MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	ACCG	2	8	203	210	25 %	0 %	25 %	50 %	392406269
2	NC_018023	CGGG	2	8	589	596	0 %	0 %	75 %	25 %	392406269
3	NC_018023	GCCG	2	8	1233	1240	0 %	0 %	50 %	50 %	392406270
4	NC_018023	CCAC	2	8	1811	1818	25 %	0 %	0 %	75 %	392406270
5	NC_018023	CCAG	2	8	1969	1976	25 %	0 %	25 %	50 %	392406270
6	NC_018023	ACGC	2	8	2713	2720	25 %	0 %	25 %	50 %	392406271
7	NC_018023	TCCT	2	8	3077	3084	0 %	50 %	0 %	50 %	392406271
8	NC_018023	ATCG	2	8	3089	3096	25 %	25 %	25 %	25 %	392406271
9	NC_018023	CGGA	2	8	3808	3815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018023	CGCA	2	8	4189	4196	25 %	0 %	25 %	50 %	392406272
11	NC_018023	TCGA	2	8	4365	4372	25 %	25 %	25 %	25 %	392406272
12	NC_018023	CAGC	2	8	4456	4463	25 %	0 %	25 %	50 %	392406272
13	NC_018023	GATC	2	8	5142	5149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018023	CCCG	2	8	5329	5336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_018023	GGTC	2	8	5448	5455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018023	CGCC	2	8	5479	5486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_018023	CGGC	2	8	5490	5497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018023	GGCT	2	8	5590	5597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018023	GGAC	2	8	6220	6227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018023	AGAC	2	8	6457	6464	50 %	0 %	25 %	25 %	392406275
21	NC_018023	GATT	2	8	6773	6780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018023	CAGC	2	8	6892	6899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018023	CGGC	2	8	6938	6945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018023	ACTG	2	8	8274	8281	25 %	25 %	25 %	25 %	392406276
25	NC_018023	TCGG	2	8	8850	8857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018023	GCCG	3	12	8987	8998	0 %	0 %	50 %	50 %	392406277
27	NC_018023	TCTA	2	8	9135	9142	25 %	50 %	0 %	25 %	392406277
28	NC_018023	GCTG	2	8	9495	9502	0 %	25 %	50 %	25 %	392406277
29	NC_018023	TCGG	2	8	10157	10164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018023	CTAC	2	8	10309	10316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018023	CTTA	2	8	10703	10710	25 %	50 %	0 %	25 %	392406278
32	NC_018023	CGAG	2	8	10748	10755	25 %	0 %	50 %	25 %	392406278
33	NC_018023	TGGT	2	8	11188	11195	0 %	50 %	50 %	0 %	392406278
34	NC_018023	GGCA	2	8	11200	11207	25 %	0 %	50 %	25 %	392406278
35	NC_018023	CGTG	2	8	11366	11373	0 %	25 %	50 %	25 %	392406278
36	NC_018023	CGCA	2	8	11668	11675	25 %	0 %	25 %	50 %	392406279
37	NC_018023	TCTG	2	8	11791	11798	0 %	50 %	25 %	25 %	392406279
38	NC_018023	TGCT	2	8	11988	11995	0 %	50 %	25 %	25 %	392406279
39	NC_018023	CTCG	2	8	12197	12204	0 %	25 %	25 %	50 %	392406280
40	NC_018023	CGTC	2	8	12544	12551	0 %	25 %	25 %	50 %	392406280
41	NC_018023	TCAG	2	8	12831	12838	25 %	25 %	25 %	25 %	392406280
42	NC_018023	TGCA	2	8	13185	13192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018023	TCCT	2	8	13374	13381	0 %	50 %	0 %	50 %	392406281
44	NC_018023	CGAT	2	8	13497	13504	25 %	25 %	25 %	25 %	392406281
45	NC_018023	GCTC	2	8	14013	14020	0 %	25 %	25 %	50 %	392406281
46	NC_018023	ATGG	2	8	15090	15097	25 %	25 %	50 %	0 %	392406281
47	NC_018023	GCCG	2	8	15223	15230	0 %	0 %	50 %	50 %	392406281
