MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	CGGA	2	8	3808	3815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018023	GATC	2	8	5142	5149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018023	CCCG	2	8	5329	5336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_018023	GGTC	2	8	5448	5455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018023	CGCC	2	8	5479	5486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_018023	CGGC	2	8	5490	5497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018023	GGCT	2	8	5590	5597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018023	GGAC	2	8	6220	6227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018023	GATT	2	8	6773	6780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018023	CAGC	2	8	6892	6899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018023	CGGC	2	8	6938	6945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018023	TCGG	2	8	8850	8857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018023	TCGG	2	8	10157	10164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018023	CTAC	2	8	10309	10316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018023	TGCA	2	8	13185	13192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018023	AGGT	2	8	15730	15737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018023	CGTG	2	8	15764	15771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018023	ATGG	2	8	21509	21516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018023	TCGC	2	8	24046	24053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018023	ACGC	2	8	32761	32768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018023	GACG	2	8	38673	38680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018023	TGCG	2	8	38685	38692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018023	GATG	2	8	42136	42143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018023	CGGG	2	8	42659	42666	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018023	AGCC	2	8	48189	48196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018023	AGCG	2	8	52521	52528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018023	CTCG	2	8	55331	55338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018023	ACCA	2	8	61312	61319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018023	AGCC	2	8	61463	61470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018023	GATG	2	8	61643	61650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018023	GCCC	2	8	61899	61906	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_018023	CTCC	2	8	63337	63344	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_018023	GCCT	2	8	65644	65651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018023	CGGC	2	8	65784	65791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018023	CCGG	2	8	65812	65819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018023	GACA	2	8	65868	65875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018023	GCTG	2	8	67160	67167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018023	GCCG	2	8	74142	74149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018023	GCCT	2	8	74455	74462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018023	CGGG	2	8	74646	74653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018023	CGGC	2	8	76918	76925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018023	GGGT	2	8	78188	78195	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018023	GGCA	2	8	79740	79747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018023	CTCG	2	8	86656	86663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018023	ACGT	2	8	89275	89282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018023	CGGC	2	8	89413	89420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018023	GCCA	2	8	95034	95041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018023	CCAC	2	8	97723	97730	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_018023	GGCG	2	8	98206	98213	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018023	CGTG	2	8	110459	110466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018023	CCCG	2	8	110589	110596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018023	CTCA	2	8	112341	112348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018023	GGCT	2	8	112410	112417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018023	CAAT	2	8	117034	117041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018023	AGGA	2	8	117296	117303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018023	ATGC	2	8	117909	117916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018023	GCCA	2	8	121374	121381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018023	GACA	2	8	122358	122365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018023	CGTC	2	8	122459	122466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018023	GCTT	2	8	122547	122554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018023	GAGC	2	8	122864	122871	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018023	GGGT	2	8	125235	125242	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018023	CGGT	2	8	131971	131978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018023	CGCC	2	8	135535	135542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_018023	CCGG	2	8	135600	135607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018023	CAGC	2	8	137281	137288	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.