MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.02

Total Repeats: 2068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018023	GTC	2	6	180	185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406269
2	NC_018023	CTG	2	6	197	202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406269
3	NC_018023	CTG	2	6	242	247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406269
4	NC_018023	CGG	2	6	406	411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406269
5	NC_018023	CGG	2	6	490	495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406269
6	NC_018023	CGC	2	6	527	532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406269
7	NC_018023	CGG	2	6	743	748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406269
8	NC_018023	GGC	2	6	762	767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406269
9	NC_018023	ACG	2	6	768	773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406269
10	NC_018023	GCC	2	6	866	871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406269
11	NC_018023	TCA	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406269
12	NC_018023	CTG	2	6	905	910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406269
13	NC_018023	GCG	3	9	1223	1231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406270
14	NC_018023	ATG	2	6	1267	1272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406270
15	NC_018023	GGT	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406270
16	NC_018023	CGT	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406270
17	NC_018023	TCG	2	6	1471	1476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406270
18	NC_018023	GTG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406270
19	NC_018023	TCA	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406270
20	NC_018023	TGA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406270
21	NC_018023	GTC	2	6	1641	1646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406270
22	NC_018023	GTC	2	6	1680	1685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406270
23	NC_018023	GTC	3	9	1770	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406270
24	NC_018023	GTG	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406270
25	NC_018023	CGA	2	6	1823	1828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406270
26	NC_018023	GCA	2	6	1850	1855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406270
27	NC_018023	GTC	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406270
28	NC_018023	CGG	2	6	1891	1896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406270
29	NC_018023	GCC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406270
30	NC_018023	GGC	3	9	1959	1967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406270
31	NC_018023	TGA	2	6	1985	1990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406270
32	NC_018023	GCG	2	6	2014	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406270
33	NC_018023	GCA	2	6	2230	2235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406270
34	NC_018023	CGA	2	6	2257	2262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406270
35	NC_018023	CCG	2	6	2310	2315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406270
36	NC_018023	CGA	2	6	2369	2374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406270
37	NC_018023	CGC	2	6	2390	2395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406270
38	NC_018023	CGG	2	6	2521	2526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406271
39	NC_018023	TCA	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406271
40	NC_018023	CGA	2	6	2770	2775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406271
41	NC_018023	GCC	2	6	2827	2832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406271
42	NC_018023	CTC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406271
43	NC_018023	TTG	2	6	2919	2924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406271
44	NC_018023	CCG	2	6	2949	2954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406271
45	NC_018023	TCG	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406271
46	NC_018023	CTC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406271
47	NC_018023	GCG	2	6	3065	3070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406271
48	NC_018023	GGC	2	6	3160	3165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406271
49	NC_018023	CCG	2	6	3199	3204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406271
50	NC_018023	GCC	2	6	3291	3296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406271
51	NC_018023	ACA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406271
52	NC_018023	CGG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406271
53	NC_018023	CTG	2	6	3485	3490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406271
54	NC_018023	GGT	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406272
55	NC_018023	GAA	2	6	4160	4165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406272
56	NC_018023	TCG	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406272
57	NC_018023	GCC	2	6	4332	4337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406272
58	NC_018023	TCG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406272
59	NC_018023	GGC	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406272
60	NC_018023	GTC	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406272
61	NC_018023	CGG	2	6	4520	4525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406272
62	NC_018023	CTT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392406272
63	NC_018023	GTC	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406272
64	NC_018023	CAT	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406272
65	NC_018023	CCT	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406273
66	NC_018023	GAG	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406273
67	NC_018023	CGT	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406273
68	NC_018023	CAG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406273
69	NC_018023	GCG	2	6	5070	5075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406273
70	NC_018023	AGC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406274
71	NC_018023	CCG	3	9	6289	6297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406274
72	NC_018023	TCA	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406274
73	NC_018023	CAT	2	6	6504	6509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406275
74	NC_018023	CGA	2	6	7416	7421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406276
75	NC_018023	CAA	2	6	7461	7466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406276
76	NC_018023	GTC	2	6	7516	7521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406276
77	NC_018023	GAC	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406276
78	NC_018023	CGA	2	6	7685	7690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406276
79	NC_018023	TGT	2	6	7698	7703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406276
80	NC_018023	CGG	2	6	7742	7747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406276
81	NC_018023	TCG	2	6	7817	7822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406276
82	NC_018023	GCG	2	6	7829	7834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406276
83	NC_018023	GTC	2	6	7906	7911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406276
84	NC_018023	GAC	2	6	7930	7935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406276