48	NC_018023	CCTG	2	8	15317	15324	0 %	25 %	25 %	50 %	392406281
49	NC_018023	AGGT	2	8	15730	15737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018023	CGTG	2	8	15764	15771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018023	CCGA	2	8	16458	16465	25 %	0 %	25 %	50 %	392406282
52	NC_018023	CGAT	2	8	16589	16596	25 %	25 %	25 %	25 %	392406282
53	NC_018023	GGGC	2	8	16860	16867	0 %	0 %	75 %	25 %	392406282
54	NC_018023	AGCC	2	8	17033	17040	25 %	0 %	25 %	50 %	392406282
55	NC_018023	GCGA	2	8	18504	18511	25 %	0 %	50 %	25 %	392406284
56	NC_018023	CAGC	2	8	19594	19601	25 %	0 %	25 %	50 %	392406284
57	NC_018023	CTCG	2	8	19841	19848	0 %	25 %	25 %	50 %	392406285
58	NC_018023	TCCT	2	8	20467	20474	0 %	50 %	0 %	50 %	392406285
59	NC_018023	CGGC	2	8	20512	20519	0 %	0 %	50 %	50 %	392406285
60	NC_018023	CGGT	2	8	20728	20735	0 %	25 %	50 %	25 %	392406286
61	NC_018023	TCGC	2	8	21093	21100	0 %	25 %	25 %	50 %	392406286
62	NC_018023	CGTG	2	8	21322	21329	0 %	25 %	50 %	25 %	392406286
63	NC_018023	ATGG	2	8	21509	21516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018023	CGTC	2	8	22008	22015	0 %	25 %	25 %	50 %	392406287
65	NC_018023	GGCG	2	8	22488	22495	0 %	0 %	75 %	25 %	392406287
66	NC_018023	AGTC	2	8	22676	22683	25 %	25 %	25 %	25 %	392406287
67	NC_018023	TCAT	2	8	22694	22701	25 %	50 %	0 %	25 %	392406287
68	NC_018023	CAGG	2	8	22789	22796	25 %	0 %	50 %	25 %	392406287
69	NC_018023	GACA	2	8	22933	22940	50 %	0 %	25 %	25 %	392406287
70	NC_018023	ACCT	2	8	23307	23314	25 %	25 %	0 %	50 %	392406288
71	NC_018023	ATTG	2	8	23466	23473	25 %	50 %	25 %	0 %	392406288
72	NC_018023	GTCG	2	8	23972	23979	0 %	25 %	50 %	25 %	392406289
73	NC_018023	TCGC	2	8	24046	24053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018023	CTGG	2	8	24383	24390	0 %	25 %	50 %	25 %	392406290
75	NC_018023	GTCT	2	8	25796	25803	0 %	50 %	25 %	25 %	392406291
76	NC_018023	TGGG	2	8	25872	25879	0 %	25 %	75 %	0 %	392406291
77	NC_018023	CGTT	2	8	26116	26123	0 %	50 %	25 %	25 %	392406292
78	NC_018023	ATCT	2	8	26127	26134	25 %	50 %	0 %	25 %	392406292
79	NC_018023	GGAA	2	8	26410	26417	50 %	0 %	50 %	0 %	392406292
80	NC_018023	CACG	2	8	26499	26506	25 %	0 %	25 %	50 %	392406292
81	NC_018023	ACTG	2	8	26567	26574	25 %	25 %	25 %	25 %	392406292
82	NC_018023	CAGC	2	8	27170	27177	25 %	0 %	25 %	50 %	392406292
83	NC_018023	GCAT	2	8	28307	28314	25 %	25 %	25 %	25 %	392406293
84	NC_018023	CGAG	2	8	29775	29782	25 %	0 %	50 %	25 %	392406295
85	NC_018023	CGGC	2	8	29938	29945	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
86	NC_018023	TGGG	2	8	29953	29960	0 %	25 %	75 %	0 %	392406295
87	NC_018023	GTCA	2	8	29976	29983	25 %	25 %	25 %	25 %	392406295
88	NC_018023	GAAG	2	8	30620	30627	50 %	0 %	50 %	0 %	392406295
89	NC_018023	GCCG	2	8	31040	31047	0 %	0 %	50 %	50 %	392406295
90	NC_018023	GATG	2	8	32274	32281	25 %	25 %	50 %	0 %	392406296
91	NC_018023	GCAC	2	8	32703	32710	25 %	0 %	25 %	50 %	392406296
92	NC_018023	ACGC	2	8	32761	32768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_018023	CCGT	2	8	33333	33340	0 %	25 %	25 %	50 %	392406297
94	NC_018023	GCGG	2	8	33400	33407	0 %	0 %	75 %	25 %	392406297
95	NC_018023	TGGA	2	8	33727	33734	25 %	25 %	50 %	0 %	392406297
96	NC_018023	GTGG	2	8	33960	33967	0 %	25 %	75 %	0 %	392406297
