0 %	60 %	40 %	392406346
58	NC_018023	GCGCA	2	10	97282	97291	20 %	0 %	40 %	40 %	392406348
59	NC_018023	CGCTG	2	10	100463	100472	0 %	20 %	40 %	40 %	392406352
60	NC_018023	ATCAG	2	10	100821	100830	40 %	20 %	20 %	20 %	392406352
61	NC_018023	CGGCG	2	10	100931	100940	0 %	0 %	60 %	40 %	392406352
62	NC_018023	GGCCC	2	10	104742	104751	0 %	0 %	40 %	60 %	392406355
63	NC_018023	ATCAC	2	10	104950	104959	40 %	20 %	0 %	40 %	392406355
64	NC_018023	CCCGC	2	10	106449	106458	0 %	0 %	20 %	80 %	392406355
65	NC_018023	ACGCA	2	10	107080	107089	40 %	0 %	20 %	40 %	392406356
66	NC_018023	TCGGC	2	10	107803	107812	0 %	20 %	40 %	40 %	392406356
67	NC_018023	AACCA	2	10	108979	108988	60 %	0 %	0 %	40 %	392406357
68	NC_018023	CAGTC	2	10	110772	110781	20 %	20 %	20 %	40 %	392406359
69	NC_018023	GCGTC	2	10	111767	111776	0 %	20 %	40 %	40 %	392406361
70	NC_018023	TCGCC	2	10	114136	114145	0 %	20 %	20 %	60 %	392406363
71	NC_018023	GCCCA	2	10	115268	115277	20 %	0 %	20 %	60 %	392406366
72	NC_018023	CGCCC	2	10	115849	115858	0 %	0 %	20 %	80 %	392406366
73	NC_018023	CCAGC	2	10	115959	115968	20 %	0 %	20 %	60 %	392406366
74	NC_018023	GATGT	2	10	117741	117750	20 %	40 %	40 %	0 %	392406367
75	NC_018023	GGCGC	2	10	118702	118711	0 %	0 %	60 %	40 %	392406368
76	NC_018023	GCGCT	2	10	120367	120376	0 %	20 %	40 %	40 %	392406371
77	NC_018023	AGTCG	2	10	123328	123337	20 %	20 %	40 %	20 %	392406373
78	NC_018023	CAGTG	2	10	123844	123853	20 %	20 %	40 %	20 %	392406373
79	NC_018023	GGTGC	2	10	125464	125473	0 %	20 %	60 %	20 %	392406375
80	NC_018023	CGATC	2	10	125762	125771	20 %	20 %	20 %	40 %	392406375
81	NC_018023	CGGCG	2	10	127050	127059	0 %	0 %	60 %	40 %	392406376
82	NC_018023	CACTC	2	10	131008	131017	20 %	20 %	0 %	60 %	392406380
83	NC_018023	GCGCT	2	10	131249	131258	0 %	20 %	40 %	40 %	392406380
84	NC_018023	CCGCA	2	10	131813	131822	20 %	0 %	20 %	60 %	392406381
85	NC_018023	GGCGG	2	10	132488	132497	0 %	0 %	80 %	20 %	392406382
86	NC_018023	GGCGG	2	10	133697	133706	0 %	0 %	80 %	20 %	392406383
87	NC_018023	TCGAG	2	10	134164	134173	20 %	20 %	40 %	20 %	392406383
88	NC_018023	TTGCG	2	10	134896	134905	0 %	40 %	40 %	20 %	392406384
89	NC_018023	CTGGG	2	10	135866	135875	0 %	20 %	60 %	20 %	392406385
90	NC_018023	CAGCT	2	10	137861	137870	20 %	20 %	20 %	40 %	392406389
91	NC_018023	CAACG	2	10	139780	139789	40 %	0 %	20 %	40 %	392406390
92	NC_018023	GGCAA	2	10	142466	142475	40 %	0 %	40 %	20 %	392406390
93	NC_018023	ACCCC	2	10	143447	143456	20 %	0 %	0 %	80 %	392406390
94	NC_018023	GCGCC	2	10	143499	143508	0 %	0 %	40 %	60 %	392406390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.