85	NC_018023	TCG	2	6	7949	7954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406276
86	NC_018023	CCA	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406276
87	NC_018023	TCG	3	9	8003	8011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406276
88	NC_018023	GGC	2	6	8056	8061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406276
89	NC_018023	TGT	2	6	8087	8092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406276
90	NC_018023	TCC	2	6	8207	8212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406276
91	NC_018023	AAG	2	6	8293	8298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406276
92	NC_018023	CGA	2	6	8375	8380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406276
93	NC_018023	CAC	2	6	8526	8531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406276
94	NC_018023	GAC	2	6	8939	8944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406277
95	NC_018023	ACC	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406277
96	NC_018023	CGA	2	6	9309	9314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406277
97	NC_018023	CGT	3	9	9334	9342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406277
98	NC_018023	CGC	2	6	9427	9432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406277
99	NC_018023	GTC	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406277
100	NC_018023	GCC	2	6	9613	9618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406277
101	NC_018023	CTA	2	6	9635	9640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406277
102	NC_018023	TGA	2	6	9705	9710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406277
103	NC_018023	ACA	2	6	9813	9818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406277
104	NC_018023	AGC	2	6	10029	10034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406277
105	NC_018023	TCG	2	6	10620	10625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406278
106	NC_018023	CGA	2	6	10662	10667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406278
107	NC_018023	AGA	2	6	10793	10798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406278
108	NC_018023	TTG	2	6	10827	10832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406278
109	NC_018023	GCA	2	6	10872	10877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406278
110	NC_018023	GCC	2	6	10902	10907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406278
111	NC_018023	CCG	2	6	10938	10943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406278
112	NC_018023	CGA	2	6	11009	11014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406278
113	NC_018023	CCG	2	6	11257	11262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406278
114	NC_018023	AAC	2	6	11280	11285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406278
115	NC_018023	CAC	2	6	11697	11702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392406279
116	NC_018023	ATC	2	6	11763	11768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406279
117	NC_018023	TAC	2	6	11856	11861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406279
118	NC_018023	CGA	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406279
119	NC_018023	GAA	2	6	11933	11938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406279
120	NC_018023	TAC	2	6	11952	11957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406279
121	NC_018023	ACG	2	6	12061	12066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406279
122	NC_018023	CGC	2	6	12185	12190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406280
123	NC_018023	CAG	2	6	12303	12308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406280
124	NC_018023	GCC	2	6	12318	12323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406280
125	NC_018023	ACA	2	6	12334	12339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406280
126	NC_018023	CGG	2	6	12404	12409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406280
127	NC_018023	GCC	2	6	12456	12461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406280
128	NC_018023	CCT	2	6	12608	12613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392406280
129	NC_018023	CGC	2	6	12686	12691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406280
130	NC_018023	CGA	2	6	12701	12706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406280
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134	NC_018023	AGA	2	6	12996	13001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406280
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242	NC_018023	TAC	2	6	21703	21708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406287
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252	NC_018023	CAA	2	6	22470	22475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392406287
253	NC_018023	CGC	2	6	22500	22505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406287
254	NC_018023	CAG	2	6	22604	22609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406287
255	NC_018023	TAC	2	6	22660	22665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406287
256	NC_018023	GCC	2	6	22712	22717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406287
257	NC_018023	CGC	2	6	22773	22778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406287
258	NC_018023	CGC	2	6	22838	22843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406287
259	NC_018023	CGC	2	6	22875	22880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406287
260	NC_018023	GGC	2	6	22884	22889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406287
261	NC_018023	CGG	2	6	22991	22996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406288
262	NC_018023	GCG	2	6	23019	23024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406288
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265	NC_018023	CAT	2	6	23099	23104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406288
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269	NC_018023	GGA	2	6	23261	23266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406288
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283	NC_018023	CTG	2	6	24685	24690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406290
284	NC_018023	CTG	2	6	24728	24733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406290
285	NC_018023	CGC	2	6	24738	24743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406290
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376	NC_018023	AAG	2	6	30175	30180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392406295
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379	NC_018023	TTG	2	6	30598	30603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406295
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389	NC_018023	GGA	2	6	31136	31141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392406295
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400	NC_018023	ACG	2	6	31766	31771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406296
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497	NC_018023	CGG	2	6	39920	39925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406303
498	NC_018023	CGG	2	6	39928	39933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406303
499	NC_018023	CGA	2	6	39974	39979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406303
500	NC_018023	GAC	2	6	40035	40040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406303

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