97	NC_018023	CGAC	2	8	34352	34359	25 %	0 %	25 %	50 %	392406298
98	NC_018023	CGTT	2	8	34734	34741	0 %	50 %	25 %	25 %	392406299
99	NC_018023	GGCT	2	8	34971	34978	0 %	25 %	50 %	25 %	392406299
100	NC_018023	GACC	2	8	35553	35560	25 %	0 %	25 %	50 %	392406299
101	NC_018023	TCGT	2	8	36563	36570	0 %	50 %	25 %	25 %	392406300
102	NC_018023	ACCG	2	8	36639	36646	25 %	0 %	25 %	50 %	392406300
103	NC_018023	GTTC	2	8	37165	37172	0 %	50 %	25 %	25 %	392406300
104	NC_018023	GCTC	2	8	37437	37444	0 %	25 %	25 %	50 %	392406301
105	NC_018023	GACG	2	8	38673	38680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018023	TGCG	2	8	38685	38692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018023	GGCG	2	8	39208	39215	0 %	0 %	75 %	25 %	392406303
108	NC_018023	CGAG	2	8	39393	39400	25 %	0 %	50 %	25 %	392406303
109	NC_018023	TGCG	2	8	39470	39477	0 %	25 %	50 %	25 %	392406303
110	NC_018023	CGCC	2	8	39504	39511	0 %	0 %	25 %	75 %	392406303
111	NC_018023	GTCG	2	8	40407	40414	0 %	25 %	50 %	25 %	392406303
112	NC_018023	CTGC	2	8	40512	40519	0 %	25 %	25 %	50 %	392406303
113	NC_018023	CGAT	2	8	40667	40674	25 %	25 %	25 %	25 %	392406303
114	NC_018023	GATG	2	8	42136	42143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018023	CGGG	2	8	42659	42666	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018023	GGTC	2	8	42819	42826	0 %	25 %	50 %	25 %	392406304
117	NC_018023	CCAG	2	8	43234	43241	25 %	0 %	25 %	50 %	392406304
118	NC_018023	GTGC	2	8	43374	43381	0 %	25 %	50 %	25 %	392406304
119	NC_018023	CAAG	2	8	43577	43584	50 %	0 %	25 %	25 %	392406304
120	NC_018023	TTCA	2	8	44378	44385	25 %	50 %	0 %	25 %	392406305
121	NC_018023	GCCT	2	8	45284	45291	0 %	25 %	25 %	50 %	392406305
122	NC_018023	CGGG	2	8	45310	45317	0 %	0 %	75 %	25 %	392406305
123	NC_018023	ACCG	2	8	45712	45719	25 %	0 %	25 %	50 %	392406305
124	NC_018023	GGGT	2	8	46593	46600	0 %	25 %	75 %	0 %	392406306
125	NC_018023	GTTG	2	8	47274	47281	0 %	50 %	50 %	0 %	392406306
126	NC_018023	AGCC	2	8	48189	48196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018023	GTGC	2	8	48840	48847	0 %	25 %	50 %	25 %	392406307
128	NC_018023	CCTT	2	8	49605	49612	0 %	50 %	0 %	50 %	392406308
129	NC_018023	TGCG	2	8	49858	49865	0 %	25 %	50 %	25 %	392406308
130	NC_018023	CAAC	2	8	49906	49913	50 %	0 %	0 %	50 %	392406308
131	NC_018023	CCGG	2	8	50291	50298	0 %	0 %	50 %	50 %	392406309
132	NC_018023	CTTC	2	8	50555	50562	0 %	50 %	0 %	50 %	392406309
133	NC_018023	GAGC	2	8	50927	50934	25 %	0 %	50 %	25 %	392406309
134	NC_018023	CCGG	2	8	52074	52081	0 %	0 %	50 %	50 %	392406310
135	NC_018023	GTCG	2	8	52255	52262	0 %	25 %	50 %	25 %	392406310
136	NC_018023	AGCG	2	8	52521	52528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018023	AGGT	2	8	52579	52586	25 %	25 %	50 %	0 %	392406311
138	NC_018023	TGGT	2	8	52687	52694	0 %	50 %	50 %	0 %	392406311
139	NC_018023	CTGG	2	8	52786	52793	0 %	25 %	50 %	25 %	392406311
140	NC_018023	GGCC	2	8	52916	52923	0 %	0 %	50 %	50 %	392406311
141	NC_018023	TTCG	2	8	53158	53165	0 %	50 %	25 %	25 %	392406311
142	NC_018023	GCTT	2	8	54560	54567	0 %	50 %	25 %	25 %	392406313
143	NC_018023	CGAC	2	8	54674	54681	25 %	0 %	25 %	50 %	392406313
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273	NC_018023	GGCG	2	8	98206	98213	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.